Ca_03780, Ca_03780_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_03780
Unique NameCa_03780_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length5898
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_2supercontigCa_LG_2:11520671..11526568 +Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_03780.1Ca_03780.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_03780_ICC4958_v2 ID=Ca_03780_ICC4958_v2; Name=Ca_03780; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5898bp
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ATTGTGGCTATGAACGCGGCCTCATTAGACCGTTACCTCCTCCTATCAAG
TTTCGGATAAAGGAACTTTCATTCGGACTCTGTGTTGATGTGAATTATCA
GGAAGCTTGGTGGGAAGGGGTGATATTCGACCGAAACGACGGATTCGAGG
AGAGGAGCATTTTCTTCCCTGATTTAGGTGATGAAATGAAGGTTGGAGTT
CAACAATTGAGGATCACTCAGGATTGGGATGAAGAAACTGAGAATTGGTT
GCCAAGAGGGAAATGGGTGTTTCTTGAGTTGTTTGAGGAGTGTGAGAGAG
TATCCTATGTTGCGGTTTCGGTGAAACAGATTTGGTATGATGTTAGGATA
AGAAAGGATTTTGCTGAAACCATTAGAGAATGGACTTGTAATGTGAAGGA
TTTGTGGAGAGAGCTTGTTGTGGAAGTAATTGGTGAATACTATACTCTCA
CACTAAGTGAAGTTCGCTCCGCCTTAAATGTTCCGAAGAATTTACTGGAA
GGAGGGTCATTTGAACACACTGATAATGTTCTTTGTGATGATAGGCCTAA
GGAAAACGGCGATTCCTCAAAATTGTTGGATACTGATCAAAACTGTGGTA
GCACTAGTATCATTCCTGTTCAAGAGGAATTTGAGAAGGAAAATCTTTTG
GATGAAGAGCCTGAATCACAGAAAGAAATTTCCTGCAATGATGATGAATT
GGTTTCGAATAAGAATAAAAAACGGAGACGCTCCAAGTCCGTAGTTTGGA
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TATGCAGCTGGATGTAGGAGCAAGACGGTTCGGGAGCTTTTGAAGACGAA
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ACAATTATCCTCAACATAAACGATACCGGTACATGTCTCCTGATAAACTC
GATCAGAAGGCTTACGCTTCGATTTTTCAAGTTACTAAAGTTTTGCTAAA
GGAGCCTGTGCCGTCTCAAATTGATCGCAATAGGATGCATTCGCAATTTG
ACAGCAATATTTTAAATCTGCTTTCTGATCCACCTCAAATGAAAAAGGAT
TTAGATGTTAACCCTCCAACCAAGAAACCTTCTCCAGTGATAGTTGAAGT
TGAACCTGAATTATGTCCTATAGCCGTCGTTAAATATTACTTTCATGCAC
TAGAGAGAAACTCGGCTGAAAAAAGGACATGGAAATTGAAGGCGAAAAAA
CATCTATTAGCAGAAGGATGGATCTTTGACTACCCAACTGAAAGAAGGAA
GACAACTTTGTACAAGTCTCCACAAAATCAGTGTTTAGGCACACTTCGAG
GTGCGTGCAGACTATACCTTAAAGCAAAGATTCCTGAATGGACTAATGCT
GATGATGGTGATGATGATCTATTGGTGAGTGTGTTTCAATTGCTTCAAAA
AGAGCCTGAATTGCATACTATAGACAATTCTCTGCCAAGTAAATCATCTG
TGAAGAGAACATACAGACGCACCACGAATTCAAAGGCTAGCCAACCAAAG
AGCATAGAGGAGAATGAAGTAGATACCGGCCGGGTGCTAAGGTCAAGCAA
AAGGGTGCAGAAGGTGTTGGGTTTGACGCATCAAAAGCCTCAAAATGTTA
TATCTTGGTTAATAGATTGCAACATTCTGTTGCCAAAATACAAGGTCTTT
TACTGGGAAACCGAAAAAGGGAACGCTCCCATGGTCGAGGGAAGGATAAC
TCAAGAAGGAATCAGGTGCAGTTGTTGTCAGAAGGTTTATGGCCTTAGAG
GCTTTGCAAATCATGCTGGTGGAAGTAGTAGCTTCAGGCCTTCTGCCTGT
ATCTTTTTGAAGGATGGTAGATCACTGTTAGATTGCATGATGCAAGTAAT
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TCGAAGGCGAAAATGACAACATTTGTTCTGTTTGTAACTATGGTGGCGAA
CTCATTTTATGCGACCAATGCCCCTCGTCGTTTCATAAGAAGTGTCTTAA
TTTGGAGGTAGATTAACTAGTTTCCTTTTCAATCATGGCATATTTAAGTT
CTATCTTGTTGCTATATTTCATTTCCATTTATGTGTATTGAGTTATTTCT
TTGGATGTGTAGGATATCCCTGATGGTGATTGGTTTTGTCCATCATGCCA
ATGCGGGATTTGCGGCCAAAACAAAATTGAAGAGGCTAAGGATGGACATT
TTCTTTCTTGCATTCAGTGTGAACATAAATGTAAGCTCATAGATAGATTT
GCTTCAATATTTCATCCATTCCTTTGTGAATGTGTTTTTGTTTTGCTGCA
ATATATAACTTTTTTTCGACCAATGAAAAATTTCTTCAATTCTATGTAGA
TCATGTTGAGTGCCTCAAAAATAGAGCAAAAGAAAATTCAAGAAGATATA
TGGAAAAAAATTGGCTATGTGGAGAAGAGTGTGAACGGGTAAGTTAAATC
GACATCCCTTTTTTTCTTCTATTTTAGAAAAAGTTTCATCTCATTCTGCA
TGAAGATTTGTTTATGCCTTATTTGCCTTGAAGTTGTTTTTTCATTTCAT
TTCATCCCTTTTTTTCATTTCATTTCTTTAGAAAACATTTAAGGCTCTAT
ATCTTCAATATATATACTGCTAGAATTATGTTTTTATGACGATGGTTATG
ATTATACACTACATTTATGCTGTACGCTCTCGCAGATCTACACGGGCCTC
CAAAATCTATTGGGAAAGCCGGTTTTAGTTGGTGCAGACAATCTAACTTG
GACATTGGTGAAGTATGTCAACTCTGAGAATTGTGGTGCTGGCAGTGCTG
AAAATGACTTACCGGAAGAGAGTTTTAGCAAACTCCACGTTGCACTTTCA
GTGATGCATGAATGTTTTGAGCCCTTACATAACCCTTTCTCTAGCAGAGA
TATCGTCGAAGATGTTTTATTCAACCAAAGGTCAGAAACTCCTGTCCTTC
AAATTTATGTTCATAACATTTTATTAGGATTCTTTGCATACTGCGTTTGT
CATACTCACAATTCATGTATACTTTTAATTACTGTCAATATTATTACTGT
GGATTCTATGATCTATCAATTTTCTCATAAGGAAAACAAAACTCTACTAT
TTTTATACAATAGAATTTAGAAATTTTTCTCTTGCATTAGTTAGTGCCTA
GTTTGTAGTTTTATGTTTATCATGCAGGAGGAATTTATGGAACTACAGTC
ATATTTATATGAAGATACTAATAAAAAAGTTTCCTTAATTTTTTGTACAC
ATTTCTTCTCTTCAAGCATATTGTGGAAAATCTAAGCCCTTGGATGGTAT
CATGAATAGTAGTGAGCCATTATTTGAAGAGTAAACAAAGTATTTCGGCT
CTCGTTGGGTCTTTCGTTATGATTTTGGTTTTTTTAAATTCAATGATTCT
AATGGATTGAACATATGGCTCTCAACTCTTCACGTGCTTAGTTTTTTTTA
ATCAAACAAATGGCATGCAAAAACATTACTATAGGGTTTGAGATCGTAAC
TATGTTGGCGCCTCAAAGCCTTAGTTTTGATCAGTATTTGTTTCATTTAA
AATGTGTGGATCATTACATCGTTGAGTCCCTTCATTCACTAAAGGATTTG
TTCACAAGTATACATAGTCTGTGATCATGATATTTTATCTCTAAATTGTG
ATATACATTATTGTTATATTCGCACCGAGTCATTGCCTGATATATATGTA
CTTTGGAACGTTACAGGTCCGAGCTCAATCGACTAAACTTCCGGGGTTTC
TATACCGTACTTCTAGAGAAAAATGAACAATTGGTTAGTGTGGCAACTGT
TAGGTGAGTATAGGATCTGCTACTACAGAGAACCAAATCAAGTTGTGATT
GCATTTTTCATTTTTAAGTTGCATTTTTTTAAATATTTTTTGGTTCCTTA
ACAAGCCATTTCATTTTTGTAGGATATTTGGAGAGAAGATAGCTGAAGTC
CCCCTTATAGGTACCAGATTTCAGTATCGACGACTTGGAATGTGCCGCGT
TTTAATGGATGAGCTTGAAAAGGTAACATAAAAATCATACAAATGTGTCA
TTTTAGCTGGTTGTTTTATGAACTATACATCAAGTGATCTTGATATGGCA
TGTAGCGTTCAAATTGTTATTCATTTTTTATGTATCAATTTTTCTGAGTT
TAAAAGCCGATAAAACGTACAACCTCTGACTTAGTATAAGTGTATCTATT
TGTAGCTTTAGAAAATTCACGTTCAAGTAGCCTTGGAAAGCAAGAAACAA
AATCTAAACGTGAATCAAAATCTCATGATTTATTCAAATAATAATTGAAA
AGATATCAAAATTTATGTTGAAGTTCTTTTAATATAATTTCTAACTTTAA
ATTCAATGTACTTATTAGGTACTATGTTTGTACAAGAGTGATTAATTATT
TAAATTTATGTCCTAAAAGTTATGGTTATGTTCCAAAGTATACTATCAAA
TTTCTCACTTGAATTTTTTCTTTCATCAGAAGCTAAAGCAACTGGGGGTG
GAGAGGCTAGTCTTACCTGCTGTTCCTGGTGTACTAGAAACATGGACCAA
TTCCTTTGGCTTTGTGCAGATGAAAAATTTTGAGAGATCAAAGTTTTTGG
ACTACTCTTTCCTAGATTTTCAAGGAACTGTCATGTGTCAGAAAATGTTG
ACAAGACTTCCATCACCGGATTCAGTTATAACTAGAGGTTTGTAACTTTT
TCACGATTCTTGTTTCCTATGTCTGGATTGACGGTCAGTTTAACAGAATC
TTGATCTGTCGCAATGGTTTCTTCAAACATGCATGTAATTAAATTGTTTC
ATTGATTGGATTACATTTACAACCTTATTGTTTCATATTGCAGACATAAA
TACAAAGCAACAGGATGCTGGTTTCTCCGTCAAATGTCGAATTGATTTTG
AGAAGTCGAGTCCCATATCAGAAGTGGACCAAGAAGAAGGGATTGGCAAA
AGTGGAATAATGGATCTACAAGTTTGGAAACCAAGGCCTAATTCCTAA
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gene from alignment at Ca_LG_2:11520671..11526568+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_03780_ICC4958_v2 ID=Ca_03780_ICC4958_v2; Name=Ca_03780; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5898bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_2:11520671..11526568+ (Cicer arietinum
ATGGAGGTTGATGATGGTGGTGGTGATAAGGGTAATGGAAATAGAAAACG TAAAAGAGGATCGCCCAAAAGAAAGCTTCTTGTTAATGAAAAAGTCGAGG TAATGCAAGATGATTTTTTTTTTTAATAAAGATGTGATTTTTTTTTTGTT TATGAATTTCTGGGTTGTTGATTTTGTTTTAGGTTTTGTGATGTGATGTT TTTAGGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTACCAAATTGTTATAATTCTGTTA TATCAAGAATCTGTTTTTTTTTTCATGGTTTTTTTTAATTTTATTTTGTG TTTTTGTTTATGATTCTTTGATTTTCTGTTGTTGATTTGCGGTTTCAGTG GGTTTTGATGTGACACTCTATGATTCTTGTTTTCATGATTGAATTGAATT ACCATTCACCTTTGTTTAATTTGCTCTGCATTTTCCTTGTTTTTGAACTA TGTTTTCGATTTCATGCAAGTGATGATGAATTGGGAATTGGATACTGTTT ATGGTAACATAATGTGGACTCAATGTTATTTCCTTTATTAACAATTTTAC ATTTTTTTAATTATTATTATTTTGACATAACATGCATGTTGAGAATAGTG ATTGAGATTTCCTTCGTCTGAAATTTCCACTTCATGGAAAATATTTTAAA AGTTATGTTTTTTTTTTAGCTGAGGAGTTTGGAGGAAGGTTTTCTGGGAT CATGGCATCCAGGGAAAGTAATTCGGTGCGGAAAGATGAAGCGTTATGTC AAATATGACAATATTCTTGATGATGACGAATCAGATTATCTTGTGGAAGT GGTGAATGTTTCAAGTGTTTTGGATGGTGCTAATTCTTCTTCTGTTTCAA ATTGTGGCTATGAACGCGGCCTCATTAGACCGTTACCTCCTCCTATCAAG TTTCGGATAAAGGAACTTTCATTCGGACTCTGTGTTGATGTGAATTATCA GGAAGCTTGGTGGGAAGGGGTGATATTCGACCGAAACGACGGATTCGAGG AGAGGAGCATTTTCTTCCCTGATTTAGGTGATGAAATGAAGGTTGGAGTT CAACAATTGAGGATCACTCAGGATTGGGATGAAGAAACTGAGAATTGGTT GCCAAGAGGGAAATGGGTGTTTCTTGAGTTGTTTGAGGAGTGTGAGAGAG TATCCTATGTTGCGGTTTCGGTGAAACAGATTTGGTATGATGTTAGGATA AGAAAGGATTTTGCTGAAACCATTAGAGAATGGACTTGTAATGTGAAGGA TTTGTGGAGAGAGCTTGTTGTGGAAGTAATTGGTGAATACTATACTCTCA CACTAAGTGAAGTTCGCTCCGCCTTAAATGTTCCGAAGAATTTACTGGAA GGAGGGTCATTTGAACACACTGATAATGTTCTTTGTGATGATAGGCCTAA GGAAAACGGCGATTCCTCAAAATTGTTGGATACTGATCAAAACTGTGGTA GCACTAGTATCATTCCTGTTCAAGAGGAATTTGAGAAGGAAAATCTTTTG GATGAAGAGCCTGAATCACAGAAAGAAATTTCCTGCAATGATGATGAATT GGTTTCGAATAAGAATAAAAAACGGAGACGCTCCAAGTCCGTAGTTTGGA AAACTCTGGTAATGTCTGAAGTTGAATTCTGTCCTGAAGTTATAAATGAA TATGCAGCTGGATGTAGGAGCAAGACGGTTCGGGAGCTTTTGAAGACGAA AGTAAGAAAACATCTTGCATATCTTGGATGGACAATTGAGTGGACTGAAA ACAATTATCCTCAACATAAACGATACCGGTACATGTCTCCTGATAAACTC GATCAGAAGGCTTACGCTTCGATTTTTCAAGTTACTAAAGTTTTGCTAAA GGAGCCTGTGCCGTCTCAAATTGATCGCAATAGGATGCATTCGCAATTTG ACAGCAATATTTTAAATCTGCTTTCTGATCCACCTCAAATGAAAAAGGAT TTAGATGTTAACCCTCCAACCAAGAAACCTTCTCCAGTGATAGTTGAAGT TGAACCTGAATTATGTCCTATAGCCGTCGTTAAATATTACTTTCATGCAC TAGAGAGAAACTCGGCTGAAAAAAGGACATGGAAATTGAAGGCGAAAAAA CATCTATTAGCAGAAGGATGGATCTTTGACTACCCAACTGAAAGAAGGAA GACAACTTTGTACAAGTCTCCACAAAATCAGTGTTTAGGCACACTTCGAG GTGCGTGCAGACTATACCTTAAAGCAAAGATTCCTGAATGGACTAATGCT GATGATGGTGATGATGATCTATTGGTGAGTGTGTTTCAATTGCTTCAAAA AGAGCCTGAATTGCATACTATAGACAATTCTCTGCCAAGTAAATCATCTG TGAAGAGAACATACAGACGCACCACGAATTCAAAGGCTAGCCAACCAAAG AGCATAGAGGAGAATGAAGTAGATACCGGCCGGGTGCTAAGGTCAAGCAA AAGGGTGCAGAAGGTGTTGGGTTTGACGCATCAAAAGCCTCAAAATGTTA TATCTTGGTTAATAGATTGCAACATTCTGTTGCCAAAATACAAGGTCTTT TACTGGGAAACCGAAAAAGGGAACGCTCCCATGGTCGAGGGAAGGATAAC TCAAGAAGGAATCAGGTGCAGTTGTTGTCAGAAGGTTTATGGCCTTAGAG GCTTTGCAAATCATGCTGGTGGAAGTAGTAGCTTCAGGCCTTCTGCCTGT ATCTTTTTGAAGGATGGTAGATCACTGTTAGATTGCATGATGCAAGTAAT GCAATATCATAGGAGAAAGGAAGTTGCGGAGAAACCGTGCAGTGATCCGT TCGAAGGCGAAAATGACAACATTTGTTCTGTTTGTAACTATGGTGGCGAA CTCATTTTATGCGACCAATGCCCCTCGTCGTTTCATAAGAAGTGTCTTAA TTTGGAGGTAGATTAACTAGTTTCCTTTTCAATCATGGCATATTTAAGTT CTATCTTGTTGCTATATTTCATTTCCATTTATGTGTATTGAGTTATTTCT TTGGATGTGTAGGATATCCCTGATGGTGATTGGTTTTGTCCATCATGCCA ATGCGGGATTTGCGGCCAAAACAAAATTGAAGAGGCTAAGGATGGACATT TTCTTTCTTGCATTCAGTGTGAACATAAATGTAAGCTCATAGATAGATTT GCTTCAATATTTCATCCATTCCTTTGTGAATGTGTTTTTGTTTTGCTGCA ATATATAACTTTTTTTCGACCAATGAAAAATTTCTTCAATTCTATGTAGA TCATGTTGAGTGCCTCAAAAATAGAGCAAAAGAAAATTCAAGAAGATATA TGGAAAAAAATTGGCTATGTGGAGAAGAGTGTGAACGGGTAAGTTAAATC GACATCCCTTTTTTTCTTCTATTTTAGAAAAAGTTTCATCTCATTCTGCA TGAAGATTTGTTTATGCCTTATTTGCCTTGAAGTTGTTTTTTCATTTCAT TTCATCCCTTTTTTTCATTTCATTTCTTTAGAAAACATTTAAGGCTCTAT ATCTTCAATATATATACTGCTAGAATTATGTTTTTATGACGATGGTTATG ATTATACACTACATTTATGCTGTACGCTCTCGCAGATCTACACGGGCCTC CAAAATCTATTGGGAAAGCCGGTTTTAGTTGGTGCAGACAATCTAACTTG GACATTGGTGAAGTATGTCAACTCTGAGAATTGTGGTGCTGGCAGTGCTG AAAATGACTTACCGGAAGAGAGTTTTAGCAAACTCCACGTTGCACTTTCA GTGATGCATGAATGTTTTGAGCCCTTACATAACCCTTTCTCTAGCAGAGA 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