Ca_06027, Ca_06027_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_06027
Unique NameCa_06027_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length7166
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_3supercontigCa_LG_3:18132849..18140014 -Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_06027.1Ca_06027.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_06027_ICC4958_v2 ID=Ca_06027_ICC4958_v2; Name=Ca_06027; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=7166bp
AACAGCGCAGCTTTTTTCCTCCAAAAACTCCGAACAAAAAACATCAAAAG
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TGAATTATTGATTCTATTAAGTAAGTTTTTGCTACGTTTTTAAGATGCCT
TTCTTGAATTTGTGTATATTCTATCTTCTATTAGTGGATTCTAGTTTTTT
ATGAAGATTTAAGCTATCTTGCTCTTGAATTCAATTTGTATTATTAATAT
TTAGCTTAGGGATATTGTGACTCTTTGAGCTCATGGTATTATGATTAAGG
CTTGTTTGGGTAAGCAACTTAATTAAGCGCTTATAGCATAAATACTTATC
ATATAAGTGCTTATTTATAATCTATTTCTATAGCAAAAGATACAGTGAAG
TCGAACTATTTTCATATAAATTATAAGCTGTTTTTATAAGCTATCTTGAG
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TCAAATAGGCCAATCCAAACAATGCCCTAAATTTGCATCTACAAGGTTTG
CATCCTAATTAAGTTCACTCAATTCTGCAGGCTAGATAAAACTAAGTTCT
ATGTCGTTGGAGCTGGACTCTTCACTGGTGTTACAGTTGCACTTTACCCG
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CTGGTTTGTATCGAGGGTTTGGCACGGTTATTGCCGGTGCAATACCGGCC
AGAATCATATTCCTCTCTGCTCTAGAGATTACAAAGGTGTCTACCTTTAA
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TTGTTCTCATTTTGTTTATGAATTCTAAATTGATATTAAAATTTATTTTA
AACATTGTGCTGCATTTGTATTGTTCACTCTGACTATATGGATGGTGCTT
TTATTTTATGTAGTTGGGAGTTGGACTTAGGATGTGGAAAGAATTCGGAT
TCCCTACAGTTAAGGGATCCTGCATTCACACAAATGGGACATTGATGGCC
ATTTGGTCGAGATTAGACGGTCTAGAAAAATGAAGATTTTTCTTTTTATT
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AGTCTATAATGCTTAAATATCAGAAAATTTTATGTGGAAGAAGGATGGAA
AGTCAGGTTATGCAATGATGTGTTAGGTCTGCAGACTTGTGATGTATTGA
ATTGGAACATGATGTGAGATTTTACATATATCAACATTTTCAGTTAATTT
GTGCTATTAATGTCTTTTTTCTTTGTGATAATGTTCAAGTGATGCTTCAT
TTTAAGGGTGCCATCGACATATACTTAGATATATAAGAACAATCATTTTT
AATTTTTGTTATTCCTTTTATGTTATCTCATTTTGTTTTAGTTTTTGTTG
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CGGTTCAAGTCAACGGTTCATTTGGAGGTAAGACATTGGTAATGCTTGTA
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GCTCAGCTTTCTATAGGAGGATAGCGGTCTGTCTGCTTTTATCAATGTTT
TTATCTAGAACTATGTTTAATATTTGATATCAGACCTTGCAACTGATCTC
TCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCCACACACACACACACTGAAAGAGTT
GCTTTGATGTAACTTTCCATGATCAAGGCACTACCTTGGTGTCGACTTTC
TTTAAATAATGAAGATTTTGATTAGAGATTCATAAAATGAAACCTTAAAA
GTTTTCATTTTAAAGTTGAGTTGTAACTGTTTTTTTTGCTATGCCGCGAT
TAGTATGAGTGTGTTGATAATGTTCACATGGTATCTTCTATACAACGGTT
ATTTATGTTTTATACATTAGTTTCAAACAGCTTATAGGTCTTTCATATAA
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AGCTGTCGAAGCACTAGTATAGGGGATTGCTTAAATCGGATAAATGTTCT
TAATGTTAGATTGGTCAGATTAGTGTACTTTATTCACTCTATAAGGATCG
AATTACACGTTGAAATATGGGATGCCGTAACTGCATCTGCATGCATGTAG
GGTAATGAATTTTAAACTTGTATGGTTTTACACGTTGAAATATGTGATGC
TGCATCTGCATTTGCATAAAACTTAAGATTTCCTTTTTTCACAAAAGTTA
ACATCGTGGTAACTTTTATTAATAATAGGGTAATCAATTTTTTTTATGTG
CTTGCCATTATTTTGTTTCTGCATTGTTATGCAAACTTTCTAATATTCAA
GACAATTTAAAACTATTTGTATGAACAGATTCTTAGACCAAGGTGGAAAT
GATGGAGACACTCCTAGTGTGCAGAAGATTGTGTTAGTTCAAGCTGCGGG
AGGGATAATTGCCGGTGCATCTGCTTCCTGCATTACAACCCCATTGGACA
CTATCAAGACACGGTTACAGGTTTGCACAACCTCGTTTTGTTTTCTCTTG
TTCGTTCATTGTCCTTGGTGATCGTTATTGTGCATGCTACTTCTTTTTTT
TTTGTTATTACTTATAACTTTCTTATGGAATTTCGGAAGTGGCGATTGGC
TACAACCCCACTGGATAGTATCAACATCTTACCCTTTCTTAAACTCAACA
GATGTTTTTCCCTTTGTATGAAGCTTCTATTGCTTCATTAATCTTATATG
AATCAAAGTATCATTATGCTCTCTTCCTCCGCAACATGATATTGGAGCGA
TACTCTACTCCATGACAGCATGGCCTAATCTCATCATTATTCAACTTCCA
AATTCCCAAAAACCATAAGCAGAAAAGTCTACTTTAATATTGTTGGAAAT
TATAATATAAAACAATTGAAGTGTTTTCACCTTAGAAGCAAGAGCTTAAG
CTTTTGGGATAGTTGATTCATGACATAGTATCACGCTCAAAGCTGATAGG
GCTCGTGCATTGCATGAGGGGACATGTTTGAAGTAAATTAATGTAAAACC
ATTCATATGTTATCACCTAACAGTTTAAGCTTTCAGGAGATTTAGTTCGT
GACCATATCATGGTCTATTTTTCCTTTATCTTGAAATCATTCCATCACTT
GAATCCAACTTCTTTATTCTCCTTTTACTTTAGGTGTCAGGTTTGTGTTT
AGAAAAACAATTTTTGATTCTTTCTTTGTTACTCCCACACAAGCTGCATT
GAGCTTGGTTTTTCTCTGGCTCTTTTTTTTTTGCACGTCACTTTTCATGA
ATCTTCTCTCATCTTCTCTCTTTTCCTTTCTGTTCATGTTCTTACTGTCA
TTCTAAGGATCTGTTTGGATTGACTTATTGAGCTTATCTACTGAAATAAA
CACTTGCGACACTATTTGGGAGAGCTTATTGAAACTACTTGTGACATGTC
TTTAAGCTGTTTTCAGCTTATTTCCATAAGCTCTTCAAGACAGCTTATAA
AAATAGTCTGACTATACATTTTATCTTTTATTATAGAAACAAGTTATACA
TAAGCGTTTATATGATAAGCGTCGTTTATGCTTTAAGCCAGTATTGTTAA
ATTGCGGCCATGGCGGAATGGCATGGCAGATTTTTTGACAACCACTATAG
CTAATTTGTAAAGGGATGGCCGTAATGGCGTGTTTTCCTGCATCCTCCAT
ATTCTGTCATCCCCTATCGACAATGTTGCTATAAGCACTTAGTTAAGCTG
TTTATCCGAATAGGGCTTAAGTGTAGAACTTGGTTTGTAAAGATGAAGAG
GTTATAATAAACTTGGCTTCGATTACTTACATATTTGCTTCATTGGACAA
TTATGGTGATGTTAGATTGTGACCATACTGTCCAAAAGAAAAGAGCGAAA
AGAAATAACATTTCATGAATACTGTGTTGTTGTGTTTTACTTAATTATTG
ACATTTTATCATCCTGATTTATTACTGCTTATTTAATTTATTCTAACTGG
ATAGTTCTGCACTCCAGGTGATGGGACATGATAGTAGAAGCTCTATAAAA
CAAGTTACTAAAGATTTAATCAGTGAAGATGGTTGGAAAGGACTCTATAG
AGGGTTTGGTCCAAGATTTTTTAGCATGTCAGCATGGGGAACTTCAATGA
TATTGACTTATGAGTATCTGAGTAAGATCTCTTCCTCTTTTGCATTATAT
TCTCTTTTTGTGTATCTTCACTTGTGCTTTTGTTTATGCTGTTTGTTTGT
GTTTCACATTTATTAGAGAAACAACAGGGGTAAAATTAAACCCCCAGGCC
CCCCTACCCATCCTTCTGATTGTTTGAATGACTGTTAGATTTTTTGTATG
TGCTTATTGAAGCACGGCACTTCAAATTGAATGTATGTCTGATGTCCGAC
ACCGATACATGTGATTACATTCAATTACTTTCATTTTCTCAAATTATTAT
GAGGGTTGACATGTCATTGTGCTAGTGTCGTATCTAATATCTATTTTTCG
GCTAGTGCTTCATAGATAGTGATAGTGACACATCACCCCTTTATCACAAA
TTGTTTAGTAATGTCACCCAGTCCATGTCCACAAACTATTTTTAATGTCC
TCTTGAATGTATTTATCTCCTTTTCTTTTCCTTTTACAATTCTGAGGTAT
GCCTAAATGTCACTTATTCCTCTTCTATTTTGCAAACAAACACTAATGCC
CTTATTTTTTTAGAAAATTTGCACTTGCATTCGCATAGGTACATTTAAAT
GACACACAAACCCTCTAACTTATAAAATATAGGAAAGTGAGTGTCATTTT
ACAAAATTGATGAGGCATATCTGTCATATGACATATATCAAGGGAGGTGA
AAAGCAATTCCGCTTTTCTCATTCGCGCATTTCGTTTTTCCTTTTCCTCT
TTTTCTTCTGTCTCTTCTCTTTAGAGACTATGCTATGACTAACCGTCTAA
TCTTATCGGTGGTTCTCTTCCAAGTAGTAAATACTAAAAGTTACATTTTG
TAAAAAAAATAACAAAAGTTACAAAATTTTATGCAGTTATTTAAAAAATT
TCAATTACTTTGATTGGGTAAAGAAGGATAAAATTGTAAATTAAATAATT
TAAATAAAGGATAAAATTATAAGAAAAATGGCTACTCCAAAATTGAGTAT
TCCTTTTATATATAAGTATAATATAGAAGATTACGACTTGCGTTTTTCAA
TTGGGCTTTTGTTCTCATATTGTTATTGACTATTAAGCATACAAATAAAT
ATGCAAATTTTGAATGCTAATGTATCATGGTAGCTTTTCTCTTTGTTTAT
ATCTATCTATCTTATCCTAAACATTTTTTTTCCTTTGCTCAGAACGGTTA
TGCACCAAAGACGAATAGATGCAATTGGTCTGCCAGCTTTTCTTCAATTG
ATTGATTAAGCCATGATTAGGGTGGTAATGTTGTTGTAGAATTACACAAA
AGCTTTAACCCTACACCTTCAACACTGTAGTTTCTGTTTGACATTTATCA
GTTTTGACTGGAGGGTTAAAATTTTAAGCAGCAAAGCTGTTCTAACAGAT
TATTCTCAAAATAATTGCTGGTTATACTAGGAATTTTATAGTTTCATTCT
TTAATGATTAGATTGGATTTTTTGTAATGCTTTTTTAGCATTGATGTGGA
TTATGTATCATGAAAG
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gene from alignment at Ca_LG_3:18132849..18140014-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_06027_ICC4958_v2 ID=Ca_06027_ICC4958_v2; Name=Ca_06027; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=7166bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_3:18132849..18140014- (Cicer arietinum
AACAGCGCAGCTTTTTTCCTCCAAAAACTCCGAACAAAAAACATCAAAAG TTGTTAAACAGACTTAACCAATCAATCATTTCCACATTACAAATTACAAA TTCTTGGTGCAATACTTTTCTTCTATCATCAATCAACGTAACAAAGCAAC TAGGAATGATATTTTGTTCTTGTTGACAAATAGTTGATCAACCAAATGGC CCAATCCTTCGGTCAGACTGAGATTAATTGGGACAAGTATATTCTTCTCT TCCTTTAACTTTTTTTTTAATTTGCATTTCTGAATGGTACTGTTGCTTGA TTATCTTTTCTTATGTTTGTTGCATTTCATGATATCAATTATTCGGATAA AAATTGATACTTTATAATAGCCCTTTTACTTTTTAAATATGATGATTATT AGGGATTTCTGGTTAGGGAAATCAGCAGAAGGGTAAGTTGTTGATAGGGG AGAAATAGATGAAGCTGATATATTTCTTAATTTTTTAGCTTAACTCTCTG GTTTCTAGGGCAAAGGACTCTGGTAAAATTTGGAGTTTGGTAAGTAAAGT TTGACTAAAGATTGTTCTGGCTAGGGTTTCAACTCGAGTTTTTCTGATCG ATTTGACTTTCCGTGAAAGTCATTAACTACTTGAGATCAATCACTTGGTT AAATTTTTCAATTATATAGGAAATATGATAGGAACTCCTGAAAAAGTTGA GATTGTTTTGTTAATGGATATTCAAGGTGATTGATTGCATTGTGTTGCTT TGAATTATTGATTCTATTAAGTAAGTTTTTGCTACGTTTTTAAGATGCCT TTCTTGAATTTGTGTATATTCTATCTTCTATTAGTGGATTCTAGTTTTTT ATGAAGATTTAAGCTATCTTGCTCTTGAATTCAATTTGTATTATTAATAT TTAGCTTAGGGATATTGTGACTCTTTGAGCTCATGGTATTATGATTAAGG CTTGTTTGGGTAAGCAACTTAATTAAGCGCTTATAGCATAAATACTTATC ATATAAGTGCTTATTTATAATCTATTTCTATAGCAAAAGATACAGTGAAG TCGAACTATTTTCATATAAATTATAAGCTGTTTTTATAAGCTATCTTGAG AGATTATGGAAATAAGCTGAAAATTGTTAATGAATATGTCATAAATTGTT TCCATAAGCTCCCTCAAACAGTTTCGCAAGTGCTTATCTAGTCGATCAGT TCAAATAGGCCAATCCAAACAATGCCCTAAATTTGCATCTACAAGGTTTG CATCCTAATTAAGTTCACTCAATTCTGCAGGCTAGATAAAACTAAGTTCT ATGTCGTTGGAGCTGGACTCTTCACTGGTGTTACAGTTGCACTTTACCCG GTTTCAGTTGTGAAAACTAGGCTTCAAGTTGCAACAAAGGATGCTGTAGA GAGAAGTGCCTATTCTGTTGCTAAAGGATTACTTAAAACAGATGGCATCC CTGGTTTGTATCGAGGGTTTGGCACGGTTATTGCCGGTGCAATACCGGCC AGAATCATATTCCTCTCTGCTCTAGAGATTACAAAGGTGTCTACCTTTAA CATGCTGCAACCATTCGGACTATCAGAAACTACTCAGGCTGCCTTGGCAA ATGGAGTTGCAGGCATGACATCGTCACTTGTCGCTCAATCTGTGTTTGTA CCAATTGATGTGGTACGAAAATCTAATTCCAGTTGATATGGATATTGCGG TACATTCAGTGCATCTGCTCTGAATCTTAATCAAGTTTTTTAGTCAGCTT ATCAATCTTTGATGTTTATTTTTTACTGTTGCAAGTACTGAAATTTGGAA TTTGTTTGCTGATTTTCATGATATGTGCTGCGATCTAACTTAAGTGTTTA TTGTTCTCATTTTGTTTATGAATTCTAAATTGATATTAAAATTTATTTTA AACATTGTGCTGCATTTGTATTGTTCACTCTGACTATATGGATGGTGCTT TTATTTTATGTAGTTGGGAGTTGGACTTAGGATGTGGAAAGAATTCGGAT TCCCTACAGTTAAGGGATCCTGCATTCACACAAATGGGACATTGATGGCC ATTTGGTCGAGATTAGACGGTCTAGAAAAATGAAGATTTTTCTTTTTATT TGTAATTCAAAATACTGAGCTTGGATCTGGACCGTCCGATCTTGATCGAA CCATCACTGATGACCCGACTGCGAGTGATCCTCGGTTGCAAGGACTCCAG TCCGATGTAGAACACATACTTATTACTTCAAATGCTATGGTTGACTCTGT AGTCTATAATGCTTAAATATCAGAAAATTTTATGTGGAAGAAGGATGGAA AGTCAGGTTATGCAATGATGTGTTAGGTCTGCAGACTTGTGATGTATTGA ATTGGAACATGATGTGAGATTTTACATATATCAACATTTTCAGTTAATTT GTGCTATTAATGTCTTTTTTCTTTGTGATAATGTTCAAGTGATGCTTCAT TTTAAGGGTGCCATCGACATATACTTAGATATATAAGAACAATCATTTTT AATTTTTGTTATTCCTTTTATGTTATCTCATTTTGTTTTAGTTTTTGTTG TTTCTTTTTAAATGTGAAGAAGTTTCTTATCCTATTAATTTGTTCCAATT TTTTTATTGCTGATAAAATTTTATTCTTCCACAACAATTTGGCTAACTCT AATCTCTAATTCTCATTGGATGATATTCAGGTTAGCCAAAAAATGATGGT GCAAGGATACTCAGGCCATGCCCGATATAGCGGGGGTATGGATGTGGCTC GTAAGATTTTAAGGTCTGATGGCATTCGAGGATTGTATCGAGGATTCGGT CTTTCTGCTCTTACTTATTCGCCTTCTAGCGCGGTATGGTGGGCAAGTTA 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CTTGCCATTATTTTGTTTCTGCATTGTTATGCAAACTTTCTAATATTCAA GACAATTTAAAACTATTTGTATGAACAGATTCTTAGACCAAGGTGGAAAT GATGGAGACACTCCTAGTGTGCAGAAGATTGTGTTAGTTCAAGCTGCGGG AGGGATAATTGCCGGTGCATCTGCTTCCTGCATTACAACCCCATTGGACA CTATCAAGACACGGTTACAGGTTTGCACAACCTCGTTTTGTTTTCTCTTG TTCGTTCATTGTCCTTGGTGATCGTTATTGTGCATGCTACTTCTTTTTTT TTTGTTATTACTTATAACTTTCTTATGGAATTTCGGAAGTGGCGATTGGC TACAACCCCACTGGATAGTATCAACATCTTACCCTTTCTTAAACTCAACA GATGTTTTTCCCTTTGTATGAAGCTTCTATTGCTTCATTAATCTTATATG AATCAAAGTATCATTATGCTCTCTTCCTCCGCAACATGATATTGGAGCGA TACTCTACTCCATGACAGCATGGCCTAATCTCATCATTATTCAACTTCCA AATTCCCAAAAACCATAAGCAGAAAAGTCTACTTTAATATTGTTGGAAAT TATAATATAAAACAATTGAAGTGTTTTCACCTTAGAAGCAAGAGCTTAAG CTTTTGGGATAGTTGATTCATGACATAGTATCACGCTCAAAGCTGATAGG GCTCGTGCATTGCATGAGGGGACATGTTTGAAGTAAATTAATGTAAAACC ATTCATATGTTATCACCTAACAGTTTAAGCTTTCAGGAGATTTAGTTCGT GACCATATCATGGTCTATTTTTCCTTTATCTTGAAATCATTCCATCACTT GAATCCAACTTCTTTATTCTCCTTTTACTTTAGGTGTCAGGTTTGTGTTT AGAAAAACAATTTTTGATTCTTTCTTTGTTACTCCCACACAAGCTGCATT GAGCTTGGTTTTTCTCTGGCTCTTTTTTTTTTGCACGTCACTTTTCATGA ATCTTCTCTCATCTTCTCTCTTTTCCTTTCTGTTCATGTTCTTACTGTCA TTCTAAGGATCTGTTTGGATTGACTTATTGAGCTTATCTACTGAAATAAA CACTTGCGACACTATTTGGGAGAGCTTATTGAAACTACTTGTGACATGTC TTTAAGCTGTTTTCAGCTTATTTCCATAAGCTCTTCAAGACAGCTTATAA AAATAGTCTGACTATACATTTTATCTTTTATTATAGAAACAAGTTATACA TAAGCGTTTATATGATAAGCGTCGTTTATGCTTTAAGCCAGTATTGTTAA ATTGCGGCCATGGCGGAATGGCATGGCAGATTTTTTGACAACCACTATAG CTAATTTGTAAAGGGATGGCCGTAATGGCGTGTTTTCCTGCATCCTCCAT ATTCTGTCATCCCCTATCGACAATGTTGCTATAAGCACTTAGTTAAGCTG TTTATCCGAATAGGGCTTAAGTGTAGAACTTGGTTTGTAAAGATGAAGAG GTTATAATAAACTTGGCTTCGATTACTTACATATTTGCTTCATTGGACAA TTATGGTGATGTTAGATTGTGACCATACTGTCCAAAAGAAAAGAGCGAAA AGAAATAACATTTCATGAATACTGTGTTGTTGTGTTTTACTTAATTATTG ACATTTTATCATCCTGATTTATTACTGCTTATTTAATTTATTCTAACTGG ATAGTTCTGCACTCCAGGTGATGGGACATGATAGTAGAAGCTCTATAAAA CAAGTTACTAAAGATTTAATCAGTGAAGATGGTTGGAAAGGACTCTATAG AGGGTTTGGTCCAAGATTTTTTAGCATGTCAGCATGGGGAACTTCAATGA TATTGACTTATGAGTATCTGAGTAAGATCTCTTCCTCTTTTGCATTATAT TCTCTTTTTGTGTATCTTCACTTGTGCTTTTGTTTATGCTGTTTGTTTGT GTTTCACATTTATTAGAGAAACAACAGGGGTAAAATTAAACCCCCAGGCC CCCCTACCCATCCTTCTGATTGTTTGAATGACTGTTAGATTTTTTGTATG TGCTTATTGAAGCACGGCACTTCAAATTGAATGTATGTCTGATGTCCGAC ACCGATACATGTGATTACATTCAATTACTTTCATTTTCTCAAATTATTAT GAGGGTTGACATGTCATTGTGCTAGTGTCGTATCTAATATCTATTTTTCG GCTAGTGCTTCATAGATAGTGATAGTGACACATCACCCCTTTATCACAAA TTGTTTAGTAATGTCACCCAGTCCATGTCCACAAACTATTTTTAATGTCC TCTTGAATGTATTTATCTCCTTTTCTTTTCCTTTTACAATTCTGAGGTAT GCCTAAATGTCACTTATTCCTCTTCTATTTTGCAAACAAACACTAATGCC CTTATTTTTTTAGAAAATTTGCACTTGCATTCGCATAGGTACATTTAAAT GACACACAAACCCTCTAACTTATAAAATATAGGAAAGTGAGTGTCATTTT ACAAAATTGATGAGGCATATCTGTCATATGACATATATCAAGGGAGGTGA AAAGCAATTCCGCTTTTCTCATTCGCGCATTTCGTTTTTCCTTTTCCTCT TTTTCTTCTGTCTCTTCTCTTTAGAGACTATGCTATGACTAACCGTCTAA TCTTATCGGTGGTTCTCTTCCAAGTAGTAAATACTAAAAGTTACATTTTG TAAAAAAAATAACAAAAGTTACAAAATTTTATGCAGTTATTTAAAAAATT TCAATTACTTTGATTGGGTAAAGAAGGATAAAATTGTAAATTAAATAATT TAAATAAAGGATAAAATTATAAGAAAAATGGCTACTCCAAAATTGAGTAT 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