Ca_04680, Ca_04680_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview


Name	Ca_04680
Unique Name	Ca_04680_ICC4958_v2
Type	gene
Organism	Cicer arietinum (chickpea)
Sequence length	5169

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
Ca_LG_2	supercontig	Ca_LG_2:28158725..28163893 -	Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	n/a

Analyses

This gene is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	2015-08-11

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Ca_04680.1	Ca_04680.1_ICC4958_v2	Cicer arietinum	mRNA

Sequences

The following sequences are available for this feature:

gene sequence
gene from alignment at Ca_LG_2:28158725..28163893-

gene sequence

>Ca_04680_ICC4958_v2 ID=Ca_04680_ICC4958_v2; Name=Ca_04680; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5169bp
CTCCTATCACACGTCACCTTAGTATTTTTGATTGATTGTGATTCAATTTG
AAACCCATCCATCCACACTCATTCAACAATACATTAATTCATTCTCCAAA
CCAAAACGTAACATAATTCTTCTTTCACTCTAAAACGACCTCGTTTCGTC
ATTCTTAACCATGTCGTACGATTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCG
ACACAGGTTCGTTAATTCGTTTATACCCTTTTGCTTTTCTCTCAATTGGG
TAACTGATTCTGATTTCAAGTTTGGGTTTTTGTTCCGTGTGGTGCAGGTG
TAGGGAAATCTTGTCTGCTCCTTCAGTTCACCGACAAGAGGTTTCAACCT
GTTCATGATCTTACAATTGGTGTTGAGTTTGGTGCTCGTATGCTCACCAT
TGATTCTAGGCCTATTAAGCTTCAGATATGGGACACTGTTAGTTTCTCTC
TCTAGAATTTATTTATTTAATAGTTTTTTTGGTAGGGTATTTCAAATTAG
GTGGTAATAGTTACCTAATAGCGATTACATCACATGAGATGACACGAGTT
TATTCTAGCTTAACCAAAGTCTCCGGTTCGGATCCGAACTTGGGCATGCA
GCAGTATTCACATTCTTAGGGATAGTTTGCTGCCCATTTGAGTCTTACAA
GACTCAAGGGATTAGTCTCCGCAGTTGATCACAGAGGATATCTGGTTTAC
ACCAAAAAAATTAAGTGATAACAGTAATTGGTTGGGGTATGTATTAGAAC
TTGAACACTAAAGCAAACTATTTGTAACTAATGGATTTGAATGTGAATGT
TTCATAAAGGTTGGAATATTTATTTAGTTTTTTGGTAAGGGTTTAAAGGA
TATGCAATATTAGGGTAAATCACATCCAACATAAAGTTACTAGTTTGCCA
CACTACTCCACTTTTATAACTGTATTTTTAAATTGATGATATGACATAGT
AAAATGAAAACTTTTCATCCAGTGTCAATGTAAAATTGATTTGTAGTGAC
TTTATATGTTCATTAAACTCTTTTGGTAAACATTTTTCCTATTTATTGTT
TTGGTCCTATAATAGGAAATAGCGGTGTAGACTAGGGACATGTGAGTATG
AACAAGGCTCTCCATCTCTATATGTGTATGTGGGGGAGGTGATGGATCCT
CTCATGTTGAATCTCAACTATTCATCTAATATGTTCAATGAGAGAAATGC
GTGATTACCCCCTCATGTTTCTTTCAACATGAGAGGATCCACTCATGTGT
GTAAATGTAGATATAGATGTTGGAAGAAGGTGTTACTATCACAAGTCGAC
CAGATGAAGGATTACTCCAATAAGCATGATCTGAGGCAGATAATCTATCT
ATCGACCTAATATACAACATGATTTTTTGATGTCTACTGTTTTATTTTAT
GTAGCCGATTCTACTTAGTGGAAAAAGACTTTGTTGTTGTTATTGTTGTT
TTTGTACAAGTGATGCTTTGGATTAGAAGGAAACAGCAATTAAGGTGCTG
CTTAATTCAGCTGGTGTAGAAGCGATTGATTGTTAGACTTGTGAAATGAA
AGATGTCTTTAATGAATATGTGCGGTCTCTTCTTTCCCTCCATGGTGTGA
GTGAGTAAAAGATATTTACTCTCGAAATCTAAAGGGTTTTAGGATGACAA
ATCTCTGCTTGAATTTGTTCAAGCACAAGCATACATCAGAGACATGCCTG
TTTGAATTGACTTATTTGCACCTATCTTATGACATAAACACTTGTGGGAC
TGTTTGGGAGAGCGATAGAAACAACTTACGATATGTCCATAAGCTGTTTT
TAGCCTATTTCAATAAGCTTTCCAAGATAGCTTATGAAAATAATTTGACT
TTATTTTATCTTTTGCTATAGAAATAGCTTATACATAAGCACTTATACGA
TAAGTGCTTCTGTTATAAGCGCTTAATTAAGTTGTATATGCCCCGGGTTA
CTTACAACTTCTTTATTTGTGGTACTGCTTAATTTTCTTCTATTATGAGG
TATTCCAAGAAGATGGTCCTCAAAATTTGTAGTCATTCAACCTAGCAAAA
CTAGTTATTTTAATTATATTTGACACCTTTTTAGCATGAGCCTGTAACTA
CAGTTCTTGGTTCTGCATGGTGAGGTTAAATTAATACAGCAATGAATGCT
TTCACTGCTCTTCTTTATCCCATCATGGATGTGTATTTATACAATATGAA
TAAGTTCAAACAGTCTTAATAGAGCTCAAAATAGGATTACTTAGTCTTAT
ATTTTGTTGAAGTGTCCACGCCTCCGCTGTTGTAGCTTTCAATAAGATTC
AAATACTGATGAAGAGTATGTTGTTTAATTGTAGGCTGGACAAGAGTCTT
TTAGATCCATCACTAGATCTTACTACAGAGGAGCAGCAGGGGCACTTCTA
GTTTATGACATTACAAGGTTTGTGGTGCTATTGTCTCTTTGTTTGCCCCA
CAATCATGGTCTGCATCCCGAGAATAATACCTAACTGTATTACATGCACC
TTGCATGATGTTTTCCACTCTGATGAATGCTAAATGTTTGTAGATATTCA
TAATACTTACAAAAGGATTTGAGTCTTTCAAATTGAGAGACTGCTCTTTC
GAGTATAAAATGCAAGAATAACCATAGATCGACAAATATATGCACGTATT
GTTAAAGTCTCAGTTATTGTTATTCCAATCAATAGTTCTAATTGCGAATT
TTATTCGTTAAAGGGAACTCCTTCCTTCACTCTAGATGAGTCAAATCCTA
AACAACCAAAGATAAATGTTTTATATTTGTGCAGTTAGGTGTCTACAAAC
CTTTTGTGGCTGACTGAAGCTTTGTCATTGCATTCTGTTTTGTTATTGTT
GATTGTCCTATTTGAATGTTTCAATTCTTCTGAACTAGAAGTCTTATAAC
ATTTGTGGCTTAGTTTACCATCAAACTTCAAATTTCAAACCATCTTATGC
GATTTTTTGGTTTTCCAATACCTCATCTGAGGAGCTCTAGTACTGGTGGT
TGCAAGCAGCATGTTTTCATGGTTTTCTTTTTTCTTCTTCTCAAGTTTAC
AAATGAATGTGGTATGTAATCCTTCTTCCTTTGCTAAGGGCTCCAAAACA
ATATACACATTCATTCCATATAAACAAATTAACTTATGTTCAATTCGTTT
CCTTTTTTCTTTTCTGTATGCTGTGGTGTGGGATCCGAGTTGTGTGCAGT
CACAACTCCGCGACTACATGCAGTCAGCCACATTTGGGTTGTTCGATCAA
GATCAGACGATCAAGATTTCAAGCTCGGTATTTAGATTTAAAAAAAAAAT
CAAAATTTGCATTGAATTATGGACTGTCCGATCTTTGATCATACAATCCA
AATATGGCTGACTGCATGTAGTCATAGCGCGCACAATCCAGATCCGGTGG
TGTGATGTGGTGGCGAGGTTTGCTTACTTTTCAAATCACGCTTTTAACTG
AAAACCAGAAAATTCTTTTGTTGGATCAGGAGAGAGACATTTAATCATTT
AGCAAGTTGGTTGGAAGATGCCCGGCAGCATGCAAATCCTAACATGACAA
TCACGCTCATAGGGAACAAGTGCGATCTATCTCACCGAAGGGCGGTAAGC
AAAGAGGAGGGAGAGCAGTTTGCTAAGGAAAATGGACTTTTATTCATGGA
GGCTTCTGCCAAGACAGCTCAAAATGTAGAAGAGGTGATTGATCTCAACC
AATAGCAAGCAAGATGCAGCATAAACGGTAGCCTCAAGCATATTATGATT
TTGGTGACCATCAAAAGTAACCTAGTGCTTATTTTGCAGGCTTTCATAAA
GACTGCTGCAAAGATTCTTCAGAACATCCAGGATGGTGTCTTCGATGTGT
CCAATGAGGTAACTAACTACAGTCAGTTCCATGTAAACAGATATGAGAAA
TTAGTTGTGATGATCCTGGACTCAGGTCGGCATTGGTCCCATGCCACACC
TATATGGCGTTGGGTTTATAAATCATGGATAACAGTTTGTTTAAGATGAA
GAAACAGTGATTTTCAGATAAAATAATTTAGAGATTAGTTTTTAGATATC
TTACGTGAATTAGAAGATAATTTGTGTTTGCTTAAAATAATAATAAAAAT
TACTTTTTTAATCTTCTCTTTCTTCTACTACACTAATAAAATCAGATTAC
CTTGTGTAGTTGTGTTATTGATTGTTGGTTTCACCAAAATGTGTCTCATG
AAGCAGAAGCATGGATGCTTTTTTTTTCTTCTTATTTTTATTCATTAAAA
TAAAGAGACTTTAATGGATATACAACATGGTAAGTTTAAAATAGTTTTAC
ACTAACATCTAAGGAGAGTCCTCCATTTTATCATGTCATACAATTAAAAT
AGTTTTACACTGTCATCCAATGGGAGTCCTTCATTTTATCATGTCATACC
ACTAATTTTAAAATACAGTTACGGAAGTGTGATGTTGCAAAATACTGGAT
TTTCGTTGGACGGCAATGTAAAACTAGTTTACACTGATAATGCATGTCCC
ATTTTCTTTAAAATAAATAAAATTAATAGGAAATCTTCCCAGAGTTTGGA
TCCCTTACTTTCACGCAATTATACAGTCCGTCCAACAGATTAAGATCAGA
TGACTCACATTTTAGAAACCCTACATTTTGGACCTGATTTTCCAAAGTTG
GACTGTGACCCGTCCGATTATGATTCAACAGTCCATATCATGCGGCTGCA
TCAAATGCTTGATACTTGTATTTAGAGTATTCGTGTCCATTTTCCTGTCG
CCTAATTTTTTCTTTTGGCTAAAATTAGTAATGAATCTATTATTTATTTC
AGACATGTGGTATAAAAGTTGGGTATGGACGTCCACAAGGCCAGTCAGGA
GGCAGAGATGGAACTGTTGCTGCAGGAGGTGCATGTTGCGGCTGATTGGG
AGGAAAACAACTCTGAATATAATCCTTTTCTCAATCTATCTCTGGAAAAC
TGAGTGTATACTCTTTTAGACTAAACATGAACTTTTTGATAATCCTACAA
TTTCATGTATAGTTTTTCTTAAAGGCCTTCTTGGGAGGAGATTTGACTGA
ATAGCTGTTAAGCTTAGTAAATGTTTGAAATTGTTGGTTGTTATGTTAAA
TGCCATTATGAATTTGTTCTATGCAATAGCATAGAGTAATTTTATGAGTA
GGTATTACCTATGATAGAC

gene from alignment at Ca_LG_2:28158725..28163893-

Legend: mRNA

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Ca_04680_ICC4958_v2 ID=Ca_04680_ICC4958_v2; Name=Ca_04680; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5169bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_2:28158725..28163893- (Cicer arietinum
CTCCTATCACACGTCACCTTAGTATTTTTGATTGATTGTGATTCAATTTG
AAACCCATCCATCCACACTCATTCAACAATACATTAATTCATTCTCCAAA
CCAAAACGTAACATAATTCTTCTTTCACTCTAAAACGACCTCGTTTCGTC
ATTCTTAACCATGTCGTACGATTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCG
ACACAGGTTCGTTAATTCGTTTATACCCTTTTGCTTTTCTCTCAATTGGG
TAACTGATTCTGATTTCAAGTTTGGGTTTTTGTTCCGTGTGGTGCAGGTG
TAGGGAAATCTTGTCTGCTCCTTCAGTTCACCGACAAGAGGTTTCAACCT
GTTCATGATCTTACAATTGGTGTTGAGTTTGGTGCTCGTATGCTCACCAT
TGATTCTAGGCCTATTAAGCTTCAGATATGGGACACTGTTAGTTTCTCTC
TCTAGAATTTATTTATTTAATAGTTTTTTTGGTAGGGTATTTCAAATTAG
GTGGTAATAGTTACCTAATAGCGATTACATCACATGAGATGACACGAGTT
TATTCTAGCTTAACCAAAGTCTCCGGTTCGGATCCGAACTTGGGCATGCA
GCAGTATTCACATTCTTAGGGATAGTTTGCTGCCCATTTGAGTCTTACAA
GACTCAAGGGATTAGTCTCCGCAGTTGATCACAGAGGATATCTGGTTTAC
ACCAAAAAAATTAAGTGATAACAGTAATTGGTTGGGGTATGTATTAGAAC
TTGAACACTAAAGCAAACTATTTGTAACTAATGGATTTGAATGTGAATGT
TTCATAAAGGTTGGAATATTTATTTAGTTTTTTGGTAAGGGTTTAAAGGA
TATGCAATATTAGGGTAAATCACATCCAACATAAAGTTACTAGTTTGCCA
CACTACTCCACTTTTATAACTGTATTTTTAAATTGATGATATGACATAGT
AAAATGAAAACTTTTCATCCAGTGTCAATGTAAAATTGATTTGTAGTGAC
TTTATATGTTCATTAAACTCTTTTGGTAAACATTTTTCCTATTTATTGTT
TTGGTCCTATAATAGGAAATAGCGGTGTAGACTAGGGACATGTGAGTATG
AACAAGGCTCTCCATCTCTATATGTGTATGTGGGGGAGGTGATGGATCCT
CTCATGTTGAATCTCAACTATTCATCTAATATGTTCAATGAGAGAAATGC
GTGATTACCCCCTCATGTTTCTTTCAACATGAGAGGATCCACTCATGTGT
GTAAATGTAGATATAGATGTTGGAAGAAGGTGTTACTATCACAAGTCGAC
CAGATGAAGGATTACTCCAATAAGCATGATCTGAGGCAGATAATCTATCT
ATCGACCTAATATACAACATGATTTTTTGATGTCTACTGTTTTATTTTAT
GTAGCCGATTCTACTTAGTGGAAAAAGACTTTGTTGTTGTTATTGTTGTT
TTTGTACAAGTGATGCTTTGGATTAGAAGGAAACAGCAATTAAGGTGCTG
CTTAATTCAGCTGGTGTAGAAGCGATTGATTGTTAGACTTGTGAAATGAA
AGATGTCTTTAATGAATATGTGCGGTCTCTTCTTTCCCTCCATGGTGTGA
GTGAGTAAAAGATATTTACTCTCGAAATCTAAAGGGTTTTAGGATGACAA
ATCTCTGCTTGAATTTGTTCAAGCACAAGCATACATCAGAGACATGCCTG
TTTGAATTGACTTATTTGCACCTATCTTATGACATAAACACTTGTGGGAC
TGTTTGGGAGAGCGATAGAAACAACTTACGATATGTCCATAAGCTGTTTT
TAGCCTATTTCAATAAGCTTTCCAAGATAGCTTATGAAAATAATTTGACT
TTATTTTATCTTTTGCTATAGAAATAGCTTATACATAAGCACTTATACGA
TAAGTGCTTCTGTTATAAGCGCTTAATTAAGTTGTATATGCCCCGGGTTA
CTTACAACTTCTTTATTTGTGGTACTGCTTAATTTTCTTCTATTATGAGG
TATTCCAAGAAGATGGTCCTCAAAATTTGTAGTCATTCAACCTAGCAAAA
CTAGTTATTTTAATTATATTTGACACCTTTTTAGCATGAGCCTGTAACTA
CAGTTCTTGGTTCTGCATGGTGAGGTTAAATTAATACAGCAATGAATGCT
TTCACTGCTCTTCTTTATCCCATCATGGATGTGTATTTATACAATATGAA
TAAGTTCAAACAGTCTTAATAGAGCTCAAAATAGGATTACTTAGTCTTAT
ATTTTGTTGAAGTGTCCACGCCTCCGCTGTTGTAGCTTTCAATAAGATTC
AAATACTGATGAAGAGTATGTTGTTTAATTGTAGGCTGGACAAGAGTCTT
TTAGATCCATCACTAGATCTTACTACAGAGGAGCAGCAGGGGCACTTCTA
GTTTATGACATTACAAGGTTTGTGGTGCTATTGTCTCTTTGTTTGCCCCA
CAATCATGGTCTGCATCCCGAGAATAATACCTAACTGTATTACATGCACC
TTGCATGATGTTTTCCACTCTGATGAATGCTAAATGTTTGTAGATATTCA
TAATACTTACAAAAGGATTTGAGTCTTTCAAATTGAGAGACTGCTCTTTC
GAGTATAAAATGCAAGAATAACCATAGATCGACAAATATATGCACGTATT
GTTAAAGTCTCAGTTATTGTTATTCCAATCAATAGTTCTAATTGCGAATT
TTATTCGTTAAAGGGAACTCCTTCCTTCACTCTAGATGAGTCAAATCCTA
AACAACCAAAGATAAATGTTTTATATTTGTGCAGTTAGGTGTCTACAAAC
CTTTTGTGGCTGACTGAAGCTTTGTCATTGCATTCTGTTTTGTTATTGTT
GATTGTCCTATTTGAATGTTTCAATTCTTCTGAACTAGAAGTCTTATAAC
ATTTGTGGCTTAGTTTACCATCAAACTTCAAATTTCAAACCATCTTATGC
GATTTTTTGGTTTTCCAATACCTCATCTGAGGAGCTCTAGTACTGGTGGT
TGCAAGCAGCATGTTTTCATGGTTTTCTTTTTTCTTCTTCTCAAGTTTAC
AAATGAATGTGGTATGTAATCCTTCTTCCTTTGCTAAGGGCTCCAAAACA
ATATACACATTCATTCCATATAAACAAATTAACTTATGTTCAATTCGTTT
CCTTTTTTCTTTTCTGTATGCTGTGGTGTGGGATCCGAGTTGTGTGCAGT
CACAACTCCGCGACTACATGCAGTCAGCCACATTTGGGTTGTTCGATCAA
GATCAGACGATCAAGATTTCAAGCTCGGTATTTAGATTTAAAAAAAAAAT
CAAAATTTGCATTGAATTATGGACTGTCCGATCTTTGATCATACAATCCA
AATATGGCTGACTGCATGTAGTCATAGCGCGCACAATCCAGATCCGGTGG
TGTGATGTGGTGGCGAGGTTTGCTTACTTTTCAAATCACGCTTTTAACTG
AAAACCAGAAAATTCTTTTGTTGGATCAGGAGAGAGACATTTAATCATTT
AGCAAGTTGGTTGGAAGATGCCCGGCAGCATGCAAATCCTAACATGACAA
TCACGCTCATAGGGAACAAGTGCGATCTATCTCACCGAAGGGCGGTAAGC
AAAGAGGAGGGAGAGCAGTTTGCTAAGGAAAATGGACTTTTATTCATGGA
GGCTTCTGCCAAGACAGCTCAAAATGTAGAAGAGGTGATTGATCTCAACC
AATAGCAAGCAAGATGCAGCATAAACGGTAGCCTCAAGCATATTATGATT
TTGGTGACCATCAAAAGTAACCTAGTGCTTATTTTGCAGGCTTTCATAAA
GACTGCTGCAAAGATTCTTCAGAACATCCAGGATGGTGTCTTCGATGTGT
CCAATGAGGTAACTAACTACAGTCAGTTCCATGTAAACAGATATGAGAAA
TTAGTTGTGATGATCCTGGACTCAGGTCGGCATTGGTCCCATGCCACACC
TATATGGCGTTGGGTTTATAAATCATGGATAACAGTTTGTTTAAGATGAA
GAAACAGTGATTTTCAGATAAAATAATTTAGAGATTAGTTTTTAGATATC
TTACGTGAATTAGAAGATAATTTGTGTTTGCTTAAAATAATAATAAAAAT
TACTTTTTTAATCTTCTCTTTCTTCTACTACACTAATAAAATCAGATTAC
CTTGTGTAGTTGTGTTATTGATTGTTGGTTTCACCAAAATGTGTCTCATG
AAGCAGAAGCATGGATGCTTTTTTTTTCTTCTTATTTTTATTCATTAAAA
TAAAGAGACTTTAATGGATATACAACATGGTAAGTTTAAAATAGTTTTAC
ACTAACATCTAAGGAGAGTCCTCCATTTTATCATGTCATACAATTAAAAT
AGTTTTACACTGTCATCCAATGGGAGTCCTTCATTTTATCATGTCATACC
ACTAATTTTAAAATACAGTTACGGAAGTGTGATGTTGCAAAATACTGGAT
TTTCGTTGGACGGCAATGTAAAACTAGTTTACACTGATAATGCATGTCCC
ATTTTCTTTAAAATAAATAAAATTAATAGGAAATCTTCCCAGAGTTTGGA
TCCCTTACTTTCACGCAATTATACAGTCCGTCCAACAGATTAAGATCAGA
TGACTCACATTTTAGAAACCCTACATTTTGGACCTGATTTTCCAAAGTTG
GACTGTGACCCGTCCGATTATGATTCAACAGTCCATATCATGCGGCTGCA
TCAAATGCTTGATACTTGTATTTAGAGTATTCGTGTCCATTTTCCTGTCG
CCTAATTTTTTCTTTTGGCTAAAATTAGTAATGAATCTATTATTTATTTC
AGACATGTGGTATAAAAGTTGGGTATGGACGTCCACAAGGCCAGTCAGGA
GGCAGAGATGGAACTGTTGCTGCAGGAGGTGCATGTTGCGGCTGATTGGG
AGGAAAACAACTCTGAATATAATCCTTTTCTCAATCTATCTCTGGAAAAC
TGAGTGTATACTCTTTTAGACTAAACATGAACTTTTTGATAATCCTACAA
TTTCATGTATAGTTTTTCTTAAAGGCCTTCTTGGGAGGAGATTTGACTGA
ATAGCTGTTAAGCTTAGTAAATGTTTGAAATTGTTGGTTGTTATGTTAAA
TGCCATTATGAATTTGTTCTATGCAATAGCATAGAGTAATTTTATGAGTA
GGTATTACCTATGATAGAC

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