Ca_12681, Ca_12681_ICC4958_v2 (gene) Cicer arietinum

Gene Overview
NameCa_12681
Unique NameCa_12681_ICC4958_v2
Typegene
OrganismCicer arietinum (chickpea)
Sequence length5458
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Ca_LG_5supercontigCa_LG_5:14155829..14161286 +Cicer arietinum ICC 4958 genome v2n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Cicer arietinum ICC 4958 genome v22015-08-11
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Ca_12681.1Ca_12681.1_ICC4958_v2Cicer arietinummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Ca_12681_ICC4958_v2 ID=Ca_12681_ICC4958_v2; Name=Ca_12681; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5458bp
CGTAGATTATTAGAAATTTATGTGGTAGTTCATGGCTCTTTCTCATGTAC
TTCCTCTGCTTATTCTTCACTACTCATTTTTGGTTGCATTGGTATCTGGA
TGGAAAACATTGCAAGGTTTGTGTTTCTAATTCATATTCCATTCATTGTT
CTAATTTATGTTTTTTAATTGTTTTTGGTTTGTGCTTTAATAAATTAACT
ATATGTTATTTCTTTAACATTTATTTACTATGCATGTATGGAAAGTTCAA
GATTAAATATTAAGTTGTAGCATAGAGAAAAGATGATAATAAACTGCAAG
TAATGTTAATTTGTTGACAATGTTAACTTTGCAATGGTTTTTCATCACTT
AAAAAGTAGTGAAATTTTGTTGCAAGATTTGTTCTTCATAAACAAATGTC
ACAAATTGGACTTTGTCTATGAAGATTAGTGTTGTCAAAATCTCAGATTG
TAAGAAGTTGCGGTTTGTTTAAATTTCGTTATGCAACAGTGTTATAACCA
CTGTTTCACAACATTTTGTATTAAACAATGTATTAGAGAATATTAGTGGT
ATGTTCAAATTGAGATACACTATAGCATATTAGAGCTGCTATTTAACAAC
ACTAATAAAGATGCATACATAATAACACAATGCAAAGTTGTTAAAGCGAT
TGTGTCCCTGTCATATCGCGATTCTTGATATTGCGAAAAATTGTCTGCTG
ATGCGCGGTTGTGGAGACATTAAAAACTACAATTGCGGTTGTGCTTTTTA
AAATCTTGCACAATTGCTGTACAATATTTGTTTCACTTTCTGATATACTT
TTGAAATTCAGAATTAGAATGATGGTGTTTCATAGTAATTCTCATGCTTG
TTTGGTATGCTATATGCAGGATCTCCACCATTGGTAATAGCACGCGGCGG
TTTTTCGGGGATATTTCCAGATTCAAGTTCACCTTCCTATAACTTAGCAC
TAAAAACAAGTTCCCTAAATGTCACTCTATGGTGTGATGTTCAACTGACA
AAGGATGGAGTTGGAATTTGTTTTCCAGACTTCAAGCTTGACAACGCTAC
TGACATTTCAGTTGTTTATCCGGGCAAAGCCAAGGATTACTCGGTTAATA
ACTTTTCGACCCGAGGATGGTTTTCTGCGGATTACAACTTCAATGAATTA
GCAAATGTTTCCCGTGAGTTCGATCTATCTTTAGACATGAACATTTACTT
TTCTATAACAAACTAGGATATTTTTGCTTTGGTTATAAGCCAGTTTTTTT
ACTCGTGCAATGCATAGGTAATCTGTCAAGATTCGAAGTTGTGAATAGAT
ATGTGTGTGTGTGATGTATGTAATTTTTGTAACAATTGACCATCCAAAAA
CTTCAAAATCTATAAGAATTTTGAGAATGTATGTCATTCATAACTTTTAT
AAAAACAGTTTTTTCAAACTAAAATCATTGATGTTGGTAAAGACATTGAT
TTCTTAAGTATGGAACTAGTTCTTTCTTGGTGCTTGTTTTGATCATAACA
TCTCAGAAGTAGAAAACTTAAGTATGGAACTACTATTTCTCTTTTTCGCT
TTTTGATACTCCCTATGTAGTAAAATATAAGCAAAAAAGTACATATATCT
GGACCAAATATTGTCGAGATACATTTACTTTTTTTGCTTCTATTTTGTTA
GAGAGGGAGTATATGCATGTAACTACTGATAATTTTCTTGTTACTTGGAC
AGTGGTTCAGGGAGTGTATTCGCGAACTAATAAGTTTGATGGAAGTAAAT
ATCACATTCTCAAAGTTGAAGATGTAGCTAAATTAGTAAAATCACCGTCA
ACAGGCTTATGGTTAAATGTTCAGGTAATGATGGAATGTTATAGATTATT
TTGTATCAAACTAGGTCCTAAGTTTAGGATTGAGGAATTTGACTTTTAAT
CTCTACTATTGCTGACTCAATATGTTTTTGAAAATACTATGCAGCATGAT
ACATTCTACAAGCATCACAATTTGAGTGTAAAGAAATTTCTTCTATCTCT
TTCTACTAAAGGAGTGTCTATCAATTACATCTCATCAACGAACGTGGATT
TTCTAAGACGAGTAAGATCAAATTCTAGTCTTAGAAAATCCATCTTGATC
TTCAGGTTTCTAGAGAAGCATAAGATTGAACCTACAACCAACCAAACTTA
TGGTGCACTTCTGAAAAACCTCACATTGATAAGGAAATTTGCTTCAGGAA
TTCTTGTTCCTAAAGGCTATATATGGCCTGTAGACTCAGAACTTTATCTA
CAGCAACATACTTCAATTGTCTCAGATGCTCATAAAAAAGGGCTAAAAGT
TTTTGTTTCAGAAATTGTTAATGATGTTTCATTCAGCTACAATTTCAGTT
ATGATCCTATGGCTGAGTGCTTGTCTTTCATTGACAATGGTAACTTTTCT
GTTGATGGTGTGTTGTCTGATTTCCCAGTAACTCCATCTGCAGCCATAAG
TAAGTTTTTCTTTCCCACTATAGATACATTCAGAACTATTGTGTATATTG
GTTAATTTATCATTATATTTATTAAAGTGGAACTATATAGTGGGTGTGGC
TAAGTTGGATATGTAGCATTAAGTTTATGACTATTGGTTAATTTATTAAA
TACAAGTCTAGAGCTTTATATGCACAATCTTTTTATTTATTTTTTCAAAC
TAATTAATGATACACCTTTAAAATGAGACATGGAATTTCCTTCAACATTC
ATTCTTCACATCTTTCTTAGGAAAAAATCCTCCTCATTTTCTTGATTTTT
TATAAACACATTCCTTCTGCAGATTGCCTTTCTGGTCTAGGAAAAAAGGC
CAAAAAACAAGGTATAATTTATTTGAACTCTCTATTGACACGTTTCATTT
CTTCATTTTAGACAAGTTATATGTAAATAATCTTTCATTCTTTTTTTCAT
GGTAAAGTGGAGACTTTGGTTATCACAAAATATGGAGCAAGTGGAGACTA
TCCAGCTTGTACTGATCTTGCATATAAGAAAGCTAAATCAGATGGAGCAG
ATGTACTTGATTGTCCTGTTCAAATGTCCAAGGATGGAATACCCTTTTGC
TTAAGCTCTATAGATCTTTCAATGAGCACAACAGTTGCTAATACAAAATT
CAGAAACCATACAGCCACTATTCCAGAGATTAAAAATGGCAGTGGCATAT
ATACATTTAGCTTGACATGGAATGAAATAAAAACATTGACTCGTAAGTTG
AATGATGTTCTTGCATGCACATTTTGTGTATATGAAATTGTTTAGCAAAT
AGCAAATGTTCCTTTGATTTCTTACTTTGTTTTTCATTGCAGCCTCAATA
TTGAAACCTTATGAGAAATACCTATTGTTCAGGAATCCAAAATTCAAAAA
TCAAGGGAATTTTGTAACCTTGTCTGAGTTTTTGTCTTTGGCTAAAGGCT
CTGGCATCTTGATCAGCATAGAGGTGAGTTCTTCCATTTTCTTTTCTGTC
AAGGAGTTATCCTTGTGTGAGCTGTTAATTTGCATAGTCATTAATTATGC
ATATTAGAAGTTAATTCAATGATGTTAGAGATAAAAAAGTAGGATCATAA
ATATTAAAAATCTAAAGAGATATGGCCTCAAAGTGACTTGTCTCATCTTA
CAAGTCAGCTTTGTAAGGGGTGAGTTAGGCTCAATCCAAATTTTAAGATG
GTATTAGAGCCTATCCATGATCTATTGGGCCACCCGCTATCGGGCAACTC
AGGCCACACTCCAGATGTTCAGACTTAGTCGTGATGAGAGTGTGTTTAGA
GTCCCACGTTGGATAAGATATATGACTTTAAAATGAGTTTTTTAAGTGAG
GGGCATTTCTCACTTTACAAGTCAATAAATGGCATTAAAGGAAAATATTT
GATACTCCCTCTGTTCTTATTTATAAACAAAAGTGAGTCAACAAAAGTTG
ATATATTTGGTCCAAATATGGTATCTGTACTATAGTTGTTGCACGTATCA
TGAAAACTTTATGTGAATTTCACAATACTAATTTCTTGACTCTTCGCCCC
ATTTATTTAGAGTAAGCATGTTTTCTATGTGACTGCTACTTGGACAATTT
TGCATTTCATGATTATAACAAATGATTTGTTGCTACTAAATGGTTTCCAC
CTTGATTAATTCCATTTATGCTTTGTTAATTATATTTATATTTCATTATC
AGAATGCAGCCTACCTCGCCGAGAAGCGAGGATTAAGTGTGACCAATGCA
GTCCTTAACACTCTAAAAAAAGCAGGTTATGATAAACCAAAATCTCCAAA
AGTTATGATTCAATCAACTCACAGCTCAGTACTAAAGATATTCAAGAATA
AATCAAAATATGAAAGGGTTTACAAAGTTGACGAAAATATTCATGACGCT
GATGACAAAGCTGTTGAAGACATAAAAACATTTGCTGATTCTGTTGTAAT
ACAAAAGGCATCAGTTTTTCCTCAAAGTGAAGCTTTTCTAGTTAACTCTA
CAAATACTGTAGAAAGGTTTCAATCATTTAAGCTATCAGTTTATGTAGAA
ACTTTCAGCAATGAATTTGTATCTCAAGCATGGGATTATTACTCAGATGC
ATTTGTTGAGATCAACTCATTTGTCATTGGTGCCAAGGTTAATGGCATTA
TTACTGACTTTCCAAAGACTGCTGCAAGATACACGAGTAAGTACTCCCTC
CGTCTCATATTGACTATCGTTTATGGTAATGCATACATCATAAAAAAAAT
GTCTAGGGACTAAAATATCATTATAAAATGGCAAATTATATATAGATGTG
CCACACATTTTCGTATAGTGTGTGACATAGTTTTAAATTGCGGTCCGCAA
ATATGAAAGTTTTAAAGGTCTCTACAACAGCATCATAGTTGCAATTGTGG
CTGAGTCAGCCTCATTTTGCAACAATATCAAGATTTTCAGTATAATCAAT
TTAGAACCATGGTCTATGAGGCTTCCTTAATGATAGCTGCAAGAAAGATT
ATAGACTAAGATATTAATGTAGAAATATTCTGAAGACTTAACAAATTTTT
GTAGCTTTTACAACTTTTTCTTTGCTTTGTTTATTATGTGCCTGACAACA
GTAACAAGGGACAAAAAAAAACACTACCTCTCATTGCTGACTTGTTTGTT
GTTCTACTTGTTGCAGAGAACAAGTGTTTAAAGCATCGGAACAAAGCACC
TTATACGAGGCCTATTGAACCTGGAAAACTTTTAAAACAAATTACACAAT
TATACCTTCCAGCACCTGTCCCTCCACTCCCAATCTTAAATGATAACAAT
GTGACAGAGCCACCTTTGCCAAGTGTTTCTAGATAAACTTCCAGTTCTCA
GTATAAGCAAAGCATAATATGAAATACAATGATTTCTGTCAACTGAGATG
TATTTTATCATTCAACATTACATTTATTATTATTATGATTGTCTATTGTA
AGATGTGATTATTCAAATAGCTTTGTTTCATTACAATTAAAATTCCTTTG
GATTGCGG
back to top

gene from alignment at Ca_LG_5:14155829..14161286+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ca_12681_ICC4958_v2 ID=Ca_12681_ICC4958_v2; Name=Ca_12681; organism=Cicer arietinum; type=gene; length=5458bp; location=Sequence derived from: Ca_LG_5:14155829..14161286+ (Cicer arietinum
CGTAGATTATTAGAAATTTATGTGGTAGTTCATGGCTCTTTCTCATGTAC TTCCTCTGCTTATTCTTCACTACTCATTTTTGGTTGCATTGGTATCTGGA TGGAAAACATTGCAAGGTTTGTGTTTCTAATTCATATTCCATTCATTGTT CTAATTTATGTTTTTTAATTGTTTTTGGTTTGTGCTTTAATAAATTAACT ATATGTTATTTCTTTAACATTTATTTACTATGCATGTATGGAAAGTTCAA GATTAAATATTAAGTTGTAGCATAGAGAAAAGATGATAATAAACTGCAAG TAATGTTAATTTGTTGACAATGTTAACTTTGCAATGGTTTTTCATCACTT AAAAAGTAGTGAAATTTTGTTGCAAGATTTGTTCTTCATAAACAAATGTC ACAAATTGGACTTTGTCTATGAAGATTAGTGTTGTCAAAATCTCAGATTG TAAGAAGTTGCGGTTTGTTTAAATTTCGTTATGCAACAGTGTTATAACCA CTGTTTCACAACATTTTGTATTAAACAATGTATTAGAGAATATTAGTGGT ATGTTCAAATTGAGATACACTATAGCATATTAGAGCTGCTATTTAACAAC ACTAATAAAGATGCATACATAATAACACAATGCAAAGTTGTTAAAGCGAT TGTGTCCCTGTCATATCGCGATTCTTGATATTGCGAAAAATTGTCTGCTG ATGCGCGGTTGTGGAGACATTAAAAACTACAATTGCGGTTGTGCTTTTTA AAATCTTGCACAATTGCTGTACAATATTTGTTTCACTTTCTGATATACTT TTGAAATTCAGAATTAGAATGATGGTGTTTCATAGTAATTCTCATGCTTG TTTGGTATGCTATATGCAGGATCTCCACCATTGGTAATAGCACGCGGCGG TTTTTCGGGGATATTTCCAGATTCAAGTTCACCTTCCTATAACTTAGCAC TAAAAACAAGTTCCCTAAATGTCACTCTATGGTGTGATGTTCAACTGACA AAGGATGGAGTTGGAATTTGTTTTCCAGACTTCAAGCTTGACAACGCTAC TGACATTTCAGTTGTTTATCCGGGCAAAGCCAAGGATTACTCGGTTAATA ACTTTTCGACCCGAGGATGGTTTTCTGCGGATTACAACTTCAATGAATTA GCAAATGTTTCCCGTGAGTTCGATCTATCTTTAGACATGAACATTTACTT TTCTATAACAAACTAGGATATTTTTGCTTTGGTTATAAGCCAGTTTTTTT ACTCGTGCAATGCATAGGTAATCTGTCAAGATTCGAAGTTGTGAATAGAT ATGTGTGTGTGTGATGTATGTAATTTTTGTAACAATTGACCATCCAAAAA CTTCAAAATCTATAAGAATTTTGAGAATGTATGTCATTCATAACTTTTAT AAAAACAGTTTTTTCAAACTAAAATCATTGATGTTGGTAAAGACATTGAT TTCTTAAGTATGGAACTAGTTCTTTCTTGGTGCTTGTTTTGATCATAACA TCTCAGAAGTAGAAAACTTAAGTATGGAACTACTATTTCTCTTTTTCGCT TTTTGATACTCCCTATGTAGTAAAATATAAGCAAAAAAGTACATATATCT GGACCAAATATTGTCGAGATACATTTACTTTTTTTGCTTCTATTTTGTTA GAGAGGGAGTATATGCATGTAACTACTGATAATTTTCTTGTTACTTGGAC AGTGGTTCAGGGAGTGTATTCGCGAACTAATAAGTTTGATGGAAGTAAAT ATCACATTCTCAAAGTTGAAGATGTAGCTAAATTAGTAAAATCACCGTCA ACAGGCTTATGGTTAAATGTTCAGGTAATGATGGAATGTTATAGATTATT TTGTATCAAACTAGGTCCTAAGTTTAGGATTGAGGAATTTGACTTTTAAT CTCTACTATTGCTGACTCAATATGTTTTTGAAAATACTATGCAGCATGAT ACATTCTACAAGCATCACAATTTGAGTGTAAAGAAATTTCTTCTATCTCT TTCTACTAAAGGAGTGTCTATCAATTACATCTCATCAACGAACGTGGATT TTCTAAGACGAGTAAGATCAAATTCTAGTCTTAGAAAATCCATCTTGATC TTCAGGTTTCTAGAGAAGCATAAGATTGAACCTACAACCAACCAAACTTA TGGTGCACTTCTGAAAAACCTCACATTGATAAGGAAATTTGCTTCAGGAA TTCTTGTTCCTAAAGGCTATATATGGCCTGTAGACTCAGAACTTTATCTA CAGCAACATACTTCAATTGTCTCAGATGCTCATAAAAAAGGGCTAAAAGT TTTTGTTTCAGAAATTGTTAATGATGTTTCATTCAGCTACAATTTCAGTT ATGATCCTATGGCTGAGTGCTTGTCTTTCATTGACAATGGTAACTTTTCT GTTGATGGTGTGTTGTCTGATTTCCCAGTAACTCCATCTGCAGCCATAAG TAAGTTTTTCTTTCCCACTATAGATACATTCAGAACTATTGTGTATATTG GTTAATTTATCATTATATTTATTAAAGTGGAACTATATAGTGGGTGTGGC TAAGTTGGATATGTAGCATTAAGTTTATGACTATTGGTTAATTTATTAAA TACAAGTCTAGAGCTTTATATGCACAATCTTTTTATTTATTTTTTCAAAC TAATTAATGATACACCTTTAAAATGAGACATGGAATTTCCTTCAACATTC ATTCTTCACATCTTTCTTAGGAAAAAATCCTCCTCATTTTCTTGATTTTT TATAAACACATTCCTTCTGCAGATTGCCTTTCTGGTCTAGGAAAAAAGGC CAAAAAACAAGGTATAATTTATTTGAACTCTCTATTGACACGTTTCATTT CTTCATTTTAGACAAGTTATATGTAAATAATCTTTCATTCTTTTTTTCAT GGTAAAGTGGAGACTTTGGTTATCACAAAATATGGAGCAAGTGGAGACTA TCCAGCTTGTACTGATCTTGCATATAAGAAAGCTAAATCAGATGGAGCAG ATGTACTTGATTGTCCTGTTCAAATGTCCAAGGATGGAATACCCTTTTGC TTAAGCTCTATAGATCTTTCAATGAGCACAACAGTTGCTAATACAAAATT CAGAAACCATACAGCCACTATTCCAGAGATTAAAAATGGCAGTGGCATAT ATACATTTAGCTTGACATGGAATGAAATAAAAACATTGACTCGTAAGTTG AATGATGTTCTTGCATGCACATTTTGTGTATATGAAATTGTTTAGCAAAT AGCAAATGTTCCTTTGATTTCTTACTTTGTTTTTCATTGCAGCCTCAATA TTGAAACCTTATGAGAAATACCTATTGTTCAGGAATCCAAAATTCAAAAA TCAAGGGAATTTTGTAACCTTGTCTGAGTTTTTGTCTTTGGCTAAAGGCT CTGGCATCTTGATCAGCATAGAGGTGAGTTCTTCCATTTTCTTTTCTGTC AAGGAGTTATCCTTGTGTGAGCTGTTAATTTGCATAGTCATTAATTATGC ATATTAGAAGTTAATTCAATGATGTTAGAGATAAAAAAGTAGGATCATAA ATATTAAAAATCTAAAGAGATATGGCCTCAAAGTGACTTGTCTCATCTTA CAAGTCAGCTTTGTAAGGGGTGAGTTAGGCTCAATCCAAATTTTAAGATG GTATTAGAGCCTATCCATGATCTATTGGGCCACCCGCTATCGGGCAACTC AGGCCACACTCCAGATGTTCAGACTTAGTCGTGATGAGAGTGTGTTTAGA GTCCCACGTTGGATAAGATATATGACTTTAAAATGAGTTTTTTAAGTGAG GGGCATTTCTCACTTTACAAGTCAATAAATGGCATTAAAGGAAAATATTT GATACTCCCTCTGTTCTTATTTATAAACAAAAGTGAGTCAACAAAAGTTG ATATATTTGGTCCAAATATGGTATCTGTACTATAGTTGTTGCACGTATCA TGAAAACTTTATGTGAATTTCACAATACTAATTTCTTGACTCTTCGCCCC ATTTATTTAGAGTAAGCATGTTTTCTATGTGACTGCTACTTGGACAATTT TGCATTTCATGATTATAACAAATGATTTGTTGCTACTAAATGGTTTCCAC CTTGATTAATTCCATTTATGCTTTGTTAATTATATTTATATTTCATTATC AGAATGCAGCCTACCTCGCCGAGAAGCGAGGATTAAGTGTGACCAATGCA GTCCTTAACACTCTAAAAAAAGCAGGTTATGATAAACCAAAATCTCCAAA AGTTATGATTCAATCAACTCACAGCTCAGTACTAAAGATATTCAAGAATA AATCAAAATATGAAAGGGTTTACAAAGTTGACGAAAATATTCATGACGCT GATGACAAAGCTGTTGAAGACATAAAAACATTTGCTGATTCTGTTGTAAT ACAAAAGGCATCAGTTTTTCCTCAAAGTGAAGCTTTTCTAGTTAACTCTA CAAATACTGTAGAAAGGTTTCAATCATTTAAGCTATCAGTTTATGTAGAA ACTTTCAGCAATGAATTTGTATCTCAAGCATGGGATTATTACTCAGATGC ATTTGTTGAGATCAACTCATTTGTCATTGGTGCCAAGGTTAATGGCATTA TTACTGACTTTCCAAAGACTGCTGCAAGATACACGAGTAAGTACTCCCTC CGTCTCATATTGACTATCGTTTATGGTAATGCATACATCATAAAAAAAAT GTCTAGGGACTAAAATATCATTATAAAATGGCAAATTATATATAGATGTG CCACACATTTTCGTATAGTGTGTGACATAGTTTTAAATTGCGGTCCGCAA ATATGAAAGTTTTAAAGGTCTCTACAACAGCATCATAGTTGCAATTGTGG CTGAGTCAGCCTCATTTTGCAACAATATCAAGATTTTCAGTATAATCAAT TTAGAACCATGGTCTATGAGGCTTCCTTAATGATAGCTGCAAGAAAGATT ATAGACTAAGATATTAATGTAGAAATATTCTGAAGACTTAACAAATTTTT GTAGCTTTTACAACTTTTTCTTTGCTTTGTTTATTATGTGCCTGACAACA GTAACAAGGGACAAAAAAAAACACTACCTCTCATTGCTGACTTGTTTGTT GTTCTACTTGTTGCAGAGAACAAGTGTTTAAAGCATCGGAACAAAGCACC TTATACGAGGCCTATTGAACCTGGAAAACTTTTAAAACAAATTACACAAT TATACCTTCCAGCACCTGTCCCTCCACTCCCAATCTTAAATGATAACAAT GTGACAGAGCCACCTTTGCCAAGTGTTTCTAGATAAACTTCCAGTTCTCA GTATAAGCAAAGCATAATATGAAATACAATGATTTCTGTCAACTGAGATG TATTTTATCATTCAACATTACATTTATTATTATTATGATTGTCTATTGTA AGATGTGATTATTCAAATAGCTTTGTTTCATTACAATTAAAATTCCTTTG GATTGCGG
back to top