Ca_12685, Ca_12685_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview


Name	Ca_12685
Unique Name	Ca_12685_ICC4958_v2
Type	gene
Organism	Cicer arietinum (chickpea)
Sequence length	4572

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
Ca_LG_5	supercontig	Ca_LG_5:14195493..14200064 -	Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	n/a

Analyses

This gene is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v2	2015-08-11

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Ca_12685.1	Ca_12685.1_ICC4958_v2	Cicer arietinum	mRNA

Sequences

The following sequences are available for this feature:

gene sequence
gene from alignment at Ca_LG_5:14195493..14200064-

gene sequence

>Ca_12685_ICC4958_v2 ID=Ca_12685_ICC4958_v2; Name=Ca_12685; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4572bp
ATGAACGGCGATGGAGGAAACTTCCCACCGCCGCAATCCAACGGCGGTGA
TTTTCTCCTCTCCCTTCTTCAAAAACCTCACCTTCAACCATCCCAACCCC
CAACCATCCCACCTCTACAATCTCTTACAATAGATCCCGCCGTTGCCATG
ATGGGCCCCACAATCCCCATCTCCACATCTCCATATCTAACCAACGGTCA
CGATCATCCCAACCTTAACTATCTCCCTCACCACCCTCACCCTAATTTTC
CACCATGGTCCCACACACCTTCTCCATACACGCAAAACATATTCGGGTTA
ACCCATAACCCGTTTTCCCTCCCTCAAATACCCGAAACTCATTACCCTAA
CACCAATCCACTTCACTTCAACAACGGTGTTTCCCTCGCCGAAGATTTAA
GAAGATTAGGGTTTCCTATTGAAGGAAACAACAATAGCAACAGTGTTAAT
TCCTTCATTCACCAACAACAACAGCAACACCAATTGAATGAATTGAAGTT
ACAGTTTGGATCTTTACCCACTGTTTCGTTTGCTAATTCCTCTCCAGTGC
CTTCCAATGGAAACTACAATGGTTTTGATAGGAATAATAATAATCAAAAT
CACAATCATAATCATGATGCTGTTGATTATGAAAGAAGAGGGGTTATTGG
GAATTTTAGGTCAACTGGAATATCCACTGAACAAATTAGGGTTCCACCTA
GGTTTGTGAACGATACAAGAGGAAAGGGTTATTGGGGTTCTGAGGTTGGT
GAAGTTGAATTGAATGGTAGGAATGAGAATTTGTTTAGGGAAAATGTAAG
AATTGGGTTTGGTGAAAGGAGCAACAATTCTAGAGGCAATGTGGGTGGTG
GACATGAATTGAGGCTTCCTGATCAGATTGATCATCCTGGTCCACCGTCC
GGGAGTAAGCTTCATTCTGATGTTGTTGTTGATGATGATATTGATGCTGT
TGGAGAACAGTTAGCTGATTCGTTGTTGCTTGAGGATGAGCTTGATGACA
AGAGTAGTAACTCTAGGAGGCGCCGCGGACCTAGGGATAAGGTTAATAAT
ACTTAAATATTCGTTGGTATTTATTAAATAAGTTTTGTTCTGAATTTCAA
TTTCATTTATTTACTTGGAGTAACTGTTATTTGTTTTCATATTGTCAATG
TTATGGTTAATGGTTAGGATTTTTTTTTATAAATTTCTTAGGGAACTGTT
TATGAAAAAATCTAGGTTGTTGATTGAATTTTATGGTTAGCATTGTTGTC
AATCACAGATTGCGGAAAATAATAGTTTGTTCAAATTCTGCTGCTATAGC
CCCACTATTGTTGCTTTGGCAACATTTTGTACTAAATAGTGTATCAGGGA
ACAATAAAGATTTGTTTAGATTCCACTATGTTATAGCACTATAGCCGTTA
TTTTACAACATTGATAGTTAGATACCGAATATCATATAGTGAGAGGTTCA
TATGGTATTTATTTATCTATCTTCGTAGTATAAATGAAATGGAATCTTAA
AGCATGAGGTTAACTGACAACATTTATTATCAGGATGCGAGATCATCAGA
CTCGAGAGGAACACAGTTGCTAAGCCAGCGGGCAAGATCGTATAAAAGAC
AAATGATGTGCCGCAGGGACATAGATAATCTTAGTGTTCCTTTCCTTGCA
ATATATGAGTCTTTAATACCACCGCAAGAAGAAAAGCTGAAGCAGAAACA
ATTGTTAGCGTTATTGGAGAAGTTAGTTTGCAAGGAGTGGCCAATGGCTC
GGCTTTATCTCTATGGATCATGTGCTAATTCATTCGGTGTTTCTAAAAGT
GACATTGATGTTTGCCTTGCTATTCAGGAAGCTGACATGGACAAATCTAA
GATAATAATGAAATTGGCTGATATTTTGCAATCAGATAACCTCCAGAATG
TTCAGGTGAGATTTTTGCTGTGTCCTCTTAAATTGATTTGGTATGTTTTT
GGTTTACATTTATTTTCATATATAAAGAAATATTTCTCCAAAGCATGAGG
TCCATATATAAGCTTGCTATTTCATAAATGAGATATGATGATGACCTTTG
TCATATATTAGATAAGTTCAGAAATTTACTATAAGAGGACTGAGTATGAA
TTTGAATTTTTCTTAGATGCTGGAAAAATAATCTCTATTTGGTAGACATT
TATTATTCCACCTGCCTTGTTTGGGTTTTTGTTAGTGTGGTAGTTAAAAT
TGCGATTTTACTTGTACGGTCTTGCAGTTTTACGATTTTATTACCCCTTG
CAATCACAACCATGCTCAAAAAATCGTTTCCTTTAAAACTCTGTTATTTT
CTCCAAACAGAAAGAGGTATTTTTGAAGGGAATTTGATATTATCGTATTT
TTTGGAAAAGATGTAGGACATAATGTGTTCATTTTTGCAGTTAATAGATT
ATAGTGTGATTTGCATTATCAAGGGTTTACCTCTGTTCATTGTTTTGCTA
ATTTTAGTCATATATGAATCATATAATATGATATACCCTAGTTTTTAAAC
AAGGTTTGTGTGCAATCCTAACAAGAAGACACCCGGTGTGATATGTGCCC
TTGATTTTTGCTAGATGTTTGAATGTCAAGGGGGCCCTTAACAAATCAGA
AATAACTCAAATAAAGAACTGGATTAAGACAAAGGGAATGAAAAGTTAAA
AGATGGTCTTCAATAATGTTTTTTACATGCAATGAAGCATGTAAAAAGAA
ATATTGGGAGAGAAATACAATGGTAGAAGTTATTGTATAAAGAGTATTTG
AAACCTAGAAAATAAATGAAAGTAACAAAATAAGATAGAAATGGAAGATA
ATCAATAAATTTGGAATCTGAAATGAAGGATTAATAACTTACTCATTGAA
TTATTCATTTAAATTAATTAAATTGAAATGAAAATTTCTTCAGAGTCCTT
ACTTTGAGATTGTGTACAGGCATTGACACGAGCAAGGGTTCCTATAGTAA
AGCTCATGGATCCAGTTACAGGAATCTCTTGTGACATATGCATCAACAAT
CTCCTTGCTGTTGTAAATACAAAGCTTCTTCGGGATTATGCACACATTGA
TGCAAGGTTGCGACAGCTGGCTTTTATCATTAAACATTGGGCAAAGTCAA
GAGGTGTCAATGAAACTTACCATGGGACCTTATCTAGCTATGCGTAAGTT
CTCTTCTTGTGTTATTCACTTCAAAACATTTTTTTTTTGTAAAATGAAGG
ACATGAATGAGTGATGGAATTGAAGTGCTGGTGAATGTCGTATGAAATAT
GACGCTGTAATTCTAATTTGTGCTATTCTAATTTCAGGTATGTTTTGATG
TGCATTCATTTCTTACAACAGCGACAACCTGCTATCCTTCCATGTTTACA
GGTGTGTACTGTAACTTCCATTCTTTTCTTCCAAACAGGATATATCTTCT
AGACATAAGCTTTCTTCTGCTACCTCATTATTTGTACTACTTACGGAAGT
AACCTTCATTTTATTCTGAACACATTAACTAGAATTCCTTTCATTATAGA
AAGTGAAAATCAATTCAGCAAAAAAACAAAAGAAAGTGAAAATCAAGTTA
ACCAAGTTTGTTAGGTTTCTCTTCATTAAGCACATCAAATTGTGTTATGT
TAATCCCTGAGTTGTTTTCGGACTGAAATTTTCAGTCATAGGATCAACTC
TAAGGAAAGCACTTTATATATTAATCATGTATGTAGGATTTGCAATGGTA
AAAAGATTCATCCACATTAAGTATGTCATACATGTTCACTCTGGCATGGC
TAATATCGTCACAAGAATAGCATTTATGCAATATTTTAAGCAAGCTTAGT
TGATTCCTCCTCATTAAGTATGGCATACATGTCACTTGAATAGTGTTTGT
ACATCATATATATGACTTAGTAATATAATACATGAATTTGTCGATTAAAT
ACCATTTTCTTTATAGGGGATGAAGACAACATACTCTGTGACTGTAGACA
ATGTTGATTGTGCATTCTTTGACCAAGTTGAAAAACTTGGTGAATTCGGC
CGACACAACAAGGAAAGCATTGCTCATCTTGTGTGGGGATTTTTCTATTA
TTGGGCATATTGTCATGATTATGCAAATTCTGTTATATCTGTTCGCACAG
GAAGCACAATTAGGTAAGAATTCTGTATCTATTAAACTTTTTTGTCATAG
TTCCTATCTTGAAAATATCATTATTTATTGTCACCTTTTTTTTATTGTTG
TATATGTTTTTTCTCGCTTTCTAACATGACTGAGAATATAAAATATCTAT
TAAACCATCAGTAATGCTAAATTCTGAGTAATGAAACTAACATAGTAACA
GATCTGAAATTGTTGATATAGACTTTTTATTTTACTGAATATAATACTTC
TTTTGTTGTAGCAAGCGAGATAAGGATTGGACAAGAAGGGTTGGCAACGA
TCGCCATTTGATATGTATTGAAGATCCTTTTGAAACATCTCACGATCTGG
GTCGAGTGGTAGATAAACACAGCATCAAAGTTCTCAGAGAAGAGTTTGAA
CGTGCTGCTGATATTATGCAATTTGATCCAAATCCATGCAATAAACTTTT
TGAGCCTTATGTACGTAGTTGA

gene from alignment at Ca_LG_5:14195493..14200064-

Legend: mRNA

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Ca_12685_ICC4958_v2 ID=Ca_12685_ICC4958_v2; Name=Ca_12685; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=4572bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_5:14195493..14200064- (Cicer arietinum
ATGAACGGCGATGGAGGAAACTTCCCACCGCCGCAATCCAACGGCGGTGA
TTTTCTCCTCTCCCTTCTTCAAAAACCTCACCTTCAACCATCCCAACCCC
CAACCATCCCACCTCTACAATCTCTTACAATAGATCCCGCCGTTGCCATG
ATGGGCCCCACAATCCCCATCTCCACATCTCCATATCTAACCAACGGTCA
CGATCATCCCAACCTTAACTATCTCCCTCACCACCCTCACCCTAATTTTC
CACCATGGTCCCACACACCTTCTCCATACACGCAAAACATATTCGGGTTA
ACCCATAACCCGTTTTCCCTCCCTCAAATACCCGAAACTCATTACCCTAA
CACCAATCCACTTCACTTCAACAACGGTGTTTCCCTCGCCGAAGATTTAA
GAAGATTAGGGTTTCCTATTGAAGGAAACAACAATAGCAACAGTGTTAAT
TCCTTCATTCACCAACAACAACAGCAACACCAATTGAATGAATTGAAGTT
ACAGTTTGGATCTTTACCCACTGTTTCGTTTGCTAATTCCTCTCCAGTGC
CTTCCAATGGAAACTACAATGGTTTTGATAGGAATAATAATAATCAAAAT
CACAATCATAATCATGATGCTGTTGATTATGAAAGAAGAGGGGTTATTGG
GAATTTTAGGTCAACTGGAATATCCACTGAACAAATTAGGGTTCCACCTA
GGTTTGTGAACGATACAAGAGGAAAGGGTTATTGGGGTTCTGAGGTTGGT
GAAGTTGAATTGAATGGTAGGAATGAGAATTTGTTTAGGGAAAATGTAAG
AATTGGGTTTGGTGAAAGGAGCAACAATTCTAGAGGCAATGTGGGTGGTG
GACATGAATTGAGGCTTCCTGATCAGATTGATCATCCTGGTCCACCGTCC
GGGAGTAAGCTTCATTCTGATGTTGTTGTTGATGATGATATTGATGCTGT
TGGAGAACAGTTAGCTGATTCGTTGTTGCTTGAGGATGAGCTTGATGACA
AGAGTAGTAACTCTAGGAGGCGCCGCGGACCTAGGGATAAGGTTAATAAT
ACTTAAATATTCGTTGGTATTTATTAAATAAGTTTTGTTCTGAATTTCAA
TTTCATTTATTTACTTGGAGTAACTGTTATTTGTTTTCATATTGTCAATG
TTATGGTTAATGGTTAGGATTTTTTTTTATAAATTTCTTAGGGAACTGTT
TATGAAAAAATCTAGGTTGTTGATTGAATTTTATGGTTAGCATTGTTGTC
AATCACAGATTGCGGAAAATAATAGTTTGTTCAAATTCTGCTGCTATAGC
CCCACTATTGTTGCTTTGGCAACATTTTGTACTAAATAGTGTATCAGGGA
ACAATAAAGATTTGTTTAGATTCCACTATGTTATAGCACTATAGCCGTTA
TTTTACAACATTGATAGTTAGATACCGAATATCATATAGTGAGAGGTTCA
TATGGTATTTATTTATCTATCTTCGTAGTATAAATGAAATGGAATCTTAA
AGCATGAGGTTAACTGACAACATTTATTATCAGGATGCGAGATCATCAGA
CTCGAGAGGAACACAGTTGCTAAGCCAGCGGGCAAGATCGTATAAAAGAC
AAATGATGTGCCGCAGGGACATAGATAATCTTAGTGTTCCTTTCCTTGCA
ATATATGAGTCTTTAATACCACCGCAAGAAGAAAAGCTGAAGCAGAAACA
ATTGTTAGCGTTATTGGAGAAGTTAGTTTGCAAGGAGTGGCCAATGGCTC
GGCTTTATCTCTATGGATCATGTGCTAATTCATTCGGTGTTTCTAAAAGT
GACATTGATGTTTGCCTTGCTATTCAGGAAGCTGACATGGACAAATCTAA
GATAATAATGAAATTGGCTGATATTTTGCAATCAGATAACCTCCAGAATG
TTCAGGTGAGATTTTTGCTGTGTCCTCTTAAATTGATTTGGTATGTTTTT
GGTTTACATTTATTTTCATATATAAAGAAATATTTCTCCAAAGCATGAGG
TCCATATATAAGCTTGCTATTTCATAAATGAGATATGATGATGACCTTTG
TCATATATTAGATAAGTTCAGAAATTTACTATAAGAGGACTGAGTATGAA
TTTGAATTTTTCTTAGATGCTGGAAAAATAATCTCTATTTGGTAGACATT
TATTATTCCACCTGCCTTGTTTGGGTTTTTGTTAGTGTGGTAGTTAAAAT
TGCGATTTTACTTGTACGGTCTTGCAGTTTTACGATTTTATTACCCCTTG
CAATCACAACCATGCTCAAAAAATCGTTTCCTTTAAAACTCTGTTATTTT
CTCCAAACAGAAAGAGGTATTTTTGAAGGGAATTTGATATTATCGTATTT
TTTGGAAAAGATGTAGGACATAATGTGTTCATTTTTGCAGTTAATAGATT
ATAGTGTGATTTGCATTATCAAGGGTTTACCTCTGTTCATTGTTTTGCTA
ATTTTAGTCATATATGAATCATATAATATGATATACCCTAGTTTTTAAAC
AAGGTTTGTGTGCAATCCTAACAAGAAGACACCCGGTGTGATATGTGCCC
TTGATTTTTGCTAGATGTTTGAATGTCAAGGGGGCCCTTAACAAATCAGA
AATAACTCAAATAAAGAACTGGATTAAGACAAAGGGAATGAAAAGTTAAA
AGATGGTCTTCAATAATGTTTTTTACATGCAATGAAGCATGTAAAAAGAA
ATATTGGGAGAGAAATACAATGGTAGAAGTTATTGTATAAAGAGTATTTG
AAACCTAGAAAATAAATGAAAGTAACAAAATAAGATAGAAATGGAAGATA
ATCAATAAATTTGGAATCTGAAATGAAGGATTAATAACTTACTCATTGAA
TTATTCATTTAAATTAATTAAATTGAAATGAAAATTTCTTCAGAGTCCTT
ACTTTGAGATTGTGTACAGGCATTGACACGAGCAAGGGTTCCTATAGTAA
AGCTCATGGATCCAGTTACAGGAATCTCTTGTGACATATGCATCAACAAT
CTCCTTGCTGTTGTAAATACAAAGCTTCTTCGGGATTATGCACACATTGA
TGCAAGGTTGCGACAGCTGGCTTTTATCATTAAACATTGGGCAAAGTCAA
GAGGTGTCAATGAAACTTACCATGGGACCTTATCTAGCTATGCGTAAGTT
CTCTTCTTGTGTTATTCACTTCAAAACATTTTTTTTTTGTAAAATGAAGG
ACATGAATGAGTGATGGAATTGAAGTGCTGGTGAATGTCGTATGAAATAT
GACGCTGTAATTCTAATTTGTGCTATTCTAATTTCAGGTATGTTTTGATG
TGCATTCATTTCTTACAACAGCGACAACCTGCTATCCTTCCATGTTTACA
GGTGTGTACTGTAACTTCCATTCTTTTCTTCCAAACAGGATATATCTTCT
AGACATAAGCTTTCTTCTGCTACCTCATTATTTGTACTACTTACGGAAGT
AACCTTCATTTTATTCTGAACACATTAACTAGAATTCCTTTCATTATAGA
AAGTGAAAATCAATTCAGCAAAAAAACAAAAGAAAGTGAAAATCAAGTTA
ACCAAGTTTGTTAGGTTTCTCTTCATTAAGCACATCAAATTGTGTTATGT
TAATCCCTGAGTTGTTTTCGGACTGAAATTTTCAGTCATAGGATCAACTC
TAAGGAAAGCACTTTATATATTAATCATGTATGTAGGATTTGCAATGGTA
AAAAGATTCATCCACATTAAGTATGTCATACATGTTCACTCTGGCATGGC
TAATATCGTCACAAGAATAGCATTTATGCAATATTTTAAGCAAGCTTAGT
TGATTCCTCCTCATTAAGTATGGCATACATGTCACTTGAATAGTGTTTGT
ACATCATATATATGACTTAGTAATATAATACATGAATTTGTCGATTAAAT
ACCATTTTCTTTATAGGGGATGAAGACAACATACTCTGTGACTGTAGACA
ATGTTGATTGTGCATTCTTTGACCAAGTTGAAAAACTTGGTGAATTCGGC
CGACACAACAAGGAAAGCATTGCTCATCTTGTGTGGGGATTTTTCTATTA
TTGGGCATATTGTCATGATTATGCAAATTCTGTTATATCTGTTCGCACAG
GAAGCACAATTAGGTAAGAATTCTGTATCTATTAAACTTTTTTGTCATAG
TTCCTATCTTGAAAATATCATTATTTATTGTCACCTTTTTTTTATTGTTG
TATATGTTTTTTCTCGCTTTCTAACATGACTGAGAATATAAAATATCTAT
TAAACCATCAGTAATGCTAAATTCTGAGTAATGAAACTAACATAGTAACA
GATCTGAAATTGTTGATATAGACTTTTTATTTTACTGAATATAATACTTC
TTTTGTTGTAGCAAGCGAGATAAGGATTGGACAAGAAGGGTTGGCAACGA
TCGCCATTTGATATGTATTGAAGATCCTTTTGAAACATCTCACGATCTGG
GTCGAGTGGTAGATAAACACAGCATCAAAGTTCTCAGAGAAGAGTTTGAA
CGTGCTGCTGATATTATGCAATTTGATCCAAATCCATGCAATAAACTTTT
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