Ca_06001, Ca_06001_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_06001
Unique NameCa_06001_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length9604
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_3supercontigCa_LG_3:17554675..17564278 +Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_06001.1Ca_06001.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_06001_ICC4958_v2 ID=Ca_06001_ICC4958_v2; Name=Ca_06001; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=9604bp
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CATGCAGTGTAGCTACCAACCATCTCTACTTCGTCAATTAGGGTTTCCTC
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GAAGCTAGTTTCTACTTAGAGGCTATTGTCTTGAAAATTAGTTATTATTT
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TTTCAACTAATTTTAGAAGCTAATCCTTTTAAAGAAAGCACTAAAACATT
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ATCCAACATGATTCTCAATTGATTATGATGAATCATAACTTGTCCTTGAA
CTTTGTGTAACCAGTCACTTTTTTAGTCAACACTGTGTAGCCAACCACTT
TTCTCTGTCATTTGATTTATGACTTCCATCATGAAATATTTTAAGGTTCA
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AAATATGTCTTCCAATTCACAAATTGAATCTTGATTTGATAACTATAATT
GGAATAACCGGATAACTAGTTTTAATGGATTTCCTTCGGTCTCTTCCCTC
AGCTCCTCTAAAAGAGTTAGAAAGCTTGTTTGTTGTTTTTTATTTCCTTT
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GTCTGTGCGATGCAAGAGCAAGGTTGTTCTATAAGCGGGGAAACTGCTAT
TAATCTGGCTTTGATGACTAGGAGTAGGATCTTTAATATCAATTATCAGA
GTCTGATCTGTTAATTGTTGGTGGTGAGAATGTTCTTTCCAATTTGACTA
GCTTGATGCATGTGCCTGAATCCCATTTCTTCATTTAGGACAACTATACA
ATGTTTAGTTTTTTTAATGGTTGTGCTATTTTCCCCCCTTAGATGTTCAT
ATTATTCAATGGCAATATCTTGGTTGTGTTGTGCAGTCAAATACTAGGGT
GATACCTATTTTTTCTCTCTCCAAACTCTATTCTTTATTTACATTTTTCC
CCACGTCGGTGGAGCATTGTGCACTTGGCTGCAATTTTTATTCTGTTTAA
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TACTGGATTCACCTTAAAGAAAATTTGGTTATGACTGCAATAATGTAAAA
AGGGATCAATTTATACATATACCTCACCTGTAATAATTGGTTACCAGATT
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TTTCTGGTGATTCCCAAAAATAACACAATTGCGGTTGGATGTGACTGCAT
TATTGCAGCCACATTATGTGATGCAGTCCACGACTTAAAACTATGATGGA
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TGTCATTGTAGGAGCATTGCTTCATATCACACAGTATCTTGAAATATGTA
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ATGGGAAAAATATATAGAGGATTTTTTCTTTAAAAATCAGGATTATTGGA
GAAGATGAATATCGGTAAACTAATTTGGAAGTCAGTGACTAATATTGGGA
GCTAGTAGTGCACAGGTTGTGACATCACAAATAAGACATATTATGAGTGC
TTTGCTTACTTTAAAATCCTGTTGTGCTCACTTTTACATTGTAGAATTGC
TAGAGGATTTTGCAATCTTATGAAAATTCTATTTTTGGATCTGGAGTGGA
AGAAAAGAGAAGAAGCCGCAAACTTCATTTCTACTATTCTGAGAAATTAT
TTTATTATTTTTATCCCAAGCAACCTCCCCTTGCCCATAGAAAGGTTTAA
ATGTCTAGCTATACTACTTAAACTTGCTTAGATGCGCATTTGTAAATAAG
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GAAATAGTTATTGCATATTCATCCAGAGTTTGAGTTTATGATAGAAGTGT
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GTTAGCAGTAGTCGAGACTTGAGACTAGTGGGAATCTGTGATGCAGGACC
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TTCCAACTTTGGAAGTCTTGAGTTCAGATTTTAGGACTTAAACATTCTTC
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AATAAATTTTCATTTAAGGTAGGGGCTTTCCCTTTTTATTAGCTTACTTT
TACATGTGGGTTCTCCTCTACATCACTTTATTCTTATAGGAATAAGACTT
GATAGTTATTCTTCATTCTAGTTAGTTGAGTTATAAGGTTTACAGTGATG
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ATTTGTCTATTGCAATCAAACCCTCAGTTGATGCTTAGTTTCCTTGTTTC
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TGAGCTTCATCTTTTTATTCTGATATATCTCCCTAACTGGTTAACCAATA
TTTTCTACAAATTCTCATAGTTGTAGTTTGCATATTGCTCTCATAAATTT
TCTTTCCTCCTGTTAGAATTCAGTCTATGATTTTATTATTCGTTGATTGT
ACAGCTTCCTAGTAATTGTTAGTATTCCTAGGTAATACAACTTCATAGAC
TTTGAATGTAATTGTTGTAGCATCATATAAATAGAAGGTGTGTGATCTTG
TTTTAGGCATACAGAAATCATATTCTCACACCTCCAAAAGCCATCGATTT
CTCAGAACTGATGATTTCTGATGTCATTAAAATTCCACTTAACATGGCAG
ATTTCTTTAGCTTGATTTGATCCTTGAAACTGTATGAACCTGAAATCCTA
ATTTCATAGGTACAGAATCTGCACTCTTGACTTCCAAAGATGGAATCTCT
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TGATTGATTCCCCCTTTGCAGTTTTAATTCTGAGCCATTTCATTATCTTA
TTAATTCAAACTCATGGGAGTCTCTTCAATCTAAAATCTATAGATTCGCC
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TGCTCGTATGCCCATTCTATCTAGTCTACTATCCAAATGGCCACCAATGT
GACTCTTCAATCCAATCCAATAATTCCTGTTGATCCTTACATCAGATCCA
CCAATTTCCACCTGTTGTTCACCCACGTTAACCCTGAACCCAAACCATAT
TTGTATTCTCTCTTTCCTTACAGCTTGCTAGTGTAGCGTCAGACTACCAT
TTTAAGTTCCCCTGATATTCTGTTGTTCTGGTCATGCAGGGCCACTTATG
ACTATGAAAAGAAATTATACAATGACCACCTTGAGTCACTTCAAGTGATG
GAAAAGAACTATGTTTCTATGAGTAGGGAGGTGGAGAAGCTTCGAGCAGA
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TACCTGTTTTCTAAGTTAGAGTCCTTAGTCTTCAATTTTTCATGTTTTGT
GGATTGATCCTGGCGTGCAATAAAATTTAGGTGGGCCCTATGGTGGCACC
TCTGGAACTAATGATAATGAGGCTTCTGGTCTTCCTCTGGGACAAACTGC
ATATAAAGATGGTTATGCTGTTGCACAGGTGTGTGATGACCCCATGTGTT
ACGTTGTTTTAAGTTCCTTGCGGGAGTGTAGCATTATAGTCCGTTGTGTA
GTATATTTATTAATTCGTGAAATTTCTTTATAACAATCAATATCTGGATT
AGTTTTTGCTTGTGTTGACTTATTTATCTAGTTATTTCTATAAAATATCT
CCAATTAAATATAGCATATCTTTACATTGATTCCAAGTTAATAATAATTA
TAACTACGTACATCTGGTCTGCTATCAAGTAGTAATTGTATGTTGCTAGG
ATTATTGTACTTCAAATAACCTGATGAGTTTTTCCTAAATATCTTATAGC
TTAGCACTAGTTTGTCTGAATACCTGAGTTCAACAGACTTTGATCTGATT
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TGGCGGCGCTATAGCAATATTGTGTAGCAGAACTTTAACGAATCGCACTA
TTTTCTGCGATCTGCAATTGACAACACTGATATAGAAACTCATTAATATT
TACTTTTCACCATTCTGATAGTACCAATTTGACATACAACAGTAGCGTTG
GTTACCACCGTGATAATTTTTTTTAAAATCTAGTGCAATTGTCTCTGTTG
ATATATCCAGTATGTTGTTTGCTTGATAACCATAGAGGGGACTATTTACC
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TGCATAATAGAAATTGTGTGTTCAACTGCTATGTTATAATATGTACTAGA
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TGCGGCCAGAACTTAAGAGTTGCCATATTCCTGCCTATATATGCTTTATT
TTCCACATGGATTTTAAATATTAATGCTTCACTGTTCCTTTGTTTGGCAG
GCACGTGGTTCTCTCCCTGCTGCCAGTGGCGGCGGTGGTAATGCTACTAC
AACTACTCCTGCACCGGCTGGAGGTCAACCTGGTCAAGCTTCTGCAGGGA
CTGGTTATGAGGCTCCCAGAGGAGGTCCTGGTTACATTGCACCTACAGGG
CCTACTTACGACCCACAGAAGGGTTCTACTTACGACCCACAGAGGATGAA
TGGTTACGATGCATTTAGAGGATCTGCTTACGAACCAAACAGAGGACAGA
TGTTTGATGCTTCTCAGAGAACTGGCTATGATCCACAGGGAGGTTCTGGT
TATGAAGCGCAGAGAGGACCTGCACCTGCTTATGATGCATCAAGAGCAGC
CGGCTATGATGCACAATCAAGAGGTGTTGCTGGTCAACATGGACATGTTC
CTCCGGCGAACAATATGACTTATGGGTCCACGACACCACCTGTTCGTAGT
GGAGGTGGTGGTGGATACGATCCTGCTCGAGGTGTAAACCCTGCTAGGAG
ATGA
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gene from alignment at Ca_LG_3:17554675..17564278+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_06001_ICC4958_v2 ID=Ca_06001_ICC4958_v2; Name=Ca_06001; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=9604bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_3:17554675..17564278+ (Cicer arietinum
AGAAAAGAAAATAAATTCTACAAAGATCGGAAAACGCTGTCACTCATTCA CATGCAGTGTAGCTACCAACCATCTCTACTTCGTCAATTAGGGTTTCCTC TTCTTTTCATCCATCATCATCCCCAATTTCCTCACTCTTCTACGGTATCA ATCCTCTCTTCCTTCATCACTTCAATTTCACAAATTTCATCTTTTTTTTA ATCACCCCCAAAAATCAATTTTGTGACCTAATTTCACGATTTTCGCAAAA ATCTCATATTTCAGATCGATGGGAAGCAAGGGTCGCATGCCACCGCCACA GCATCTCCGGCGGCCACATCAACCAGGTCCTGCCATGCTTCACCACGAAC AAGTGGGTCCCACAATGCACCACGCGCTACCACCCGGTCCCTTCGACCTT ATGCCACCACCACAGGTAATGGAACAGAAACTCGCTTCACAGCACGGGGA AATGCAGCGGTTAGCCACCGAGAATCAGAGACTCGCCGCAACACACGGTG TTCTGAGACAGGAGCTTGCTGGTGCGCAACATGAGCTGCAGATGCTGCAC GCGCACGTGGGGTCGCTTAAGGCGGAGAGGGAGCAGCAGATGCGGGGTGT GATTGATAAGATTGCGAAGATGGAAGCGGAGTTGAAGGCGGCTGAACCGT TGAAAATGGAGATTCAGCAGGCGCGTGGAGAGGCTCAGAATTTGGTGGTT GTGAGGGAAGAGCTTATTTCAAAAGCTCAACATTTGAGTCAAGAGATTCA GAGGGTTCATGTTGATGTGCAGCAGATTCCTGCTCTTATGACAGAGCTTG AATGTCTTAGACAGGAATATCAGCATTGCAGGTAATTTTTTGGACCCTTT TGTTTTGATTTTTAGCTTAGTGGGTTAAATGTGTAGTTACATCATACATG ATTCTCTCAATTGACTCACCAACCTGTGTTGTCAACAGTGGCACTATAGC 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GAACGGGAAAGGAAACATTGATATATATTGTTTTTCCCTTTCTTTTTTGT GGTCTTGTTGAATGTTGATGATTGAATTAAAGAAGTAAACTTGGAAATTA CTTGCATTGCATGCAATGTATTAAATTTAGTGGAAATATTGTGAATAAAT TGTTTGTTAGAAGAGTTGAGATTGGAGAAACCACGATTGCTGTAGAAGAT GAATATCACTAAACCAATTTGGACGACAGGTAATGATCCTGCTGTTCCCA CTTTCGCAAGGTAGCATTTATAGAGATAGAAACCTGGGAGGTTTTAATTT TTACAATCATATTTATGAGGGTCTTGTATTTTGCTTGAATGATGGACATA ATTGGACTATTGGATTAACACTAATAATTTGCTGCAGGTTTTTAGACCTC CTGAAATGTGTCTATAGTTTGCAAAATGTGAATAAATACTACATTGTCCA TGAATTGTATTGCCGCCACTTTTTTCCCCACAGTTTTTTGTTGATGCAGA GCGTGTCCCCCTGAATTTGGACTTTGGAACAAGGTTCTGTGATTAACTTG GGGGTTTTCGACAATGAGGAAGGAGAGATTTTAGTTGTTGTAGTAACTAA AACTACTTAGGGTGTCTTTGTTTAAAGCTTAGAAAAATAATGTTTCTATA TTTCAACTAATTTTAGAAGCTAATCCTTTTAAAGAAAGCACTAAAACATT ATTTTTAGTATTTGCTTATACCCAATAAAACCTGGCATATTTATTAAGTT CTTTTATCTCAATTTTTAATTAAAATTTGAAAAGCGCTATTCCTTTTCAT TTTTAAAGAAGCAGAAACAAATAGACCCTTAAATCTTAAGTGTTGTGGAT GAATTTTCTTTTAAAGAAAATAGATCCGTAATCTTATCTGTTTTGGATGA ATTCTTACCATACCTCAAGTTGTACTTCCCTTTTCTCTATAATAGCAGTC TAATTAAATTTGTTTTCCTAATTAGATGGAATAAAGGAGGGAAAAACCTA ATGTTGTTGTCTGATTTTGCAATCCTTGTTTTATATTGGCTAGCATGAAG TTCTTTTGTTATGATGATGTTTTGTCATCCTTCCGGCTGTTATTATAGGC ATAGTGTATTTACGAAGTTATGACACATTCAAGTCATATCTCGATTAAAC AAAACTGAATTCAGTCGATACAAATCATTGCTTATCTCTTTTAAACATGA ATCCAACATGATTCTCAATTGATTATGATGAATCATAACTTGTCCTTGAA CTTTGTGTAACCAGTCACTTTTTTAGTCAACACTGTGTAGCCAACCACTT TTCTCTGTCATTTGATTTATGACTTCCATCATGAAATATTTTAAGGTTCA TATACAATGTATCAGCTTATGTTTTTGCTTACTTGTTTTTGCTTAGAAGT GTCATATTTTTATTGATCATATATCTTTCAATTCATAATGTTAGAAGATG AATTCGTGATTCATTCAGTTTTGGTAATTCTCTGATATTCACATTTCAGT TTTCATTGCTTAATTGTCCAGTGATTACACTGATAGCTACTTTTGTCCTT TTTATAGCAGTGTTTTGGTAACTAACTCTTACAACAGGTAACTAACTGAT TTCTATTCAGTTAGTCAGTTACAAGGAAACTATTATCTAGGTGCAACCCT GTACTAGATGGGATGCACTGGAGGTAATAAGATTCGATTCATGATTTGAG AAATATGTCTTCCAATTCACAAATTGAATCTTGATTTGATAACTATAATT GGAATAACCGGATAACTAGTTTTAATGGATTTCCTTCGGTCTCTTCCCTC AGCTCCTCTAAAAGAGTTAGAAAGCTTGTTTGTTGTTTTTTATTTCCTTT CTGGTTGTCTTTATTGAGGTAACCTGGTCATCCTTTTTACATGTGTGTTG 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