Ca_10012, Ca_10012_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview


Name	Ca_10012
Unique Name	Ca_10012_ICC4958_v2
Type	gene
Organism	Cicer arietinum (chickpea)
Sequence length	4308

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
Ca_LG_4	supercontig	Ca_LG_4:24751880..24756187 -	Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	n/a

Analyses

This gene is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	2015-08-11

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Ca_10012.1	Ca_10012.1_ICC4958_v2	Cicer arietinum	mRNA

Sequences

The following sequences are available for this feature:

gene sequence
gene from alignment at Ca_LG_4:24751880..24756187-

gene sequence

>Ca_10012_ICC4958_v2 ID=Ca_10012_ICC4958_v2; Name=Ca_10012; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4308bp
TACCCTCCTTTTTTTTCTTCCTTCTATACCGTTCTTCCTCCACTTTTCAA
CCTCTGAACCAAAATTTTATATCTTTTCCTCATTCTCTTATACCCTTTAC
AAACTTCTTCAAAACCACTTTTTTATTTTTTTAGTTATTTTTGTTACTCT
ACAAGAGCTACAAACAGTGGTTCTTGTATTCTATTCTTGAACTTTTTTTT
TTCTTTCTCTTCTGCCATGGCTGTGACACAGTTTAAAAACCCCACTTGCT
CAAAAACCCAACTTTATTCATCACAACTCTCATTTCTATCTAAGACTCTA
CCTAGGCGCCATCACTGTACTTTTGCACCACTTCACAGAACTCAGCATGC
CAGAATTTCTTGTTCTGTTGCGCCAAAGTGAGCAACTTTATTCTTTTTCA
TTCAACTTTATGTTTATTAAGCTACTTGGGTATGAATCAATTTTCTTACT
TTTTATTTTCAGTCAAGTGCAGGTGCCAGCTGCACAATTCCAGGATCCTA
AGAGTAAGCCTGATTGCTATGGTGTGTTTTGCCTTACCTATGATTTGAAG
GCTGTGAGTATTCCTTCCTACTCTTCTCTATTTATTCATGAATGTATATA
TGTTGTTTCAGCTTGTTTTGTATCCAAATTCTGGGTTCATGATTCTGTGA
TTAATATATGTTTTGTTGGGTATTTGGGAGCAGAATTTTGTTTTAAGGAT
CACCGGTGGTGTTTGTCAATATATGCATGTTGATGCACATTTTGCCTTTT
TATTTTATCATGTATATTGGCTAGAAGCTGAACTTCAGATTAAAGACATT
TCAGATTAAAGACATATTTGAGTGTCCAACATGTGTCGGTGTTTCATACT
GACACTTGTAATTACATATGATCGCTTGTATTTTCTCAAATTATTACGGG
TGTGTGTTGATGTGTGTTGTGTCTGGTGTCCGTGATTGTGTCAGTGATTC
ATAATTTGTACCTAGCTGGATTCTTCCTCTTTTGTGAAGAAAGTTATTGG
CTGTTTCCCATATCAAAACTGTGTTTCTCATTGATGCCAAAATGCAGGAT
TTAATAAGTTTTTTACTTCATTACTATTTAGTCATAAAGCTTCTACTAAG
TAAAATTTCAATCTTCTTGATGTAATAGGAGGTCACCAATATTTGAGGAA
AGTCTAAAAGAAATCTGTAACAAGTATCTTTTATAGTTGATGTATGAGCA
GTTTACGATCAAATGTCTTAAACAATGTGGAGTTAATCCATCGATTCGTC
CTCCACGTGATGGCAATTTAAATAGCTACCCTAATCCTATTAATTCCTCT
AGATACAACGATTCGCCATCTTAGAACTAAATCCTTTGTTTCATTTGGCA
TCCTTTCAAATTTTCCACGATTCTACTTAATGTAACGATTATATTAGTCT
AGGTGTTAATATCTTTGGGAATATGGTGTGACAGGACTAGGATGACAATG
CATCCTTGCTTTAGTAACTTGTAACAATGACTTTCCAGGGTTCTGTTTTT
ATATTCAAAATTTGATATCCAATCTAATGGCTCATTGATGCCAGAACACA
GTTAAATTTAACAATCTATGCTATATGTGTTGATGTCTTGTGGACGCATT
TGGCTAATGTGTTTACAGGAAGAAGAGACAAAATCCTGGAAGAAATTAAT
TAACATTGCAGTCTCAGGTGCTGCTGGAATGATTTCTAATCATTTACTTT
TCAAGGTGAGACTCTCTTGGATTTAAATCAGGACCGTGTTGGTAAATCAG
AGAGTTTAATCTTGCATCTACTTGGAGGTTTCTTTTTACAAGGGATGCAC
TATCTTTAATGGTCAAAATTTAGTTTCATTATGAGTTAATTTCTTATGTC
AGCTTGCATCTGGTGAAGTTTTTGGTCCAAATCAACCTATTGCTCTAAAA
TTATTAGGATCAGAAAGGTCAATACAAGCTCTTGAAGGTAAGCTTCCTAC
ATGCGTATTATACGAGTACGCCCCCGTTTTTGGAGTATAAATGTATCATA
GGATATGATTGTTCTAATTCAACATGCAGGTGTTGCGATGGAACTGGAGG
ACTCATTGTTTCCTTTGCTGAGGGAGGTTATTATTAGCATTGATCCTTAT
GAGGTGTTCCAAGATGCAGAATGGGCTTTGCTAATAGGTGCAAAGCCTCG
AGGACCTGGAATAGAGCGTGCAGCTTTGCTAGACATAAATGGACAGATTT
TTGCAGAGCAGGTAAATTGGTATTCAAAATTTAAGCCATGTCTAAAGTTT
TCTGCTATAAGACAATTTATATTATTGACACTGTATCTTACCATGTGTAC
AACAGGGACAAGCACTAAACGCTGTCGCATCGCGCAATGTCAAAGTTATA
GTTGTGGGAAACCCTTGCAATACAAAGTCAGCTTGGTGCTTCATGTGTAA
ACTAGAAGTTGTGCCTTGTTGCTCCTAATGTTGCTAATGTTCATGTGTAT
CTTAATGCAGTGCATTAATATGCTTGAAGAATGCTCCAAATATTCCCGCA
AAAAATTTCCATGCTTTAACTCGTTTAGATGAGAACAGAGCAAAATGTCA
GGTAACAAAGCATATAAACTTCATTATTACATAGAAAAATTGTGTCGCTT
CAGAAGAAATAACAACTATATTCTCCGCATTGCTTCAATCGAATTTGCAG
CTTGCCCTCAAGGCAGGTGTCTTCTACGATAAAGTGTCGAATATGACGAT
ATGGGGCAACCACTCAACTACTCAGGTCATTAAAGAATCATAACCAGAAT
GATATGAATGCATGAACTTATTTGATTCTCTTTCATGATATGTCATTAAC
TTGTTTTCAGGTTCCCGACTTCTTAAATGCCAGAATCGATGGTTTGCCTG
TCAAAGAAGTGATTAAGGATCATAAGTGGTTAGAGGAAGAGTTCACTGAA
AAGGTTCAAAAGGTAAAATTTGTAATTTGCATCCATATAGAGTTAAATAT
ATATGTGGAATAGAGAATATTTAGTTTCCTTGTGTAAGAAGTTAACAAGT
AATTGTTTGATTGGTAGAGAGGTGGCGTGCTTATTCAAAAATGGGGAAGA
TCATCTGCTGCATCAACTTCAGTGTCGATAGTTGATGCCATACGATCTTT
AATCACTCCTACGCCCAAGGGTGATTGGTTTTCTACCGGTGTAAGTTGGT
TTTACGTAAACAACCACGTCATTGTTTACTTGACATAGAATTAGACGACC
TTTTCAGAAAGATGGCAAACTTGTTTTGCAACTTGACAGAAACAATTTAG
TCAAAATAAATAGTTTATTTTAAAGCTTAATTAGAGGCCTATAAACAGTT
TTTGTCTTTATTTTTTCTGTTTTCTAGTATCTACTTCAATCATAAAGTTT
GCAATTGCAATACCAGGTGTATACCAGTGGAAATCCATACGGAATAGCTG
AAGATATTGTTTTCAGCATGCCGTGTCGATCAAAGGCAAGTGTGTCTACT
GTGTTCTTCATTCTTTACTATAATTTTTGAATTGCTTTTGTTCCTCCTAT
GACAAAAAAAAATATTCATTAGGGAGATGGTGATTATGAACTCGTCAAGG
ATGTTATATTTGATGACTACCTACGACAGAAATTAGCCAAGGTGAGTGTG
AAACTTCATATTTTTTATCATACAGCATAAACATATGCATATTTGATATA
CAAAGAAATAAGTCACAGTTACTATTATATACTTATAATTGTTTTATGAT
ATTATTCACATGTGCTTGAACCTTGAGTATATGCATTATTTGTGAATTTC
ATCATTCATGTCAAAACATCATATTTTGCAGACGGAAGCTGAGTTGTTGG
CTGAGAAAAAATGTGTTGCTCACCTAACAGGCGAGGTAAATATTGCAGCC
CAAATTGCGGTTCTTTTTTGAAACCTTACATATTCATGATTTCACTTTAA
TGTAAACATTTATATTGTCTCATCAGGGAATTGCTGTTTGTGAATTACCT
GGTGATACCATGCTCCCAGGAGAAATGTAACAAGCAAATCTTCTGAATGT
CAAAGCAGATTTGGAAGATCACACCAATTGATGTAAAAATAATGGTTATG
TGATAAAGGTGAAAAACATTTATTGAGCAATTATTTAAATTTCAAAACAT
TCATTTGATTTTAAAACCATATAAAGCTCATCAATAATGTAATAAGTGGG
ATTTTGTAGTTATGAAGCTTGAGATGAGTCAGTCTAAATTTCCATGTTAG
ATAAATTGGAGTACAATTTCAGTGTCTTACTCTTAAGCATACTCTACAAA
TTGTATCATCACATTAAATTAGACTCTTTGAGCTAGTTTTAAATAAAATC
AAAGTTTC

gene from alignment at Ca_LG_4:24751880..24756187-

Legend: mRNA

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Ca_10012_ICC4958_v2 ID=Ca_10012_ICC4958_v2; Name=Ca_10012; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4308bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_4:24751880..24756187- (Cicer arietinum
TACCCTCCTTTTTTTTCTTCCTTCTATACCGTTCTTCCTCCACTTTTCAA
CCTCTGAACCAAAATTTTATATCTTTTCCTCATTCTCTTATACCCTTTAC
AAACTTCTTCAAAACCACTTTTTTATTTTTTTAGTTATTTTTGTTACTCT
ACAAGAGCTACAAACAGTGGTTCTTGTATTCTATTCTTGAACTTTTTTTT
TTCTTTCTCTTCTGCCATGGCTGTGACACAGTTTAAAAACCCCACTTGCT
CAAAAACCCAACTTTATTCATCACAACTCTCATTTCTATCTAAGACTCTA
CCTAGGCGCCATCACTGTACTTTTGCACCACTTCACAGAACTCAGCATGC
CAGAATTTCTTGTTCTGTTGCGCCAAAGTGAGCAACTTTATTCTTTTTCA
TTCAACTTTATGTTTATTAAGCTACTTGGGTATGAATCAATTTTCTTACT
TTTTATTTTCAGTCAAGTGCAGGTGCCAGCTGCACAATTCCAGGATCCTA
AGAGTAAGCCTGATTGCTATGGTGTGTTTTGCCTTACCTATGATTTGAAG
GCTGTGAGTATTCCTTCCTACTCTTCTCTATTTATTCATGAATGTATATA
TGTTGTTTCAGCTTGTTTTGTATCCAAATTCTGGGTTCATGATTCTGTGA
TTAATATATGTTTTGTTGGGTATTTGGGAGCAGAATTTTGTTTTAAGGAT
CACCGGTGGTGTTTGTCAATATATGCATGTTGATGCACATTTTGCCTTTT
TATTTTATCATGTATATTGGCTAGAAGCTGAACTTCAGATTAAAGACATT
TCAGATTAAAGACATATTTGAGTGTCCAACATGTGTCGGTGTTTCATACT
GACACTTGTAATTACATATGATCGCTTGTATTTTCTCAAATTATTACGGG
TGTGTGTTGATGTGTGTTGTGTCTGGTGTCCGTGATTGTGTCAGTGATTC
ATAATTTGTACCTAGCTGGATTCTTCCTCTTTTGTGAAGAAAGTTATTGG
CTGTTTCCCATATCAAAACTGTGTTTCTCATTGATGCCAAAATGCAGGAT
TTAATAAGTTTTTTACTTCATTACTATTTAGTCATAAAGCTTCTACTAAG
TAAAATTTCAATCTTCTTGATGTAATAGGAGGTCACCAATATTTGAGGAA
AGTCTAAAAGAAATCTGTAACAAGTATCTTTTATAGTTGATGTATGAGCA
GTTTACGATCAAATGTCTTAAACAATGTGGAGTTAATCCATCGATTCGTC
CTCCACGTGATGGCAATTTAAATAGCTACCCTAATCCTATTAATTCCTCT
AGATACAACGATTCGCCATCTTAGAACTAAATCCTTTGTTTCATTTGGCA
TCCTTTCAAATTTTCCACGATTCTACTTAATGTAACGATTATATTAGTCT
AGGTGTTAATATCTTTGGGAATATGGTGTGACAGGACTAGGATGACAATG
CATCCTTGCTTTAGTAACTTGTAACAATGACTTTCCAGGGTTCTGTTTTT
ATATTCAAAATTTGATATCCAATCTAATGGCTCATTGATGCCAGAACACA
GTTAAATTTAACAATCTATGCTATATGTGTTGATGTCTTGTGGACGCATT
TGGCTAATGTGTTTACAGGAAGAAGAGACAAAATCCTGGAAGAAATTAAT
TAACATTGCAGTCTCAGGTGCTGCTGGAATGATTTCTAATCATTTACTTT
TCAAGGTGAGACTCTCTTGGATTTAAATCAGGACCGTGTTGGTAAATCAG
AGAGTTTAATCTTGCATCTACTTGGAGGTTTCTTTTTACAAGGGATGCAC
TATCTTTAATGGTCAAAATTTAGTTTCATTATGAGTTAATTTCTTATGTC
AGCTTGCATCTGGTGAAGTTTTTGGTCCAAATCAACCTATTGCTCTAAAA
TTATTAGGATCAGAAAGGTCAATACAAGCTCTTGAAGGTAAGCTTCCTAC
ATGCGTATTATACGAGTACGCCCCCGTTTTTGGAGTATAAATGTATCATA
GGATATGATTGTTCTAATTCAACATGCAGGTGTTGCGATGGAACTGGAGG
ACTCATTGTTTCCTTTGCTGAGGGAGGTTATTATTAGCATTGATCCTTAT
GAGGTGTTCCAAGATGCAGAATGGGCTTTGCTAATAGGTGCAAAGCCTCG
AGGACCTGGAATAGAGCGTGCAGCTTTGCTAGACATAAATGGACAGATTT
TTGCAGAGCAGGTAAATTGGTATTCAAAATTTAAGCCATGTCTAAAGTTT
TCTGCTATAAGACAATTTATATTATTGACACTGTATCTTACCATGTGTAC
AACAGGGACAAGCACTAAACGCTGTCGCATCGCGCAATGTCAAAGTTATA
GTTGTGGGAAACCCTTGCAATACAAAGTCAGCTTGGTGCTTCATGTGTAA
ACTAGAAGTTGTGCCTTGTTGCTCCTAATGTTGCTAATGTTCATGTGTAT
CTTAATGCAGTGCATTAATATGCTTGAAGAATGCTCCAAATATTCCCGCA
AAAAATTTCCATGCTTTAACTCGTTTAGATGAGAACAGAGCAAAATGTCA
GGTAACAAAGCATATAAACTTCATTATTACATAGAAAAATTGTGTCGCTT
CAGAAGAAATAACAACTATATTCTCCGCATTGCTTCAATCGAATTTGCAG
CTTGCCCTCAAGGCAGGTGTCTTCTACGATAAAGTGTCGAATATGACGAT
ATGGGGCAACCACTCAACTACTCAGGTCATTAAAGAATCATAACCAGAAT
GATATGAATGCATGAACTTATTTGATTCTCTTTCATGATATGTCATTAAC
TTGTTTTCAGGTTCCCGACTTCTTAAATGCCAGAATCGATGGTTTGCCTG
TCAAAGAAGTGATTAAGGATCATAAGTGGTTAGAGGAAGAGTTCACTGAA
AAGGTTCAAAAGGTAAAATTTGTAATTTGCATCCATATAGAGTTAAATAT
ATATGTGGAATAGAGAATATTTAGTTTCCTTGTGTAAGAAGTTAACAAGT
AATTGTTTGATTGGTAGAGAGGTGGCGTGCTTATTCAAAAATGGGGAAGA
TCATCTGCTGCATCAACTTCAGTGTCGATAGTTGATGCCATACGATCTTT
AATCACTCCTACGCCCAAGGGTGATTGGTTTTCTACCGGTGTAAGTTGGT
TTTACGTAAACAACCACGTCATTGTTTACTTGACATAGAATTAGACGACC
TTTTCAGAAAGATGGCAAACTTGTTTTGCAACTTGACAGAAACAATTTAG
TCAAAATAAATAGTTTATTTTAAAGCTTAATTAGAGGCCTATAAACAGTT
TTTGTCTTTATTTTTTCTGTTTTCTAGTATCTACTTCAATCATAAAGTTT
GCAATTGCAATACCAGGTGTATACCAGTGGAAATCCATACGGAATAGCTG
AAGATATTGTTTTCAGCATGCCGTGTCGATCAAAGGCAAGTGTGTCTACT
GTGTTCTTCATTCTTTACTATAATTTTTGAATTGCTTTTGTTCCTCCTAT
GACAAAAAAAAATATTCATTAGGGAGATGGTGATTATGAACTCGTCAAGG
ATGTTATATTTGATGACTACCTACGACAGAAATTAGCCAAGGTGAGTGTG
AAACTTCATATTTTTTATCATACAGCATAAACATATGCATATTTGATATA
CAAAGAAATAAGTCACAGTTACTATTATATACTTATAATTGTTTTATGAT
ATTATTCACATGTGCTTGAACCTTGAGTATATGCATTATTTGTGAATTTC
ATCATTCATGTCAAAACATCATATTTTGCAGACGGAAGCTGAGTTGTTGG
CTGAGAAAAAATGTGTTGCTCACCTAACAGGCGAGGTAAATATTGCAGCC
CAAATTGCGGTTCTTTTTTGAAACCTTACATATTCATGATTTCACTTTAA
TGTAAACATTTATATTGTCTCATCAGGGAATTGCTGTTTGTGAATTACCT
GGTGATACCATGCTCCCAGGAGAAATGTAACAAGCAAATCTTCTGAATGT
CAAAGCAGATTTGGAAGATCACACCAATTGATGTAAAAATAATGGTTATG
TGATAAAGGTGAAAAACATTTATTGAGCAATTATTTAAATTTCAAAACAT
TCATTTGATTTTAAAACCATATAAAGCTCATCAATAATGTAATAAGTGGG
ATTTTGTAGTTATGAAGCTTGAGATGAGTCAGTCTAAATTTCCATGTTAG
ATAAATTGGAGTACAATTTCAGTGTCTTACTCTTAAGCATACTCTACAAA
TTGTATCATCACATTAAATTAGACTCTTTGAGCTAGTTTTAAATAAAATC
AAAGTTTC

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