Ca_12257, Ca_12257_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview


Name	Ca_12257
Unique Name	Ca_12257_ICC4958_v2
Type	gene
Organism	Cicer arietinum (chickpea)
Sequence length	11634

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
Ca_LG_5	supercontig	Ca_LG_5:6724756..6736389 -	Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	n/a

Analyses

This gene is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	2015-08-11

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Ca_12257.1	Ca_12257.1_ICC4958_v2	Cicer arietinum	mRNA

Sequences

The following sequences are available for this feature:

gene sequence
gene from alignment at Ca_LG_5:6724756..6736389-

gene sequence

>Ca_12257_ICC4958_v2 ID=Ca_12257_ICC4958_v2; Name=Ca_12257; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=11634bp
ATGAGTACTAGTAATGGAACACCTAAGGAACACATTGAAGGAATACGAAG
GAAAAAGTTTTCAATTGGAGGTGAACAAAACCCTTTAACTGAAGACCTTC
ATCACGCTGTCAAAAATCTCTCTGCTGAACTTTATGCTAAAGATGTTCAT
TTCCTCATGGAACTCGTTCAAGTATATATATACTCTTCTTTCTTATGATC
AATGTTTGTCAAAATTTTATTTCATTCTTATTTTTTCATGTATGTTCGTT
TAAGCATGTTATAAAAAAATATTATGAATGCGTTTGTTTGAGTTTAAATA
AAATTAATTTCTAGTTTAAAAAATTTAGAGATTTATTTAAAAATAATTTT
TGTTTGATTTTCTAAAAAAAATAATTTTTAATCTGTTTCACTGTTTGTAT
ATAATTTTTTAAATATACTGATCTCTTAATTTTTTTTTATCTACTATTCC
CTTCTTATTCCCCGTCTTTTCAAAACTAATATCAACATCAATCAAATTTT
ATAATCATTTTTTCTCATTAGTGAGTTAATTTTAGAGTTTTTCAATTTTG
TACTATCTTTCTCTCTTATTTATGACATGATAATTATGCGATTCTATCAT
TTTTAACTTTTTAATTTTAATAAAACAAATGATTTCTAAAAAATATGAAA
CAAATTCCATTCAAACAATAAAATATGATTTTTGGTTTTTAGTGGAAGTT
GTTTTGTGTTTGTTCATATTAATGAATATTATTTTATTTTTCAAAATTCA
ATTTAAAAAATTGATTTTATAGAAAGTTACTCAAAATAGATTCTCATGTA
ATAGTTTTTAAATTATTTTTAGAAACTATAACAAATATGTATATGTATGA
ATTTTTTTTGACTCAGCTTTAACAAACATATAAACACTTATAAAAGGGAT
TATTTTATTTTAAATGTAATTAGAGATTTTAAAGAAAAACTATTTTATGT
TTGTGCGAGGAAGATCAAATTTTTTAAGAAAAATGATTTTTTTTTAAAAC
TTAATAAAAACAACTTTTCTATTGATTTTTTTATGTATTTTTCTTTAAAT
TCTCATTATTTCAAAAAGACAGAGATGGAGACTTTCAAAAGTAATTAAAT
AGAAAAAAAGTGATTTTTTTTACAAAATAAACCGGATTCTATTTCCTGGA
TTTTGGTGTAGGTTGAGTGATTTATGAATATGTTAAGACTAAGCTTGTTC
TTCTTTTTTATTTTAAATTTCTTTTTATACAATGAATGATTGGAGATAAC
GGAGTGATTAATTTTCTGTATCTAGAATGATGCAATCATGTTTTTTAAGT
AATTACAGTGGTTGAACTTATCACCATAAATTTGTTGTCAATTTCAACAG
AATGCTGAAGACAACCACTACAATGAAGGAGATAGTCCATCATTGGAGTT
TGTCATAACTTCAGATGACATAACTGGTACTGGTGCTTCAGCCACATTAC
TTATTTTCAATAATGAAAAGGGTTTCTCTCCAAAAAACATTGAGTCCATT
TGCAGTGTTGGAAGATCAACAAAGAAAGGCAATAGAAGCAGTGGTTACAT
TGGAGAGAAAGGTATATCACAAACTTATATTTAAATGTTTCTTATTTGTT
GTGTACTTTTGACTCAAGAAGAATTGTACTAAGATGGTTAATTTTGAATA
AGATTAGTTGAATGTTTTCATTGGTATGAAGTTTTAACATCTATGTTGTA
AATAACTAAGTATATGCATTTGATTTGTTTGAATAAATTCAATGTTCAAT
TAAACTTTTTTGTAAAAAGAACATTTTCAGCTATTATGTTGTATCAAAGG
TGTTGAATAAGAGAAAATGAGAGAGACATATGGTGAAACCGTGTGTCTGA
ACTACACAAAGGAGTTGTTTTATATAGGCTCAAGGCAATAAATACAAAAA
TAAATATGGGAGATATTATCCCTATTTACATGATATGTAATAAATATAAA
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NNTTGAATAAGAGAAAATGAGAGAGACATATGGTGAAACCGTGTGTCTGA
ACTACACAACGGAGTCTGTTTTATATAGGCTCAAGGCAATAAATACAAAA
ATAAATATGGGAGATATTATCCCTATTTACATGATATGTAATAAATATAA
ATATATTTTCAACAAAAGGAAAGAAAGAGAGTCTGATTTAACTGCTTCTT
TGGTTTTATTTCTTGTACAACATTTATATTTATGAAATTCAAACATGTTT
ACTTTTTGAAGATAACTTTGTCTCTTTTGGAAGTCCTTATTAATTATGGA
TATAAACTTATATATATCCATTAGAGTAGGCAAATTGAAGAAAATGATAG
AAATCCTTGACTTAATCATTGTTATGGTTAAATTTCAGGAATTGGCTTCA
AGAGCGTGTTTCTGGTTACTGCTCAGCCTTATATTTTTAGCAATGGATAT
CAAATAAGGTTCAATGAGAGGCCTTGTCCACATTGCAGTCTTGGGTATGT
AGTTCCTGAATGGGTTGAGGAGAAGCCAACCCTTGAGGATATAAAGAAGA
TATATGGTGTTGGTAATAATTCTCTTCCAACTACAACAATTGTCTTACCT
CTGAAGCCTGACAAGGTCAAACCTGTTAAACAACAGCTCTCTAGCATTCA
TCCAGAAGTTCTGTTGTTTCTTACAAAAATCAGACAACTTTCTGTCAGAG
AAGTTAATGAGAATCCCAAACAGAACACCGTGACTGCCGTATCTATTTCA
AGCGAGGTTAACTTTGTGACTAGGAAAAACATGAATGCTGAGTCTTACAC
ACTTCATCTATCTGCAGAGGAAAATAGTAATGCTGAGAAGGAATGTGCCT
ACTATATGTGGAAGCAAAAGTTTCCGGTCAGGTTGGAAAATGTGGTCGAA
CGGAGAACTGATGTGGAAGAATGGGTTATAACATTGGCTTTCCCAAATCA
GGAGAGGCTTAGCAGAGGTAAGAGCTTACCAGGGGTCTATGCATTTCTTC
CTACAGAGATGGTCACAAATTTTCCTTTCATAGTTCAAGCAGATTTTGTC
CTTGCCTCATCGAGGGAGACGATTTTACTGGATAATAAATGGAACCAAGG
GATACTTGAATGTGTTCCGTTGGCCTTTATGGATGCATTCAAAACACTTG
TCATAGGATCAGATGAAGCTCCAATATCCAGTTTGCCTCGTATGTTCAAG
TTCCTTCCCATTGATAGTTCTCCATTTGAGAAGTTTAATTATGTTAGGGA
GAAAATCAAAGCAAAATTGGTTGACGAAAATATTGTTCCTATTGAGACCT
ACACCAAACAGAAGCACTTCTATAAGCCTGGTGAAGTTAACAGACTGCTA
CCCGGATTCTGGAATATTTTGACTAAAGCCCGCAAGGAAGGAGTGTACTT
GCTTAACTTATCTTCTCACGATGGGAGGAAGATCTTGAGTTCTTCATTTG
ACAAAAGTGAGTACGACGACGTACTCAATTTTTTAGGGGTGAAATATGTG
ACTGTTGATTGGTATGCAAAGTGCATCCAGAGTTCTAATCTTGTGGGCGG
AGTATCAGAAGATCTCTATCTTAAGCTTTTACTGTTTGTTGCTAAAAATT
GGTCTTCAATGTTTAAGGGCACAGACATTAATAATATTCCATTGATTAAA
TATGTGGCTTCTGATGGAACTCTATCCACTTTTAGTCTTTTTGATTGCAC
ACAGAACCACAATGGTGCCAAGCGAGTAGTACTAACAGACTCAAGTCAGT
CTAATGCTTGTTCTTGGCTGATCAATTGGAACAGAGAATTTGCATGTGCA
GCAAACCGGTATTTTATGCCTGAAAGCACACAAGATGCTATCTTGTGTTT
GGCCCAGAAACAGACTTTGATAGAATGGCTTTCAACTCATGTTTTTGTTA
CTAATATGAGCGTCTACACTTTTGCAAATGTTCTCTGCAGTTTTGTTAAT
AGCAGCTGCAAACTTGCCATTGCATATGCTCATTTCTTATACCACTCTTT
CTCAATGGGTTATCTGTCACATCGGGATGTTGATAGTCTATGTTCTTCTA
TGCCACTAGTGGACAACTATGGATGTATCACAATAAGAAGAGAAGGAGTT
CTTGTGCCTGCAAATGTGAGCAAATGGGCAGATTTGATTGTTTCAAATCC
ATGGAGTAGGGAAAATTATGTTGAGCTTGGAGTGGAGTACCTGAATTCCT
CATGTTATGCTGGCCAACACACAGGTTCTGGGAAGCTTATCGAATTTCTC
AAAACTCATGTTGGAGCTTCTGACATACCTGATATATCACCTCCAAATGC
TGGATTTTCAGCCGTAGAGACACCACTTACCAAAGACAATGCGTTTTTGC
TTTTGGATTGGATTCATAATCTGAAGTATAAGGGAGTACGTCTACCAGAT
AGGTTTTTGAAATGTATAAAAGATGGCAGCTGGCTTAAAGTTACGGTCAA
TGGATACAGGCCTCCTTCCAAGTCGTTCTTAATTCGCTCACCCTTGGGAA
AAATTTTGCAAAGTGGCTCAGTTCTTGTGGACATTCCCCTGATTGATGAG
AGCTTCTATGGGGATAGAATAAACAAATATGCCGAGGAGTTGAAAACAAT
TGGAGTGATGTCCAGTTGTGAGGAAGCATGTGATTTCATTGGAAGAGAAC
TGATGTCTCGTGCATCTACCTTTGCTTTAAGTAAGAATCATGTTCTTTTG
ATGCTGAATTTCATCCAATATCTCAGGAAAAGTCTTCTCCCTTTGGACAA
ATTTGTAAACAACATCAAAGAAGGGACTTGGCTAAAGACATCCCGTGGTC
TCAAGTCTCCTGTGGGATCTGTATTGAATGATTCTAAATGGCTAGTTGCA
GCACAAATCAGTGACATTCCATTCATTGATAAATCTTATTATGGTGATGA
AATTTATAATTACATAGAGGAGCTCAAGTTGCTAGGAGTGATAGTTGACT
TAAATGGTAATTACCAAGTTGTCATTGACCATTTAAAATCACCTTCAAAT
CTGGCCTCTTTGACCGCTGAGTCTGTTATTTTGGCAATGCGTTGTATCAA
ATTCTTGAAGGCCCCTAGTAAACTCTTAAGTTCACTGAAGGGAACAAGCT
GCTTGAAAACAAACATGGGTTTCAAAATACCTAGTGAATGTTTCTTGTAT
GACCCGGTGTGGGGATGCATTTTAGATGTATTCAATGGCTTTTGTGTGAT
TGATCATGAATTCTATGGAGAGAAGATTTTCTTTTACAAATATCAACTGA
GGCAAATTGGGGTGGTGGTTGATTTTGGAGATACTATCAAGAAGTTTGCT
TCTCTCTTCAAACAGAAGGCATCACAAACATCATTTAACCAACAGCATGT
GATGTCATTTCTCTCCTGTTGCCGGCTGCTGAAGGGAACTGAACATAGAT
TTCCTTCTGATTTCTCAACAATCATACATAATGAGAAGTGGTTGTATACT
AAGGTTGGTTGTTATTCATGCCCTAGAAAATGCGTTTTATATGGACCGGA
GTGGAAATCTATATCTTCTATTACTTGTCTCCCGTTCATTGATGACAGTG
ACAAATGCTATGGTATGAAAATACATGAATACAAGGAAGAGCTGAAGAAC
ATTGGTGTAGTTACTGAATTGAAAAAGGGAGTGAGATTTGTGCCTGAATG
TCTGAATTTTCCTTCAGATCCCTCCACCATTAGTCCCGAAAGTGTGTTTT
CCTTGCTGGAGTGCATCCGAAGTCTAATGGAAGAGCATAAGCTTGCCATT
GAAGATGGTTTCAGAAAAAGATTGTCTAGAAATTGGTTGAAGACACATGC
TGGTTATAGGCCTCCAGAGATGTGTTTGTTGTTTGATTCAAAGTGGAGTT
CTTTCTTGAATCCATCCGATGGGCCTTTTATTGATGCGGATTTTTATGGA
CCTAAAATTGCATCTTTCCAGAAAGAACTCCATGCTATAGGAGTTACTAT
CGACCTTGATAAAGGGTGCCCCTTGCTTGCCTGTCACCTTGATTCTCTCT
CTGACACTGATAATATTATGAAAATATATAGGTACGTTAAACAACATGTT
ATGTCATTTATCTCTTCTTGCTTCTTTGCTTGTCTCCTTAATACTAATTT
TGACTTTGATAATATTGTGAAAATATATAGGTACTTGTCTGAGTACAATT
GGAAACCAGAGGAAAATGCTGCCAAGAAAATTTGGATTCCACAAGTTACT
AAAGGTGGAAAGTGGGTCAACTCTGAAGAGTGCATCATACATGACCCAGA
TAAACTTTTTGGTCTGAAGTTATATGTTCTTGAAGATGTCTATGATAAGA
AGATTCTCCCCTTTCTAACATTTGCCATGGAAGTCAGGTCTAAGCCCTCA
CTTGATGATTATGTTGACCTGTGGAATGGTTGGGAAAAATCATCTGAAGA
GTTGTCATATGACAAGTGCAGTAAGTTCTGGATGTTCATCCTGAAACACT
TGGGCATTAATACAGAGAAGATACTTTCTAAGAGGTTGGTCAAACTACCG
GTAACAACCGGAGGCAATGAAATATTTCTGTTGGATAAAGAAAATGTTTT
TATTCCTGATAACCTTCATCTGAAGAAACTTTTTGAGCAGGAGAAAGTTT
TTGTGTGGTATCCTCAGAAGAACTTTGGGCCATTGTCCATTTCTAAGTTA
TACGGCATCTACAGAAAAATCGGTGCTCGTAATATATCTGAATCACTATG
CAAAGAAGAACCATCCTCAGTGAATGATGATGTCGAACTGGTGCAAGTTG
ATCAGAATAATATTTTCAGCTTAAAAGGTTTGGTAAAGCTCATTCTTGGT
TTCCTTGCTTGTTCTAGCTTGAAAATGGAACCAGATAAGAGACATGAAGC
TGTTCAAGGTCTTCTAAACCTGAGTTTCCTTGAGACAATGGAGCAAGTCA
CGGTAAGCTATAGTTTATCACTGTCTTCAGGGGACATCATTTCTAAGAAA
GATGACAAAATGGTACGCTGGGAAAGACAAAGTTCCAAGTTTTTCACCCA
GAAGATGGACGGGCATCAAGGAAATTCTCTTAAATATGCAATGTGTTTCT
CCGAAGCAATATCAGAGGGTGTTTTGTGTGAGAATCATGAATTTGTTCCT
GCTCTTACTGAACTGATCACATTGGGTTTTGTGCTGAAATTCAAGAATGA
AGACATTGAATTTCTGATGTTGTCCAAGAATTTGCAGATTTTCAGTGAGG
ATGTTGAGTTCCTCAGTTCTTCGTTCGCAACTGACTAAGTTTTCTACGTT
GGTTTACTTGTTACTATGTCTATCTGTTTATGGAGCATGTCTTAAGTTTT
CTTGTTCTCTTTTTGGTGTTTGTGACTATGCTGT

gene from alignment at Ca_LG_5:6724756..6736389-

Legend: mRNA

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Ca_12257_ICC4958_v2 ID=Ca_12257_ICC4958_v2; Name=Ca_12257; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=11634bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_5:6724756..6736389- (Cicer arietinum
ATGAGTACTAGTAATGGAACACCTAAGGAACACATTGAAGGAATACGAAG
GAAAAAGTTTTCAATTGGAGGTGAACAAAACCCTTTAACTGAAGACCTTC
ATCACGCTGTCAAAAATCTCTCTGCTGAACTTTATGCTAAAGATGTTCAT
TTCCTCATGGAACTCGTTCAAGTATATATATACTCTTCTTTCTTATGATC
AATGTTTGTCAAAATTTTATTTCATTCTTATTTTTTCATGTATGTTCGTT
TAAGCATGTTATAAAAAAATATTATGAATGCGTTTGTTTGAGTTTAAATA
AAATTAATTTCTAGTTTAAAAAATTTAGAGATTTATTTAAAAATAATTTT
TGTTTGATTTTCTAAAAAAAATAATTTTTAATCTGTTTCACTGTTTGTAT
ATAATTTTTTAAATATACTGATCTCTTAATTTTTTTTTATCTACTATTCC
CTTCTTATTCCCCGTCTTTTCAAAACTAATATCAACATCAATCAAATTTT
ATAATCATTTTTTCTCATTAGTGAGTTAATTTTAGAGTTTTTCAATTTTG
TACTATCTTTCTCTCTTATTTATGACATGATAATTATGCGATTCTATCAT
TTTTAACTTTTTAATTTTAATAAAACAAATGATTTCTAAAAAATATGAAA
CAAATTCCATTCAAACAATAAAATATGATTTTTGGTTTTTAGTGGAAGTT
GTTTTGTGTTTGTTCATATTAATGAATATTATTTTATTTTTCAAAATTCA
ATTTAAAAAATTGATTTTATAGAAAGTTACTCAAAATAGATTCTCATGTA
ATAGTTTTTAAATTATTTTTAGAAACTATAACAAATATGTATATGTATGA
ATTTTTTTTGACTCAGCTTTAACAAACATATAAACACTTATAAAAGGGAT
TATTTTATTTTAAATGTAATTAGAGATTTTAAAGAAAAACTATTTTATGT
TTGTGCGAGGAAGATCAAATTTTTTAAGAAAAATGATTTTTTTTTAAAAC
TTAATAAAAACAACTTTTCTATTGATTTTTTTATGTATTTTTCTTTAAAT
TCTCATTATTTCAAAAAGACAGAGATGGAGACTTTCAAAAGTAATTAAAT
AGAAAAAAAGTGATTTTTTTTACAAAATAAACCGGATTCTATTTCCTGGA
TTTTGGTGTAGGTTGAGTGATTTATGAATATGTTAAGACTAAGCTTGTTC
TTCTTTTTTATTTTAAATTTCTTTTTATACAATGAATGATTGGAGATAAC
GGAGTGATTAATTTTCTGTATCTAGAATGATGCAATCATGTTTTTTAAGT
AATTACAGTGGTTGAACTTATCACCATAAATTTGTTGTCAATTTCAACAG
AATGCTGAAGACAACCACTACAATGAAGGAGATAGTCCATCATTGGAGTT
TGTCATAACTTCAGATGACATAACTGGTACTGGTGCTTCAGCCACATTAC
TTATTTTCAATAATGAAAAGGGTTTCTCTCCAAAAAACATTGAGTCCATT
TGCAGTGTTGGAAGATCAACAAAGAAAGGCAATAGAAGCAGTGGTTACAT
TGGAGAGAAAGGTATATCACAAACTTATATTTAAATGTTTCTTATTTGTT
GTGTACTTTTGACTCAAGAAGAATTGTACTAAGATGGTTAATTTTGAATA
AGATTAGTTGAATGTTTTCATTGGTATGAAGTTTTAACATCTATGTTGTA
AATAACTAAGTATATGCATTTGATTTGTTTGAATAAATTCAATGTTCAAT
TAAACTTTTTTGTAAAAAGAACATTTTCAGCTATTATGTTGTATCAAAGG
TGTTGAATAAGAGAAAATGAGAGAGACATATGGTGAAACCGTGTGTCTGA
ACTACACAAAGGAGTTGTTTTATATAGGCTCAAGGCAATAAATACAAAAA
TAAATATGGGAGATATTATCCCTATTTACATGATATGTAATAAATATAAA
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ACTACACAACGGAGTCTGTTTTATATAGGCTCAAGGCAATAAATACAAAA
ATAAATATGGGAGATATTATCCCTATTTACATGATATGTAATAAATATAA
ATATATTTTCAACAAAAGGAAAGAAAGAGAGTCTGATTTAACTGCTTCTT
TGGTTTTATTTCTTGTACAACATTTATATTTATGAAATTCAAACATGTTT
ACTTTTTGAAGATAACTTTGTCTCTTTTGGAAGTCCTTATTAATTATGGA
TATAAACTTATATATATCCATTAGAGTAGGCAAATTGAAGAAAATGATAG
AAATCCTTGACTTAATCATTGTTATGGTTAAATTTCAGGAATTGGCTTCA
AGAGCGTGTTTCTGGTTACTGCTCAGCCTTATATTTTTAGCAATGGATAT
CAAATAAGGTTCAATGAGAGGCCTTGTCCACATTGCAGTCTTGGGTATGT
AGTTCCTGAATGGGTTGAGGAGAAGCCAACCCTTGAGGATATAAAGAAGA
TATATGGTGTTGGTAATAATTCTCTTCCAACTACAACAATTGTCTTACCT
CTGAAGCCTGACAAGGTCAAACCTGTTAAACAACAGCTCTCTAGCATTCA
TCCAGAAGTTCTGTTGTTTCTTACAAAAATCAGACAACTTTCTGTCAGAG
AAGTTAATGAGAATCCCAAACAGAACACCGTGACTGCCGTATCTATTTCA
AGCGAGGTTAACTTTGTGACTAGGAAAAACATGAATGCTGAGTCTTACAC
ACTTCATCTATCTGCAGAGGAAAATAGTAATGCTGAGAAGGAATGTGCCT
ACTATATGTGGAAGCAAAAGTTTCCGGTCAGGTTGGAAAATGTGGTCGAA
CGGAGAACTGATGTGGAAGAATGGGTTATAACATTGGCTTTCCCAAATCA
GGAGAGGCTTAGCAGAGGTAAGAGCTTACCAGGGGTCTATGCATTTCTTC
CTACAGAGATGGTCACAAATTTTCCTTTCATAGTTCAAGCAGATTTTGTC
CTTGCCTCATCGAGGGAGACGATTTTACTGGATAATAAATGGAACCAAGG
GATACTTGAATGTGTTCCGTTGGCCTTTATGGATGCATTCAAAACACTTG
TCATAGGATCAGATGAAGCTCCAATATCCAGTTTGCCTCGTATGTTCAAG
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