Ca_10052, Ca_10052_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview


Name	Ca_10052
Unique Name	Ca_10052_ICC4958_v2
Type	gene
Organism	Cicer arietinum (chickpea)
Sequence length	4374

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
Ca_LG_4	supercontig	Ca_LG_4:25246766..25251139 -	Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	n/a

Analyses

This gene is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	2015-08-11

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Ca_10052.1	Ca_10052.1_ICC4958_v2	Cicer arietinum	mRNA

Sequences

The following sequences are available for this feature:

gene sequence
gene from alignment at Ca_LG_4:25246766..25251139-

gene sequence

>Ca_10052_ICC4958_v2 ID=Ca_10052_ICC4958_v2; Name=Ca_10052; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4374bp
ATAATAATCAACGTATTCCGACCGAAAAGGAAGAACCAGCGAAACCCCTT
AACCACGATTTTCTCTTAATTCCATCGTATAAAGCTTTCCAAATCAGGGG
CGATCTTCTTCGATCAACCTTCTAATTCACGCGTACTGTGAAAATAAAGA
GTAATCAAATTTTGAAGAACGACAGATCAAAATGGTGCGAATTTTCTCTC
TCTTTTTTTGTTGCATGAATTTTATCAGGATTAGGGTTTTTGTTTAGATC
GTTACTTGCACACGTCTTTTCCGTGAATATTCTCTGTTATTGAGCATTTG
AAATCGTAATTTATGAATATGTCCTGTGGTGTTTGATTTTTTGAAGTTAA
ACTATTATCAATTTGTAACGGTTCCTTTATAATACATTATTTTATCAATA
TCAATTTAATCTTCTCAAGGTTTAGGGATCAAATTGATGGATGATATATT
CTTCTAGCTATTAATGTTTATTGTTTAATTTTTTATTTTATTATGATTAT
TTCGACTTGTTTGATGATGTTATGTTGATTGTTGAGCTTGGTGTAAATCG
TGGGATGTGTCATTCTATAAGTTGATTTGAGTTAATTGGCTTGCGTTTGA
ATAATCTAAAACTTGATTAATAGGCGTGAAATTCTCTGTTAGTCTGATAT
AGTATTGTACCATAGGAGTTTTTGACGGAAGAGTGGATATAAAACTGATA
CAGGAGTCTGACATACTTTATAAGTTATACGGTGTGACATTGATAGAGTA
TTGCATATAAAATTGTATACATGATTGTAACTTGAAAAGAACAAATCCTA
AATTAAAGTAAATATTATAAAAGTCTGCATTAGTTGTTACTCACCTAATT
AGTGTGGTATCCAACTGCAAACAACACTGTTACAAAAATTTTAATAAAAA
ATGGAAGTAAAAAGTTGAAGGTTGTGGGATGGGAATATCCTTCAGTGCTT
GTGGAGTGTCTAACCTTGGCATGGAATCCATTTTGAAGTGCTAGTGATTC
ATTGATTGAAATTATTTTTAAATACATATCAATTACACGCACACACGCAC
ACCCACATCTGCCAAAACAGGTCAATTCTAATAGATTTAAAATGTCTGGG
TGATGGTGGGGGGAGGGGATAGTACATTGACTACATTATAATGAAAATTA
TGGATTTTGTTACAGCCTCGTCAACAACATTGATAATGTATTGATGTTCA
ATAAAAATGCTATATGTTGGATATTTATCTGCAATGGATTTTTTTTTCCT
TTTTCAAAAGGACGTCAGAATTAGAATTCTGTACATGCTTGGTAGTATAT
CTAATATGAGTAGTTGTGGATATCTAGGCTAAAGTTTTAAATTTCTATCG
TCAGCCCTTAATCTCTGACTCTACATGGCCAGTGCCACCACAAGAAAAAG
ATTTGTGACTCGTATTTTATGTGGTATTTGTTACTTTAGTTTTCAACACA
CTGAACTTGCATTGCTTGTATTCTTTCAGTCCTCCCTTGCAGCTGCTAGA
GCGGACAACTTTTACTATCCTCCAGAATGGGATCCAAGTCAGGTATATTT
GATTTCAAAATGTCTGTTCTGTTAAATTATTTACTATTTAATAGTGAGAG
GTCTTATACTATGTTTCTTCCTTCCAGGGTTCTCTGAACAAGTTTCATGG
TCAACATGCCTTGAGAGAGAGAGCAAGGAAGATAGATCAGGGTATCTTGA
TCATAAGGTAAATGATTCATTTTAACAGCAGCTACTGGGCTACGGTGTGG
CCATTTATCTATTTGTTGTCATAGTTATTCTTGAAAGTTGGGTCTCCAAC
TGTAGGTCCTTTAGCTCTGTAATATGGTAAATGAAACAATGTTGATGATG
ATCATTTTATGCCATCTATGCCCATTTTGTACCTGGAATAGTAAGAAATG
AGTTAAGTTGCATGATATCTACAACATATTTGATGCGTTTTATGATTTAT
GAATTCTGACCAATTTAATGATTCATTATGATTGAAAGGGATAATCTATT
TGATATACTCTTACGGGGTGTGTTTTTACTTACAAGTGTATTATTTGGTT
TGTGTATTTGAGTGCATGCTTTAATTTAGCTTGTGTGTATACTCTTGAAA
GCTAGCTGTTAGCCTTCAGTTGGCCTCCTTTCCCAATCCGGGATATAGAT
TGGATAGTTTAGGATGCATGTTAGCCTTCAGTTGGCCTCCTTTTCCAATC
CGGGATATAGATTGGATAGTTTAGGATGCATTATTTTTATTTTAACTACT
AATTCCAAATTATCTGATGAACCTGCTATCAGGTTTGAGATGCCTTTTAA
TATATGGTGTGGAGGATGCAATTCTATGATTGCAAAGGGGGTTCGGTTCA
ATGCAGAGAAAAAGCAAGTTGGGAATTACTACTCCACAAAGGTATGGGAA
ACTAAAGTGCAAAGCATCTAATGTTTATGTTGGCTACAGTGTCAGTGACA
AATATTTTTTATTTTGTTAGTTATTTTTTGAAAACAAAGGCAGATGTAGA
AGCACCTGCTCATGCGTACAAATTCCTTATATGTAATTTATCATACAGGA
ATTTATTTTGATTCAATAACTGTGTAAACCTTGCTTCGCCTTATGATGCC
ACCTTTTTTTATGACTTTCTGAAAAATCTTGTTGCAAATTGAAAATTTCG
AACTATGCTAATGCTGTGATAACTTCTTTACTGCTAGTGTAAAAACTAAT
CAGTTATAATTTGATAGTGATGTATATACTATCCTTGCATCTTATTATTT
TCAAATGTTAATGCAATGCATTATCTTGGGACCAATTTATATAGTGTTGT
TAAATGTCTCTATTATTTACTATTAGTTAACGTATTAACTCTGTACCTTC
AGATATGGAGCTTTACCATGAAGGCTGCATGCTGTAAACAAGAGATCGTC
ATCCAGACTGATCCAAAGAACTGTTTGTATGAAATCATCAGTGGGGCTCA
GAAAAAAACTGAGGATTTTGATGTTGAGGATGCAGAAACTTTTGAATTAC
CTGCTGATGAAGGTGTGCCTTATGGAAGAAATCTTTGCTGTTCTTATTTT
AGTTTATTAGTTGGGTGTACATTTGCTCCAGTAGTTTTAAATGTGCTATT
GCATCTTTCAATTTCATTATTGAAGCTGGGAGAGTTTCCCATTGAACCCT
TGGATCCAATGGCTGTTTTTATGGATTATGTCCTTTTGACAAGTTTAGTG
CTTTACCTATTTCAGCATCGCAACTGTCTGTTAAGTGTAGCCACTGGTTC
ACTATTGTGGATGTTAGCTAACTTTATTTATTTTAAAATTTGTGTTGCAG
AGAGGGGGAAACTTGCTGATCCATTTTACCGCCTTGAACACCAGGAAGAA
GATTTGAAGAAAAAGAAAGAAGCTGAACCAGTGCTTGTGCGTCTCCAGAG
AATGTCTGATGCCAGACATTCAGATGACTATGCCCTAAATAAGAGTCTCC
GTGCCAAACTTAGAGTATGTTACTTAGCTTATGAAAATTATCTTTTAGTT
ATCCATTCCATTTTCCCTCTAATATTTTTTTCTCCCTTTTTCCATTTTCT
CAGAATCAAAAGAAAAGAGTTGCTGAAGAAGAAGCTGCTTCCAGGAAAAG
AGGCCTTGGGATTCGATTGCTTCCAGCTTCAGAACAAGATGCTGCTGCAG
CAGCAAAAGTGAAGTTTTCAAATAAGTTTGACAAAAATAGGAAGGACAAG
CGGGCATTGATCAATGCTGCTTCCATATTCCCAGGATTGCCAGACTCATC
CATGTCTGGCAAGAGAAGGCTAGAGCTAGAGTCTAAAAGAAGAAAAATTT
CTGCATGCCAAGCATCTAGCCTTTTGGCTGGGGGATATAAGCCGTCATCG
TGGTCACAAAGGGCTGTTTTGTCAAGCAGGCAAAAGGGATCTTCAATCAA
TGCTAGACACTAGAAAGCTGAAAAATGTCATCAGAGTTGGTCAGTCATCG
ATGATTTTGGCTTGTCACACTTGACTTGTATATAAAAATTGCTTTATAAG
GTTCTTTGTTAATGCAGTTGCTTGTCCTGGAAGCTTAAGATAAATGGAAG
TATGTGATAATTTTGTATTCTATAGTGTAAGCCATTTATAATGTGTGATG
GAAGTGTTTGATTTCCGGTAATAGCCCCCTTTTTCTTGTGACTAGACTGT
CTTGTGCCCTTATCACAATCTTCCTAATTAGTATTGATCTGAATGGAAGA
GTAACCCAGTAATTAGTATCATCAGATTCAGGTGGAGATTGTCGATGCTG
GGCTGTGTATACTTGCATTAGTACTTTGACAAGCTGTCATGACTGCTGAA
ACTTGTATCATTTATCTGTACACCCACCACCTAATGTGAATACTTATATT
CCATAACAGAAATATGGACCCGAT

gene from alignment at Ca_LG_4:25246766..25251139-

Legend: mRNA

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Ca_10052_ICC4958_v2 ID=Ca_10052_ICC4958_v2; Name=Ca_10052; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4374bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_4:25246766..25251139- (Cicer arietinum
ATAATAATCAACGTATTCCGACCGAAAAGGAAGAACCAGCGAAACCCCTT
AACCACGATTTTCTCTTAATTCCATCGTATAAAGCTTTCCAAATCAGGGG
CGATCTTCTTCGATCAACCTTCTAATTCACGCGTACTGTGAAAATAAAGA
GTAATCAAATTTTGAAGAACGACAGATCAAAATGGTGCGAATTTTCTCTC
TCTTTTTTTGTTGCATGAATTTTATCAGGATTAGGGTTTTTGTTTAGATC
GTTACTTGCACACGTCTTTTCCGTGAATATTCTCTGTTATTGAGCATTTG
AAATCGTAATTTATGAATATGTCCTGTGGTGTTTGATTTTTTGAAGTTAA
ACTATTATCAATTTGTAACGGTTCCTTTATAATACATTATTTTATCAATA
TCAATTTAATCTTCTCAAGGTTTAGGGATCAAATTGATGGATGATATATT
CTTCTAGCTATTAATGTTTATTGTTTAATTTTTTATTTTATTATGATTAT
TTCGACTTGTTTGATGATGTTATGTTGATTGTTGAGCTTGGTGTAAATCG
TGGGATGTGTCATTCTATAAGTTGATTTGAGTTAATTGGCTTGCGTTTGA
ATAATCTAAAACTTGATTAATAGGCGTGAAATTCTCTGTTAGTCTGATAT
AGTATTGTACCATAGGAGTTTTTGACGGAAGAGTGGATATAAAACTGATA
CAGGAGTCTGACATACTTTATAAGTTATACGGTGTGACATTGATAGAGTA
TTGCATATAAAATTGTATACATGATTGTAACTTGAAAAGAACAAATCCTA
AATTAAAGTAAATATTATAAAAGTCTGCATTAGTTGTTACTCACCTAATT
AGTGTGGTATCCAACTGCAAACAACACTGTTACAAAAATTTTAATAAAAA
ATGGAAGTAAAAAGTTGAAGGTTGTGGGATGGGAATATCCTTCAGTGCTT
GTGGAGTGTCTAACCTTGGCATGGAATCCATTTTGAAGTGCTAGTGATTC
ATTGATTGAAATTATTTTTAAATACATATCAATTACACGCACACACGCAC
ACCCACATCTGCCAAAACAGGTCAATTCTAATAGATTTAAAATGTCTGGG
TGATGGTGGGGGGAGGGGATAGTACATTGACTACATTATAATGAAAATTA
TGGATTTTGTTACAGCCTCGTCAACAACATTGATAATGTATTGATGTTCA
ATAAAAATGCTATATGTTGGATATTTATCTGCAATGGATTTTTTTTTCCT
TTTTCAAAAGGACGTCAGAATTAGAATTCTGTACATGCTTGGTAGTATAT
CTAATATGAGTAGTTGTGGATATCTAGGCTAAAGTTTTAAATTTCTATCG
TCAGCCCTTAATCTCTGACTCTACATGGCCAGTGCCACCACAAGAAAAAG
ATTTGTGACTCGTATTTTATGTGGTATTTGTTACTTTAGTTTTCAACACA
CTGAACTTGCATTGCTTGTATTCTTTCAGTCCTCCCTTGCAGCTGCTAGA
GCGGACAACTTTTACTATCCTCCAGAATGGGATCCAAGTCAGGTATATTT
GATTTCAAAATGTCTGTTCTGTTAAATTATTTACTATTTAATAGTGAGAG
GTCTTATACTATGTTTCTTCCTTCCAGGGTTCTCTGAACAAGTTTCATGG
TCAACATGCCTTGAGAGAGAGAGCAAGGAAGATAGATCAGGGTATCTTGA
TCATAAGGTAAATGATTCATTTTAACAGCAGCTACTGGGCTACGGTGTGG
CCATTTATCTATTTGTTGTCATAGTTATTCTTGAAAGTTGGGTCTCCAAC
TGTAGGTCCTTTAGCTCTGTAATATGGTAAATGAAACAATGTTGATGATG
ATCATTTTATGCCATCTATGCCCATTTTGTACCTGGAATAGTAAGAAATG
AGTTAAGTTGCATGATATCTACAACATATTTGATGCGTTTTATGATTTAT
GAATTCTGACCAATTTAATGATTCATTATGATTGAAAGGGATAATCTATT
TGATATACTCTTACGGGGTGTGTTTTTACTTACAAGTGTATTATTTGGTT
TGTGTATTTGAGTGCATGCTTTAATTTAGCTTGTGTGTATACTCTTGAAA
GCTAGCTGTTAGCCTTCAGTTGGCCTCCTTTCCCAATCCGGGATATAGAT
TGGATAGTTTAGGATGCATGTTAGCCTTCAGTTGGCCTCCTTTTCCAATC
CGGGATATAGATTGGATAGTTTAGGATGCATTATTTTTATTTTAACTACT
AATTCCAAATTATCTGATGAACCTGCTATCAGGTTTGAGATGCCTTTTAA
TATATGGTGTGGAGGATGCAATTCTATGATTGCAAAGGGGGTTCGGTTCA
ATGCAGAGAAAAAGCAAGTTGGGAATTACTACTCCACAAAGGTATGGGAA
ACTAAAGTGCAAAGCATCTAATGTTTATGTTGGCTACAGTGTCAGTGACA
AATATTTTTTATTTTGTTAGTTATTTTTTGAAAACAAAGGCAGATGTAGA
AGCACCTGCTCATGCGTACAAATTCCTTATATGTAATTTATCATACAGGA
ATTTATTTTGATTCAATAACTGTGTAAACCTTGCTTCGCCTTATGATGCC
ACCTTTTTTTATGACTTTCTGAAAAATCTTGTTGCAAATTGAAAATTTCG
AACTATGCTAATGCTGTGATAACTTCTTTACTGCTAGTGTAAAAACTAAT
CAGTTATAATTTGATAGTGATGTATATACTATCCTTGCATCTTATTATTT
TCAAATGTTAATGCAATGCATTATCTTGGGACCAATTTATATAGTGTTGT
TAAATGTCTCTATTATTTACTATTAGTTAACGTATTAACTCTGTACCTTC
AGATATGGAGCTTTACCATGAAGGCTGCATGCTGTAAACAAGAGATCGTC
ATCCAGACTGATCCAAAGAACTGTTTGTATGAAATCATCAGTGGGGCTCA
GAAAAAAACTGAGGATTTTGATGTTGAGGATGCAGAAACTTTTGAATTAC
CTGCTGATGAAGGTGTGCCTTATGGAAGAAATCTTTGCTGTTCTTATTTT
AGTTTATTAGTTGGGTGTACATTTGCTCCAGTAGTTTTAAATGTGCTATT
GCATCTTTCAATTTCATTATTGAAGCTGGGAGAGTTTCCCATTGAACCCT
TGGATCCAATGGCTGTTTTTATGGATTATGTCCTTTTGACAAGTTTAGTG
CTTTACCTATTTCAGCATCGCAACTGTCTGTTAAGTGTAGCCACTGGTTC
ACTATTGTGGATGTTAGCTAACTTTATTTATTTTAAAATTTGTGTTGCAG
AGAGGGGGAAACTTGCTGATCCATTTTACCGCCTTGAACACCAGGAAGAA
GATTTGAAGAAAAAGAAAGAAGCTGAACCAGTGCTTGTGCGTCTCCAGAG
AATGTCTGATGCCAGACATTCAGATGACTATGCCCTAAATAAGAGTCTCC
GTGCCAAACTTAGAGTATGTTACTTAGCTTATGAAAATTATCTTTTAGTT
ATCCATTCCATTTTCCCTCTAATATTTTTTTCTCCCTTTTTCCATTTTCT
CAGAATCAAAAGAAAAGAGTTGCTGAAGAAGAAGCTGCTTCCAGGAAAAG
AGGCCTTGGGATTCGATTGCTTCCAGCTTCAGAACAAGATGCTGCTGCAG
CAGCAAAAGTGAAGTTTTCAAATAAGTTTGACAAAAATAGGAAGGACAAG
CGGGCATTGATCAATGCTGCTTCCATATTCCCAGGATTGCCAGACTCATC
CATGTCTGGCAAGAGAAGGCTAGAGCTAGAGTCTAAAAGAAGAAAAATTT
CTGCATGCCAAGCATCTAGCCTTTTGGCTGGGGGATATAAGCCGTCATCG
TGGTCACAAAGGGCTGTTTTGTCAAGCAGGCAAAAGGGATCTTCAATCAA
TGCTAGACACTAGAAAGCTGAAAAATGTCATCAGAGTTGGTCAGTCATCG
ATGATTTTGGCTTGTCACACTTGACTTGTATATAAAAATTGCTTTATAAG
GTTCTTTGTTAATGCAGTTGCTTGTCCTGGAAGCTTAAGATAAATGGAAG
TATGTGATAATTTTGTATTCTATAGTGTAAGCCATTTATAATGTGTGATG
GAAGTGTTTGATTTCCGGTAATAGCCCCCTTTTTCTTGTGACTAGACTGT
CTTGTGCCCTTATCACAATCTTCCTAATTAGTATTGATCTGAATGGAAGA
GTAACCCAGTAATTAGTATCATCAGATTCAGGTGGAGATTGTCGATGCTG
GGCTGTGTATACTTGCATTAGTACTTTGACAAGCTGTCATGACTGCTGAA
ACTTGTATCATTTATCTGTACACCCACCACCTAATGTGAATACTTATATT
CCATAACAGAAATATGGACCCGAT

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