Ca_11420, Ca_11420_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_11420
Unique NameCa_11420_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length3713
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_4supercontigCa_LG_4:46022302..46026014 +Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_11420.1Ca_11420.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_11420_ICC4958_v2 ID=Ca_11420_ICC4958_v2; Name=Ca_11420; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=3713bp
ATGGACCCTGAGGGGAAACTTATAATGGGGTTCAGGAAGGCAACAGATTC
TGCTTCAGTACAGGTAATAATCACTTTTAGCTCATACAGCATACTCAAAC
TTATTGAATTGATATTAAATTACCTATTAAGCAGGAAACTTTTCCGTCTA
AAATGCACAATGGTTCTCATTCAAGTGAAACTTCCTATTCTGGTGTTTAT
GTGAATGTACCTATATTAAGTGGTTACTCTGGCCTTCTTCAGTCACAAAA
GGGATGTTCAGAAAACCACCTAAATGCGCTGTCTAATAGATGGAACTCAG
CTGGTGGTGACATGGATTGGCATAATGTAGAAATGCCTCAAAGCAGGAAA
AGAGATGGATTGTGTTTGCCACCCATTCTGGTTCCCGAGAAGAAAAAAAC
TCGAAATATTGGGTCAAAAAGTAAGAGGTTGCTTATTGATAGCCAGGATG
CACTGGAGCTGAAACTTACTTGGGAAGAGGCTCAGGATTTACTTTGTCCA
CCTCTAGCAGTTAAGCCAAGTGTTGTCATGATTGAGGATCACCTATTTGA
AGAATATGAAGTGAGTATACTATTTATAACCAGTAATTATTTATGAAATT
ATCTCGTTCGTGTTGTCATACATATATACATTTGACAGAGAAAGAGAATC
TTTCACTAGCTCTAATCATTTAATTATTGCATTAATTTGCCATCCAAACT
TTTACAGTTCAGGTGAATCTAAATCTCAGAAGAATATATAACTTGTTAGG
AACTTTTCTGAAATAACTTCTAAGAAGAGTTGATGGGTAGGGGATGACTA
TGTAATTTTGTAACTAGAAAGAATGGAGGCATAAGTTTCAAAACCCTCTC
TTGAAGAATCAAGAGATATCAGATTTGATTCTCTATGATTTTATATTATT
CTCTTTTTTTTTTAATTTTTTTTATGATTTCGTCATTACTATAACTATTG
TAATATATTTCCTATATTAACAGTCTAAAGCTATAGTAATAAAATATGAA
AATATTATTCCATTAGTTTCTTCATCTTCCAATTAGGTTGCCCCTATAAT
GTACTCATTTTTTTAATGTGGACTTTACTTGCATCAATCTGTCAGTACAG
TAACTAATATTGGAGTTACAAATTTTATTATCTCTGCTCAACTAATATTT
CACACATCGCAGTGATTAAATTTGTGTGGATAACATATAAAGCTAAAGTA
CTTCCATTTATTTTTAGGTCTTAATACGTTAACTTTTGAAGTAAAGTCTC
GACTAATGTGGTTACATTTTATTATACAGCATGTATAAGATCTTCCTTAT
ATGTTAACTTCAACTCATGCAGCAACCTCCTGTCTTTGGAAAGAAGAGTA
TATTTGTGGTACGATCAACTGGGTAAGATGAATGTATGCATTATTTTTTT
TATTGCTTGCATCTTTTATATTTTATATTGAACTTAATGATATTTCTTTT
AGAAAGTTCTACAAATACAGAAGCTTATATATTTCAACAAAGCCTGAAAA
TTTGGAGTATGACTGTACCTCAGGATAAATGAGCAATGGACACAGTGTGA
TAGTTGCTTAAAATGGCGGAAGTTACCAGTTGATGTACTTATTCCCCCTA
ATTGGACATGTATGGAGAATTTATGGGATCAAAGCAGGTGAGTAGAAGAC
TCTATCGTGATGTTGTTATTTGCCAAAAACTTGTTTTTAGTAAAACCTTT
GTGCTTCTGCATTGCTGTCAGCAGGTGTTCATGTGCTGCTCCCAATGAAT
TGAACCCAAGGGAACTGGATAATCTTTTGAGAATGAACAAGGGTATTTCT
CTATTTCATGCTTTAATTTATTAAAAACACGCTTTGCTTTTATAGTTACT
GTTGATCATAAATCCTGGTAGAAAATGGTTTTATCTTCAATTAGTTGACC
TTGCATTTGAAGCTATGCTTCCTTTCAGAGAGAATTTTCCTATTAGTATT
TGTTACAAATGGTTTTGAAATATGTCTTTATTAGGTTCTTATATTGTACC
TACCTCGTCCTTACAATATCAGCTTGTTAGACGAGGAGTAGCTCTCTTTA
TAAACTTACTTGAGACCTTCTTATCTTTAATTTATTTGGGACTTGGGTTT
TTTCCAATACATCCCTCAAGCCCAGTACTATTGGTCGTGGTGCGTGGATG
TAAATGGTGGGTAGCCCGGACCGATAGACTCTTATACCATATTAAGTTTT
TATATTAGACCTAACTCATTCTTACAAAACCGGCTTATAAGACGAGAGTG
ACTCACTTTATAAACTCATTTGATTCCTAATGGGCTTCCGTTTTAAATTT
GGATGAGAGTGACTGCAAGTCACATTCTGTTGATGAGCTTTTATTGCTAT
TTCCTTGTTCTTGGTTTTGTTTTTCTTTCTTCCTTTTTTGTGTCTCTTAA
AAAGGAAACACATGCACAACTGAAAACACAAAAGCCTCTTCAGTATCTTA
TTCTTGTTTACATATTTAGTTCATATGTTTGAATTAGGAGAATCGAAAAT
CTGTACAATGTACAATTAGTACAGATATTTAAATAAATGCACAGGATGGT
TATAAATGTTAAGTATTGATTTTTATGCATGATCTATTTCCATCTTTCGA
TTGTTGATAAATTTATCAAAACTGATTAGCATACAAGGTATATACATAGT
GAGTTTTAAAATGCCATCCTAGCACGTTTTCTATCATTCTTATCTTTAAC
TGATCTTGAGCCTCCGCTTGAAAGAACCAATATGACCAGAATGTGACTTG
CATAATGCTTTCTACTAGGGTGTTGCTACCATGGAGCTGTTGCTTTTGTT
AGCAAGTTATGTCTTAATACTTCGTGCTAACCCTTATTAGTTTTCAAATT
ATCTGTTTTGAATGAACTTAACAAATCCATAATCCCAAACTATGCTGCAT
GAGTAAAGACAGTGATTTTGTGATTGTTATACATGCATGTAGACACGTTT
TTCATGCAAACCAATTCATTTATTCTAAAACATTTAAATCCATCATTTCG
GAATAGAGTTCAAGAAACAAAGACTAGCAGCAGCTAGCCAGAGGTCAGCA
CTGGAACGTGAATCTTCTGGTCTTGATGCTTTGTCAAATGCTGCAATAGT
TGGAGATGATGCAAGTGACTCTGGCAGGACCCCAGTTGTGACCACCACAA
GACATCCTCGTCATAGACCCGGGTGCTCCTGCATCGTTTGTATCCAGCCA
CCAAGTGGAAAGGGCAAACACAAACCTACATGCACCTGTAACGTGTGCAT
GACAGTTAAACGTCGGTTTAAAACCCTGATGATGCGAAAGAAGAAACGTC
AATCTGAGAGGGAAGCTGAGATTGCTCAGAAAAATATGCTATCATGGAGG
ACCAAAGATGAATCAGAAGGAGACAGCACCTCTCGACATTTAACTCCAGT
TGGTGGTTCGGAGAATCAAGCAACAGTGCTAAATGAGTTGGATTCAAGGA
GTCAAGACCATGTGTCTGAAGCAGCTAAGGGACAATTAGACCTGAATTGC
CAACCAGACCGAGAAGTCATGCAATCTGGGCAAAACACTCTGACCATGAT
GACTCTTCTTGAAGAAGCAATTCTCCCCCTGGAGACATACTTGAAGCAAA
ATGGTCTTTCTAGCTTGATATCAGAGCAGCAAACAAATTCAGATACAAAT
GTGCAGGCACAGACAACCAATGAGAGTGAGGGTAGACAAAATGAAGACAC
TTTTTCCTCGTAA
back to top

gene from alignment at Ca_LG_4:46022302..46026014+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_11420_ICC4958_v2 ID=Ca_11420_ICC4958_v2; Name=Ca_11420; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=3713bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_4:46022302..46026014+ (Cicer arietinum
ATGGACCCTGAGGGGAAACTTATAATGGGGTTCAGGAAGGCAACAGATTC
TGCTTCAGTACAGGTAATAATCACTTTTAGCTCATACAGCATACTCAAAC
TTATTGAATTGATATTAAATTACCTATTAAGCAGGAAACTTTTCCGTCTA
AAATGCACAATGGTTCTCATTCAAGTGAAACTTCCTATTCTGGTGTTTAT
GTGAATGTACCTATATTAAGTGGTTACTCTGGCCTTCTTCAGTCACAAAA
GGGATGTTCAGAAAACCACCTAAATGCGCTGTCTAATAGATGGAACTCAG
CTGGTGGTGACATGGATTGGCATAATGTAGAAATGCCTCAAAGCAGGAAA
AGAGATGGATTGTGTTTGCCACCCATTCTGGTTCCCGAGAAGAAAAAAAC
TCGAAATATTGGGTCAAAAAGTAAGAGGTTGCTTATTGATAGCCAGGATG
CACTGGAGCTGAAACTTACTTGGGAAGAGGCTCAGGATTTACTTTGTCCA
CCTCTAGCAGTTAAGCCAAGTGTTGTCATGATTGAGGATCACCTATTTGA
AGAATATGAAGTGAGTATACTATTTATAACCAGTAATTATTTATGAAATT
ATCTCGTTCGTGTTGTCATACATATATACATTTGACAGAGAAAGAGAATC
TTTCACTAGCTCTAATCATTTAATTATTGCATTAATTTGCCATCCAAACT
TTTACAGTTCAGGTGAATCTAAATCTCAGAAGAATATATAACTTGTTAGG
AACTTTTCTGAAATAACTTCTAAGAAGAGTTGATGGGTAGGGGATGACTA
TGTAATTTTGTAACTAGAAAGAATGGAGGCATAAGTTTCAAAACCCTCTC
TTGAAGAATCAAGAGATATCAGATTTGATTCTCTATGATTTTATATTATT
CTCTTTTTTTTTTAATTTTTTTTATGATTTCGTCATTACTATAACTATTG
TAATATATTTCCTATATTAACAGTCTAAAGCTATAGTAATAAAATATGAA
AATATTATTCCATTAGTTTCTTCATCTTCCAATTAGGTTGCCCCTATAAT
GTACTCATTTTTTTAATGTGGACTTTACTTGCATCAATCTGTCAGTACAG
TAACTAATATTGGAGTTACAAATTTTATTATCTCTGCTCAACTAATATTT
CACACATCGCAGTGATTAAATTTGTGTGGATAACATATAAAGCTAAAGTA
CTTCCATTTATTTTTAGGTCTTAATACGTTAACTTTTGAAGTAAAGTCTC
GACTAATGTGGTTACATTTTATTATACAGCATGTATAAGATCTTCCTTAT
ATGTTAACTTCAACTCATGCAGCAACCTCCTGTCTTTGGAAAGAAGAGTA
TATTTGTGGTACGATCAACTGGGTAAGATGAATGTATGCATTATTTTTTT
TATTGCTTGCATCTTTTATATTTTATATTGAACTTAATGATATTTCTTTT
AGAAAGTTCTACAAATACAGAAGCTTATATATTTCAACAAAGCCTGAAAA
TTTGGAGTATGACTGTACCTCAGGATAAATGAGCAATGGACACAGTGTGA
TAGTTGCTTAAAATGGCGGAAGTTACCAGTTGATGTACTTATTCCCCCTA
ATTGGACATGTATGGAGAATTTATGGGATCAAAGCAGGTGAGTAGAAGAC
TCTATCGTGATGTTGTTATTTGCCAAAAACTTGTTTTTAGTAAAACCTTT
GTGCTTCTGCATTGCTGTCAGCAGGTGTTCATGTGCTGCTCCCAATGAAT
TGAACCCAAGGGAACTGGATAATCTTTTGAGAATGAACAAGGGTATTTCT
CTATTTCATGCTTTAATTTATTAAAAACACGCTTTGCTTTTATAGTTACT
GTTGATCATAAATCCTGGTAGAAAATGGTTTTATCTTCAATTAGTTGACC
TTGCATTTGAAGCTATGCTTCCTTTCAGAGAGAATTTTCCTATTAGTATT
TGTTACAAATGGTTTTGAAATATGTCTTTATTAGGTTCTTATATTGTACC
TACCTCGTCCTTACAATATCAGCTTGTTAGACGAGGAGTAGCTCTCTTTA
TAAACTTACTTGAGACCTTCTTATCTTTAATTTATTTGGGACTTGGGTTT
TTTCCAATACATCCCTCAAGCCCAGTACTATTGGTCGTGGTGCGTGGATG
TAAATGGTGGGTAGCCCGGACCGATAGACTCTTATACCATATTAAGTTTT
TATATTAGACCTAACTCATTCTTACAAAACCGGCTTATAAGACGAGAGTG
ACTCACTTTATAAACTCATTTGATTCCTAATGGGCTTCCGTTTTAAATTT
GGATGAGAGTGACTGCAAGTCACATTCTGTTGATGAGCTTTTATTGCTAT
TTCCTTGTTCTTGGTTTTGTTTTTCTTTCTTCCTTTTTTGTGTCTCTTAA
AAAGGAAACACATGCACAACTGAAAACACAAAAGCCTCTTCAGTATCTTA
TTCTTGTTTACATATTTAGTTCATATGTTTGAATTAGGAGAATCGAAAAT
CTGTACAATGTACAATTAGTACAGATATTTAAATAAATGCACAGGATGGT
TATAAATGTTAAGTATTGATTTTTATGCATGATCTATTTCCATCTTTCGA
TTGTTGATAAATTTATCAAAACTGATTAGCATACAAGGTATATACATAGT
GAGTTTTAAAATGCCATCCTAGCACGTTTTCTATCATTCTTATCTTTAAC
TGATCTTGAGCCTCCGCTTGAAAGAACCAATATGACCAGAATGTGACTTG
CATAATGCTTTCTACTAGGGTGTTGCTACCATGGAGCTGTTGCTTTTGTT
AGCAAGTTATGTCTTAATACTTCGTGCTAACCCTTATTAGTTTTCAAATT
ATCTGTTTTGAATGAACTTAACAAATCCATAATCCCAAACTATGCTGCAT
GAGTAAAGACAGTGATTTTGTGATTGTTATACATGCATGTAGACACGTTT
TTCATGCAAACCAATTCATTTATTCTAAAACATTTAAATCCATCATTTCG
GAATAGAGTTCAAGAAACAAAGACTAGCAGCAGCTAGCCAGAGGTCAGCA
CTGGAACGTGAATCTTCTGGTCTTGATGCTTTGTCAAATGCTGCAATAGT
TGGAGATGATGCAAGTGACTCTGGCAGGACCCCAGTTGTGACCACCACAA
GACATCCTCGTCATAGACCCGGGTGCTCCTGCATCGTTTGTATCCAGCCA
CCAAGTGGAAAGGGCAAACACAAACCTACATGCACCTGTAACGTGTGCAT
GACAGTTAAACGTCGGTTTAAAACCCTGATGATGCGAAAGAAGAAACGTC
AATCTGAGAGGGAAGCTGAGATTGCTCAGAAAAATATGCTATCATGGAGG
ACCAAAGATGAATCAGAAGGAGACAGCACCTCTCGACATTTAACTCCAGT
TGGTGGTTCGGAGAATCAAGCAACAGTGCTAAATGAGTTGGATTCAAGGA
GTCAAGACCATGTGTCTGAAGCAGCTAAGGGACAATTAGACCTGAATTGC
CAACCAGACCGAGAAGTCATGCAATCTGGGCAAAACACTCTGACCATGAT
GACTCTTCTTGAAGAAGCAATTCTCCCCCTGGAGACATACTTGAAGCAAA
ATGGTCTTTCTAGCTTGATATCAGAGCAGCAAACAAATTCAGATACAAAT
GTGCAGGCACAGACAACCAATGAGAGTGAGGGTAGACAAAATGAAGACAC
TTTTTCCTCGTAA
back to top