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Marker Overview
| Name | Vu_UCR09-1_0019 |
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| dbSNP ID | N/A |
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| Type | SNP |
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| SNP Alleles | T |
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| 5' Flanking Sequence | CTCAGCCTTATCTTCATAAACTCTTTTGCCATACCTACTCTCTGCAATTTCAGATCTATT
CTTTTCCTTACCTCCGATGCTTCTTTCGTCACCGGATCGGGATGGATCTGATCAAGATCT
ACACGTCCATGGTAGTTTCGGCCTGGTTCGATCAACTTCATGTTGGGATTATGCTCCGGT
AGATAATCCATGGGATGAAAGCTGATCCAACTATAGATTGATGGATCCATTTGCCGATGC
TCCTTCGATCGTTATGTATGGATGCTTGTATCGGATGATTTGGATTGTTGAAGAAGCAGT
GTTACTTGCTAGGCTGCATATGTTGCTGGTCTCAGATGTAAAATTATTGTATGATGTGAA
GCTTTCAGGTGGAAATATGTGGATGTAGGAGATTTCGGGATGAATGACCTCAAAACGCTG
AGTCGTTTGGGGTTGGGAGTCCTGAGTGATCTTGTCATCCGACCTTTGCCATGTCAGGTG
CGCTTGCTTGGCAGGTCAAATAATTGTTAATAAAAAAAGTTTTGTTGGTTTCGGGAGAGA
TCGCACGGGAGTTGCCCGGGATCTCTCCCTCGTGTGGTGTGTGCTGTGCTCTCTTTCGTT
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GGGTCTTTGTTTTCGAAGGTATTTTAATTATGAATTATTTATTTTAAGCAGTCATTAAGC
CAGTTTTCATGAATCAACGATGGTACTCGATACTATTAACGTCGATCCATGCCTATTTAA
TAATTACTTCCTCATTATTACTGTCTTATCTATAAACGTCGATTCATGCTTATTTAATAA
TTACTTTCTTCCTTATTACTGCCTTATCGAA |
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| 3' Flanking Sequence | AAAATAATGCTTTATTGAAATAGCGCAGCAGTACTATTGTCATTTTGTTAATGTTCATTA
TTGTTTTATTTCACTTGAGGTGGGTTAATCTGGTGACATCTGCTTATAAAGATTGATCAC
ATGTAGTATTGCCGGTTTAGTACCATATACTTGTAAATTTGATAACATGTAATAAGTTCA
GCTTCGGCAGTCAATATTTGTAATGCAGAAATAGCTTATTTTCAAAGCGAATTATTTGAG
GATTGTAGCATTGTTAAGCTTTGCCAATGAGATCTTCTGGCCAACATCGAAGTATCCGTC
TTCAATTAAGTAAAGACGCTATATGGCTTCCGCTGGGGAAATATCACGGGGTAGGAGAAT
GCGATTATGATGAAATTATCTTGTGGATTGCAGAAGATTCTGATCTATGCTTGTATTTTT
AACGTGAAGATGATTTCGGCACTCTACACGGAAAGTATATATTTCTTCCAATTTAATTTA
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TGAAACCTAGGTAGTATATATTTATAGTTATTTGTTAGAGAAAACTTATTAAGATACTGC
TTACTGCACTTAATTTGTATTATCGTCAATTGGTTACACACATGAAAGGCTAATTCATGT
TGTCAGTAGTACTGTTCAAAAATTCTATTATTAAGTTATTTTAATACTACGGTTAGTTAT
GTTTATTTATGAAACATGGATAGTATATATTTATAGTTTTGTTAGAGAAAAAAAAAAAAA
AAAA |
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| Species | Vigna unguiculata |
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| Publication | [view all] |
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| Contact | Timothy Close
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Publications
| Year | Publication |
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| 2009 | Muchero W, Diop NN, Bhat PR, Fenton RD, Wanamaker S, Pottorff M, Hearne S, Cisse N, Fatokun C, Ehlers JD, Roberts PA, Close TJ. A consensus genetic map of cowpea [Vigna unguiculata (L) Walp.] and synteny based on EST-derived SNPs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009 Oct 27; 106(43):18159-64. |
Sequence
>Vu_UCR09-1_0019 ID=Vu_UCR09-1_0019; Name=Vu_UCR09-1_0019; organism=Vigna unguiculata; type=genetic_marker; length=2018bp
CTCAGCCTTATCTTCATAAACTCTTTTGCCATACCTACTCTCTGCAATTT
CAGATCTATTCTTTTCCTTACCTCCGATGCTTCTTTCGTCACCGGATCGG
GATGGATCTGATCAAGATCTACACGTCCATGGTAGTTTCGGCCTGGTTCG
ATCAACTTCATGTTGGGATTATGCTCCGGTAGATAATCCATGGGATGAAA
GCTGATCCAACTATAGATTGATGGATCCATTTGCCGATGCTCCTTCGATC
GTTATGTATGGATGCTTGTATCGGATGATTTGGATTGTTGAAGAAGCAGT
GTTACTTGCTAGGCTGCATATGTTGCTGGTCTCAGATGTAAAATTATTGT
ATGATGTGAAGCTTTCAGGTGGAAATATGTGGATGTAGGAGATTTCGGGA
TGAATGACCTCAAAACGCTGAGTCGTTTGGGGTTGGGAGTCCTGAGTGAT
CTTGTCATCCGACCTTTGCCATGTCAGGTGCGCTTGCTTGGCAGGTCAAA
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GTTGCCCGGGATCTCTCCCTCGTGTGGTGTGTGCTGTGCTCTCTTTCGTT
ATGCCTTTTATTATTACCTTTCTCTGTCGCTCCACTCCGTTATACATCTC
TGCACCAGAGGGATTCAACAGAGGATTCGCTTCAACCAAAAGGTATTATT
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ATTTTAAGCAGTCATTAAGCCAGTTTTCATGAATCAACGATGGTACTCGA
TACTATTAACGTCGATCCATGCCTATTTAATAATTACTTCCTCATTATTA
CTGTCTTATCTATAAACGTCGATTCATGCTTATTTAATAATTACTTTCTT
CCTTATTACTGCCTTATCGAA[T]AAAATAATGCTTTATTGAAATAGCGC
AGCAGTACTATTGTCATTTTGTTAATGTTCATTATTGTTTTATTTCACTT
GAGGTGGGTTAATCTGGTGACATCTGCTTATAAAGATTGATCACATGTAG
TATTGCCGGTTTAGTACCATATACTTGTAAATTTGATAACATGTAATAAG
TTCAGCTTCGGCAGTCAATATTTGTAATGCAGAAATAGCTTATTTTCAAA
GCGAATTATTTGAGGATTGTAGCATTGTTAAGCTTTGCCAATGAGATCTT
CTGGCCAACATCGAAGTATCCGTCTTCAATTAAGTAAAGACGCTATATGG
CTTCCGCTGGGGAAATATCACGGGGTAGGAGAATGCGATTATGATGAAAT
TATCTTGTGGATTGCAGAAGATTCTGATCTATGCTTGTATTTTTAACGTG
AAGATGATTTCGGCACTCTACACGGAAAGTATATATTTCTTCCAATTTAA
TTTAGTTTGCATTCATTTTCCGAATTGAGTTGCGATGTTGTTATTGTTGA
TAAATCATGTTGTCAGTAGTACTGTTCAAAAATTCAATTATTAAGTTATT
TTAATACAAAAAAAAAAAAGTTTATGAAACCTAGGTAGTATATATTTATA
GTTATTTGTTAGAGAAAACTTATTAAGATACTGCTTACTGCACTTAATTT
GTATTATCGTCAATTGGTTACACACATGAAAGGCTAATTCATGTTGTCAG
TAGTACTGTTCAAAAATTCTATTATTAAGTTATTTTAATACTACGGTTAG
TTATGTTTATTTATGAAACATGGATAGTATATATTTATAGTTTTGTTAGA
GAAAAAAAAAAAAAAAAA
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