Ca_08257, Ca_08257_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview


Name	Ca_08257
Unique Name	Ca_08257_ICC4958_v2
Type	gene
Organism	Cicer arietinum (chickpea)
Sequence length	4181

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
Ca_LG_4	supercontig	Ca_LG_4:3108692..3112872 -	Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	n/a

Analyses

This gene is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	2015-08-11

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Ca_08257.1	Ca_08257.1_ICC4958_v2	Cicer arietinum	mRNA

Sequences

The following sequences are available for this feature:

gene sequence
gene from alignment at Ca_LG_4:3108692..3112872-

gene sequence

>Ca_08257_ICC4958_v2 ID=Ca_08257_ICC4958_v2; Name=Ca_08257; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4181bp
ATGGCTGCTGCTACAAACTCATCAGTATTTCACATATCCAACACCAGACA
CACTTTCTATAAGAGGTATCCGTGCTACAGAGGTCATAGTTCATTCGAAC
TACCTCATTTGAGTTTTGTTAGTCATAGGAATGTCAAGTTGGATTTTGAG
TCCAAAAAATTGGAATGGAAGAGAGGAAGAAGGGAAGAGTTGGAGAGAAA
GAGAACGAAATTGAGTGTGAAGTGTACTGCAGAAGGAATAGATGGAGGAA
TGATTGTGGGAGAAGATGGTATTAATAATGTTATTAGTAATATTCCTGAG
AGGTACAAGGTTGTGTGTTTGGTGGCATGTGTGATGTGTCTTTGTAATGC
TGACCGTGTTGTCATGTCAGTTGCTGTTGTTCCTCTTGCTGCTAAACATG
GTTGGTCTAGTTCTTTTCTTGGCATTGTTCAGGTACTATACATAATAATA
ATCATTCCAAAACTTCTCATCATGAATATAGGAAACTCAACTATATATAT
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TCAATGTCCTGCACCATCACTACACCAATATGTATAGATATATTTAATCA
TTTCCTTTTTTAAGTTATTATCAAGATTTCATTGTTAGTGTCCTGTCTGT
GTAAGTGTTTTACAAAAACTGACACAATTCACATAAGAAGGACAATTCAC
AATTCTAGGGAATGGCTTCGGAAGGAGTACTACTTCTTTGAAAAGAATCA
AATCATTATATTATTACTAATACTTACTAATTAATCAATTTACTAGTGAT
TGGCAGTAAAAAGTTTGTTTTCAAGAATTCAGTTGAAGACAAGCATTTGT
TTTTGTTCAATTCTATACCATGCCCAAACTGGTTTGTAGTTTCTAGAACC
AAGGTTTTTAATAATCTCCGTGTAGAGATCTTTAATATTACAAAGAATCA
CATTCGATGTGGCGGAAACATAAAAAACTTTGATGTTGAGACTCAGATCG
TGGTTGCAGACCTTTTTCTAATACCTTGTCTTAAATGTATAATAGTTTCA
TTTAGTGTCCTATGACTATGATACATGACAGTATCATTTAAAACAAAAAC
CGCTTTCTTCTGTTTTTGTTTGTTTGTGGTGAAGTCACTGGCTAACATAA
AGCTCATATATTTCATGCATTTATCAGTCATCTTTTCTGTGGGGTTACAT
ATTCTCTTCAGTGATTGGAGGAGCTTTGGTAGATAGATATGGAGGAAAAA
GGGTGATGGCTTGTGGTGTATTGTTGTGGTCTTTGGCAACTCTTCTTACA
CCTTTAGCAGCCAACCATTCCACAATAGCCTTGTTGGCAATTCGTGCTTT
CTTTGGACTAGCTGAAGGAGTGGCTCTTCCGTCCATGAGTACTCTCTTAT
CAAGGTGATGCCTCTAGAATCTCCTTAAACATAAATATTTATACATACCT
TGTAAGCCAAATACTGAAAATTTGAGTATTTCAATCATGGTTTAGCTTGT
TTATACTTCAATGTCAAGTTTTTCAATTGCAACCTTATTAGTAGGCTTTT
GTTGTGTATGACTCATAGTTTCCTTATAAGTGGATAAGTTGCTTGAGCAG
TTCAAAAGTAATCTTGTGAACTGAACCGTAGGGTTTAAACACAAGTTGTA
CACTGTAATCCCTCAGCTTGAAATTAATAGAAAGGAACTGCAGTCACTCT
ACAGTCAGAGACATAGACACAATTGGCCGAACTCTGTGATAAAATCTCAT
GTGTTCTTTTTGTTTGCGTTTTTCATTTCTATTTTCTTTTGAACCAAGGT
TGCCGTTCTAACAGTTCTCTATAATTTGAAAGCTGATGTAATCTTTCAAT
TTGAATAGGTGGTTTCCAAATAATGAGAGAGCAACTGCTTTTGGAATTTC
AATGGCTGGATTTCATATTGGCAATGTCATAGGCTTGTTGATAACACCAA
TTATGTTATCCTCTATTGGAATTTATGGTCCATTCATATTATTCTCATTT
CTTGGTTTGCTTTGGGTGATGGCATGGACACATCAAGTTACAGATGATCC
TTTGGAAAGCAATTTCATCAGCAGATCAGAATTAAGATTAATCCAAGCTG
GTAAAATTCTTTCTACAAAAAAGAGTAATAACAAGTTTCCTCCATTAGGC
CTTATTTTATCAAAATTACCATCATGGGCTATAATATTTGCCAATGCAAC
AAACAATTGGGTGAGTTTCTAGTTGCTTTTGTGTGAAAGAGAAGAACTTG
TTATCATAAATCAAATTTTAAGTATACTGATGATGAAACCTTGGTTAATT
TGCAGGGTTACTTTGTTCTCCTCTCTTGGATGCCGGTTTATTTCAAAAGC
GTAATTACTTTCTGTTTGTTCTTGTTACTTATAATAAAAAACAACTTACC
AACGTTACGTTGGTCCGAGTTGAACTCGACTTAGATCCCTGAATCAAGGT
TTTAGGTTCGAGTCAAGTAGATGGAAAAGATGTAGTTTGGATGAGAGAGA
CTCCACTACTTTGCACCCATAATAAATAACATTATGTTGTTGTTTCATAT
ATTGCTTAAAAAATATGGATACTAGAATGAGCTAGCTTGTATGTAAAATA
CACAAGTAAAGGTATATATATTCTTGAAGCTTGCAAAATTCAACATTGGA
CTATTTTTTTTTTTCTGTAGGTGTATAATGTGAATTTGAAGCAGGCAGCA
TGGTTTAGTGCAGTTCCATGGGCAACAATGGCATTTTCAGGTTATCTAGC
TGGTACTGCATCAGATTTCTTAATCAATGCAGGGTACCCTACAACATTTG
TCCGTAAATTAATGCAGGTAACTCTTTCAGCCTCATCACGCCTAAGAATG
TACTTGTATCTCCATAAGAAACATTTTTAAGATTGTGAAAATTTGTATGT
TTGCATTTTGAAGCAATTATAGACCAAAAAAAGCAGATGAAATTCATATT
AACTGGTGGAGACTAAAATATGTAACGCCTCAGAGCTTTTATCATGTAAC
AACATGTTTACCATGTTGTTTTTAGTAATGTATATATGTCCAATTACAGA
CAATTGGATTTATTGGGCCAGCTGTGACCTTGCTATGCTTGAATTATGCA
AATACACCAACAATTGCTGCTACACTCTTGACTGCAGCTTTGAGTTTGAG
CTCTTTCAGCCAAGCTGGATTTATGCTTAACATACAAGTAAGTCTACCAC
ACAAAAATCGAACTTTAACCATTATATTATATATTTAAGACATTTCATTG
AACTTACAAATATAATAGTGAGGCCTTAACCTCACATGCTCACACTTTTT
ACATTTTACATGATCAGGACATTGCTCCTCAGTATGCAGGAATTCTACAT
GGTAAGAAGTTGAGCAAATTTGTTGGAAATGTTCTTTTTTTTTTTTTCCC
TTGTGTTTGGCTTTAATATCTCTCTATTCCATATAATATGCATATTTGTT
TGTTTTAGTTTCTATAACTTTCTTTCGTTCAATTTTAGTCCCTTTAATAT
TGAAAAAGTTGTTTCTGATCTTTATTGTTTATTTCCTATAAACATTTGTG
CATGTTGGAACCAATCCATATGTGAACTTATTCTATTTTAGTCCTTAGAA
TATGATATATATATATATATATATATATATGGACTAATTTCAACATTATC
AAATAATATAAGGACTAAAATCAAAATGATAAAGATCAAAAACAATATTT
CCCATGTTTCAGGAGACTTGAACCTCTATCCTTAGTTTTACGATGTAGCA
AATTGTAGACCATTAGATTAACGGAAAAAATTCATCTAATTAGATTAAAG
AAAAAAATTCATCTAAAGTTCTACAACCGACTAAACCTTAAAATCAATGG
TAGAGGATCCATTTTGTATTTCAGATACTAAAGCCGACAATTTTTTTATA
GAAACAAAAATCAGTAAATGTATATATTTTATGGGCTAAAAAGTAAATTA
AGCCTTTGTTTTTACATCATAGTTCTTCTTTTAACAATAACAAAACTATT
ACAATTTACAGGAATAGCAAATTCAGCTGGAACTTTAGCAGCTATCATAA
GCACAATTGGAACTGGTTATTTTGTCCAATGGTTGGGATCATTTCAGGCA
TTCTTAACTATAACATCAGGTCTCTATGTTGTGACCACCATTTTTTGGAA
TCTTTTTGCCACAGGAGACCAAGTTTTGTGA

gene from alignment at Ca_LG_4:3108692..3112872-

Legend: mRNA

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Ca_08257_ICC4958_v2 ID=Ca_08257_ICC4958_v2; Name=Ca_08257; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4181bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_4:3108692..3112872- (Cicer arietinum
ATGGCTGCTGCTACAAACTCATCAGTATTTCACATATCCAACACCAGACA
CACTTTCTATAAGAGGTATCCGTGCTACAGAGGTCATAGTTCATTCGAAC
TACCTCATTTGAGTTTTGTTAGTCATAGGAATGTCAAGTTGGATTTTGAG
TCCAAAAAATTGGAATGGAAGAGAGGAAGAAGGGAAGAGTTGGAGAGAAA
GAGAACGAAATTGAGTGTGAAGTGTACTGCAGAAGGAATAGATGGAGGAA
TGATTGTGGGAGAAGATGGTATTAATAATGTTATTAGTAATATTCCTGAG
AGGTACAAGGTTGTGTGTTTGGTGGCATGTGTGATGTGTCTTTGTAATGC
TGACCGTGTTGTCATGTCAGTTGCTGTTGTTCCTCTTGCTGCTAAACATG
GTTGGTCTAGTTCTTTTCTTGGCATTGTTCAGGTACTATACATAATAATA
ATCATTCCAAAACTTCTCATCATGAATATAGGAAACTCAACTATATATAT
GAAACTAACACTTCAGATCAAAGACGTGATTGTGTACTGTCTGACATGTG
TCAATGTCCTGCACCATCACTACACCAATATGTATAGATATATTTAATCA
TTTCCTTTTTTAAGTTATTATCAAGATTTCATTGTTAGTGTCCTGTCTGT
GTAAGTGTTTTACAAAAACTGACACAATTCACATAAGAAGGACAATTCAC
AATTCTAGGGAATGGCTTCGGAAGGAGTACTACTTCTTTGAAAAGAATCA
AATCATTATATTATTACTAATACTTACTAATTAATCAATTTACTAGTGAT
TGGCAGTAAAAAGTTTGTTTTCAAGAATTCAGTTGAAGACAAGCATTTGT
TTTTGTTCAATTCTATACCATGCCCAAACTGGTTTGTAGTTTCTAGAACC
AAGGTTTTTAATAATCTCCGTGTAGAGATCTTTAATATTACAAAGAATCA
CATTCGATGTGGCGGAAACATAAAAAACTTTGATGTTGAGACTCAGATCG
TGGTTGCAGACCTTTTTCTAATACCTTGTCTTAAATGTATAATAGTTTCA
TTTAGTGTCCTATGACTATGATACATGACAGTATCATTTAAAACAAAAAC
CGCTTTCTTCTGTTTTTGTTTGTTTGTGGTGAAGTCACTGGCTAACATAA
AGCTCATATATTTCATGCATTTATCAGTCATCTTTTCTGTGGGGTTACAT
ATTCTCTTCAGTGATTGGAGGAGCTTTGGTAGATAGATATGGAGGAAAAA
GGGTGATGGCTTGTGGTGTATTGTTGTGGTCTTTGGCAACTCTTCTTACA
CCTTTAGCAGCCAACCATTCCACAATAGCCTTGTTGGCAATTCGTGCTTT
CTTTGGACTAGCTGAAGGAGTGGCTCTTCCGTCCATGAGTACTCTCTTAT
CAAGGTGATGCCTCTAGAATCTCCTTAAACATAAATATTTATACATACCT
TGTAAGCCAAATACTGAAAATTTGAGTATTTCAATCATGGTTTAGCTTGT
TTATACTTCAATGTCAAGTTTTTCAATTGCAACCTTATTAGTAGGCTTTT
GTTGTGTATGACTCATAGTTTCCTTATAAGTGGATAAGTTGCTTGAGCAG
TTCAAAAGTAATCTTGTGAACTGAACCGTAGGGTTTAAACACAAGTTGTA
CACTGTAATCCCTCAGCTTGAAATTAATAGAAAGGAACTGCAGTCACTCT
ACAGTCAGAGACATAGACACAATTGGCCGAACTCTGTGATAAAATCTCAT
GTGTTCTTTTTGTTTGCGTTTTTCATTTCTATTTTCTTTTGAACCAAGGT
TGCCGTTCTAACAGTTCTCTATAATTTGAAAGCTGATGTAATCTTTCAAT
TTGAATAGGTGGTTTCCAAATAATGAGAGAGCAACTGCTTTTGGAATTTC
AATGGCTGGATTTCATATTGGCAATGTCATAGGCTTGTTGATAACACCAA
TTATGTTATCCTCTATTGGAATTTATGGTCCATTCATATTATTCTCATTT
CTTGGTTTGCTTTGGGTGATGGCATGGACACATCAAGTTACAGATGATCC
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GTAAAATTCTTTCTACAAAAAAGAGTAATAACAAGTTTCCTCCATTAGGC
CTTATTTTATCAAAATTACCATCATGGGCTATAATATTTGCCAATGCAAC
AAACAATTGGGTGAGTTTCTAGTTGCTTTTGTGTGAAAGAGAAGAACTTG
TTATCATAAATCAAATTTTAAGTATACTGATGATGAAACCTTGGTTAATT
TGCAGGGTTACTTTGTTCTCCTCTCTTGGATGCCGGTTTATTTCAAAAGC
GTAATTACTTTCTGTTTGTTCTTGTTACTTATAATAAAAAACAACTTACC
AACGTTACGTTGGTCCGAGTTGAACTCGACTTAGATCCCTGAATCAAGGT
TTTAGGTTCGAGTCAAGTAGATGGAAAAGATGTAGTTTGGATGAGAGAGA
CTCCACTACTTTGCACCCATAATAAATAACATTATGTTGTTGTTTCATAT
ATTGCTTAAAAAATATGGATACTAGAATGAGCTAGCTTGTATGTAAAATA
CACAAGTAAAGGTATATATATTCTTGAAGCTTGCAAAATTCAACATTGGA
CTATTTTTTTTTTTCTGTAGGTGTATAATGTGAATTTGAAGCAGGCAGCA
TGGTTTAGTGCAGTTCCATGGGCAACAATGGCATTTTCAGGTTATCTAGC
TGGTACTGCATCAGATTTCTTAATCAATGCAGGGTACCCTACAACATTTG
TCCGTAAATTAATGCAGGTAACTCTTTCAGCCTCATCACGCCTAAGAATG
TACTTGTATCTCCATAAGAAACATTTTTAAGATTGTGAAAATTTGTATGT
TTGCATTTTGAAGCAATTATAGACCAAAAAAAGCAGATGAAATTCATATT
AACTGGTGGAGACTAAAATATGTAACGCCTCAGAGCTTTTATCATGTAAC
AACATGTTTACCATGTTGTTTTTAGTAATGTATATATGTCCAATTACAGA
CAATTGGATTTATTGGGCCAGCTGTGACCTTGCTATGCTTGAATTATGCA
AATACACCAACAATTGCTGCTACACTCTTGACTGCAGCTTTGAGTTTGAG
CTCTTTCAGCCAAGCTGGATTTATGCTTAACATACAAGTAAGTCTACCAC
ACAAAAATCGAACTTTAACCATTATATTATATATTTAAGACATTTCATTG
AACTTACAAATATAATAGTGAGGCCTTAACCTCACATGCTCACACTTTTT
ACATTTTACATGATCAGGACATTGCTCCTCAGTATGCAGGAATTCTACAT
GGTAAGAAGTTGAGCAAATTTGTTGGAAATGTTCTTTTTTTTTTTTTCCC
TTGTGTTTGGCTTTAATATCTCTCTATTCCATATAATATGCATATTTGTT
TGTTTTAGTTTCTATAACTTTCTTTCGTTCAATTTTAGTCCCTTTAATAT
TGAAAAAGTTGTTTCTGATCTTTATTGTTTATTTCCTATAAACATTTGTG
CATGTTGGAACCAATCCATATGTGAACTTATTCTATTTTAGTCCTTAGAA
TATGATATATATATATATATATATATATATGGACTAATTTCAACATTATC
AAATAATATAAGGACTAAAATCAAAATGATAAAGATCAAAAACAATATTT
CCCATGTTTCAGGAGACTTGAACCTCTATCCTTAGTTTTACGATGTAGCA
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TAGAGGATCCATTTTGTATTTCAGATACTAAAGCCGACAATTTTTTTATA
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ACAATTTACAGGAATAGCAAATTCAGCTGGAACTTTAGCAGCTATCATAA
GCACAATTGGAACTGGTTATTTTGTCCAATGGTTGGGATCATTTCAGGCA
TTCTTAACTATAACATCAGGTCTCTATGTTGTGACCACCATTTTTTGGAA
TCTTTTTGCCACAGGAGACCAAGTTTTGTGA

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