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Marker Overview
| Name | Vu_UCR09-1_0001 |
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| dbSNP ID | N/A |
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| Type | SNP |
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| SNP Alleles | G |
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| 5' Flanking Sequence | GCTACCTTGCTCCTCTCAGCTGCAATACTCACTGAGGCTTGTGGTCTGCTCGTGTCACTA
GGGTTAACGTTTCATTTCTTCATCTCTCCACCAGTTCCTAGAATCGCAAGCCATGGGAAA
ATCTTACCCAACCGTCAGCGCCGATTACCAGAAGGCCATTGAGAAGGCAAAGAAGAAGCT
CAGAGGCTTCATCGCTGAGAAGAGATGCGCTCCTTTGATGCTCCGTTTGGCATGGCACTC
TGCTGGTACCTTTGACGTCAGCACGAAGACCGGTGGTCCTTTTGGAACCATCAAGCACCC
TGCCGAACTCGCTCACGGTGCCAACAACGGTCTTGATATCGCTGTTAGGCTATTGGAGCC
AATTAAAGCGGAGTTTCCTATCTTGAGCTACGCAGATTTCTACCAGTTGGCTGGCGTTGT
CGCAGTTGAGGTCACTGGTGGACCTGAAGTTCCCTTCCACCCGGGCAGAGAGGACAAGCC
AGAACCACCTCCAGAGGGTCGCTTGCCCGATGCAACCAAGGGGTCTGATCACCTAAGGGA
TGTGTTCGGCAAGGCTATGGGACTTAGTGATCAGGATATTGTTGCTCTATCTGGTGGCCA
CACCATTGGTGCGGCACACAAGGAGCGTTCAGGATTTGAGGGCCCATGGACCTCAAACCC
TCTTATTTTTGACAACTCATACTTTAAGGAGTTGTTGAGTGGTGAAAAGGAAGGCCTCCT
TCAGTTGCCTTCTGACAAGGCACTTTTGTCTGATCCTGTATTCCGCCCTCTTGTTGAAAA
ATATGCAGCGGACGAAGATGCCTTCTTCGCTGATTACGCTGTTGCTCACCAAAAGCTTTC
CGAGCTTGGGTTTGCTGATGCGTAATCCACATATAGGCTGTTGGAGATTTAGAGATCTAA
GGGATGTG |
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| 3' Flanking Sequence | TTTTTAATGTCGATGTGAGGATGTGTTTTGCCCAGCCTTTATTTCACCATTGGCAAGTTG
GATTGTTTTTTTCCTTTATTGTGGTTGATCCTTTTGTTAAATAACATTTCTAAGAGTTAA
TGGTTGAACTCATTGGGACCTCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTTTCG
TTGTTTGCGTTCTTACTATGTGCCTTTTTGCGTTTGCGAATTGTTATAATTAGACCGTTC
TTAGTGTTCATATAGGAAGTGCGATTTTTGATTAATAATCATATCTTTATTATGTTTATT
ATGTGGACTTTTTGTATTTTCCAAAAGTTCCACACGGTAATAGTAATTGTTGTTTAGCTA
ATTACATATCTATTTAATTATTGTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAA |
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| Species | Vigna unguiculata |
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| Publication | [view all] |
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| Contact | Timothy Close
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Publications
| Year | Publication |
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| 2009 | Muchero W, Diop NN, Bhat PR, Fenton RD, Wanamaker S, Pottorff M, Hearne S, Cisse N, Fatokun C, Ehlers JD, Roberts PA, Close TJ. A consensus genetic map of cowpea [Vigna unguiculata (L) Walp.] and synteny based on EST-derived SNPs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009 Oct 27; 106(43):18159-64. |
Sequence
>Vu_UCR09-1_0001 ID=Vu_UCR09-1_0001; Name=Vu_UCR09-1_0001; organism=Vigna unguiculata; type=genetic_marker; length=1318bp
GCTACCTTGCTCCTCTCAGCTGCAATACTCACTGAGGCTTGTGGTCTGCT
CGTGTCACTAGGGTTAACGTTTCATTTCTTCATCTCTCCACCAGTTCCTA
GAATCGCAAGCCATGGGAAAATCTTACCCAACCGTCAGCGCCGATTACCA
GAAGGCCATTGAGAAGGCAAAGAAGAAGCTCAGAGGCTTCATCGCTGAGA
AGAGATGCGCTCCTTTGATGCTCCGTTTGGCATGGCACTCTGCTGGTACC
TTTGACGTCAGCACGAAGACCGGTGGTCCTTTTGGAACCATCAAGCACCC
TGCCGAACTCGCTCACGGTGCCAACAACGGTCTTGATATCGCTGTTAGGC
TATTGGAGCCAATTAAAGCGGAGTTTCCTATCTTGAGCTACGCAGATTTC
TACCAGTTGGCTGGCGTTGTCGCAGTTGAGGTCACTGGTGGACCTGAAGT
TCCCTTCCACCCGGGCAGAGAGGACAAGCCAGAACCACCTCCAGAGGGTC
GCTTGCCCGATGCAACCAAGGGGTCTGATCACCTAAGGGATGTGTTCGGC
AAGGCTATGGGACTTAGTGATCAGGATATTGTTGCTCTATCTGGTGGCCA
CACCATTGGTGCGGCACACAAGGAGCGTTCAGGATTTGAGGGCCCATGGA
CCTCAAACCCTCTTATTTTTGACAACTCATACTTTAAGGAGTTGTTGAGT
GGTGAAAAGGAAGGCCTCCTTCAGTTGCCTTCTGACAAGGCACTTTTGTC
TGATCCTGTATTCCGCCCTCTTGTTGAAAAATATGCAGCGGACGAAGATG
CCTTCTTCGCTGATTACGCTGTTGCTCACCAAAAGCTTTCCGAGCTTGGG
TTTGCTGATGCGTAATCCACATATAGGCTGTTGGAGATTTAGAGATCTAA
GGGATGTG[G]TTTTTAATGTCGATGTGAGGATGTGTTTTGCCCAGCCTT
TATTTCACCATTGGCAAGTTGGATTGTTTTTTTCCTTTATTGTGGTTGAT
CCTTTTGTTAAATAACATTTCTAAGAGTTAATGGTTGAACTCATTGGGAC
CTCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTTTCGTTGTTTGCG
TTCTTACTATGTGCCTTTTTGCGTTTGCGAATTGTTATAATTAGACCGTT
CTTAGTGTTCATATAGGAAGTGCGATTTTTGATTAATAATCATATCTTTA
TTATGTTTATTATGTGGACTTTTTGTATTTTCCAAAAGTTCCACACGGTA
ATAGTAATTGTTGTTTAGCTAATTACATATCTATTTAATTATTGTTTCTT
TAAAAAAAAAAAAAAAAA
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