|
|
Marker Overview
| Name | Vu_UCR09-1_0172 |
|---|
| dbSNP ID | N/A |
|---|
| Type | SNP |
|---|
| SNP Alleles | A |
|---|
| 5' Flanking Sequence | AAACACTTCCCCTACTGTTGTAGCTGCTTCTGCCTTTGCTCCATCCCCGAACCACTTCCT
CTGCAAAACGCGTTTCGCTCACGCAAGGTTTTAAAAGATGGCTGATGCCGAGGACATTCA
ACCTCTTGTTGTTGATAATGGAACGGGAATGGTCAAGGCTGGCTTTGCGGGTGATGATGC
TCCTAGAGCTGTGTTCCCCAGTATTATTGGGCGACCGCGCCATACTGGTGTAATGGTTGG
AATGGGTCAGAAGGATGCTTATGTGGGTGATGAAGCCCAATCAAAACGAGGTATACTCAC
CTTGAAGTATCCCATAGAGCATGGCATAGTCAGCAACTGGGATGATATGGAGAAGATTTG
GCATCACACGTTTTACAATGAGCTTCGTGTTGCCCCTGAAGAACACCCTGTACTTCTTAC
CGAGGCACCACTCAATCCCAAGGCCAACAGAGAGAAGATGACCCAAATTATGTTTGAGAC
TTTCAATGTGCCTGCAATGTATGTGGCAATTCAGGCTGTCTTGTCTCTGTACGCCAGTGG
ACGTACTACAGGTATTGTGCTTGATTCTGGTGATGGTGTAAGCCACACGGTGCCCATATA
TGAAGGATACGCTCTTCCTCATGCAATTCTTCGGTTGGATCTTGCTGGCCGGGACTTAAC
GGAGTACTTGGTGAAAATTCTTACTGAGAGAGGATACTCCTTCAGCACCTCTGCCGAAAA
GGAAATTGTCCGTGATGTTAAGGAGAAATTGGCATATGTGGCCCTTGATTTTGAACAAGA
AATGGAGACTACTAAGAGTAGTTCTGCAGTAGAGAAGAGCTATGAATTGCCTGATGGACA
GGTCATTACAATCGGTTCTGAGAGATTCCGTTGCCCTGAAGTATTGTTCCAGCCTTCTCT
AATTGGTATGGAAGCTACTGGAATTCATGAAACGACATACAACTCAATCATGAAATGTGA
TGTTGATATTAGGAAGGATCTGTATGGAAACATTGTTCTTAGTGGAGGGTCTACTATGTT
TCCCGGAATTGCTGATCGTATGAGCAAGGAAATCAGTGCTCTAGCACCTAGCAGCATGAA
AATCAAGGTGGTTGCACCTCCCGAGAGGAAGTACAGTGTCTGGATTGGTGGTTCTATCTT
GGCATCACTAAGTACCTTCCAACAGATGTGGATCTCTAAGGGTGAATATGATGAATCTGG
GCCAGCTATAGTTCACCGGAAGTGCTTCTAAGATGGGTCAAGTTGAGCTGGATGGTTATG
AAGCTCTTAATGCTCCCAGTCCTGTGCC |
|---|
| 3' Flanking Sequence | TATTTCCCTCAAGCTTGGTTGACTTGTTGGATATTTGATGCTTTGGGTTTTTAATAGGTA
TATCTAGTTAATGAACGGATTTGTAAGTTGAGTATGTTATATGTTTCCCCCGTTAGGTCG
TTGGAAGCCAGACTTTTTATGCAGTTGGCGATGGCATTTGAACGTTGTAGGTTCTGCTTG
GTTTGATTTTCCTTTTATTCTTTTTTTATGCTGTGGCAAAAAAATTAGGTGCCTCGAGAT
AGGAGGACGATAAGTTTAAGCATCCTTTTTACTAGAGGGGTTTTTGATTTAGTTTCTGTT
GATATTAATTATATGCTTAATTGGTTATGTTTGAAGTAAAAAAAAAAAGTTTTTATTGTT
TGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA |
|---|
| Species | Vigna unguiculata |
|---|
| Publication | [view all] |
|---|
| Contact | Timothy Close
|
|---|
Publications
| Year | Publication |
|---|
| 2009 | Muchero W, Diop NN, Bhat PR, Fenton RD, Wanamaker S, Pottorff M, Hearne S, Cisse N, Fatokun C, Ehlers JD, Roberts PA, Close TJ. A consensus genetic map of cowpea [Vigna unguiculata (L) Walp.] and synteny based on EST-derived SNPs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009 Oct 27; 106(43):18159-64. |
Sequence
>Vu_UCR09-1_0172 ID=Vu_UCR09-1_0172; Name=Vu_UCR09-1_0172; organism=Vigna unguiculata; type=genetic_marker; length=1676bp
AAACACTTCCCCTACTGTTGTAGCTGCTTCTGCCTTTGCTCCATCCCCGA
ACCACTTCCTCTGCAAAACGCGTTTCGCTCACGCAAGGTTTTAAAAGATG
GCTGATGCCGAGGACATTCAACCTCTTGTTGTTGATAATGGAACGGGAAT
GGTCAAGGCTGGCTTTGCGGGTGATGATGCTCCTAGAGCTGTGTTCCCCA
GTATTATTGGGCGACCGCGCCATACTGGTGTAATGGTTGGAATGGGTCAG
AAGGATGCTTATGTGGGTGATGAAGCCCAATCAAAACGAGGTATACTCAC
CTTGAAGTATCCCATAGAGCATGGCATAGTCAGCAACTGGGATGATATGG
AGAAGATTTGGCATCACACGTTTTACAATGAGCTTCGTGTTGCCCCTGAA
GAACACCCTGTACTTCTTACCGAGGCACCACTCAATCCCAAGGCCAACAG
AGAGAAGATGACCCAAATTATGTTTGAGACTTTCAATGTGCCTGCAATGT
ATGTGGCAATTCAGGCTGTCTTGTCTCTGTACGCCAGTGGACGTACTACA
GGTATTGTGCTTGATTCTGGTGATGGTGTAAGCCACACGGTGCCCATATA
TGAAGGATACGCTCTTCCTCATGCAATTCTTCGGTTGGATCTTGCTGGCC
GGGACTTAACGGAGTACTTGGTGAAAATTCTTACTGAGAGAGGATACTCC
TTCAGCACCTCTGCCGAAAAGGAAATTGTCCGTGATGTTAAGGAGAAATT
GGCATATGTGGCCCTTGATTTTGAACAAGAAATGGAGACTACTAAGAGTA
GTTCTGCAGTAGAGAAGAGCTATGAATTGCCTGATGGACAGGTCATTACA
ATCGGTTCTGAGAGATTCCGTTGCCCTGAAGTATTGTTCCAGCCTTCTCT
AATTGGTATGGAAGCTACTGGAATTCATGAAACGACATACAACTCAATCA
TGAAATGTGATGTTGATATTAGGAAGGATCTGTATGGAAACATTGTTCTT
AGTGGAGGGTCTACTATGTTTCCCGGAATTGCTGATCGTATGAGCAAGGA
AATCAGTGCTCTAGCACCTAGCAGCATGAAAATCAAGGTGGTTGCACCTC
CCGAGAGGAAGTACAGTGTCTGGATTGGTGGTTCTATCTTGGCATCACTA
AGTACCTTCCAACAGATGTGGATCTCTAAGGGTGAATATGATGAATCTGG
GCCAGCTATAGTTCACCGGAAGTGCTTCTAAGATGGGTCAAGTTGAGCTG
GATGGTTATGAAGCTCTTAATGCTCCCAGTCCTGTGCC[A]TATTTCCCT
CAAGCTTGGTTGACTTGTTGGATATTTGATGCTTTGGGTTTTTAATAGGT
ATATCTAGTTAATGAACGGATTTGTAAGTTGAGTATGTTATATGTTTCCC
CCGTTAGGTCGTTGGAAGCCAGACTTTTTATGCAGTTGGCGATGGCATTT
GAACGTTGTAGGTTCTGCTTGGTTTGATTTTCCTTTTATTCTTTTTTTAT
GCTGTGGCAAAAAAATTAGGTGCCTCGAGATAGGAGGACGATAAGTTTAA
GCATCCTTTTTACTAGAGGGGTTTTTGATTTAGTTTCTGTTGATATTAAT
TATATGCTTAATTGGTTATGTTTGAAGTAAAAAAAAAAAGTTTTTATTGT
TTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
|
