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Gene Overview
| Name | Ca_01002 |
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| Unique Name | Ca_01002_ICC4958_v2 |
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| Type | gene |
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| Organism | Cicer arietinum (chickpea) |
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| Sequence length | 5463 |
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Alignments
The following features are aligned
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The
following sequences are available for this feature:
gene sequence >Ca_01002_ICC4958_v2 ID=Ca_01002_ICC4958_v2; Name=Ca_01002; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5463bp
CCTCGTTAACGCCGCGTAAAGAACCTACATTTTTCCTTCCATTCGTATAT
CCAAATCTTATTTAATTTAATTTAATTCCATTACATTACATATTTTATCC
TACTCAACAGTCAACACCAAAACATGTTTCTCACCCATTAGCCACCCTTA
ACTAACTAATCATGTCTCTCTCTTTCACTTTCCCTCCCTCTTCCCGCCGG
CACCACCGCCGGCACCGCAACCACACACTTTTTCATTTTCTTTTCCTCGC
TGTCGCTGCAATCCTCTGCAGTCACGCCCACGCTCGCTTCCTTACACCCG
ATCTAGTTTCCGATGGTTGGAGTAATGTTCTCAGACTCCCCACGGATGAA
TCAACCTGCGAGGAGACCTACGGATTCTTACCGTGCACCACCACCATTCT
TGGAAACTTGTTTCTCATCTTGGTCTATGGTTTCCTCATGTATACTGCTG
CTACTTTTTTATCTAACGGTAGTGAACTCTTGCTTGAGATCTTAGGTCCC
GGCATTGTTGGTGGATTGTTTCTTCCTGTACTCGGTGCTCTCCCTGATGC
AATGCTCATTCTCGGTACCGTAACCAAAATTCATTCATTTTATATTTTTT
ATTTTTTATTTTTCAGTTATTAGAACCGATTCTCTTTGTTGTTCAATTGA
TTCTGTTTTTTGTTTAATTGAATAGCCACAAATATTGATTTTGTAAAATT
GTTGATTTTGAGATAAAAATTTGAGAACATGAATTAATTAAAGGTAGTAC
ATGTTTAGGTGTTAACCTTAGTAATTCAGATTTAGTATTCTACTCTTGTA
ACAAAAAGAATAAAAATTTTGTTCATTTTTATTTTGTTGTAAAATTTCAG
TTTTTTGGGTTGTTCTAATTGCATCTGTCTTATTCACTGGGTTTGTTAGT
TAAAGTGACTCGTTATATTACTATTCTTGAGTATAACTTTTTTGTTCACT
GCCACTCGGAAGAATTGGAACCTTGTTTGTTCATGTCAAATATCTTCCTT
TATATGTTTTGACTCTTATGTATATTACTTTTTGAGGTATTTTGTGGAGA
TATTTCTGACTCGTTATGTGACTCAGTGGAGAGAATATATCTTGGATTAG
CTCATTTGGATTCTGTGTTGAACCAGTTTCTGCTTTATCTGTTGTGTTAT
GTTGCATTTTCTCCTTTTTTTTATTCTCTTTCTTTTATTAATTTGGCCTT
CGTTTTCAATTTCTTTTGGTGCTTCACTTTTGGGCAGCATAAGAGAAAGC
ATGAACCCCACAAGATGGAATTACCATGACACTTTCCACTGCAGTTTTCT
TCTTTTTTCTCTCTCTAACCTTGCGAGCATAATATTTGCTTTGGATTTGT
GAACATAAAAGTAGCTTATTTTTATTTAGCCCTATTTGGATTAACAACTT
AGTTGAGCATTTATCATATAAGTGTTTATGTGTAAGATATTTCTCTAATA
AAAGATAAAATAAAATCAAACTGTTTTCATATAAACCATAAGTTGTTTTC
ACAAGCTATCAGAAAGAGCTTATGGAGATAAGCTGAAAACAACTTATAGA
CATGTCATAAATTGTTTTCATAAGTTCTCTTAAACAATCTCATAAGTGTA
TATGTTGGTAAATAAACTCAAATAAGCCAATCAAAACATGCCCGTAATGT
TTTTTAGTGTATTTGTGTTTATATTTTTTGACCTTTTGATATCTAATTTG
TCTTTCTTGTTTGGTTTAGTGTCTGGGCTTTCAGGAAGTACAGAAACTGC
TCAAAGTCAGGTATCTGTTGGAATGGGACTGTTAGCTGGATCAACAGTGC
TGCTTCTGACTATAATATGGGGAACTTGTGTTATTGTTGGCAAGTGTGAC
ATTGAGGATTCAATTGCGATAGATTCACAAGACACTAGAGGCTTCAGTTT
AACTGGTATGCCATTTGATATTCTTCATTGTTCTATTTTAATTTTTTTTG
AGAGTTAATGCATCAAACTTCTTTCTGCCCTGTCATTCAGATTATAGTGT
TTTCTTTCCTCATCTTTGTGGTCATCCAAGCAATCAACTCTCTTCTAAAA
CATTCACTATGTTTTATCTTTCACTATTTTTATGCTGGATACTTATTTGT
TAATTGGATTGTTCTTTGAGGAGTGTCATGACTCATTAACCATTGTTAGA
GCTTACACTATAACGTCTCTAACATGTCCTCTCATGCTAGTGCCCCTTGG
CTCAGAGCATGCGCAATGCAGTGGACCACCTACTTTGTGCTTAGTTTCAT
CTCTCCCTCTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATA
TATATATAGGATAATGGGGATGGTGAGTATTAAACTCTTGACTATTTGTC
AGACTCTTGTATCATGTTATGAACAAACTATTCCAAAATCTTAAAAGCCA
TTTGTTGTGAAAGCAAATGAATGGTTTTATTTGATAACATCTCTAACAAG
AAATGATATTTGGGAGATATCTACCTTCTTAATAACTGCAAGCAAGGTTT
TAAAAAACGCTCTGCGACAAGGTTTTTTATGTCTTGGTTATTAAAATTGC
ACCTGTGTCAGCCATATTTGACTGCAATTTGTTGCAATATCAATGTGGCA
ACACAATCACAATTTAAAACTGACTGTAAGTACCTTAGTTTCTTCCACCA
GGATTTGGGATCACTTATTGTATAATGCATTCAGAAACTGGATGGATGCA
CTGATCATTATCGTCGCCCTTTGTTAAAAATTAGATGAGCTTTAGAGTCT
AAGAAGGGTGCTGGTATTTGACAACTATATTGTGATTCACCTTTTTCTTA
ATTGTTTTTAAACCACGATGTCTGAAGTTATGCCGTTCTGTGTACATGCC
TGGTGTGTTCAATTCATTCTGTTCTGCAGTTCTACTAAAATCTCCATGTG
CAGGTTCTGGTGTTAGCACTGATATTTGGACAAGTTATGCTGCAAGGATT
ATGGTTATATCTGTCATTCCATTTTTGATTGTTCAATTACCACAAATTCT
CCATTCAACTTCTGGAAGGCACTTGGCAGTTTTGATTGGTCTTGCTGTCT
CTATCTGTTTATTGATCTCTTATTGCCTTTACCAGGTAATTTTCTTTATT
TGTAGTGTACTTGTATTTCCTGTGCCATTTTATTTAACATTGATGGTACA
CATAATTTAATTTAATCTATAGTTGGCGCTTTCAAGAACTTTATACCCGA
TAAATATGACTGTTGTTATTATTTGTTTCGACAAAGTTGTGTACTGTTAT
TTTAAACATCTAGAAATTGAGCAAAATGAAAAAATGGTGCAGATTTTCCA
ACCCTGGATACAAAGGAGAAAATTGGAATATATTAAACACAAACATGTTA
TTTTGGGACTTTTGAAACATTTGAAGATGCGTTCATTGGGAAGGCTGCTG
AAAGATGATGGCGAACCAAATAAAGAAGTAATTAGAAAGTAAGAATTTCT
CTCCACTGTGCTTTGACTTAAGACATGTTACTTTTAAGGAAGTTTGTTGC
TTTTCATATTCTCATCCTTTTGGTTGCCGCTGACTTCTTAATCGCATAAA
CAGGTTGTTTACAACAATTGATGAAAATAAAGATGGACATCTTACTCATG
GTGAAATGAGAGCACTGGTCGTTGGAATTCAATTTGAGGAGATAGACCTG
GATCATGACGACGCTGTGAAAAGAATAATGGTAGATTTTGATACTTCTCG
TAATCAACTTGTCGACGAAGAAGAATTTGTTAATGGTGTCTGTAGATGGC
TTCAAACAGCCAGGCGTTCTAAAGCTGCATCTGGTGATGCTGGTCCACAC
ACAATGAAGTTTTTAAGTGATTTTCACACAGTAAGTTTTGCTTTGCTCGG
CTTCATAAACATGTTCTTTTTGGTACTCAAGTCTGACAGGGATTTTGTGC
ACAGGAAACAAGGAGGGAACACGATCTTCTGGACGTGGGGGGTCAGAGTG
ATGAAGTCGAAGAGGGTGTTGAGAATGCTAGATGGATTTCCATAAAAGCA
GTACTGCTTCTTCTGCTGGGTGCTATTATTGCAGCTGCATTTGCTGATCC
TCTGGTTGATGCTGTCGATAACTTTTCTGAAGCTACAAGTATTCCAGCTT
TCTTCATTTCCTTCATTTTTCTACCTCTTGCAACCAATTCAAGTGAAGCA
GTATCAGCAATAATTTTCGCTAGTCGTGATAAGAGGCAAACAGCTTCATT
AACATTTTCTGAGGTTTGTTTTCTTGTTTAAAATACTGTCTCTTTTAGGC
GTATAATAAAGTATAAACTAAAGCATTTGGAAATCATCTCACTTTAATTA
TTGCATTTTCTGTTTTGATCTATTGAATCGTGATTTTGCTGCACAATACT
AGGTTGTTATCTTGATGTGGTTATTCAAATAACACAACCAGTAATGAGTA
AATCAAATTAAGTTCTTCTGGTATTTGCATAGATATAATGCTGGATGGGT
TGTGTTCATGTTTTCTCAAACAATAATATCTTTATATATTAGAAAAATGT
TCTTAGAGGGAAGTGAAGACAAACCATATAAGAAGGGGGGAGAATGAAGA
AAGTTAGGGATTATTTCTAACTTAGGGGACCAAAATGTCTTTTTCGTATT
TAATTTGAATCTCAGAGACCAATTTGTTGCTTTCTCTATCACACAAAACG
TCACTAGATACCATGGACCTGCAAATGATACAACTAAGAAAGAGACGAAA
AGTAGAGTTTATCTTTCTTTGGATCTAAAGTTTTTTCTCAAGGACCAGAT
TAGGTACACATTATTTAAGCCTTAATTTAATGATGACTGCATGCCCAGGT
TTTTCAAATTACTGGTACCTCATGGAATTAATAGCGTAATAGTGAAAGTG
ATGATTGAAGCTGTTGTACTGGTGTAACAAGACTAGCTGCTTTAGCTTAG
CTATTAACCTAATCATAGTGCTGATTTTCTTATTTTTGGTCCTTTAACAT
ACTTCTCTTTCATTTTTCCCTTAGTATTTTCCTTGCTAATTTTTATTCTG
ACTTAAGATTTAGGTAGTCTGTATCTTCATAGACATGTCTATTTCACCGA
GCCATAAAGCATTTAAAAATGATGTTTTTTGCAGATATATGGTGCAGTAA
CAATGAACAATGTGCTATGCCTATCGGTTTTTTTGGCGCTTGTATATGCG
AGGGGATTGACATGGGACTTCTCTTCAGAAGTGTTGGTTATTCTCATCGT
GTGCATTGTCATGGGCGTCTTCGCCAGTTTCCGTACTGTTTTCCCTCTAT
GGACATCTATACTGGCTATCCTACTTTATCCCTTCTCCCTAGTATTGGTG
TATGTTCTTGATTATGTATTTGGGTGGTCATAGATCAAATGATGTTTTAT
AGAATGTCTAGTTGTATGTGTCTTTTCCTTCTTGAGGGTGTATTGTTTAT
CGAGAACAGTTGAGTGGGTACAGTTTTGACTCATTCAACACACTGTGAGT
ATTTATATAAAAT back to topgene from alignment at Ca_LG_1:11773094..11778556- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Ca_01002_ICC4958_v2 ID=Ca_01002_ICC4958_v2; Name=Ca_01002; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5463bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_1:11773094..11778556- (Cicer arietinum
CCTCGTTAACGCCGCGTAAAGAACCTACATTTTTCCTTCCATTCGTATAT
CCAAATCTTATTTAATTTAATTTAATTCCATTACATTACATATTTTATCC
TACTCAACAGTCAACACCAAAACATGTTTCTCACCCATTAGCCACCCTTA
ACTAACTAATCATGTCTCTCTCTTTCACTTTCCCTCCCTCTTCCCGCCGG
CACCACCGCCGGCACCGCAACCACACACTTTTTCATTTTCTTTTCCTCGC
TGTCGCTGCAATCCTCTGCAGTCACGCCCACGCTCGCTTCCTTACACCCG
ATCTAGTTTCCGATGGTTGGAGTAATGTTCTCAGACTCCCCACGGATGAA
TCAACCTGCGAGGAGACCTACGGATTCTTACCGTGCACCACCACCATTCT
TGGAAACTTGTTTCTCATCTTGGTCTATGGTTTCCTCATGTATACTGCTG
CTACTTTTTTATCTAACGGTAGTGAACTCTTGCTTGAGATCTTAGGTCCC
GGCATTGTTGGTGGATTGTTTCTTCCTGTACTCGGTGCTCTCCCTGATGC
AATGCTCATTCTCGGTACCGTAACCAAAATTCATTCATTTTATATTTTTT
ATTTTTTATTTTTCAGTTATTAGAACCGATTCTCTTTGTTGTTCAATTGA
TTCTGTTTTTTGTTTAATTGAATAGCCACAAATATTGATTTTGTAAAATT
GTTGATTTTGAGATAAAAATTTGAGAACATGAATTAATTAAAGGTAGTAC
ATGTTTAGGTGTTAACCTTAGTAATTCAGATTTAGTATTCTACTCTTGTA
ACAAAAAGAATAAAAATTTTGTTCATTTTTATTTTGTTGTAAAATTTCAG
TTTTTTGGGTTGTTCTAATTGCATCTGTCTTATTCACTGGGTTTGTTAGT
TAAAGTGACTCGTTATATTACTATTCTTGAGTATAACTTTTTTGTTCACT
GCCACTCGGAAGAATTGGAACCTTGTTTGTTCATGTCAAATATCTTCCTT
TATATGTTTTGACTCTTATGTATATTACTTTTTGAGGTATTTTGTGGAGA
TATTTCTGACTCGTTATGTGACTCAGTGGAGAGAATATATCTTGGATTAG
CTCATTTGGATTCTGTGTTGAACCAGTTTCTGCTTTATCTGTTGTGTTAT
GTTGCATTTTCTCCTTTTTTTTATTCTCTTTCTTTTATTAATTTGGCCTT
CGTTTTCAATTTCTTTTGGTGCTTCACTTTTGGGCAGCATAAGAGAAAGC
ATGAACCCCACAAGATGGAATTACCATGACACTTTCCACTGCAGTTTTCT
TCTTTTTTCTCTCTCTAACCTTGCGAGCATAATATTTGCTTTGGATTTGT
GAACATAAAAGTAGCTTATTTTTATTTAGCCCTATTTGGATTAACAACTT
AGTTGAGCATTTATCATATAAGTGTTTATGTGTAAGATATTTCTCTAATA
AAAGATAAAATAAAATCAAACTGTTTTCATATAAACCATAAGTTGTTTTC
ACAAGCTATCAGAAAGAGCTTATGGAGATAAGCTGAAAACAACTTATAGA
CATGTCATAAATTGTTTTCATAAGTTCTCTTAAACAATCTCATAAGTGTA
TATGTTGGTAAATAAACTCAAATAAGCCAATCAAAACATGCCCGTAATGT
TTTTTAGTGTATTTGTGTTTATATTTTTTGACCTTTTGATATCTAATTTG
TCTTTCTTGTTTGGTTTAGTGTCTGGGCTTTCAGGAAGTACAGAAACTGC
TCAAAGTCAGGTATCTGTTGGAATGGGACTGTTAGCTGGATCAACAGTGC
TGCTTCTGACTATAATATGGGGAACTTGTGTTATTGTTGGCAAGTGTGAC
ATTGAGGATTCAATTGCGATAGATTCACAAGACACTAGAGGCTTCAGTTT
AACTGGTATGCCATTTGATATTCTTCATTGTTCTATTTTAATTTTTTTTG
AGAGTTAATGCATCAAACTTCTTTCTGCCCTGTCATTCAGATTATAGTGT
TTTCTTTCCTCATCTTTGTGGTCATCCAAGCAATCAACTCTCTTCTAAAA
CATTCACTATGTTTTATCTTTCACTATTTTTATGCTGGATACTTATTTGT
TAATTGGATTGTTCTTTGAGGAGTGTCATGACTCATTAACCATTGTTAGA
GCTTACACTATAACGTCTCTAACATGTCCTCTCATGCTAGTGCCCCTTGG
CTCAGAGCATGCGCAATGCAGTGGACCACCTACTTTGTGCTTAGTTTCAT
CTCTCCCTCTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATA
TATATATAGGATAATGGGGATGGTGAGTATTAAACTCTTGACTATTTGTC
AGACTCTTGTATCATGTTATGAACAAACTATTCCAAAATCTTAAAAGCCA
TTTGTTGTGAAAGCAAATGAATGGTTTTATTTGATAACATCTCTAACAAG
AAATGATATTTGGGAGATATCTACCTTCTTAATAACTGCAAGCAAGGTTT
TAAAAAACGCTCTGCGACAAGGTTTTTTATGTCTTGGTTATTAAAATTGC
ACCTGTGTCAGCCATATTTGACTGCAATTTGTTGCAATATCAATGTGGCA
ACACAATCACAATTTAAAACTGACTGTAAGTACCTTAGTTTCTTCCACCA
GGATTTGGGATCACTTATTGTATAATGCATTCAGAAACTGGATGGATGCA
CTGATCATTATCGTCGCCCTTTGTTAAAAATTAGATGAGCTTTAGAGTCT
AAGAAGGGTGCTGGTATTTGACAACTATATTGTGATTCACCTTTTTCTTA
ATTGTTTTTAAACCACGATGTCTGAAGTTATGCCGTTCTGTGTACATGCC
TGGTGTGTTCAATTCATTCTGTTCTGCAGTTCTACTAAAATCTCCATGTG
CAGGTTCTGGTGTTAGCACTGATATTTGGACAAGTTATGCTGCAAGGATT
ATGGTTATATCTGTCATTCCATTTTTGATTGTTCAATTACCACAAATTCT
CCATTCAACTTCTGGAAGGCACTTGGCAGTTTTGATTGGTCTTGCTGTCT
CTATCTGTTTATTGATCTCTTATTGCCTTTACCAGGTAATTTTCTTTATT
TGTAGTGTACTTGTATTTCCTGTGCCATTTTATTTAACATTGATGGTACA
CATAATTTAATTTAATCTATAGTTGGCGCTTTCAAGAACTTTATACCCGA
TAAATATGACTGTTGTTATTATTTGTTTCGACAAAGTTGTGTACTGTTAT
TTTAAACATCTAGAAATTGAGCAAAATGAAAAAATGGTGCAGATTTTCCA
ACCCTGGATACAAAGGAGAAAATTGGAATATATTAAACACAAACATGTTA
TTTTGGGACTTTTGAAACATTTGAAGATGCGTTCATTGGGAAGGCTGCTG
AAAGATGATGGCGAACCAAATAAAGAAGTAATTAGAAAGTAAGAATTTCT
CTCCACTGTGCTTTGACTTAAGACATGTTACTTTTAAGGAAGTTTGTTGC
TTTTCATATTCTCATCCTTTTGGTTGCCGCTGACTTCTTAATCGCATAAA
CAGGTTGTTTACAACAATTGATGAAAATAAAGATGGACATCTTACTCATG
GTGAAATGAGAGCACTGGTCGTTGGAATTCAATTTGAGGAGATAGACCTG
GATCATGACGACGCTGTGAAAAGAATAATGGTAGATTTTGATACTTCTCG
TAATCAACTTGTCGACGAAGAAGAATTTGTTAATGGTGTCTGTAGATGGC
TTCAAACAGCCAGGCGTTCTAAAGCTGCATCTGGTGATGCTGGTCCACAC
ACAATGAAGTTTTTAAGTGATTTTCACACAGTAAGTTTTGCTTTGCTCGG
CTTCATAAACATGTTCTTTTTGGTACTCAAGTCTGACAGGGATTTTGTGC
ACAGGAAACAAGGAGGGAACACGATCTTCTGGACGTGGGGGGTCAGAGTG
ATGAAGTCGAAGAGGGTGTTGAGAATGCTAGATGGATTTCCATAAAAGCA
GTACTGCTTCTTCTGCTGGGTGCTATTATTGCAGCTGCATTTGCTGATCC
TCTGGTTGATGCTGTCGATAACTTTTCTGAAGCTACAAGTATTCCAGCTT
TCTTCATTTCCTTCATTTTTCTACCTCTTGCAACCAATTCAAGTGAAGCA
GTATCAGCAATAATTTTCGCTAGTCGTGATAAGAGGCAAACAGCTTCATT
AACATTTTCTGAGGTTTGTTTTCTTGTTTAAAATACTGTCTCTTTTAGGC
GTATAATAAAGTATAAACTAAAGCATTTGGAAATCATCTCACTTTAATTA
TTGCATTTTCTGTTTTGATCTATTGAATCGTGATTTTGCTGCACAATACT
AGGTTGTTATCTTGATGTGGTTATTCAAATAACACAACCAGTAATGAGTA
AATCAAATTAAGTTCTTCTGGTATTTGCATAGATATAATGCTGGATGGGT
TGTGTTCATGTTTTCTCAAACAATAATATCTTTATATATTAGAAAAATGT
TCTTAGAGGGAAGTGAAGACAAACCATATAAGAAGGGGGGAGAATGAAGA
AAGTTAGGGATTATTTCTAACTTAGGGGACCAAAATGTCTTTTTCGTATT
TAATTTGAATCTCAGAGACCAATTTGTTGCTTTCTCTATCACACAAAACG
TCACTAGATACCATGGACCTGCAAATGATACAACTAAGAAAGAGACGAAA
AGTAGAGTTTATCTTTCTTTGGATCTAAAGTTTTTTCTCAAGGACCAGAT
TAGGTACACATTATTTAAGCCTTAATTTAATGATGACTGCATGCCCAGGT
TTTTCAAATTACTGGTACCTCATGGAATTAATAGCGTAATAGTGAAAGTG
ATGATTGAAGCTGTTGTACTGGTGTAACAAGACTAGCTGCTTTAGCTTAG
CTATTAACCTAATCATAGTGCTGATTTTCTTATTTTTGGTCCTTTAACAT
ACTTCTCTTTCATTTTTCCCTTAGTATTTTCCTTGCTAATTTTTATTCTG
ACTTAAGATTTAGGTAGTCTGTATCTTCATAGACATGTCTATTTCACCGA
GCCATAAAGCATTTAAAAATGATGTTTTTTGCAGATATATGGTGCAGTAA
CAATGAACAATGTGCTATGCCTATCGGTTTTTTTGGCGCTTGTATATGCG
AGGGGATTGACATGGGACTTCTCTTCAGAAGTGTTGGTTATTCTCATCGT
GTGCATTGTCATGGGCGTCTTCGCCAGTTTCCGTACTGTTTTCCCTCTAT
GGACATCTATACTGGCTATCCTACTTTATCCCTTCTCCCTAGTATTGGTG
TATGTTCTTGATTATGTATTTGGGTGGTCATAGATCAAATGATGTTTTAT
AGAATGTCTAGTTGTATGTGTCTTTTCCTTCTTGAGGGTGTATTGTTTAT
CGAGAACAGTTGAGTGGGTACAGTTTTGACTCATTCAACACACTGTGAGT
ATTTATATAAAAT back to top
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