Ca_01778, Ca_01778_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_01778
Unique NameCa_01778_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length4064
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_1supercontigCa_LG_1:27719679..27723742 -Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_01778.2Ca_01778.2_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA
Ca_01778.1Ca_01778.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_01778_ICC4958_v2 ID=Ca_01778_ICC4958_v2; Name=Ca_01778; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4064bp
CTGCCATTGTAGTTGTCCTCCAGCCCAAATTCAAACCCCATGGAAACCCT
AACTTTTGGAAACCCCAATTAGAAGAAACCTTCATCTCACTCTCAAATTT
CACATACATCGAACCTTCACTAACTCATCTTCTTTTGCTTCTAAAATCCC
AAATCGCTAGACCCGCTTCTTCTCTTTGTTTCGTTCAAATCGCGTCTTAC
TGGTACGGCTTTTCAGTTTCAGTTCAAATCCACTTCCTTTTATAAACGTT
GTTCCATTTTTTGTTTGTTCCCAATGTAGTAAAAACATATTCTACCAAAA
TATGTTTCTTTTTTTGCTCTTTGGTTGAAAAGTGTGGCGTATTGTTGATG
CATTTAGTTTTGGGAGAATAGAGTAGTACTGATCGGTAAATGTGATGATA
TATTTGCGAGTTGAAATTTTTGACTTTTTTGGTTGCAATATGTTGTGAAT
GTTTTTGAGATATCTTAAGAAAATGTGGTTTAAGTAATTCTAGTTTTAAG
GATTTTTCTTTGGGGTTCTTCTTGTTTTTAATCATGTTTGAATATTCATA
CTATGTTATACATTGAATCATTTTTCACAAGGTATTTATATATTTGCACT
GGTTCTTAGGATTTTGGGCATTTCTGCTGTCTATTTTAAGAGTTTAATAG
ATATGCACTGTCGATTTAAACAATTTTACTCTAACAACCAACGCAAGCCA
TTGATTGGGTATTTATTTTGTGATGGAAGGTACAATCATGTGGTGAGATG
ATAAATCAATGGTTTCTATTAACTATGAGTGTAAAAAACAATTCTTTTTA
ACAAAAAATATTTTGAAGAAAAATGTACCAAAGGAGGAAACTAAAGTTGC
CAAAGGGGCTATCACTAATCCTAATCTCCTAAGCCCTCCACAGAAAAAAA
CTTTGACAACCAATCATATGTTGATCCTTGGTCAAGTTATGTGAATTTTT
TAATTTCCTTTTATTTTGGTTCAGTTTAAGGTTGTGGTGAGGATATGATC
TATGGCACTTGCACCACAGCTTTTAAGTCACTGTAAGAATTCCTTGCTTC
TTCTGGTTTTAACTTCAAATCTGATTTGTTAAAAAATAAGAATTTTTTTA
ATTGGATTCTGTGTTTGTTACCAGTTATTTAAAATTTTTATTATTATATT
TGGTTATATACTATGTCTGAACTTTGAATTTTACTCAACCTAGAATAGTG
CTCAGTCCAGTGGTTGAGAAGTGCTTTTGTTTTGCCTGGAGGAAAATGCA
AAGACTTGCAGTTTAATATTGAACGATTCTAGTTGTGTTGGGATTTCTCA
TCAAACAAAGGATTGAAAGTAGTAGTTTTGAAGTTCTTTTTTCTTTTGTT
TACTTTTGCTTGATTCATGGCACAATATTATAGTGATTGATCATGTACGT
ACCGATGCCAACCCATTGAAAAGACTTATGTTTTTTATTAATTTTATTTT
TTTATTTAAATTCTCCTTCTATAAGGATTGATTTTTCTTTTGCAGGAGTT
CCAGACCACTACTGTTGCAGAATTCATTGAATTATCAAGCAAAGTTATCC
TCCAAGTGTTTTCCTAGGCAGATAAGAATGGAAGGTAATCTTAGTTGTAG
CATAGAGGGCAACAATAAGGATTATAGAGGTGCCTTGATTGTCCTAGAAG
GCTTGGATCGGTCTGGGAAGTCTTCTCAGTGCAGCAGACTAGTGTCCTAC
TTGGAGGGACAAGGGCTCCCTTCTGAACTATGGAGATTTCCTGATAGAAC
TACTAGCGTTGGGCAAATGATATCTGCTTATCTTACAAATGCATCGCAGT
TGGATGATCATACTATTCATCTTCTCTTCAGTGCTAATCGTTGGGAAAAG
AGGTTTCTACTTTTGTGTTTTTGTTTTCATATCTGTTATGTTATTATTTG
TCATATGCGCCATTCTGGGATTTAGTTTGTGAAATTCATGTCCTGTGAAC
TGCCATTATGTCTTAATTTTGCTTGTAGCTTGTGGGAGGACAGCTGGAGG
TTTAGGAGGTTTTAATATAGTAAAAGTGGTTTGTAAAAAACAGCATGGGA
AGATCAAAGAAATTCTTGATTCGTGACTTGGAAGTTTGATATATGGGCAT
GGATCATTGTCTAGCTGGAAAGTAGATAAGTATTCCAAGAAGAGTGGGGG
TATAAAGCAGGAAGTGGAAACCATACACGACTTAGGCATTTAAGTCCTTT
GATTAAAAACTCTATTTTCCATAATGATTTTAGAAGCCAAAGAAGCGATA
TCTTATAATATGAACATATGCTTTATGTAATCAGAAGAAGAAAGCTGCTG
TGTTGTATTACTGCTGTGATGACATGTGGTTTTGTAAGGCTGACATGGAC
TCTGACTCTGAGGGAAGCAGAGTTCAATAAGCTTGATACATGGCTCCAGT
TACTAAGTTAATATGGCTATTATGACTTTGGTGATATCATGATTAGATTC
ATATCCTAAAATGTGGTGCTATTATCTTATGTTGCATGCAGGTTTCATAG
CAATCAAACCATTTGGATATTTTTTCCTTTCACTTGCTCATGACAAGTGA
AATTGCAAGATTTTTTTTGATTAAGTTGTGTTGTCTCTGCAGGTCATTGA
TGGAAGCAAAATTGAAAAGTGGAATCACCCTCATTGTTGATCGTTATTCT
TATTCTGGGGTGGCTTTCTCATCTGCTAAGGGACTAGATATTGAATGGTG
TAAGGTAAAATGTTCATGAGAACTTCTAAAGAGGTCTTCTATTCTAATTC
AGTTTTTTATATGTATAATAGCTTACATTCTCTCTCTGTTAGTAAACAGT
GAATTTTATATTTTGCAGGCCCCGGAAATTGGATTGCTGGCTCCAGATCT
GGTAGCATACCTTGACATATCACCAGATGTAAGCAACACTTGCTATGTGG
CAATAAAATGTGATTTGTTAGGTCAGGTTTTGAGATTTGAGACTCTATTT
CAAAACTGCTTTATTTATCATAACCGCAGTTTTAGAAACAATATTTCTTG
CCCATTACTTTTTATTTGTTTTCATGCTGGGAAAAGTTTTTATTCTGTAA
TAAAACCACACTTATTTCTGTAGTGTTTCTCTGCTCCCTTTTCTATGTTC
CATGATGTTGGGGAGTTGATTTCTAAAAAGTTAGATGTATTACTTTCCTT
CAGGAGGGTGGTTCAAGTCCTAATGCACAAATGATTTCTGATCTCTTGCT
TCTATAATATGTCCACCTTGATTTTCTGATTTTTTTCACTATTGATTGGC
TAGCATGTTTTAGTTTTGTTCATGCATGCTTCCCTGTTTTCTTATTTATA
TTTGTTGCATATTCATATCAGAAAGCTGCAGAAAGAGGAGGGTATGGTGG
TGAGAGATATGAAAAATTGGAATTTCAAAAGAAAGTTGCTGAACATTACA
AAGTTCTTCACGATTCCTCCTGGAAGGTAATGGACTATTTTTCTGGTGTT
TCCTCCTGAAATTGACAGTTCCGATACTAATACTTTGTTGTCGTATGTCA
GTCTGTTAAATTGGTAATTTTGTTTCTGTGATCCCTACATGTCTTGCTCG
TTGCCATTCAATACATATTTGGTATCACGTTGGGTTTGCCATAATCTCGG
TAGCCAATGTGATTTTACAAAAGCTACAACTTGTTTTACTTTTGTTTTTC
ATCCTCTTTCCACTGGTTTGATGCAGGTTGTAGATGCTTGCCAGCCTATA
GAAGATGTGGAGAAACAGTTGCAAGAGATTGTACTTGCTTGTGTCACAGA
ATGCCGGAAGGGGAGACCACTCTCCTCGTTGTGGTCGACAGACATGTAGT
GCCCTTGAATGAGATGTCATATATGAACAAGTATGCCATATATATTCTGC
ACACCAAACCCTTTTTATGGATAATTCTGGTTGATTCATTCCCACATCAT
AATTTCAAATTGTTTGCTAAGTAATTTGATGACAGCTTGGAGAATTTTAG
TATACTCAAGTTGGAAGGAATGAAAAATTCCTTATTCAACAAATATGGCA
GCTCTATCATTGGGATTGCCTCAAGAGTCTTTCATGTCTGGTGCGACTGA
TAGGACGATATTAT
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gene from alignment at Ca_LG_1:27719679..27723742-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_01778_ICC4958_v2 ID=Ca_01778_ICC4958_v2; Name=Ca_01778; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4064bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_1:27719679..27723742- (Cicer arietinum
CTGCCATTGTAGTTGTCCTCCAGCCCAAATTCAAACCCCATGGAAACCCT
AACTTTTGGAAACCCCAATTAGAAGAAACCTTCATCTCACTCTCAAATTT
CACATACATCGAACCTTCACTAACTCATCTTCTTTTGCTTCTAAAATCCC
AAATCGCTAGACCCGCTTCTTCTCTTTGTTTCGTTCAAATCGCGTCTTAC
TGGTACGGCTTTTCAGTTTCAGTTCAAATCCACTTCCTTTTATAAACGTT
GTTCCATTTTTTGTTTGTTCCCAATGTAGTAAAAACATATTCTACCAAAA
TATGTTTCTTTTTTTGCTCTTTGGTTGAAAAGTGTGGCGTATTGTTGATG
CATTTAGTTTTGGGAGAATAGAGTAGTACTGATCGGTAAATGTGATGATA
TATTTGCGAGTTGAAATTTTTGACTTTTTTGGTTGCAATATGTTGTGAAT
GTTTTTGAGATATCTTAAGAAAATGTGGTTTAAGTAATTCTAGTTTTAAG
GATTTTTCTTTGGGGTTCTTCTTGTTTTTAATCATGTTTGAATATTCATA
CTATGTTATACATTGAATCATTTTTCACAAGGTATTTATATATTTGCACT
GGTTCTTAGGATTTTGGGCATTTCTGCTGTCTATTTTAAGAGTTTAATAG
ATATGCACTGTCGATTTAAACAATTTTACTCTAACAACCAACGCAAGCCA
TTGATTGGGTATTTATTTTGTGATGGAAGGTACAATCATGTGGTGAGATG
ATAAATCAATGGTTTCTATTAACTATGAGTGTAAAAAACAATTCTTTTTA
ACAAAAAATATTTTGAAGAAAAATGTACCAAAGGAGGAAACTAAAGTTGC
CAAAGGGGCTATCACTAATCCTAATCTCCTAAGCCCTCCACAGAAAAAAA
CTTTGACAACCAATCATATGTTGATCCTTGGTCAAGTTATGTGAATTTTT
TAATTTCCTTTTATTTTGGTTCAGTTTAAGGTTGTGGTGAGGATATGATC
TATGGCACTTGCACCACAGCTTTTAAGTCACTGTAAGAATTCCTTGCTTC
TTCTGGTTTTAACTTCAAATCTGATTTGTTAAAAAATAAGAATTTTTTTA
ATTGGATTCTGTGTTTGTTACCAGTTATTTAAAATTTTTATTATTATATT
TGGTTATATACTATGTCTGAACTTTGAATTTTACTCAACCTAGAATAGTG
CTCAGTCCAGTGGTTGAGAAGTGCTTTTGTTTTGCCTGGAGGAAAATGCA
AAGACTTGCAGTTTAATATTGAACGATTCTAGTTGTGTTGGGATTTCTCA
TCAAACAAAGGATTGAAAGTAGTAGTTTTGAAGTTCTTTTTTCTTTTGTT
TACTTTTGCTTGATTCATGGCACAATATTATAGTGATTGATCATGTACGT
ACCGATGCCAACCCATTGAAAAGACTTATGTTTTTTATTAATTTTATTTT
TTTATTTAAATTCTCCTTCTATAAGGATTGATTTTTCTTTTGCAGGAGTT
CCAGACCACTACTGTTGCAGAATTCATTGAATTATCAAGCAAAGTTATCC
TCCAAGTGTTTTCCTAGGCAGATAAGAATGGAAGGTAATCTTAGTTGTAG
CATAGAGGGCAACAATAAGGATTATAGAGGTGCCTTGATTGTCCTAGAAG
GCTTGGATCGGTCTGGGAAGTCTTCTCAGTGCAGCAGACTAGTGTCCTAC
TTGGAGGGACAAGGGCTCCCTTCTGAACTATGGAGATTTCCTGATAGAAC
TACTAGCGTTGGGCAAATGATATCTGCTTATCTTACAAATGCATCGCAGT
TGGATGATCATACTATTCATCTTCTCTTCAGTGCTAATCGTTGGGAAAAG
AGGTTTCTACTTTTGTGTTTTTGTTTTCATATCTGTTATGTTATTATTTG
TCATATGCGCCATTCTGGGATTTAGTTTGTGAAATTCATGTCCTGTGAAC
TGCCATTATGTCTTAATTTTGCTTGTAGCTTGTGGGAGGACAGCTGGAGG
TTTAGGAGGTTTTAATATAGTAAAAGTGGTTTGTAAAAAACAGCATGGGA
AGATCAAAGAAATTCTTGATTCGTGACTTGGAAGTTTGATATATGGGCAT
GGATCATTGTCTAGCTGGAAAGTAGATAAGTATTCCAAGAAGAGTGGGGG
TATAAAGCAGGAAGTGGAAACCATACACGACTTAGGCATTTAAGTCCTTT
GATTAAAAACTCTATTTTCCATAATGATTTTAGAAGCCAAAGAAGCGATA
TCTTATAATATGAACATATGCTTTATGTAATCAGAAGAAGAAAGCTGCTG
TGTTGTATTACTGCTGTGATGACATGTGGTTTTGTAAGGCTGACATGGAC
TCTGACTCTGAGGGAAGCAGAGTTCAATAAGCTTGATACATGGCTCCAGT
TACTAAGTTAATATGGCTATTATGACTTTGGTGATATCATGATTAGATTC
ATATCCTAAAATGTGGTGCTATTATCTTATGTTGCATGCAGGTTTCATAG
CAATCAAACCATTTGGATATTTTTTCCTTTCACTTGCTCATGACAAGTGA
AATTGCAAGATTTTTTTTGATTAAGTTGTGTTGTCTCTGCAGGTCATTGA
TGGAAGCAAAATTGAAAAGTGGAATCACCCTCATTGTTGATCGTTATTCT
TATTCTGGGGTGGCTTTCTCATCTGCTAAGGGACTAGATATTGAATGGTG
TAAGGTAAAATGTTCATGAGAACTTCTAAAGAGGTCTTCTATTCTAATTC
AGTTTTTTATATGTATAATAGCTTACATTCTCTCTCTGTTAGTAAACAGT
GAATTTTATATTTTGCAGGCCCCGGAAATTGGATTGCTGGCTCCAGATCT
GGTAGCATACCTTGACATATCACCAGATGTAAGCAACACTTGCTATGTGG
CAATAAAATGTGATTTGTTAGGTCAGGTTTTGAGATTTGAGACTCTATTT
CAAAACTGCTTTATTTATCATAACCGCAGTTTTAGAAACAATATTTCTTG
CCCATTACTTTTTATTTGTTTTCATGCTGGGAAAAGTTTTTATTCTGTAA
TAAAACCACACTTATTTCTGTAGTGTTTCTCTGCTCCCTTTTCTATGTTC
CATGATGTTGGGGAGTTGATTTCTAAAAAGTTAGATGTATTACTTTCCTT
CAGGAGGGTGGTTCAAGTCCTAATGCACAAATGATTTCTGATCTCTTGCT
TCTATAATATGTCCACCTTGATTTTCTGATTTTTTTCACTATTGATTGGC
TAGCATGTTTTAGTTTTGTTCATGCATGCTTCCCTGTTTTCTTATTTATA
TTTGTTGCATATTCATATCAGAAAGCTGCAGAAAGAGGAGGGTATGGTGG
TGAGAGATATGAAAAATTGGAATTTCAAAAGAAAGTTGCTGAACATTACA
AAGTTCTTCACGATTCCTCCTGGAAGGTAATGGACTATTTTTCTGGTGTT
TCCTCCTGAAATTGACAGTTCCGATACTAATACTTTGTTGTCGTATGTCA
GTCTGTTAAATTGGTAATTTTGTTTCTGTGATCCCTACATGTCTTGCTCG
TTGCCATTCAATACATATTTGGTATCACGTTGGGTTTGCCATAATCTCGG
TAGCCAATGTGATTTTACAAAAGCTACAACTTGTTTTACTTTTGTTTTTC
ATCCTCTTTCCACTGGTTTGATGCAGGTTGTAGATGCTTGCCAGCCTATA
GAAGATGTGGAGAAACAGTTGCAAGAGATTGTACTTGCTTGTGTCACAGA
ATGCCGGAAGGGGAGACCACTCTCCTCGTTGTGGTCGACAGACATGTAGT
GCCCTTGAATGAGATGTCATATATGAACAAGTATGCCATATATATTCTGC
ACACCAAACCCTTTTTATGGATAATTCTGGTTGATTCATTCCCACATCAT
AATTTCAAATTGTTTGCTAAGTAATTTGATGACAGCTTGGAGAATTTTAG
TATACTCAAGTTGGAAGGAATGAAAAATTCCTTATTCAACAAATATGGCA
GCTCTATCATTGGGATTGCCTCAAGAGTCTTTCATGTCTGGTGCGACTGA
TAGGACGATATTAT
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