Ca_12260, Ca_12260_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_12260
Unique NameCa_12260_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length4013
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_5supercontigCa_LG_5:6778513..6782525 +Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_12260.1Ca_12260.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_12260_ICC4958_v2 ID=Ca_12260_ICC4958_v2; Name=Ca_12260; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4013bp
ATGGCGGAGTTCGTCGATCTCGAATCCCAAGACGGCGTTCGCATGCCGTG
GAACGTAATCCCCGGCACAAAACAAGAATCCTTAAACGTCGTCGTTCCAG
TCGCAGCAATCTACACTCCAATTAAACACTTCCCTTCCATGCCTCTTCTC
CCTTACTCTCCACTCCGTTGTCGCACTTGCCGTTCCGTTCTCAATCCTTT
CTGCATCGTCGATTTCGCCGCCAAGATCTGGATCTGTCCAATCTGTTTCC
AACGTAATCATTTTCCGCCTCACTATGCTTCAATCTCCGATGAAAATCTC
CCCGCAGAGCTTTTCCCTCAGTACACTACTGTTGAATACGATTCCCCTGG
TGATCCTGCTCCGCACGTGCCTCCTGTTTATCTCTTCGTCGTTGACACGT
GTGTCATCGAAGAGGAAATCGGTTTTCTACGATCTGCGATTTCTCAGGCG
GTTGAGCTTTTGCCGGATAATTCTCTCGTCGGACTTATCACATTTGGAAC
GTTCGTTCATGTTCATGAGCTTGGATTTGGTATTGTTCCTAAAACTTATG
TGTTTAAAGGTACTAAAGATGTTTCCAAGGATCTACTTCTAGAGCAGATG
AATTTCTTTGCGAAGAAACCGAAGCCGTCGGTTGGTGTTGTTGCTGGTGC
ACGGGATGGACTGTCCTCGGAGAGTATTTCGCGGTTCTTGCTTCCGGCGT
CGGAGTGTGAGTTCGCGCTCAATTCGGTAATGTGCCTGGTTTAGACTGTT
TAGGATTGTATGTTTTGCTGTGTCTTAATCTATGAAGCACATACACTACA
GTGCATTGACACATCCACACCAGTAATAATTTAACAAATTAGAAGTACTT
AATTGAATAATTGAATGTAATTACATGTGTAGTGTCATATAATTTCAAAC
TAGTAATAATTTGAGAAAATAGAAGTAATATAAGTAATTGAATGTGTAGT
GTCACATATGTCGGATTTTGGATATGCCTTTTGATCTAAAGTGTTGGAGC
TATATAGGTGTTATGAATTGAATTATTTGTGAGTTGTGGTTTGATTTGGT
TTGCAGGTTTTGGATGAGCTACAGAGGGATCCCTGGCAGGTGCCTAGCGA
TCAACGGGCGACGAGGTGCACCAGCACTGCGCTGAGTATTGCGGCCAGTT
TGTTGGGGGCTTGTGTTCCTGGTTCTGCGGCAAGAATAATGGCATTTATT
GGAGGACCAGCAACAGAAGGACCTGCTCCGGTAAGAATTTCTTTTCATAC
TTACAAGTGACGGTGTAATTGGTTTGATAGTGTGTTGGACGTGAAGGTGT
GTCTGGCCAATTGTAGTATAGAGTTGCTTTAGTTGTGCCTGGCCAATGAA
TTTGAGACTAGAGTTGTTTTCCTGTTGAAGTGCATTGGAACATGTGTGGA
TTGAAATCCAAACACATAACTAACTGTTCTAAATTGTCAAATTAGTTGTG
AAAGATATATCATCATGCATGGTATTAGTCCTTAAATAATTGAAACTTTG
AACCATCCCATCAGTTTTTTCTTCCTCAATTTGGTCTTTTTGTCTTTTCT
TTTGGAGTACCATCTCACCCTCCCTTGTACTTTTTCCCTTTGTATTTAGT
AACTCGTCTTTATCTAAAGAAAGTATATTAATTTTCGAGAGGCATTTGCT
CTACTGGCATTTTCACAATAGTGTGTATGATACTATGATAATGATTGCAT
TAGTTCCTGGATCAAGTAAGATATTATATTTGACTATTTAGGAACATACT
TTTAGGTATTTCATATACTTTTACTGAAATGATTTCCATCTCATATGATT
GGTTGACGACATTCAATTGTTTCTCTCCTTATGAACTATTGTATATTGTA
GATTGTATCCAAACAACTTTCTGAACCTATTCGCTCCCACAAAGATCTGG
ATAAAGATTCTGTGCCACACTACCATAAATGTGTGAAATTCTATGATGGA
CTTTCGAAGCAGCTTGTACATCAAGGTCATGTACTAGATCTCTTTGCTTG
TGCTCTTGATCAGGTAAATTTTTCTCTTTTTTCAACTGATCTTTCCTGCT
TAGCGTACACCATTTGGTTGTTTAATAAGATGGTGGATGAATATCTCTGT
TTTCCACCTAGAGTTTTTCACTTTTCAAATTTTGTCTAGCACAAAATATT
TAGATGACCGTTCATCTTGTGATTACATCCAGTGTAATCAAGAATTTGTG
ATAATGGTTTAAGTTGTAATTCATTCACTTCTTTGGTTCTTTCCATACTT
TATTATATTTAAGTTTTTCAAAGTAGTTTATGTTGAAATTTCTTATGCAT
GTCTCATCTTCATTCACTTAGTAACATCCTTGGCCTTGCATCTTTGTATT
CAATAATAGCGGCTCCATTAAAAATTTATTGACCATAATATCAGTGTATG
CCTAAACAAATGCTCCAAATAGTAACAAGAACTGCACATTGCATGAAAAT
CTAACTTCATTTCCACTCAAAATCACCAGTGTTAGTATTTAGTAACCTAG
AATTGATTTAACGACCTGGGGAACTAGTATAAAAAGAAAGTCAATTTATT
CCACAAAGAAACAACAACAGAACAATGTAAAAAATATTGGCTCTGAAATC
CTCCATTTACTACCAAAATCTTTCCATCGTCTACTGTTCCTCAGTCTTTA
AGTGCTCTCAAGAACATCAACTACAACAACAGAAATCTGTTTTGGGGTTG
GGTATATGAATCAAGCTACGTCACAATGTCCTATCATGAATCACGCTTAA
GAACAGACCATTTAATTGCTGCTCTCAACTCAATAAAAGAAGGGATTCCA
TATAGATGACCTTTAAAGCAGTTCACTCATTTTATATTATTTTATGATCA
GAGGTGGTTGCTAAACAGAGAGAATTTCAAATACCTAAATATAATGTTTG
CAATTTATTTTCCATGAACATATTTATAATTGACCAAGTTATTGTTTTTC
TTCACCTGTTTTAAACGGACTCTTGATCTTCCTTGCTTGTAAACTTTTCA
TCTATTATTTTTTTAATGTGAATCGACTGATCTCAAATCAGTAGTTGTGA
TCAATTAATGCCTGTAAATATGTGTATATATTAATGCATGGAATCGAAAT
CCGTAATGTTACATGGATAGTCTTAGCACAGACTTCCAAGAAACCAAATG
CTCACTATTCATTTCACTCTCTCCCTTCTTTCATAAACATAAAAAAGTTC
TCCTTCACTCTGTTGTCTCTACTAAAAAAAATAAGCTTAAACATTTTTTC
CCTAACTAGGAGATCGATTTAGAGAATATAATTGCATTTGAACCCATTCA
TCATAATCTTTTAGCATCTGCTGAAGTAGCAGTCGTCTGAGCTTGTCCAC
CAAAGTTTGCATCATTATGTTTCTAGGACCCTCCATCTATTATTAGATTG
TAATTTTAGGGAAAAAATGTTTCAATCATTTTTTAAGAAACTTATTGTTG
TTTGATATCTTGAGGTAATCCTGAAATGATTCTTCCTACTACTAATAACT
GGATTGTCCAACTTCATAGTTTCTATTGTCTAAAATCATTGGCTAATTTC
AAGGAGATTAAAAATGAAAAATGTTGATCATTTTGTGAACTGTCCTACTT
GATTTTGTTTTTATTGAAGTTGTTCTATGCTAAGCTTTTAGTTTTTAGGT
GGTCTGTAGGCTGATAAATGTGTTATTGCTTAATTGGTACACATATTCGA
AATCACATTCTGGTGGTTGTTTTACTTTGTCTAGTTCTCTTATATTTGAA
AAAGTATTTTTTCTGCTTTATTCTTTATCTTCCAGGTTGGCATTGCTGAG
CTTAAAACTGCTGTTGAAAGGACTGGGGGCCTTGTTGTACTTACTGAAAG
TTTTGGCCATCAAGTGTTCAAGGATTCACTTAAGCGTGTTTTCCAATCGG
GGGATTATGATCTGGGCCTAGCATCAAAGTAAGTCATAAAATATTTTAAT
TTTTCTATGATATTGATCGTCTTAAATTCTTGTTTCTTGCTTGTGTGGTA
AAGTGTTAGGTAA
back to top

gene from alignment at Ca_LG_5:6778513..6782525+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_12260_ICC4958_v2 ID=Ca_12260_ICC4958_v2; Name=Ca_12260; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4013bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_5:6778513..6782525+ (Cicer arietinum
ATGGCGGAGTTCGTCGATCTCGAATCCCAAGACGGCGTTCGCATGCCGTG GAACGTAATCCCCGGCACAAAACAAGAATCCTTAAACGTCGTCGTTCCAG TCGCAGCAATCTACACTCCAATTAAACACTTCCCTTCCATGCCTCTTCTC CCTTACTCTCCACTCCGTTGTCGCACTTGCCGTTCCGTTCTCAATCCTTT CTGCATCGTCGATTTCGCCGCCAAGATCTGGATCTGTCCAATCTGTTTCC AACGTAATCATTTTCCGCCTCACTATGCTTCAATCTCCGATGAAAATCTC CCCGCAGAGCTTTTCCCTCAGTACACTACTGTTGAATACGATTCCCCTGG TGATCCTGCTCCGCACGTGCCTCCTGTTTATCTCTTCGTCGTTGACACGT GTGTCATCGAAGAGGAAATCGGTTTTCTACGATCTGCGATTTCTCAGGCG GTTGAGCTTTTGCCGGATAATTCTCTCGTCGGACTTATCACATTTGGAAC GTTCGTTCATGTTCATGAGCTTGGATTTGGTATTGTTCCTAAAACTTATG TGTTTAAAGGTACTAAAGATGTTTCCAAGGATCTACTTCTAGAGCAGATG AATTTCTTTGCGAAGAAACCGAAGCCGTCGGTTGGTGTTGTTGCTGGTGC ACGGGATGGACTGTCCTCGGAGAGTATTTCGCGGTTCTTGCTTCCGGCGT CGGAGTGTGAGTTCGCGCTCAATTCGGTAATGTGCCTGGTTTAGACTGTT TAGGATTGTATGTTTTGCTGTGTCTTAATCTATGAAGCACATACACTACA GTGCATTGACACATCCACACCAGTAATAATTTAACAAATTAGAAGTACTT AATTGAATAATTGAATGTAATTACATGTGTAGTGTCATATAATTTCAAAC TAGTAATAATTTGAGAAAATAGAAGTAATATAAGTAATTGAATGTGTAGT GTCACATATGTCGGATTTTGGATATGCCTTTTGATCTAAAGTGTTGGAGC TATATAGGTGTTATGAATTGAATTATTTGTGAGTTGTGGTTTGATTTGGT TTGCAGGTTTTGGATGAGCTACAGAGGGATCCCTGGCAGGTGCCTAGCGA TCAACGGGCGACGAGGTGCACCAGCACTGCGCTGAGTATTGCGGCCAGTT TGTTGGGGGCTTGTGTTCCTGGTTCTGCGGCAAGAATAATGGCATTTATT GGAGGACCAGCAACAGAAGGACCTGCTCCGGTAAGAATTTCTTTTCATAC TTACAAGTGACGGTGTAATTGGTTTGATAGTGTGTTGGACGTGAAGGTGT GTCTGGCCAATTGTAGTATAGAGTTGCTTTAGTTGTGCCTGGCCAATGAA TTTGAGACTAGAGTTGTTTTCCTGTTGAAGTGCATTGGAACATGTGTGGA TTGAAATCCAAACACATAACTAACTGTTCTAAATTGTCAAATTAGTTGTG AAAGATATATCATCATGCATGGTATTAGTCCTTAAATAATTGAAACTTTG AACCATCCCATCAGTTTTTTCTTCCTCAATTTGGTCTTTTTGTCTTTTCT TTTGGAGTACCATCTCACCCTCCCTTGTACTTTTTCCCTTTGTATTTAGT AACTCGTCTTTATCTAAAGAAAGTATATTAATTTTCGAGAGGCATTTGCT CTACTGGCATTTTCACAATAGTGTGTATGATACTATGATAATGATTGCAT TAGTTCCTGGATCAAGTAAGATATTATATTTGACTATTTAGGAACATACT TTTAGGTATTTCATATACTTTTACTGAAATGATTTCCATCTCATATGATT GGTTGACGACATTCAATTGTTTCTCTCCTTATGAACTATTGTATATTGTA GATTGTATCCAAACAACTTTCTGAACCTATTCGCTCCCACAAAGATCTGG ATAAAGATTCTGTGCCACACTACCATAAATGTGTGAAATTCTATGATGGA CTTTCGAAGCAGCTTGTACATCAAGGTCATGTACTAGATCTCTTTGCTTG TGCTCTTGATCAGGTAAATTTTTCTCTTTTTTCAACTGATCTTTCCTGCT TAGCGTACACCATTTGGTTGTTTAATAAGATGGTGGATGAATATCTCTGT TTTCCACCTAGAGTTTTTCACTTTTCAAATTTTGTCTAGCACAAAATATT TAGATGACCGTTCATCTTGTGATTACATCCAGTGTAATCAAGAATTTGTG ATAATGGTTTAAGTTGTAATTCATTCACTTCTTTGGTTCTTTCCATACTT TATTATATTTAAGTTTTTCAAAGTAGTTTATGTTGAAATTTCTTATGCAT GTCTCATCTTCATTCACTTAGTAACATCCTTGGCCTTGCATCTTTGTATT CAATAATAGCGGCTCCATTAAAAATTTATTGACCATAATATCAGTGTATG CCTAAACAAATGCTCCAAATAGTAACAAGAACTGCACATTGCATGAAAAT CTAACTTCATTTCCACTCAAAATCACCAGTGTTAGTATTTAGTAACCTAG AATTGATTTAACGACCTGGGGAACTAGTATAAAAAGAAAGTCAATTTATT CCACAAAGAAACAACAACAGAACAATGTAAAAAATATTGGCTCTGAAATC CTCCATTTACTACCAAAATCTTTCCATCGTCTACTGTTCCTCAGTCTTTA AGTGCTCTCAAGAACATCAACTACAACAACAGAAATCTGTTTTGGGGTTG GGTATATGAATCAAGCTACGTCACAATGTCCTATCATGAATCACGCTTAA GAACAGACCATTTAATTGCTGCTCTCAACTCAATAAAAGAAGGGATTCCA TATAGATGACCTTTAAAGCAGTTCACTCATTTTATATTATTTTATGATCA GAGGTGGTTGCTAAACAGAGAGAATTTCAAATACCTAAATATAATGTTTG CAATTTATTTTCCATGAACATATTTATAATTGACCAAGTTATTGTTTTTC TTCACCTGTTTTAAACGGACTCTTGATCTTCCTTGCTTGTAAACTTTTCA TCTATTATTTTTTTAATGTGAATCGACTGATCTCAAATCAGTAGTTGTGA TCAATTAATGCCTGTAAATATGTGTATATATTAATGCATGGAATCGAAAT CCGTAATGTTACATGGATAGTCTTAGCACAGACTTCCAAGAAACCAAATG CTCACTATTCATTTCACTCTCTCCCTTCTTTCATAAACATAAAAAAGTTC TCCTTCACTCTGTTGTCTCTACTAAAAAAAATAAGCTTAAACATTTTTTC CCTAACTAGGAGATCGATTTAGAGAATATAATTGCATTTGAACCCATTCA TCATAATCTTTTAGCATCTGCTGAAGTAGCAGTCGTCTGAGCTTGTCCAC CAAAGTTTGCATCATTATGTTTCTAGGACCCTCCATCTATTATTAGATTG TAATTTTAGGGAAAAAATGTTTCAATCATTTTTTAAGAAACTTATTGTTG TTTGATATCTTGAGGTAATCCTGAAATGATTCTTCCTACTACTAATAACT GGATTGTCCAACTTCATAGTTTCTATTGTCTAAAATCATTGGCTAATTTC AAGGAGATTAAAAATGAAAAATGTTGATCATTTTGTGAACTGTCCTACTT GATTTTGTTTTTATTGAAGTTGTTCTATGCTAAGCTTTTAGTTTTTAGGT GGTCTGTAGGCTGATAAATGTGTTATTGCTTAATTGGTACACATATTCGA AATCACATTCTGGTGGTTGTTTTACTTTGTCTAGTTCTCTTATATTTGAA AAAGTATTTTTTCTGCTTTATTCTTTATCTTCCAGGTTGGCATTGCTGAG CTTAAAACTGCTGTTGAAAGGACTGGGGGCCTTGTTGTACTTACTGAAAG TTTTGGCCATCAAGTGTTCAAGGATTCACTTAAGCGTGTTTTCCAATCGG GGGATTATGATCTGGGCCTAGCATCAAAGTAAGTCATAAAATATTTTAAT TTTTCTATGATATTGATCGTCTTAAATTCTTGTTTCTTGCTTGTGTGGTA AAGTGTTAGGTAA
back to top