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Marker Overview
| Name | Vu_UCR09-1_0091 |
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| dbSNP ID | N/A |
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| Type | SNP |
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| SNP Alleles | T |
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| 5' Flanking Sequence | TGTTCCTCACCCACGTCTCTCTTCCTCTTCAGATCACGAAAATCGTAAGCGTTTCGCTGT
TCCAAGATGGGCGTGGCTCAGAATGTTCATGATACGGAGGAGGGTACCTTGGAGATTGGA
ATGGAATACAGAACTGTATCTGGAGTTGCTGGACCATTGGTTATTCTTGACAAAGTTAAG
GGACCCAAATTTCAAGAGATTGTTAATATTCGTTTAGGAGATGGAACTACTCGACGTGGA
CAAGTTCTAGAGGTTGATGGTGAAAAGGCTGTTGTTCAGGTATTTGAAGGTACATCTGGG
ATTGACAACAAATTTACAACAGTGCAATTTACTGGAGAGGTGTTAAAAACTCCTGTCTCA
CTAGATATGCTTGGGCGCATATTTAATGGTTCGGGAAAACCAATTGATAACGGTCCACCG
ATTTTACCTGAGGCATACCTAGATATTTCTGGAAGTTCTATCAATCCTAGTGAGAGAACC
TATCCTGAGGAGATGATACAGACAGGAATATCTACAATTGATGTCATGAATTCTATTGCT
AGAGGTCAAAAGATCCCTTTATTCTCAGCAGCTGGTCTCCCTCATAATGAAATTGCTGCA
CAGATATGTCGTCAGGCTGGCTTAGTCAAGCGACTTGAGAAATCTGATAATCTACTTGAG
AGTGGAGGAGAAGAGGACAATTTTGCTATTGTTTTTGCAGCTATGGGAGTTAACATGGAG
ACTGCACAGTTTTTCAAACGTGACTTTGAGGAGAATGGGTCAATGGAGAGAGTGACTCTT
TTCCTTAATTTGGCAAACGATCCTACAATTGAGCGAATTATCACTCCTCGTATTGCTCTC
ACTACTGCTGAATATTTGGCTTATGAATGTGGCAAGCACGTTCTTGTGATACTCACAGAT
ATGAGTTCTTATGCTGATGCTCTTCGTGAGGTATCTGCTGCCCGAGAAGAAGTGCCAGGA
AGACGTGGTTATCCTGGATACATGTATACAGATCTTGCAACAATTTATGAACGTGCTGGA
AGAATTGAGGGGCGTAAAGGCTCTATTACTCAAATTCCAATTTTAACCATGCCCAACGAT
GATATTACGCACCCAACTCCTGATCTGACAGGATATATCACTGAGGGGCAGATATACATC
GACAGGCAGCTGTATAACAGACAGATATACCCACCAATCAATGTCCTCCCATCACTGTCT
CGGTTGATGAAGAGTGCTATTGGTGAGGGAATGACCAGAAGGGATCATGCAGATGTTTCC
AACCAGCTCTATGCAAATTATGCTATTGGAAAGGATGTTCAGGCAATGAAAGCAGTGGTT
GGAGAAGAAGCACTTTCATCAGAGGACCTGTTGTATCTGGAATTTTTGGAGAAGTTTGAG
AGGAAGTTTGTTGCCCAGGGAGCTTACGACACCCGTAATATATTCCAGTCACTAGATCTT
GCGTGGACCTTGCTCCGGATTTTCCCTCGTGAACTTCTTCATCGTATACCAGCCAAGACT
CTTGACCAGTACTACAGCCGAGATGCTGGTAATTGATGATTAAGCAAGCAAGTTCGTATA
CCTTGGTCTCTTGCTCAACCAGTGCCTAATGTCATCGGCAATTTATTTGTTTCTTTGCTT
TCTCCCACAAATCCACATTTCTTCTATGCAGCTAAATATAATAAAGGATTGAGTCTGTTT
GAGTGCCTCATATTTTGAGTCGGTCGGTTAGTCAGAAAAGTAGACCCCATAGATGTTATG
ATTCATGAGCCA |
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| 3' Flanking Sequence | TTTTTCTTTTGGGTGGGGGAAAATGAGTTGTGTTAGTTTGGGATGGCTGGCGTCAATTGC
ATTGTGGGATGTTCATGTTCCCTGGTGTTGGAATTTGTGGAGACTGCTTTCCCAATGTAC
GTTGCATGTTTCATAATTTTATTTATCATGTAATTTGATTGTTTAGGATATTCATAATCA
GGACAGTTGTCTTTTGGACACTTCCTGGATGTATTTATCTGCTTTAGTTTATCAATAATT
CAAACAAGCATTTATAGTCTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA |
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| Species | Vigna unguiculata |
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| Publication | [view all] |
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| Contact | Timothy Close
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Publications
| Year | Publication |
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| 2009 | Muchero W, Diop NN, Bhat PR, Fenton RD, Wanamaker S, Pottorff M, Hearne S, Cisse N, Fatokun C, Ehlers JD, Roberts PA, Close TJ. A consensus genetic map of cowpea [Vigna unguiculata (L) Walp.] and synteny based on EST-derived SNPs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009 Oct 27; 106(43):18159-64. |
Sequence
>Vu_UCR09-1_0091 ID=Vu_UCR09-1_0091; Name=Vu_UCR09-1_0091; organism=Vigna unguiculata; type=genetic_marker; length=2041bp
TGTTCCTCACCCACGTCTCTCTTCCTCTTCAGATCACGAAAATCGTAAGC
GTTTCGCTGTTCCAAGATGGGCGTGGCTCAGAATGTTCATGATACGGAGG
AGGGTACCTTGGAGATTGGAATGGAATACAGAACTGTATCTGGAGTTGCT
GGACCATTGGTTATTCTTGACAAAGTTAAGGGACCCAAATTTCAAGAGAT
TGTTAATATTCGTTTAGGAGATGGAACTACTCGACGTGGACAAGTTCTAG
AGGTTGATGGTGAAAAGGCTGTTGTTCAGGTATTTGAAGGTACATCTGGG
ATTGACAACAAATTTACAACAGTGCAATTTACTGGAGAGGTGTTAAAAAC
TCCTGTCTCACTAGATATGCTTGGGCGCATATTTAATGGTTCGGGAAAAC
CAATTGATAACGGTCCACCGATTTTACCTGAGGCATACCTAGATATTTCT
GGAAGTTCTATCAATCCTAGTGAGAGAACCTATCCTGAGGAGATGATACA
GACAGGAATATCTACAATTGATGTCATGAATTCTATTGCTAGAGGTCAAA
AGATCCCTTTATTCTCAGCAGCTGGTCTCCCTCATAATGAAATTGCTGCA
CAGATATGTCGTCAGGCTGGCTTAGTCAAGCGACTTGAGAAATCTGATAA
TCTACTTGAGAGTGGAGGAGAAGAGGACAATTTTGCTATTGTTTTTGCAG
CTATGGGAGTTAACATGGAGACTGCACAGTTTTTCAAACGTGACTTTGAG
GAGAATGGGTCAATGGAGAGAGTGACTCTTTTCCTTAATTTGGCAAACGA
TCCTACAATTGAGCGAATTATCACTCCTCGTATTGCTCTCACTACTGCTG
AATATTTGGCTTATGAATGTGGCAAGCACGTTCTTGTGATACTCACAGAT
ATGAGTTCTTATGCTGATGCTCTTCGTGAGGTATCTGCTGCCCGAGAAGA
AGTGCCAGGAAGACGTGGTTATCCTGGATACATGTATACAGATCTTGCAA
CAATTTATGAACGTGCTGGAAGAATTGAGGGGCGTAAAGGCTCTATTACT
CAAATTCCAATTTTAACCATGCCCAACGATGATATTACGCACCCAACTCC
TGATCTGACAGGATATATCACTGAGGGGCAGATATACATCGACAGGCAGC
TGTATAACAGACAGATATACCCACCAATCAATGTCCTCCCATCACTGTCT
CGGTTGATGAAGAGTGCTATTGGTGAGGGAATGACCAGAAGGGATCATGC
AGATGTTTCCAACCAGCTCTATGCAAATTATGCTATTGGAAAGGATGTTC
AGGCAATGAAAGCAGTGGTTGGAGAAGAAGCACTTTCATCAGAGGACCTG
TTGTATCTGGAATTTTTGGAGAAGTTTGAGAGGAAGTTTGTTGCCCAGGG
AGCTTACGACACCCGTAATATATTCCAGTCACTAGATCTTGCGTGGACCT
TGCTCCGGATTTTCCCTCGTGAACTTCTTCATCGTATACCAGCCAAGACT
CTTGACCAGTACTACAGCCGAGATGCTGGTAATTGATGATTAAGCAAGCA
AGTTCGTATACCTTGGTCTCTTGCTCAACCAGTGCCTAATGTCATCGGCA
ATTTATTTGTTTCTTTGCTTTCTCCCACAAATCCACATTTCTTCTATGCA
GCTAAATATAATAAAGGATTGAGTCTGTTTGAGTGCCTCATATTTTGAGT
CGGTCGGTTAGTCAGAAAAGTAGACCCCATAGATGTTATGATTCATGAGC
CA[T]TTTTTCTTTTGGGTGGGGGAAAATGAGTTGTGTTAGTTTGGGATG
GCTGGCGTCAATTGCATTGTGGGATGTTCATGTTCCCTGGTGTTGGAATT
TGTGGAGACTGCTTTCCCAATGTACGTTGCATGTTTCATAATTTTATTTA
TCATGTAATTTGATTGTTTAGGATATTCATAATCAGGACAGTTGTCTTTT
GGACACTTCCTGGATGTATTTATCTGCTTTAGTTTATCAATAATTCAAAC
AAGCATTTATAGTCTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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