Ca_08161, Ca_08161_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_08161
Unique NameCa_08161_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length3067
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_4supercontigCa_LG_4:1990706..1993772 -Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_08161.1Ca_08161.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_08161_ICC4958_v2 ID=Ca_08161_ICC4958_v2; Name=Ca_08161; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=3067bp
ATGGCTTCAGTTGGTGTGGCACCAACTTCTGGTTTGAGAGAAACCAGTGG
TCATGCTGCAGCTGGTGTTGATAGATTGCCAGAGGAAATGAATGATATGA
AAATTAGGGATGATAGAGTATGTTGCTCACTCTATTAATTCTTCAAACTT
TTTTTTTTGTGGGTTGATTTTAAATTTCAGACCCAGTTGCTTACAGCTTG
GTTCTCTTTTAGGAAATGGAAGCTACAGTTGTTGATGGCAATGGAACTGA
GACTGGACATATTATTGTGACTACTATTGGGGGTAGAAATGGTCAGCCAA
AGCAGGTATACCTTTTCCCTCTAGTTTGCTGCTATCAATCGTTTGGGGGG
TTTGATATCATTCAACTCTTGCACTGTCTCACCAGCTTTATATTATTATT
TGTGTGCAAATGTCCGCCCAAATCAGTTGTGATTTTGAATTAGGAATAGT
TACATTTGCCAATGAAGTTGAACTACTAAAAAACGAAAGAAAACTTCAGC
GTTTTGGAATTATGCCTGCTGACTATAATATATTTACAGTGACTAGCATG
AGTAGTTGTATTGTCCAACATGTTTGTGTTGTTTTTGTCTTGTGATTGGC
AAGTATCTTACAAATTGTTAATTAGCAACAATAATGCTCTATGACATATT
AATGATAGGGTGAAAATTTTATATGGTGTGGTCTTATCATATCCTTTGTA
ACTGTATATTGTATATTATGTTTCCCAAATTTTTTATATGTTTTTTTATT
TTTACGTTGGAATAATTTTATATCTTTCTTAATATTTCAGACTATAAGCT
ATATGGCAGAGCGTGTTGTAGGACATGGATCATTTGGAGTTGTCTTCCAG
GTAACAATGTGTATCTTGTCAACTGGCTGACATGACTTGTGTTAGTTTTG
CCTTTTCAGCACAGTAGCATATGATGATTTTAGTTCTGATATCGTTTATG
ATTGTAGGCTAAGTGCTTGGAAACGGGTGAAACTGTGGCTATCAAAAAGG
TTCTTCAAGACAAGAGGTATAAGAACCGGGAACTGCAAACAATGCGCCTT
CTTGATCACCCAAATGTTGTTGCTTTAAAGCATTGTTTCTTTTCAACCAC
TGAAAAGGATGAACTCTACCTTAATTTGGTACTTGAGTATGTCCCTGAAA
CAGTTCATCGCGTGATTAAGCATTACAACAAGTTGAACCAAAGGATGCCA
CTGATTTATGTGAAACTCTATACATACCAGGTATGCCAGTTGCCCTTCCT
TATTCGACTTCTTCCATGTTGTGGTTGTAATGATTTCATTGGTATCTTGC
AGATCTTTAGGGCATTATCTTATATCCATCGTTGTATTGGAGTCTGCCAT
CGGGATATCAAGCCTCAAAATCTATTGGTATGGCCTTGATTGTATTTTCC
ATACAACCCTTTCATTAATTTTCTCTCTCTTTTGGCCCTAGTTCTCATGG
TTTATAGCTATGGTTATATTTAGAGAATGAGTGGATTAAATTTTGGTGTC
AAGACTGCTGGGTGGAAATACTAACTAAATGCTTTTATATGTAGGTTAAT
CCGCACACCCACCAGGTTAAATTATGTGACTTCGGAAGTGCAAAAGTCTT
GGTATGTTACATGTGTGTCTGCATGTCTGCTTCATCCTACATTCATTCTC
TTTAACCGTCTGTTGTCTTGAGTTAGATGGTTTATTTTTTTGACTGTATT
TTGGTCCTACTTTTGGCAGGTTAAAGGCGAACCAAATATATCGTACATAT
GTTCTAGATATTATAGAGCACCTGAGCTTATTTTTGGAGCAACTGAATAT
ACTACAGCTATTGATGTCTGGTCTGTTGGTTGTGTTTTGGCTGAGCTGCT
GCTTGGACAGGTTGGTGGCTGTTGATGCGAGCTACTATAGTTTTGTAATT
AAGTACATTTAATTGAAATATTTATATGCTTTTCCCAGCCTTTGTTCCCT
GGTGAGAGTGGAGTTGACCAGCTTGTTGAGATCATCAAGGTATTTTGTTT
TTATACTTTTAACTCCTCATTTTTGCGGATAATATTCTCTTTATTTGCAT
TGCAGTAGTTTTTTTCAGCTTGATATACTTGGATAATAATTCATTTAAGT
TGCAACATTATTGAATGCATGTTGAATTGTTGATATTGTCTTTGCTTTAG
CCTTTTAAAAATGAATTGGTTTAATTGATGAGTTGATCAGCTGGATAGGT
GGCCTTGCTTTTCAAAACGATGCCAGTATCTTATATGTAAATGGTCCATT
TATTGGTTGTTCTGATAGGTTCTGGGAACTCCGACAAGGGAAGAGATTAA
ATGCATGAATCCTAATTATACAGAATTTAAATTCCCCCAAATCAAAGCAC
ATCCATGGCACAAGGTATTAAAATAAATCTTATAGTATTTCATGGTTTTT
TCTTAAGCTCATCTTATTAATGTATTCAGAACTCCTTATTAACCATACTA
CACTAATATGTATACTTGATGAATTTCTTTTACCAGATCTTTCATAAGCG
CATGCCTCCAGAAGCTGTTGATTTGGTATCAAGATTATTACAATACTCCC
CAAACCTGCGGTGCCAAGCTGTGAGTATACGACTTCTTGCAGACCTTTCA
TACCCACCTCCTAAAAAATTACATTAGTGTTTCCCTCAATCATATAATGG
TTCTTCAAGTTTGTATTTGGCAATTTTATGGTGTTTCTAATCTAGTTATT
CAATGGCTGTTTCTCATCCTCTGAGGGCGTATGTATAACATATTTCATGT
ATTGTTGCTTTATGTGGTGCAGTTGGATGCCTTGACCCATCCTTTCTTTG
ATGAGCTTCGTGACCCGAACGCTCGCTTGCCAACTGGTCGTTTCCTTCCA
CCACTGTTTAACTTCAAACCTCACGGTATGTTGATTTTTGAATAGGCTAC
TGTATTTGTGACTTTGGCTATCTTTTGTTTTCATTGATAGTTCTGGGCTT
GTGGCTGAATGTGTTGTTGGTGCTTGTGTACCAGAACTGAAAGGAGTCCC
TGTCGAGACCTTGGTGAAATTGGTTCCAGAGCATGCAAGGAAGCAATGTC
CGTTTCTTGGCTTGTAA
back to top

gene from alignment at Ca_LG_4:1990706..1993772-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_08161_ICC4958_v2 ID=Ca_08161_ICC4958_v2; Name=Ca_08161; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=3067bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_4:1990706..1993772- (Cicer arietinum
ATGGCTTCAGTTGGTGTGGCACCAACTTCTGGTTTGAGAGAAACCAGTGG
TCATGCTGCAGCTGGTGTTGATAGATTGCCAGAGGAAATGAATGATATGA
AAATTAGGGATGATAGAGTATGTTGCTCACTCTATTAATTCTTCAAACTT
TTTTTTTTGTGGGTTGATTTTAAATTTCAGACCCAGTTGCTTACAGCTTG
GTTCTCTTTTAGGAAATGGAAGCTACAGTTGTTGATGGCAATGGAACTGA
GACTGGACATATTATTGTGACTACTATTGGGGGTAGAAATGGTCAGCCAA
AGCAGGTATACCTTTTCCCTCTAGTTTGCTGCTATCAATCGTTTGGGGGG
TTTGATATCATTCAACTCTTGCACTGTCTCACCAGCTTTATATTATTATT
TGTGTGCAAATGTCCGCCCAAATCAGTTGTGATTTTGAATTAGGAATAGT
TACATTTGCCAATGAAGTTGAACTACTAAAAAACGAAAGAAAACTTCAGC
GTTTTGGAATTATGCCTGCTGACTATAATATATTTACAGTGACTAGCATG
AGTAGTTGTATTGTCCAACATGTTTGTGTTGTTTTTGTCTTGTGATTGGC
AAGTATCTTACAAATTGTTAATTAGCAACAATAATGCTCTATGACATATT
AATGATAGGGTGAAAATTTTATATGGTGTGGTCTTATCATATCCTTTGTA
ACTGTATATTGTATATTATGTTTCCCAAATTTTTTATATGTTTTTTTATT
TTTACGTTGGAATAATTTTATATCTTTCTTAATATTTCAGACTATAAGCT
ATATGGCAGAGCGTGTTGTAGGACATGGATCATTTGGAGTTGTCTTCCAG
GTAACAATGTGTATCTTGTCAACTGGCTGACATGACTTGTGTTAGTTTTG
CCTTTTCAGCACAGTAGCATATGATGATTTTAGTTCTGATATCGTTTATG
ATTGTAGGCTAAGTGCTTGGAAACGGGTGAAACTGTGGCTATCAAAAAGG
TTCTTCAAGACAAGAGGTATAAGAACCGGGAACTGCAAACAATGCGCCTT
CTTGATCACCCAAATGTTGTTGCTTTAAAGCATTGTTTCTTTTCAACCAC
TGAAAAGGATGAACTCTACCTTAATTTGGTACTTGAGTATGTCCCTGAAA
CAGTTCATCGCGTGATTAAGCATTACAACAAGTTGAACCAAAGGATGCCA
CTGATTTATGTGAAACTCTATACATACCAGGTATGCCAGTTGCCCTTCCT
TATTCGACTTCTTCCATGTTGTGGTTGTAATGATTTCATTGGTATCTTGC
AGATCTTTAGGGCATTATCTTATATCCATCGTTGTATTGGAGTCTGCCAT
CGGGATATCAAGCCTCAAAATCTATTGGTATGGCCTTGATTGTATTTTCC
ATACAACCCTTTCATTAATTTTCTCTCTCTTTTGGCCCTAGTTCTCATGG
TTTATAGCTATGGTTATATTTAGAGAATGAGTGGATTAAATTTTGGTGTC
AAGACTGCTGGGTGGAAATACTAACTAAATGCTTTTATATGTAGGTTAAT
CCGCACACCCACCAGGTTAAATTATGTGACTTCGGAAGTGCAAAAGTCTT
GGTATGTTACATGTGTGTCTGCATGTCTGCTTCATCCTACATTCATTCTC
TTTAACCGTCTGTTGTCTTGAGTTAGATGGTTTATTTTTTTGACTGTATT
TTGGTCCTACTTTTGGCAGGTTAAAGGCGAACCAAATATATCGTACATAT
GTTCTAGATATTATAGAGCACCTGAGCTTATTTTTGGAGCAACTGAATAT
ACTACAGCTATTGATGTCTGGTCTGTTGGTTGTGTTTTGGCTGAGCTGCT
GCTTGGACAGGTTGGTGGCTGTTGATGCGAGCTACTATAGTTTTGTAATT
AAGTACATTTAATTGAAATATTTATATGCTTTTCCCAGCCTTTGTTCCCT
GGTGAGAGTGGAGTTGACCAGCTTGTTGAGATCATCAAGGTATTTTGTTT
TTATACTTTTAACTCCTCATTTTTGCGGATAATATTCTCTTTATTTGCAT
TGCAGTAGTTTTTTTCAGCTTGATATACTTGGATAATAATTCATTTAAGT
TGCAACATTATTGAATGCATGTTGAATTGTTGATATTGTCTTTGCTTTAG
CCTTTTAAAAATGAATTGGTTTAATTGATGAGTTGATCAGCTGGATAGGT
GGCCTTGCTTTTCAAAACGATGCCAGTATCTTATATGTAAATGGTCCATT
TATTGGTTGTTCTGATAGGTTCTGGGAACTCCGACAAGGGAAGAGATTAA
ATGCATGAATCCTAATTATACAGAATTTAAATTCCCCCAAATCAAAGCAC
ATCCATGGCACAAGGTATTAAAATAAATCTTATAGTATTTCATGGTTTTT
TCTTAAGCTCATCTTATTAATGTATTCAGAACTCCTTATTAACCATACTA
CACTAATATGTATACTTGATGAATTTCTTTTACCAGATCTTTCATAAGCG
CATGCCTCCAGAAGCTGTTGATTTGGTATCAAGATTATTACAATACTCCC
CAAACCTGCGGTGCCAAGCTGTGAGTATACGACTTCTTGCAGACCTTTCA
TACCCACCTCCTAAAAAATTACATTAGTGTTTCCCTCAATCATATAATGG
TTCTTCAAGTTTGTATTTGGCAATTTTATGGTGTTTCTAATCTAGTTATT
CAATGGCTGTTTCTCATCCTCTGAGGGCGTATGTATAACATATTTCATGT
ATTGTTGCTTTATGTGGTGCAGTTGGATGCCTTGACCCATCCTTTCTTTG
ATGAGCTTCGTGACCCGAACGCTCGCTTGCCAACTGGTCGTTTCCTTCCA
CCACTGTTTAACTTCAAACCTCACGGTATGTTGATTTTTGAATAGGCTAC
TGTATTTGTGACTTTGGCTATCTTTTGTTTTCATTGATAGTTCTGGGCTT
GTGGCTGAATGTGTTGTTGGTGCTTGTGTACCAGAACTGAAAGGAGTCCC
TGTCGAGACCTTGGTGAAATTGGTTCCAGAGCATGCAAGGAAGCAATGTC
CGTTTCTTGGCTTGTAA
back to top