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Marker Overview
| Name | Vu_UCR09-1_0012 |
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| dbSNP ID | N/A |
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| Type | SNP |
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| SNP Alleles | T |
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| 5' Flanking Sequence | GAGTGCGGTCTCCTTGCATTCGCTGACGATCAGAGGAAGACACGAAGCCTCTTTCCAAAC
CCTTCTTTGGGTAACCGTTTAAAGTGCAGAGATGGCGGATGGATTGCATTCACGGCATCC
ATCTGTAGTTCAGAAGTTATCTGGACAGTCTTACTTTATGTCCAGGCTTGCTCCTAATCA
TTCCAGAAACTATTCTACCAGTGGTAGTTACTTCAATGGAGGCGTGCAGTCTCTGGGCTT
GGTTCCAGTCACAGCACATGCACCAGCTGAGAAAGGGGTGTCTGGGTTTTTGGTGGATTT
CCTCATGGGAGGAGTGTCAGCTGCTGTGTCCAAGACGGCTGCAGCTCCGATCGAGCGAGT
CAAGTTACTCATCCAAAACCAGGATGAAATGATCAAGAGTGGTCGGTTGTCTGAGCCATA
CAAGGGAATTGGCGATTGTTTCTCCCGAACCATGAAGGATGAAGGGGTGATTGCTCTTTG
GAGAGGAAACACGGCTAATGTTATCAGATATTTCCCTACTCAGGCTCTGAACTTTGCTTT
TAAGGATTATTTCAAGAGGCTTTTCAACTTCAAAAAAGATAAAGATGGCTACTGGAAGTG
GTTTGCTGGGAATCTAGCGTCTGGTGGGGCTGCTGGTGCTTCATCCCTCTTGTTTGTCTA
TTCACTGGATTATGCTCGAACTCGTCTAGCAAATGATGCAAAGGCTGCAAAGAAGGGTGG
TGAGAGGCAGTTCAATGGCTTGGTTGATGTTTACAGGAAAACCATCAAGTCTGATGGTGT
TGCTGGTCTTTACCGTGGTTTCAACATCTCGTGTGTTGGAATCATAGTGTACCGTGGTCT
TTACTTTGGAATGTATGATTCTTTGAAACCAGTTGTCTTGGTTGGTGGACTGCAGGATAG
CTTCTTTGCAAGTTTTCTTCTGGGATGGGGAATCACAATAGGTGCTGGCTTGGCCTCTTA
CCCCATTGATACCGTGCGTAGAAGAATGATGATGACATCTGGAGAAGCTGTAAAATACAA
GAGTTCTTTGGAAGCATTCAAGATAATTATCGCAAAAGAGGGTACGAAGTCACTCTTTAA
AGGTGCCGGTGCAAACATATTACGTGCTGTTGCTGGTGCCGGAGTGCTTGCTGGTTATGA
TAAGCTTCAGCTCATCGTGTTCGGAAAGAAATATGGCTCTGGTGGTGGAGGCTAAGATAC
AGATAATGACGACAATAACGGTCTGGAGCAGTGTTGTTGT |
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| 3' Flanking Sequence | TCCCTTTTTGCATTTGAATAATTTCGATGAAAAACGGTTTTGAATTTTCCCCGAATGTAG
GGGCTTTAAATTAGTCCTGCAAACTTGAATTTTAGTTGGATATTTACCTGTTAAGCTTAT
AATCCGTGAATTTTTTTAGACCTTTTGGTTGATGCAGTTTGAAGTCTACTGCTTTATTTG
TTCCATGTTTGTTTGGAAGGTTTTAAGAGTCTAATTGAAGTTGCATGTCTTTGCTAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAATATCTTACAGCGGCTTTGGTTCTACAAATTTAACAAAATTTGTTG
GCCCCCGTACTATACAAATCCTGCAGCATTTTCTCATTTGTTGAGATATTGGGAAATATT
ACGGTCAGTGAACCATTGTGTTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAA |
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| Species | Vigna unguiculata |
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| Publication | [view all] |
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| Contact | Timothy Close
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Publications
| Year | Publication |
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| 2009 | Muchero W, Diop NN, Bhat PR, Fenton RD, Wanamaker S, Pottorff M, Hearne S, Cisse N, Fatokun C, Ehlers JD, Roberts PA, Close TJ. A consensus genetic map of cowpea [Vigna unguiculata (L) Walp.] and synteny based on EST-derived SNPs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009 Oct 27; 106(43):18159-64. |
Sequence
>Vu_UCR09-1_0012 ID=Vu_UCR09-1_0012; Name=Vu_UCR09-1_0012; organism=Vigna unguiculata; type=genetic_marker; length=1645bp
GAGTGCGGTCTCCTTGCATTCGCTGACGATCAGAGGAAGACACGAAGCCT
CTTTCCAAACCCTTCTTTGGGTAACCGTTTAAAGTGCAGAGATGGCGGAT
GGATTGCATTCACGGCATCCATCTGTAGTTCAGAAGTTATCTGGACAGTC
TTACTTTATGTCCAGGCTTGCTCCTAATCATTCCAGAAACTATTCTACCA
GTGGTAGTTACTTCAATGGAGGCGTGCAGTCTCTGGGCTTGGTTCCAGTC
ACAGCACATGCACCAGCTGAGAAAGGGGTGTCTGGGTTTTTGGTGGATTT
CCTCATGGGAGGAGTGTCAGCTGCTGTGTCCAAGACGGCTGCAGCTCCGA
TCGAGCGAGTCAAGTTACTCATCCAAAACCAGGATGAAATGATCAAGAGT
GGTCGGTTGTCTGAGCCATACAAGGGAATTGGCGATTGTTTCTCCCGAAC
CATGAAGGATGAAGGGGTGATTGCTCTTTGGAGAGGAAACACGGCTAATG
TTATCAGATATTTCCCTACTCAGGCTCTGAACTTTGCTTTTAAGGATTAT
TTCAAGAGGCTTTTCAACTTCAAAAAAGATAAAGATGGCTACTGGAAGTG
GTTTGCTGGGAATCTAGCGTCTGGTGGGGCTGCTGGTGCTTCATCCCTCT
TGTTTGTCTATTCACTGGATTATGCTCGAACTCGTCTAGCAAATGATGCA
AAGGCTGCAAAGAAGGGTGGTGAGAGGCAGTTCAATGGCTTGGTTGATGT
TTACAGGAAAACCATCAAGTCTGATGGTGTTGCTGGTCTTTACCGTGGTT
TCAACATCTCGTGTGTTGGAATCATAGTGTACCGTGGTCTTTACTTTGGA
ATGTATGATTCTTTGAAACCAGTTGTCTTGGTTGGTGGACTGCAGGATAG
CTTCTTTGCAAGTTTTCTTCTGGGATGGGGAATCACAATAGGTGCTGGCT
TGGCCTCTTACCCCATTGATACCGTGCGTAGAAGAATGATGATGACATCT
GGAGAAGCTGTAAAATACAAGAGTTCTTTGGAAGCATTCAAGATAATTAT
CGCAAAAGAGGGTACGAAGTCACTCTTTAAAGGTGCCGGTGCAAACATAT
TACGTGCTGTTGCTGGTGCCGGAGTGCTTGCTGGTTATGATAAGCTTCAG
CTCATCGTGTTCGGAAAGAAATATGGCTCTGGTGGTGGAGGCTAAGATAC
AGATAATGACGACAATAACGGTCTGGAGCAGTGTTGTTGT[T]TCCCTTT
TTGCATTTGAATAATTTCGATGAAAAACGGTTTTGAATTTTCCCCGAATG
TAGGGGCTTTAAATTAGTCCTGCAAACTTGAATTTTAGTTGGATATTTAC
CTGTTAAGCTTATAATCCGTGAATTTTTTTAGACCTTTTGGTTGATGCAG
TTTGAAGTCTACTGCTTTATTTGTTCCATGTTTGTTTGGAAGGTTTTAAG
AGTCTAATTGAAGTTGCATGTCTTTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATA
TCTTACAGCGGCTTTGGTTCTACAAATTTAACAAAATTTGTTGGCCCCCG
TACTATACAAATCCTGCAGCATTTTCTCATTTGTTGAGATATTGGGAAAT
ATTACGGTCAGTGAACCATTGTGTTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAA
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