Ca_09539, Ca_09539_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_09539
Unique NameCa_09539_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length5481
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_4supercontigCa_LG_4:19188979..19194459 -Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_09539.1Ca_09539.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_09539_ICC4958_v2 ID=Ca_09539_ICC4958_v2; Name=Ca_09539; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5481bp
GCTGGTATTTATAAGGTGATTGATATTGATGTAGCCACATGTTTCTCTCT
CAAGCACAGTTAGTTTGGTATTATTGATTCTCACATTTTAAGTTTCTTGC
ATTCTTTCTTCCGTTTTCTTGACATTTGACACTTTGAAGAAAGAAACAGA
AAAATGCAGTCAAGCCCTTTGCTTCTTGAGGAACCCATTAGGATGGCTTC
TATCTTAGAGCCATCCAAACCTGTCAGTAACTCTCTCTATCTCTCTATTT
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AATGTTAATGTGATGATTTGTTTGTATCTTGGATAAGATGTGTTGTGTTT
TGTTTCTGCTGATCTTGTCTTCTTTTCAGCACTGTCATTCTTTTTCTTTG
CTAAGGAATTTCATGGATCCTGTGTGTGGCTGATGTTGATTGCTAAGAGG
GTGATGTTCTTGGTGTCTTGGCAAAATCTTGTTTAGTTAGAATTTGCTAA
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AATGAGGTGTTGAATGGATGTATGGAAATTATGGGTGTATGTGTATCATT
GTTGTTTAATTTAATGGAGGCGGTAATGTAAGTAATTTTGTCTTTAGATT
GTTTCATTGTTTTTCATATTTGTTTTGGTTAACCAAGAGAAATATTTGTC
TTTGTGGCATGGAAATGAAGCATATATAGTCTTAAGATATTAAAACAAAG
GGTTTATATACATTTCCTAGAGATTCTTTTACTATCTTTATTCAATGAAG
AATTTCAATGTCTTTTCAAGATTTTGATCAAAGTTTAAAATGCTTTCTAT
TTCTGCAGAGTTTCTTTCCGGCTATGACAAAAATTATAGGGACACTTGGT
TCAGAGTCACGATCTGTTGATATAATTACCCGATGTCTTCATGCAGGAAT
GTCTGGTATCATTCCATTAAAACCTTTCACTGTTTGTGATCTTTATTCAG
AAGTTAATAAATGATTTTTGGTTAAGGATAATATGGTGAAAGATTTGTGG
TTATTTTGTTTCTCCTGTTGCTATGTTGGAAGGTTTTGTTGTCTCCAAAA
CAAGCATAACATATTGGCTCTTTGCTTGTTGCAGCTTTTTTTTCTTCTTC
ATTTTTTTGGAAAATACACATCATGAATGAGTTCAACAATAGTTTTTTTT
TATTTTTTATTGTTCTTCAATTATAGTCTGGTGTGGCACTTGCATGTCTA
TAGTCTTTGTTGAGTATGACTCATACTTATAGATAAGTAGGCAGGTCGCT
TGACTGAAGCGAGGTATTGCAACCACTCTGTAGCAAGAGACGTAGGCACA
ATTGGCCAAATTTAGTGATCAAATCTCGTGTATTCATTGTTTTTGTTTTT
TTTCGTATCTTTATTCTATTTAACCAGGGTTGTTGTTCTAACGATCTGCT
TTTGAGGCATTTGTTTTGTCATCTTATTATTCTTTTCTTACTATGTGCTA
GTGGCAAGGTTTGATTTCTCATGGGGGGATCCAAAATACCACCAAGAAAC
ATTGGAAAATTTAAGGGCTGCTATCAAAAGCTCAAACAAACTCTGCGCGG
TAAAACTTGCCACAAGTTTGTTTTTAATATACTAGCTTCTATCCAATGTA
TCTTCTACATGTGCAAAATACCTTCTGAAGGGTAATTAATGCAACAATGT
ACATGCATTTTGGTCCAATTTCAGGTTATGCTAGATACTGTGGGTCCAGA
ATTACAAGTTGTCAATACAACCGATCGCCCAATTACTCTTGAAGAAGACA
CATTCCTTGTTTTAACTCCGGATCAAACCAAAGAAGCTACTTCAAATCTA
TTACCAGTCAATTTTAGCGGGCTAGCAAAGGTCTATAGACATTTTCCATG
TTTTTTTCGTTATCACGGAAGTTTTTGGGACTACATGTTTACTTTTAGTA
ACTTTCATATTGTCCTTGATTATGTGTACTGCAATGTGATCCCACTTTAA
CTAAGGTATTCATGATTATGCAGGATGTGAAGAAGGGTGATACTATTTTT
ATCGGTAAATACTTGTTCACAGGAAGTGAAACAACTTCTGTATGGCTCGA
GGTAATGCAGTCATCAAAGTTAATATATATTTAGAAAACTGAACTTTTCT
CCAAAGTATTCTTTGGGTCCTATATGAAACATAATGCAGAAAATAGAATA
TTGCTGATACTCAAAGTTAGAATCAGTCCGTTTTGTAGTCTAAGTAGTAC
ATGTTTCACGACGCAGGTCAATGAGGTGGATGGCGAAGATGTATCTTGTC
TTATAAAAAACAGCGCTACACTTTCTGGATCACTGTATACTCTACATGTC
TCTCAAATTCGTATTGATCTTCCTACTCTTACGGATAAGGATAAAGAGGT
AACAAAAAGAACTGTGTACATAAAGTAGTGAAATTGACAAAATGTGGTTG
AGTTGCCTATATACTTTGGCTTCTCGAGAATAAATTTTTAACATTTTTGT
ATCTATATATTATTTATGAGAAAAACTGAATTATATTATGTTGTCGTAAA
ATGACTTATCTTTTTGTTAGTCTTTAATTACGGAAAATGATTTTTTCTTT
GGAAAATCAAAAGATTAAATGTAAGTGTACTGCTGTTTACACAATTAATG
AGATAAATTCTAATATCTGTTGCATCAATTACAAAAGTAAAACTGGTTTA
GTTGACCGTTTTACGGTCATGAATGGTATACCATTTTGTTATTATCTTGC
AATTTTATGATAATATAAATGTTTCTCTTGACTAACTCAGGTAATACGTA
CATGGGGTGTTAAAAACAAAATTGACTTCCTCGCCTTATACACCCGGCAC
GCTGAAGATGTTCGCCATGTAAGAGATACACCTGATAGTTTTTATGTTCT
CTAATTTGTTGTTTTTATCATCTATATATTATTTGTTTTCGTCATGCTTC
ATACATTTAACTTTCAACTTATAACTTTGCTTAGAGTCGTCAATGAAGTG
AATCATTTGCATTTTTGTATTCCTCACTGTTAGAAAACACAAACAATACC
TCCAATGTTCATTTGCAGGCCCGTGAGTTTATCTCCACATTCGAAGGCCT
CAAGCAGACACATATTTTTGCAAAGATTGAAAATATAGAGGTAAGAAGCT
CCAAGATCCATGAAAAATAGACTCTCTTGTTTTATACTAACCAGAAAAAT
GCTGTAGTTCAAAGTCTTTTGATGACTGTGCTCAATTGTGATTGAAAAAT
TAATCGTTCTTCTGTAAAATTCGTATAGGGATTGAATCATTTTGATGAGA
TACTGAGAGAAGCCGATGGTGTCATCATCTCTCGCGGAAATTTAGGGATA
GATCTCCCACCTGAGAAGGTCAGTGTCAGAAAAATATTGTGTTATAGATG
ATTTACTTGTAGTAGTGACATAATAGCTATGTTTCCATTTTGTTTATTTA
TATTTTTTAGTATCACAGGGAGATTTTGTCTGCATAATTATGGCTTTTAC
AGCGTTCGTTCCTCTCTCGGATATAAGTGTGAATAGAATCCTGAATATGT
ATGTTTTGATTTGGCAGGTGTTTTTATTCCAAAAAGCTGCTATTTATAAG
TGTAACATGGCCGGAAAGCCGGTTGTTGTCACACGTGTGGTAGATTCTAT
GACTAATAATCTGAGACCAACTCGTGCTGAAGCAACCGATGTTGCCAATG
CAGTGTTGGATGGTAATTTTACCCCCTGATCTCAGCTCCTTTTTTGTCAT
ATTTAAAGAGTACTGTATAATACATGACATGTTTCTGTTATTGCTATTCA
TCTACATTAATATTCCTTTAGTTTATTGTGTTCATCACATTATGCATAAA
TAAATATGATTCGCAACTTTCATGTCTAAATTTTCTTCTTTCTTTTATAT
CAGGCAGTGATGCAATTCTCCTTGGGGCTGAGACTTTAACAGGATTATAC
CCTGTAGAAACCATTTCTATAGTTGGAAAAATTTGTGCTGAAGTAAGTTT
GTGCTTTACTTTTAAACAACATTCCTATCACACTAAAGGAATGTTCAATT
TTGCATTCATAGAAGTTTTCTGGTTTTATCCATCTCACATTCACCGTTGT
TTCACACGTAATTGTTTTCTTGTTGTTCTGTGAAAGGATAAATGTTAAAT
GATTATTCTGCTGCTGTGTCCAGGCAGAGAAAGTTTACAATCAAGATTTG
TATTTTAAGAAGACTGTCAAGCACGTGGGAGAGCCAATGAGCCACTTAGA
ATCAATAGCATCCTCTGCGGTACATTTCTTAGTTGCATTACTATTTTTTT
TTTCCCACCAACATTATTCTATATTCATTTGCTCAAAGAACTATATACTA
ATTGAAGTATATATTTGAAAGTAAACTTCTTTTTGCCGAAACATACAGGT
TCGCGCGGCCATCAAGGTTAAAGCTTCTGTTATCATTTGCTTCACCTCAT
CTGGAAGGGCTGCAAGGTTTCATTTCATTTTATCTCCTTCTATGATTTTC
CTTTATTAAAAAGACTTCTCATATTTGGTATACTGATACAAGATTTCACT
TTTTTTCTTTCTTTCAGTATTTATTTAGTCATGTTCAATTCTGTTGCAAT
TTTGGTATCTTCCTGACATATCATTAACAACTTGATTTTATGTGTATTTA
TATAGGTTGCTTGCTAAGTACAGACCAACCATGCCAGTGATATCTGTTGT
TATTCCTCAATTGAAGACAAATCAGCTCCGGTGGACATTCACAGGTGCTT
TTCAGGTACATAATCAACAATAGCATTACATTAGTTGAAACTACATTAAG
TAACTTAAAGTTTGTCTTTGTTTGACTTACACATTACTTGACATTGAAAT
TAACAAGTTTTTGTTGCTGTCATGTTTCATTTTATGAACTTATGGCAGGC
TAGGCAATCTCTTATCGTGAGAGGTCTTTTCCCTATGCTGGCGGATCCTC
GACACCCTGTAAGAATTATTCAATGTTGGAAAAATATTAAAACCTAAGAT
GGAAAAGTGTTGTTTTTGTCATCTTTCACGTTAGAGCTATGAAACTCAAG
TGAAATTGTCTTTTGCTTGCAGGCTGAGTTTAATAGTGGAACAAATGAAT
CAATTTTGAAGGCTGCTTTAGACCATGGCAAGGCTTTTGGCATCATAAAA
CCACATGATAGAATTGTTATTTGCCAGAAAGTTGGTGACTCATCAGTTGT
GAAGATTATTGAGCTTGATGATTAGAAATTTTGTGGTCTCACCCATTTTG
CTAATTTGAGTCATGTAATAGAGTTGTACTAGTTGTTGGGTAATAAAATG
GCTGTGTAGCTTCTTCTCCTTTGTTTGTTTGAGTGTTTTAAGAGGCAACT
ATAGATTTGAGCTATAATGGTATGATAATTG
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gene from alignment at Ca_LG_4:19188979..19194459-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_09539_ICC4958_v2 ID=Ca_09539_ICC4958_v2; Name=Ca_09539; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5481bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_4:19188979..19194459- (Cicer arietinum
GCTGGTATTTATAAGGTGATTGATATTGATGTAGCCACATGTTTCTCTCT CAAGCACAGTTAGTTTGGTATTATTGATTCTCACATTTTAAGTTTCTTGC ATTCTTTCTTCCGTTTTCTTGACATTTGACACTTTGAAGAAAGAAACAGA AAAATGCAGTCAAGCCCTTTGCTTCTTGAGGAACCCATTAGGATGGCTTC TATCTTAGAGCCATCCAAACCTGTCAGTAACTCTCTCTATCTCTCTATTT CAAGTGTTCTTCTGTTGTTTTGGTGATTATGCTATTCATGGCTGAGTGCT AAAGGAATTTGGCAGATCTATTTGGAAGTTTGACTGTCATCTAGTTGAAA AATGTTAATGTGATGATTTGTTTGTATCTTGGATAAGATGTGTTGTGTTT TGTTTCTGCTGATCTTGTCTTCTTTTCAGCACTGTCATTCTTTTTCTTTG CTAAGGAATTTCATGGATCCTGTGTGTGGCTGATGTTGATTGCTAAGAGG GTGATGTTCTTGGTGTCTTGGCAAAATCTTGTTTAGTTAGAATTTGCTAA GGAGAGACATTGGACAATTTATTTAATTTAATTTTGAAAAATGTTTGGTG TGTATCCATAGGGTGTATACACCTTGAGTTTTAAAGAGATAAAAAGAGAA AATGAGGTGTTGAATGGATGTATGGAAATTATGGGTGTATGTGTATCATT GTTGTTTAATTTAATGGAGGCGGTAATGTAAGTAATTTTGTCTTTAGATT GTTTCATTGTTTTTCATATTTGTTTTGGTTAACCAAGAGAAATATTTGTC TTTGTGGCATGGAAATGAAGCATATATAGTCTTAAGATATTAAAACAAAG GGTTTATATACATTTCCTAGAGATTCTTTTACTATCTTTATTCAATGAAG AATTTCAATGTCTTTTCAAGATTTTGATCAAAGTTTAAAATGCTTTCTAT TTCTGCAGAGTTTCTTTCCGGCTATGACAAAAATTATAGGGACACTTGGT TCAGAGTCACGATCTGTTGATATAATTACCCGATGTCTTCATGCAGGAAT GTCTGGTATCATTCCATTAAAACCTTTCACTGTTTGTGATCTTTATTCAG AAGTTAATAAATGATTTTTGGTTAAGGATAATATGGTGAAAGATTTGTGG TTATTTTGTTTCTCCTGTTGCTATGTTGGAAGGTTTTGTTGTCTCCAAAA CAAGCATAACATATTGGCTCTTTGCTTGTTGCAGCTTTTTTTTCTTCTTC ATTTTTTTGGAAAATACACATCATGAATGAGTTCAACAATAGTTTTTTTT TATTTTTTATTGTTCTTCAATTATAGTCTGGTGTGGCACTTGCATGTCTA TAGTCTTTGTTGAGTATGACTCATACTTATAGATAAGTAGGCAGGTCGCT TGACTGAAGCGAGGTATTGCAACCACTCTGTAGCAAGAGACGTAGGCACA ATTGGCCAAATTTAGTGATCAAATCTCGTGTATTCATTGTTTTTGTTTTT TTTCGTATCTTTATTCTATTTAACCAGGGTTGTTGTTCTAACGATCTGCT TTTGAGGCATTTGTTTTGTCATCTTATTATTCTTTTCTTACTATGTGCTA GTGGCAAGGTTTGATTTCTCATGGGGGGATCCAAAATACCACCAAGAAAC ATTGGAAAATTTAAGGGCTGCTATCAAAAGCTCAAACAAACTCTGCGCGG TAAAACTTGCCACAAGTTTGTTTTTAATATACTAGCTTCTATCCAATGTA TCTTCTACATGTGCAAAATACCTTCTGAAGGGTAATTAATGCAACAATGT ACATGCATTTTGGTCCAATTTCAGGTTATGCTAGATACTGTGGGTCCAGA ATTACAAGTTGTCAATACAACCGATCGCCCAATTACTCTTGAAGAAGACA CATTCCTTGTTTTAACTCCGGATCAAACCAAAGAAGCTACTTCAAATCTA TTACCAGTCAATTTTAGCGGGCTAGCAAAGGTCTATAGACATTTTCCATG TTTTTTTCGTTATCACGGAAGTTTTTGGGACTACATGTTTACTTTTAGTA ACTTTCATATTGTCCTTGATTATGTGTACTGCAATGTGATCCCACTTTAA CTAAGGTATTCATGATTATGCAGGATGTGAAGAAGGGTGATACTATTTTT ATCGGTAAATACTTGTTCACAGGAAGTGAAACAACTTCTGTATGGCTCGA GGTAATGCAGTCATCAAAGTTAATATATATTTAGAAAACTGAACTTTTCT CCAAAGTATTCTTTGGGTCCTATATGAAACATAATGCAGAAAATAGAATA TTGCTGATACTCAAAGTTAGAATCAGTCCGTTTTGTAGTCTAAGTAGTAC ATGTTTCACGACGCAGGTCAATGAGGTGGATGGCGAAGATGTATCTTGTC TTATAAAAAACAGCGCTACACTTTCTGGATCACTGTATACTCTACATGTC TCTCAAATTCGTATTGATCTTCCTACTCTTACGGATAAGGATAAAGAGGT AACAAAAAGAACTGTGTACATAAAGTAGTGAAATTGACAAAATGTGGTTG AGTTGCCTATATACTTTGGCTTCTCGAGAATAAATTTTTAACATTTTTGT ATCTATATATTATTTATGAGAAAAACTGAATTATATTATGTTGTCGTAAA ATGACTTATCTTTTTGTTAGTCTTTAATTACGGAAAATGATTTTTTCTTT GGAAAATCAAAAGATTAAATGTAAGTGTACTGCTGTTTACACAATTAATG AGATAAATTCTAATATCTGTTGCATCAATTACAAAAGTAAAACTGGTTTA GTTGACCGTTTTACGGTCATGAATGGTATACCATTTTGTTATTATCTTGC AATTTTATGATAATATAAATGTTTCTCTTGACTAACTCAGGTAATACGTA CATGGGGTGTTAAAAACAAAATTGACTTCCTCGCCTTATACACCCGGCAC GCTGAAGATGTTCGCCATGTAAGAGATACACCTGATAGTTTTTATGTTCT CTAATTTGTTGTTTTTATCATCTATATATTATTTGTTTTCGTCATGCTTC ATACATTTAACTTTCAACTTATAACTTTGCTTAGAGTCGTCAATGAAGTG AATCATTTGCATTTTTGTATTCCTCACTGTTAGAAAACACAAACAATACC TCCAATGTTCATTTGCAGGCCCGTGAGTTTATCTCCACATTCGAAGGCCT CAAGCAGACACATATTTTTGCAAAGATTGAAAATATAGAGGTAAGAAGCT CCAAGATCCATGAAAAATAGACTCTCTTGTTTTATACTAACCAGAAAAAT GCTGTAGTTCAAAGTCTTTTGATGACTGTGCTCAATTGTGATTGAAAAAT TAATCGTTCTTCTGTAAAATTCGTATAGGGATTGAATCATTTTGATGAGA TACTGAGAGAAGCCGATGGTGTCATCATCTCTCGCGGAAATTTAGGGATA GATCTCCCACCTGAGAAGGTCAGTGTCAGAAAAATATTGTGTTATAGATG ATTTACTTGTAGTAGTGACATAATAGCTATGTTTCCATTTTGTTTATTTA TATTTTTTAGTATCACAGGGAGATTTTGTCTGCATAATTATGGCTTTTAC AGCGTTCGTTCCTCTCTCGGATATAAGTGTGAATAGAATCCTGAATATGT ATGTTTTGATTTGGCAGGTGTTTTTATTCCAAAAAGCTGCTATTTATAAG TGTAACATGGCCGGAAAGCCGGTTGTTGTCACACGTGTGGTAGATTCTAT GACTAATAATCTGAGACCAACTCGTGCTGAAGCAACCGATGTTGCCAATG CAGTGTTGGATGGTAATTTTACCCCCTGATCTCAGCTCCTTTTTTGTCAT ATTTAAAGAGTACTGTATAATACATGACATGTTTCTGTTATTGCTATTCA TCTACATTAATATTCCTTTAGTTTATTGTGTTCATCACATTATGCATAAA TAAATATGATTCGCAACTTTCATGTCTAAATTTTCTTCTTTCTTTTATAT CAGGCAGTGATGCAATTCTCCTTGGGGCTGAGACTTTAACAGGATTATAC CCTGTAGAAACCATTTCTATAGTTGGAAAAATTTGTGCTGAAGTAAGTTT GTGCTTTACTTTTAAACAACATTCCTATCACACTAAAGGAATGTTCAATT TTGCATTCATAGAAGTTTTCTGGTTTTATCCATCTCACATTCACCGTTGT TTCACACGTAATTGTTTTCTTGTTGTTCTGTGAAAGGATAAATGTTAAAT GATTATTCTGCTGCTGTGTCCAGGCAGAGAAAGTTTACAATCAAGATTTG TATTTTAAGAAGACTGTCAAGCACGTGGGAGAGCCAATGAGCCACTTAGA ATCAATAGCATCCTCTGCGGTACATTTCTTAGTTGCATTACTATTTTTTT TTTCCCACCAACATTATTCTATATTCATTTGCTCAAAGAACTATATACTA ATTGAAGTATATATTTGAAAGTAAACTTCTTTTTGCCGAAACATACAGGT TCGCGCGGCCATCAAGGTTAAAGCTTCTGTTATCATTTGCTTCACCTCAT CTGGAAGGGCTGCAAGGTTTCATTTCATTTTATCTCCTTCTATGATTTTC CTTTATTAAAAAGACTTCTCATATTTGGTATACTGATACAAGATTTCACT TTTTTTCTTTCTTTCAGTATTTATTTAGTCATGTTCAATTCTGTTGCAAT TTTGGTATCTTCCTGACATATCATTAACAACTTGATTTTATGTGTATTTA 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