Ca_12254, Ca_12254_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_12254
Unique NameCa_12254_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length3169
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_5supercontigCa_LG_5:6701376..6704544 -Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_12254.1Ca_12254.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_12254_ICC4958_v2 ID=Ca_12254_ICC4958_v2; Name=Ca_12254; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=3169bp
GTAGTGAACGGTGAAAGCTTTACCTTTTCCGGAAACCAGTTTGCAACTGA
ATTGTCGAAAGCACAGATTAGTATCTGAACTATGGAATTGAGTTTTGATG
AGAATGATTTCTTGTCATGCTGTGGAAGCACCCAATTCGCCAAACTCATG
GCTTCATTCTCTCCTTTCTCTTCCCACCACCATGCCGTTTCTATTGCCAG
AGACATTTGGTTTAACAACGTTCATGTCAATGCTTGGTTACAAGCTTTCT
CCGCTCACCCTTCTATTGGTCAAACTCGTTCTCCTTCTCATGCTTCTCAA
ACCAGTGCTCAGTTCAGTCATCATCAATCTCTTACGCTTTTTCTTTTTTT
TTTTACCTATCTGGGTCTCTCTCTTTTTTGTATGTTGATTTTAAAAATTA
TTACTTTAGTGTAAATTTTGTGTTTTTCATTTGTGGGTTTTTCTCATTTT
GTGTCTACGTTTGAAATTTTAGGATGCTGATAGTAATTGAAGTCAAAAAC
TTGATTGGGTCTTGCTGATTTAGTGCATGTTTGGTTCCGCTTTTGAAGGA
GTCGAAATCAATTTTTTAGTTGGAAAATTGATTTTGCCATGTTTGGACAC
TATAGAGTAGAATTGATTTTGACTATATAATAATTGATTCTAATTTGAAG
GTTGGATTTGTAGCTTTTGAGTCTGAGCGTAAGTGAAATTTATTTTTAAA
ACTTACTTTTACATGAATATCAAACATAAATCATTTTACATTGTAAAACC
AAACACACATATGCATTGTATAAGTATAAATCAGTATACTACTATTTTGT
CACATCACCCCGTTTTTGTAAGGGTATTTTGAAGTTGATGGTATGTTATG
GAAAATCGTGGTTTTTGATTGGATGTCAGTGTAAAATGGATTTATACCAA
CATGTATGCCTACTAAATTTAGTGTCTTTATTTGGAATTTTGTGATAGTG
TTGCAATGGAATTTGTCTGTTTAGTGATTCTTCTAATTCTATTCATGTTT
TTAACCATCTGGGTTGCTTTCTCTCTCTTCTTTGCATTGATATGAAAAAC
TTGAATGATTTTAGTATTAAGGTTAGGTGTTCATTTGTGATGTATGAAAT
GGCATTCGGTAAAAATAGTTCATTTCTTGCTCAATTAGCAAATTATTGTT
TGTAACTTGTTGAAGTAACTGGTTTTGGCAGGTGGAGTAAGGGAGAACAA
TCAACTGCTTTAGCTACTGCTACTGGTTCTAGTTTACAGGTTTGCTTGCT
GCTATTGAAATGCTGCCAAATGCCAATACTTTAGTGCTGTTTCATGTACT
GTGAAATATTTGGAAACTGATTGTTCTCTGGCTTTCTATCAGAATATTTA
AGATAATTTGTGTAATGTAAGAGTATTGAATTGAAAAGCACCTTTTTCTA
TAAGTTGATCATTTCATTTTGCATCCTTCATTGGCTGGACCTGCATCACG
GTTCACGGTCGATTTTATCATTTCTATGGAGGAACCATTTATCCATTAAC
GAAATTGAGCCATGGACGAGGCAATAAACATGTGGTTGTAGGGTTAATTC
AACTTCTATGTTCTTTAGCGATTATGAATTTATGATAGTTAGTAATCTAC
TCGTGATCTGTTTGGCTTTTGCAGGAACTAGCTGAATGGAATGCTCGGTA
TATGCAAAAGTTTGGGTTTGTATTTCTCATATGTGCATCTGGGAGAAGCA
CTGATGAGATACTTGCTGAACTGAAGGTAAAAATGAATTTGAAGTCTAGT
CTTGGAAATATTTTTACTTATTTATTTCAAGTCTGAAAGGTTAATCTCTC
TTTTGTTATTTTAGTAAGAATGTACATTTGATTCTTATTTAAAGGCAAAC
AGTAGGTTAAGTACTTTTTTTGTAGATTGAGCTAGTAGTGAGAGTGATGG
AATTTCTTTTGCTATTTTAGTAAGAATGTACATTTGTTTTCAACGGCGCA
GAGACGTTACACAAACAGGCCAATTGTTGAATTTGAGATTGCAGCTGAGG
AACAAATGAAAATTACGGAACTGCGCCTCGCAAAGCTCTTTTCAAGTAGA
GAAAACATATCTTCTACAACTGATAAATGTTCCACCATTGTCGCCAAAAA
GGCAGAAGGTACTTTCAAATATTTTGTTATGTTTGGTTATTTTAAAAGCA
CTTTTCAAATTTGGATCTTATCCCAAAAGGTAGCTTTGTGTTCTAATTGT
TTCAATGATTGTGATAACCATTGTACTATTTTAATGATAACATATAATAT
CGTAAAGTTAGTTAAAATTTGCTTATATTTTGAACCATCATACATGTCTA
TATTTTTGCTTGTTTTTTGTTTCCAATCGTATGTAGTATGAATGTTCAGA
TCAAAAACTTCTAGTTTTACATCATGATATTTCTCTCATACTTATCGTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTGGATGCTAGAAGATCGTATAAGCA
TTATTGGTGGTCATGTTAACGCTGCTTCGGAGAATTTATCAGGAAAATCA
ACCCAAAATCCATCCAGAACCCGCCCACCTATCACCACTCATGTGTTGGA
TGTTTCGCGGGGTTGTCCAGCTTCCGGTATCGAGGTACTTTTGGAGGTGT
GGAAGGGAAATAAAGCTCGTCCGACATTTGGGGCTGCAGATAGTGGCAGT
TGGGTGGTTCAAGGGTCTTCAACAACCAATTTAGACGGCCGAAGCGGTCA
ACTGTTGAACATAGTTGATGATGTGAATCCAGGGATATACAGGATAAGTT
TCAACACAGGGAAGTATAATCCAAGTGGTTTCTTTCCATATGTGTCTATT
GTGTTTGAAATCTTGGAGTCACAGAAAAAGGAGCATTTTCATGTTCCTCT
GCTGTTTTCGCCATTTTCATTCAGCACTTACCGCGGAAGCTAGAAGACAT
ATGAGTGAGAACTGTTGCACTATCAATGCATAATGTGTTCCTTATGTGCT
ATGAATATTTGCAAGTTTTCATGAAGTGAACTTTGTGTTTGTGCCCATTG
AACATTGGAAGGATACCAAATATGAAAAGATAATAAGTGTATCAATGTTG
TTTTTCTTGATGTATGATATCAGTACTATAGGATAATAATTGAGTCTTGC
AATGTTTTTTAAATAATTGTATTTATAAACTCTGTAGCACTGACACCTCT
TATCAAAGTCATGTCACAC
back to top

gene from alignment at Ca_LG_5:6701376..6704544-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_12254_ICC4958_v2 ID=Ca_12254_ICC4958_v2; Name=Ca_12254; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=3169bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_5:6701376..6704544- (Cicer arietinum
GTAGTGAACGGTGAAAGCTTTACCTTTTCCGGAAACCAGTTTGCAACTGA
ATTGTCGAAAGCACAGATTAGTATCTGAACTATGGAATTGAGTTTTGATG
AGAATGATTTCTTGTCATGCTGTGGAAGCACCCAATTCGCCAAACTCATG
GCTTCATTCTCTCCTTTCTCTTCCCACCACCATGCCGTTTCTATTGCCAG
AGACATTTGGTTTAACAACGTTCATGTCAATGCTTGGTTACAAGCTTTCT
CCGCTCACCCTTCTATTGGTCAAACTCGTTCTCCTTCTCATGCTTCTCAA
ACCAGTGCTCAGTTCAGTCATCATCAATCTCTTACGCTTTTTCTTTTTTT
TTTTACCTATCTGGGTCTCTCTCTTTTTTGTATGTTGATTTTAAAAATTA
TTACTTTAGTGTAAATTTTGTGTTTTTCATTTGTGGGTTTTTCTCATTTT
GTGTCTACGTTTGAAATTTTAGGATGCTGATAGTAATTGAAGTCAAAAAC
TTGATTGGGTCTTGCTGATTTAGTGCATGTTTGGTTCCGCTTTTGAAGGA
GTCGAAATCAATTTTTTAGTTGGAAAATTGATTTTGCCATGTTTGGACAC
TATAGAGTAGAATTGATTTTGACTATATAATAATTGATTCTAATTTGAAG
GTTGGATTTGTAGCTTTTGAGTCTGAGCGTAAGTGAAATTTATTTTTAAA
ACTTACTTTTACATGAATATCAAACATAAATCATTTTACATTGTAAAACC
AAACACACATATGCATTGTATAAGTATAAATCAGTATACTACTATTTTGT
CACATCACCCCGTTTTTGTAAGGGTATTTTGAAGTTGATGGTATGTTATG
GAAAATCGTGGTTTTTGATTGGATGTCAGTGTAAAATGGATTTATACCAA
CATGTATGCCTACTAAATTTAGTGTCTTTATTTGGAATTTTGTGATAGTG
TTGCAATGGAATTTGTCTGTTTAGTGATTCTTCTAATTCTATTCATGTTT
TTAACCATCTGGGTTGCTTTCTCTCTCTTCTTTGCATTGATATGAAAAAC
TTGAATGATTTTAGTATTAAGGTTAGGTGTTCATTTGTGATGTATGAAAT
GGCATTCGGTAAAAATAGTTCATTTCTTGCTCAATTAGCAAATTATTGTT
TGTAACTTGTTGAAGTAACTGGTTTTGGCAGGTGGAGTAAGGGAGAACAA
TCAACTGCTTTAGCTACTGCTACTGGTTCTAGTTTACAGGTTTGCTTGCT
GCTATTGAAATGCTGCCAAATGCCAATACTTTAGTGCTGTTTCATGTACT
GTGAAATATTTGGAAACTGATTGTTCTCTGGCTTTCTATCAGAATATTTA
AGATAATTTGTGTAATGTAAGAGTATTGAATTGAAAAGCACCTTTTTCTA
TAAGTTGATCATTTCATTTTGCATCCTTCATTGGCTGGACCTGCATCACG
GTTCACGGTCGATTTTATCATTTCTATGGAGGAACCATTTATCCATTAAC
GAAATTGAGCCATGGACGAGGCAATAAACATGTGGTTGTAGGGTTAATTC
AACTTCTATGTTCTTTAGCGATTATGAATTTATGATAGTTAGTAATCTAC
TCGTGATCTGTTTGGCTTTTGCAGGAACTAGCTGAATGGAATGCTCGGTA
TATGCAAAAGTTTGGGTTTGTATTTCTCATATGTGCATCTGGGAGAAGCA
CTGATGAGATACTTGCTGAACTGAAGGTAAAAATGAATTTGAAGTCTAGT
CTTGGAAATATTTTTACTTATTTATTTCAAGTCTGAAAGGTTAATCTCTC
TTTTGTTATTTTAGTAAGAATGTACATTTGATTCTTATTTAAAGGCAAAC
AGTAGGTTAAGTACTTTTTTTGTAGATTGAGCTAGTAGTGAGAGTGATGG
AATTTCTTTTGCTATTTTAGTAAGAATGTACATTTGTTTTCAACGGCGCA
GAGACGTTACACAAACAGGCCAATTGTTGAATTTGAGATTGCAGCTGAGG
AACAAATGAAAATTACGGAACTGCGCCTCGCAAAGCTCTTTTCAAGTAGA
GAAAACATATCTTCTACAACTGATAAATGTTCCACCATTGTCGCCAAAAA
GGCAGAAGGTACTTTCAAATATTTTGTTATGTTTGGTTATTTTAAAAGCA
CTTTTCAAATTTGGATCTTATCCCAAAAGGTAGCTTTGTGTTCTAATTGT
TTCAATGATTGTGATAACCATTGTACTATTTTAATGATAACATATAATAT
CGTAAAGTTAGTTAAAATTTGCTTATATTTTGAACCATCATACATGTCTA
TATTTTTGCTTGTTTTTTGTTTCCAATCGTATGTAGTATGAATGTTCAGA
TCAAAAACTTCTAGTTTTACATCATGATATTTCTCTCATACTTATCGTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTGGATGCTAGAAGATCGTATAAGCA
TTATTGGTGGTCATGTTAACGCTGCTTCGGAGAATTTATCAGGAAAATCA
ACCCAAAATCCATCCAGAACCCGCCCACCTATCACCACTCATGTGTTGGA
TGTTTCGCGGGGTTGTCCAGCTTCCGGTATCGAGGTACTTTTGGAGGTGT
GGAAGGGAAATAAAGCTCGTCCGACATTTGGGGCTGCAGATAGTGGCAGT
TGGGTGGTTCAAGGGTCTTCAACAACCAATTTAGACGGCCGAAGCGGTCA
ACTGTTGAACATAGTTGATGATGTGAATCCAGGGATATACAGGATAAGTT
TCAACACAGGGAAGTATAATCCAAGTGGTTTCTTTCCATATGTGTCTATT
GTGTTTGAAATCTTGGAGTCACAGAAAAAGGAGCATTTTCATGTTCCTCT
GCTGTTTTCGCCATTTTCATTCAGCACTTACCGCGGAAGCTAGAAGACAT
ATGAGTGAGAACTGTTGCACTATCAATGCATAATGTGTTCCTTATGTGCT
ATGAATATTTGCAAGTTTTCATGAAGTGAACTTTGTGTTTGTGCCCATTG
AACATTGGAAGGATACCAAATATGAAAAGATAATAAGTGTATCAATGTTG
TTTTTCTTGATGTATGATATCAGTACTATAGGATAATAATTGAGTCTTGC
AATGTTTTTTAAATAATTGTATTTATAAACTCTGTAGCACTGACACCTCT
TATCAAAGTCATGTCACAC
back to top