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Marker Overview
| Name | Vu_UCR09-1_0025 |
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| dbSNP ID | N/A |
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| Type | SNP |
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| SNP Alleles | C |
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| 5' Flanking Sequence | ACCACGAATTGCAGGTAGCGTTAAACGAAGCAGCACAATGGCGCGAGTGGATCTGGACGG
TAACCCCATCAAGCCTATCACGATCTGCATGATCGGTGCCGGTGGGTTCATCGGCTCGCA
CCTCTGCGAGAAACTCATGCACGAAACCCCTCACACGGTTTTCGCCTTGGACGTTTACAA
TGACAAGATCAAGCACCTTCTCGAACCCGATTCTCTGCCTTGGGCCGGTCGCATCACCTT
CCACCGCCTCAACATCAAACACGATTCTCGCCTCGAAGGTCTCATCAAGATGGCAGATCT
CACCATTAACCTCGCTGCGATTTGCACCCCCGCGGATTACAACACGCGCCCGCTCGACAC
CATATACAGCAATTTCATCGACGCGCTCCCCGTGGTGAAATACTGTTCGGAGAATAACAA
GCGCCTTATCCACTTCTCCACTTGCGAAGTGTACGGGAAAACGATTGGAGCCTTTCTCCC
CAAGGATAGTCCTCTTCGTAAGGATCCGGCGTACTATGTTCTTAAAGAAGATGAATCTCC
TTGTATTTTTGGTTCTATTGAAAAGCAGAGGTGGTCTTACGCCTGTGCTAAACAGTTGAT
TGAGAGGCTGATTTATGGTGAGGGTGCTGAAAATGGCTTGGAATTCACCATTGTTAGGCC
TTTTAATTGGATTGGACCTAGAATGGATTTCATTCCTGGCATCGATGGTCCAAGTGAGGG
TGTTCCTCGGGTTCTTGCTTGCTTCAGCAATAATCTTCTCAGAGGAGAGCCCCTCAAGCT
TGTAGACGGTGGACAGTCTCAAAGAACCTTTGTCTACATTAAAGATGCTATTGAAGCTGT
CTTGTTGATGATTGAAAATCCTGCCAGAGCTAATGGCCATATATTTAATGTGGGTAACCC
AAACAACGAGGTTACTGTTAGGCAGCTAGCTGAAATAATGATTCAGGTTTACTCAAAGGT
GAGCGGAGAAAAAACTCCTGCAACACCAACCATTGATGTGAGCTCCAAAGAGTTTTATGG
TGAGGGATATGATGACAGTGACAAGAGAATTCCTGACATGACCATAATAAACAAGCAGCT
TGGTTGGAATCCTAAGACTTCGCTTTTCGACCTGCTGGAATCCACTCTGACCTATCAGCA
CAAGACATATGCTGAAGCCATCAAGAAAGTAATTGCAAAACCCGTTGCAAGTTAAGCTTT
TACAGGGATGGTGATTTTGCTATCTTGGAGAAGGGTGTGGTTGCCTAAGTTTTCTGCCAT
ATTTCACTGGTTGATTTTATATAAATGGTAAATTTTCTTCCTTTCGGTTT |
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| 3' Flanking Sequence | GTTAGCCAGTAGGCAATAGCTCACATAAGTCATTGCCTTAATGTATGTTCTGGAGAAGTA
GGAATTTATATATAGGGCAATCTGTGCTGCTATGTAATTTTAATGTAGACTTTGCGTTAC
TAAACATGTTGAGGCATTTTATAATATTAGAGAAGATGTTTTTTTTAAGTGTTTTTAGGG
ATCTCTCCAACATTGTTTTGTTGTCCTTCCGGGTCAGCTGTAAGTTGTATCATTCTGTAT
TGACCCTCTTAAGAGTCATGTCTTCTTAATATTAATTTATTCTATGGTTATTTTTTGTTA
AAAAAAAAAAAAAAAATATCTATTATCAGATATATTTTTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAA |
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| Species | Vigna unguiculata |
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| Publication | [view all] |
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| Contact | Timothy Close
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Publications
| Year | Publication |
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| 2009 | Muchero W, Diop NN, Bhat PR, Fenton RD, Wanamaker S, Pottorff M, Hearne S, Cisse N, Fatokun C, Ehlers JD, Roberts PA, Close TJ. A consensus genetic map of cowpea [Vigna unguiculata (L) Walp.] and synteny based on EST-derived SNPs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009 Oct 27; 106(43):18159-64. |
Sequence
>Vu_UCR09-1_0025 ID=Vu_UCR09-1_0025; Name=Vu_UCR09-1_0025; organism=Vigna unguiculata; type=genetic_marker; length=1673bp
ACCACGAATTGCAGGTAGCGTTAAACGAAGCAGCACAATGGCGCGAGTGG
ATCTGGACGGTAACCCCATCAAGCCTATCACGATCTGCATGATCGGTGCC
GGTGGGTTCATCGGCTCGCACCTCTGCGAGAAACTCATGCACGAAACCCC
TCACACGGTTTTCGCCTTGGACGTTTACAATGACAAGATCAAGCACCTTC
TCGAACCCGATTCTCTGCCTTGGGCCGGTCGCATCACCTTCCACCGCCTC
AACATCAAACACGATTCTCGCCTCGAAGGTCTCATCAAGATGGCAGATCT
CACCATTAACCTCGCTGCGATTTGCACCCCCGCGGATTACAACACGCGCC
CGCTCGACACCATATACAGCAATTTCATCGACGCGCTCCCCGTGGTGAAA
TACTGTTCGGAGAATAACAAGCGCCTTATCCACTTCTCCACTTGCGAAGT
GTACGGGAAAACGATTGGAGCCTTTCTCCCCAAGGATAGTCCTCTTCGTA
AGGATCCGGCGTACTATGTTCTTAAAGAAGATGAATCTCCTTGTATTTTT
GGTTCTATTGAAAAGCAGAGGTGGTCTTACGCCTGTGCTAAACAGTTGAT
TGAGAGGCTGATTTATGGTGAGGGTGCTGAAAATGGCTTGGAATTCACCA
TTGTTAGGCCTTTTAATTGGATTGGACCTAGAATGGATTTCATTCCTGGC
ATCGATGGTCCAAGTGAGGGTGTTCCTCGGGTTCTTGCTTGCTTCAGCAA
TAATCTTCTCAGAGGAGAGCCCCTCAAGCTTGTAGACGGTGGACAGTCTC
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ATTGAAAATCCTGCCAGAGCTAATGGCCATATATTTAATGTGGGTAACCC
AAACAACGAGGTTACTGTTAGGCAGCTAGCTGAAATAATGATTCAGGTTT
ACTCAAAGGTGAGCGGAGAAAAAACTCCTGCAACACCAACCATTGATGTG
AGCTCCAAAGAGTTTTATGGTGAGGGATATGATGACAGTGACAAGAGAAT
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CGCTTTTCGACCTGCTGGAATCCACTCTGACCTATCAGCACAAGACATAT
GCTGAAGCCATCAAGAAAGTAATTGCAAAACCCGTTGCAAGTTAAGCTTT
TACAGGGATGGTGATTTTGCTATCTTGGAGAAGGGTGTGGTTGCCTAAGT
TTTCTGCCATATTTCACTGGTTGATTTTATATAAATGGTAAATTTTCTTC
CTTTCGGTTT[C]GTTAGCCAGTAGGCAATAGCTCACATAAGTCATTGCC
TTAATGTATGTTCTGGAGAAGTAGGAATTTATATATAGGGCAATCTGTGC
TGCTATGTAATTTTAATGTAGACTTTGCGTTACTAAACATGTTGAGGCAT
TTTATAATATTAGAGAAGATGTTTTTTTTAAGTGTTTTTAGGGATCTCTC
CAACATTGTTTTGTTGTCCTTCCGGGTCAGCTGTAAGTTGTATCATTCTG
TATTGACCCTCTTAAGAGTCATGTCTTCTTAATATTAATTTATTCTATGG
TTATTTTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAATATCTATTATCAGATATATTT
TTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAA
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