|
Transcript Overview
Name | rna-TanjilR_06521 |
Unique Name | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0 |
Type | mRNA |
Organism | Lupinus angustifolius (blue lupin) |
Sequence length | 8201 |
Product | hypothetical protein |
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Orthologs
Syntenic blocks
Orthologs
Gene/transcripts from the same species that appear to represent the same gene
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
rna-TanjilR_06521 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-protein | Lupinus angustifolius | polypeptide |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0 | Lupinus angustifolius | polypeptide |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683354..3683432 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683354..3683432 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683516..3683649 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683516..3683649 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683937..3683975 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683937..3683975 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3684126..3684218 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3684126..3684218 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3684380..3684496 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3684380..3684496 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3686640..3686753 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3686640..3686753 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3687873..3687920 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3687873..3687920 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3689248..3689398 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3689248..3689398 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3689820..3689985 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3689820..3689985 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3690768..3690837 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3690768..3690837 | Lupinus angustifolius | exon |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3691297..3691554 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-exon-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3691297..3691554 | Lupinus angustifolius | exon |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683354..3683432 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683354..3683432 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683516..3683649 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683516..3683649 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683937..3683975 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3683937..3683975 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3684126..3684218 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3684126..3684218 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3684380..3684496 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3684380..3684496 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3686640..3686753 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3686640..3686753 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3687873..3687920 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3687873..3687920 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3689248..3689398 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3689248..3689398 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3689820..3689985 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3689820..3689985 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3690768..3690837 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3690768..3690837 | Lupinus angustifolius | CDS |
rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3691297..3691554 | rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0-CDS-Chr_LG13-CM007373.1_La_Tanjil_v1.0-1579734366:3691297..3691554 | Lupinus angustifolius | CDS |
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterProScan: L. angustifolius cv. Tanjil genome v1.0
Date Performed: 2020-01-28
IPR Term | IPR Description | Source | Source Term | Source Description | Alignment |
IPR004342 | EXS, C-terminal | PFAM | PF03124 | EXS | coord: 151..391 e-value: 1.3E-67 score: 228.5 |
IPR004342 | EXS, C-terminal | PROSITE | PS51380 | EXS | coord: 219..419 score: 21.159 |
Sequences
The
following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0 ID=rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0; Name=rna-TanjilR_06521; organism=Lupinus angustifolius; type=mRNA; length=8201bp ATGTTTGGAGGTCTTGCGAGTCCTAATAGCAGTCCGCATTTGAGGAAGTC TGGAAGCAGACCTGTTATCTATGATCTTGGTAACTTCATTTATAAGCATA TGCACTATTTTACCTTTTGCATATATGCATATCAACACATCTTATAGTAG TTCAATTTTCAGGTGCAAATGAGGTAGAAAATGGTGCTGATGTTGGTTTA TTACATTCAACAGAGGCAAATGATTTTAAGGGTTCTATATTACCGATAAG TACTGCTACAATAATGCCCTCACCTATGCTGTTATGGAGATTTAAGGTCT TATTTACTTTTTGGGAAGCATTAGGAACTTTCTTGAAAATTGTCTTCTAG AATGTATTAGATGGTATTATTAAGTAAGCAGAAAAAAATTGGACTTGTCA TGGAATTGCTCCATTTCATTCTTGTGGGGTTGCTAGTGTATTGATTATTT TGGAGAGACAAATATTCAGTTGGTTGATTAGATGAAAAATATTCTTGTGT GGCTTGTACTGCTTTCCCTCCTTCTTTGTCCTGCATTCTGGTTCTTCTAC TTTTTCAGAATCTAATTTAGATGGAATGTCCAGGTACTATTGTTCCTTTT CTGGGGCTTCTTCTGTTGCAAGGTCAGTCATATTTTCTCTTCGCGGTGTT TATGTTTAAATCCACCATGGAATACTGAGATACTTATAACTTTAATAAGT TAACGAAGTACCCCCTTGACATAAGGATTGTCATATTGCCAAAATTTTAT AAGCTTTATATGAAAATTGCAGATTGGATGGGACTCTGTCATGAGAATGA GTGCAGATAAGAGGGACTTATTTCTCTATGAggcatttttatattataat ccTCTTCTTCTTGCGGTTagtcttctttctctctttctctgtcACAGGGT CTCTCTGTGCACATGTGAGTGTATCAGTTTGCATCTAGGTTCAAGGAGCT TAAAGTACTTTTTAAAAAAGTCTTCTTTGCATTCTTTGTTAAGTCAATGT TCTtcgtgttattttttatatttcagaCGTTGATGGTTTGGCTTTGGGGA GTCAACCTATGGGTTTTTGCTCATGGTAGTGTCAATTATGCAAAGATATT TGATCTCGATCAAAATCATTTGACTCACAGAGAAATATGGAAGGTAACAA TTATTGCCACTCTGCTCAAGGTTTGGTCCGCTTAATAATGTAGTTGTACT TTTATTCTTCTCCACTCGGTTTTTTTTTTATACCTGAAATAGGCATACAG CGGAatcttaataatataacaaataaagataaataagGAAGCAAAACAAA CATTAATCCCATGTTGTGTTCTAGGAGGGAATAGGATTCCAGACAAAGGA ATCCCTGTTGTTGTGTTCTATAGGTATTAGGTAGGAATGAAATGATTCAC ATATTAAATGTGCTGTGTTTTTTTATAAGCTTGTCATCTTTGTTTTGGTT GTCAGTGATTTGGTcttaaattattgttattatatcactAAAAAGGGTGG CTCAACACACTAGGCTCCCACCTAGTAGAGTCtagggtagatgtacacag cCTTACCCTCGCAAGCGAAGAGGTTGCTCCCTAGATTTGACTCTTGACCT CCAAGTCACAAGGCTAGCAACCTTAGCCATATGTTGAAGCTCACCCACAT TATTATATCTCCAAGTAGAACATAAAAAAGTTCATGTATTTCTTCCCACC TCTTTCCATTTCttcaatttgtttattttttcaacactgcttttctttcc ttttcttcaatttctaAATAATTTGGCTTGAATACCTgacttatttcttt ttatttttgtgttcatTGCAGTGGGCCACATGGATGACAATTATTGTTCC AACCAGTATGACAGCATACCTTTATCTTTATTCTCATGGAGAAGTCTCTT ATGCTGCATCACAACCAGTGTAATAGATGCATCcactcttattattatta ttatatattttgtccccTTTGCATTTTAGTACTGCAGTATTGTCATATCC TATCAGTATATAATTTGATTGCTATGTGTGTTTATTAATGAACAATGATG ATTAGTTTCAGCCACCGACTATAACAATTAGTTTTGATGGACTAATCAAT GTGGCTTCAACTCATTTTGATGCAAAATGTCCTTGCCCCTGTGTGCTGCT TATGTGATAACACCGGCACAGAATTacagaaaaagaagaaggaaattTCA CAATCGATTCGGAATCAATTCGATTCCGAATACTAATACCTCGTTTATTG CTTTGAAGAATGGAGAAGATTACAAGatgaaccctaattgattccccGAA CCAATTGCACGTTACAAGATTAATTCCCTGAATTAATCCCTCTCCTCTAC TCAATTCTCAAAAGATACTAACACTAACCCCCCTAACATCTATTTATAGC TTCTGCCCCAAGCTATCCTTTCTCCTACGGCAGTTATTCTAACTGCTATG GCAGTTAATTCTGCCACATCATACTGCCACGTGGCCTCCTTCAGTACACC TGCGTGATGGGTGGtctctccctcatcctatcattatGTCACTAGGAGGA GGTTGAAAGAGTCTGGGATTTAGTTTATAAGAGTATGATTTCATTGATAA ACTAATGATGTTGGGTTGGGAACCATTACTTAGGTAGCAGGCTGCCCCCC CTCACCCCCCCAAGTACTCTTCTGTCATTTCCGTAATATCTACTTAGATT GTCCTTAAGAGGTATCTTAATTGCTTAGCTTTGAGTATCTCTTTGATTAA GAGTATCCAAGAGGGAAATGGCAGGTTACCCTCCTGAAATTGTGTAGCCT GATCTGAAATATGATGCACCAAATAATTCTACTTCAGGTGCAATAGGGTC AACTGCTGATCATGATACCATTAATATTTGGCAtctccttttgtttttct tttaggCAGAGCATTTATTGTACTGTTTTCTTATTGAGCTtcacaattga tttttttattcaaattccTTTCCATTTTTACTTAGCAAATTTCTTAATTT GGGATCATTATTGGTTGAAAAGCAGTGCATGTTTGTCTGAATCACCTGAG TTTTTGgtgtcaaaatataaataggatATTCATCATAAATTTGCCTATGT TTATTCTGTGTTTCACCAGTGAAAAAAGTGAAACATTGTTATTCACTCAG AGGAAAACTACTGCAGCTAATACACATTGatcttattttgttaatttacg TATATTATTGGTGGTTGTTTATTCCCACTTGTGCTTCCTTTTAGCTTGAT ACTATGGTTTTGGATTTGATCTGTTTTCTTCTGCAGGTTCTCTTGTATGC TGCTGTTGTGATGGTTTTGATATTCCCATTTGATATCTTTCACTTGTCTT CTCGGTTTTACTTCTTAAGGACACTTTGGCGGATAGTCTTTCCATTGAAG GTAAGCTTGctcttattttaatatattatataatttatgtttgtCAATTC CTGCAGTGCTACTGTTGAATTGGAAGACTTGGTGTGTTAATGTCAGAGCT TTATATTTATGCTATGAGCTAACAGATGATATCAACATGAAGATAGATTA CTAGATTCGTATTTCACATATAACATGAAGATACAATACTAGattcatat ataacatattCATTAGTTTCTTGTCTGGGTTGACCAGTTGAGGGTTCAAC AAAATTTGCACGATCATGTATGCAACTCCCTCTCCGTGGGAACCATTACT AAAGCATGTGACTGGTATTACTTCAGTATATGAGATGACTGCAATGCAGA TGTTCATTTACTTTCTGCTCCAATGTAATGAAGAAAGGAGAAAAGCAGGC AAGGGTTTGTGTCATAAGTGATTCATTGATAATAATTGATGACCTTATTG CCTTTTCCATGATGGCACCCACCTATGAATGAAGCTGTTTGTGTACACAT TAAATAGATACGACTACTTGCAGAAGTAAATCCCTTGATGAAGCACTATG TTGAGCTTTTGCAATATCTTCCCTTGAAGATAGCTGGGAATTATTGCAAA TTTGCAACGCTAAACTTACTATACTTAGAAGAGAATCATTCATATTCTTT ATTTACTTCATTTGTAAAGCTTATGTCTGTCACCAAGCTCTACCCCAGAT TCATTAGATCCCTTACCAACCAATTCTTTGTGTAATTTGTTGGAACtata tttgaatataatttaatttcttgTATTTTCGTCAAAACAGGCAATATCAT TCTCTGATTTTTTCCTGGCTGATATTTTAACTTCAATGGCAAAGGTTTGC TCCCTCATCTGTCTTACTTTTCTCTAGCAAATATAGTTTCTTTGATGTTA ATATTTGTAATaaagaaagtaagaaaataGTTGATTGTTTTTATAGGCTA TGTGTATGTACTTGTAGTAGGTATTGTATTATTATAGATACAGAGAACCC ACACTGGCAGTCTGACACAACCTTGAGAATATAAAGCTGACATAATTTGT TTATCTAAATTTTCAGTTGCTATTAGTGCACTACAatgtattttgattaa aattagcaATTTTATGCAGGTCTTTTCTGATTTGGAACGTTCAGTATGCA GAATGGTCCATCAGCAGGTTTGATTCTGATAAATTGAAGTTCGTGTGTTG TGTTGAATCTGAACAGAATTATCAATATTATGCGATTGCCTTGTTCCAGC TTTCCTGGCAGGCTGGCATCTATTGAGTGCAAAACTTTGTTTAGCACTTG TTGCTCTTGACCTTCATGTTACTTGGTCCACTTGTATTATATTATTGACA TCATGCTATCTGCTAGTGAAGACCAAAAACCAACTCAGCATCAAATATTT AGTGTTTACCATTACCTAATCTAGTAAAGTGGGTGGGATCTTGCCAGTGA TAAAACCTTTTCCTTGACCTACGTCTAACACCATAACTTTTGGGATGATT GGTTTTAGACATGGTATTTGGGCCTTTTTGACTAAATGGCCAGGGGTTGA TCCTCACTGATTCCTCTCTTGTAATCAAATTAAGCTTCAACACATGATTC CTTTGCTGTGCCCAAACTTCAACCCTATAGAGAGGGCATGTTAGAGATAA AACCTGCTTTTTGGTTTGCACTTAAGATCTTACCTTGCTAGGATGACTGG ATCCTTGGAAATACTGTTGTGTAGATGACAAACGTAATTTAGCAGAAGGT TAAGCTGCATAGTAGGAGAAAAATTATGTATAAGGTCGCCTGCTCCTAAA CTCTCCTTTTGACTGAAGTCCCAAGGAATAAATATCCGAGTTCATAGAGA AACGTAACAGGAATGATGTAATGGTTTTTTAAAGGCAGGTGATTTGAGGA GCCTGAGGGGATTTAACAGGAAACCATTAGTCAGTAATGTTGTAAGCTTA GGTCTAAAACAGTctattgtaatatttcaaaggATGTGATTATTTGGAGA TCTTTCTGGTTTAAGGGTCAGGTTTCGTGTATGGAACAATTTGATAAACT TTAAACATATTATATACTTCGTTTTATTTAGCATTGTGATCATGGAATAA GGCAACCAgatttcattaaataattattctCTATTACCATGATGTAACTA AATGCTCTTCCCATTAGAGTTAAAAATAAGATCGGCCCATTTGTTTGTCC TGTGGACAGCAAGTCTAATATGCTGTTacaattatatttctttaacatGT TTAACCATTTTAGAAACTTTCTAGATGcattaacaatgaaaataatggTG CTGTTTAAGGAAACTCCCTTGGCTGTTTGGTTTCCTTTATTCTTAAAGAG ACCTAAACCTATTGCCTATCATTCTTTATTGTCATATATCTTATCCATTG ACATTTAGACTTCTGGACTACTGTGTTCTGGCTTTCTGTTACAGCAAGTG CTTCAGTTCTCTCATTAGGGGATCCTTTTACAAACTATTTGTAGGTTGCC ACAATTGCTTGGTTGGAAGCTGATTCTGTTTGTGGCAGTCACTCTATTGC GATCCCTTTAGCTCTTGTCTTGCCTTACCTTTTCCGTTTAAACCAATGTC TCCGGCAGTACAAAGATACAGGGGAGAAAACTGCTCTTCTGAACGGTTAG AGCACATGCTTTACtcaaattaatgaaaatttgaatttcataatttcatt tgatATTGGCTGTGATTTTGATCAGAGTTTGAGCAGTCATGTACAATATC ATCGACTTTGGTACTGTGTGCTTTTTAACTGTATTTTtaatatggattta atatgtatacactgacagtgtaagtgttttttatactgtcagtaaatcat ccatcattgatttgttaaccaccattgactctcaaacaaaagtaatacaa atcaatggtggatgatatgctgacagtgtaaaaaaatttacactgtcaat gcaccgattttaaactcttttaatATATCTTCCCAATCATTAAAGATAAT TTCTTAAACAGATTTAAGATTCTTTTCCTGCTTTGTAATAATACATGTTT TTGCTTATGGTTTCAGCTTTAAAATACTCGACAGCTGTGCCAGTGATTTT TCTTTCTGCTCTCAAGTATCATGTCTTCCCTGAAAGGTGGACAAACTTAT ATAGGCCTCTCTGGCTTATGTCAGCTGTTGTTAACTCTTTATACTCTTTC TACTGGGATTTGGCTCGAGATTGGGACTTGAGGTATATATAATGTCCGTC CTTACCTTGCACCTTTCATAGTATCTTTGGAACTTAGCTTCTTTTTAAAT TCAGGAATATAGATCCTTTTGTCTGAGGGAAGTGAGTTTCAATCATGGTT AAACACCTTTTAAATGGAAGAAATTGCTTTTATCTACTTAAAGCCCTTTT ATCTTGTGCCACAGAAGGGTCAAATGGGCATAAATTACTGGATTAAGTCT AAATTCCTGCTGGTTTCTATTTCTACTGTGGCATGCTTGGGGTTTGAAAT CATGTGGTAATcgtatttttttagtttttatgtgCACAAGTGAGGTTTTT ATTGGAACTTCCTGCTTTCACATGTAATCACAGTCCTGATCATGTGATTT GACGGTCCCAATTGTTTGCATGAGGTATTGGAGAAGCTGAGGGGTTAAAA TGTTTAACGGCAAGTCTAATGGCATAGATATTATCTGTTAAGTTGATCAA ACCGTTTTACATGTGCCTCAATCTTGTTATTAAGGTGACCCACTACATGA GACTCTTGCTTAGTGGGGTCcaaggagggtagatgtatgcaatCTTATCC CTGCAAGTGGGGAGGCTATTTCCAGGATTTCAACATGTGATATCATGGTT ACTAAACAACAATCTTACCATTGTCTCGATCTTGTTATCAAgggcataaa tattatatttcttttattagatttttattataaacatgaagaaaaaaaat ttcttGTTAGATATGAATTGTGTATTGTGATATACTttgtaaatattcaa ttttcttttgctaGTGGCTTCACTCGAATATTCAAGTTCAGCAAGCCACA CTTGCTCTCACATCTGTTACATGGAAGGAGATGGGTAAGCACTGTTATAT GCAAATAGGTTGAATTCAACAGTTTTTTTTCTATCTCCCTTAAAAAGGTT GTTACCTTACTGAATTTTGAAGATAAAAATTGGAAATACCTCTCTCCTTG TAGCTCCAACACATTTTAGGCTCTTACTAAGTTATCAGGCGTTCCTCACA CAGTTCTTTGCATGTAAAAGAGTTAAAAAAATCTTACTCAACTATTCTAG CAcctttaaaacataataaagtcAATTAAATTATTGGCACCTTACCATAG CCTATATTTAAATTTACCTCTTATAACTTTATATGTGCATATAAtcatat tagtttatttttaacagttttGCTAAATATGTAAAAATCCCATTTCATaa agaagaatgaaaataatagtacagaaccaaaataaaataacagaTTGTTT TTCAGTGTCCTGAAGCAGTTTATATATACACCTGAAATTGCAGGTATACT TTTGGGTGATTGGGAGCAATCTGGTTTTGCGTTGCACATGGACATACAAG CTGTCTGCACATCTTCGCCATAATCACCTGACTGTGTTCACAATTGCTTC CTTGGAGATCTTCCGCCGCTTCCAGTGGATCTTTTTCCGTATAGAAAATG AGTGGAATAAGATGAATTCCAAAGCACATGTACAGCTTTCAGCAGGTGAC ATGCCGAACGAAGAAGAGGAATTGCTTCATTCCAATAACCATAGTGTATA G back to topprotein sequence of rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0 >rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0 ID=rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0; Name=rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0; organism=Lupinus angustifolius; type=polypeptide; length=422bp MFGGLASPNSSPHLRKSGSRPVIYDLGANEVENGADVGLLHSTEANDFKG SILPISTATIMPSPMLLWRFKVLLFLFWGFFCCKIGWDSVMRMSADKRDL FLYEAFLYYNPLLLATLMVWLWGVNLWVFAHGSVNYAKIFDLDQNHLTHR EIWKVLLYAAVVMVLIFPFDIFHLSSRFYFLRTLWRIVFPLKVFSDLERS VCRMVHQQVATIAWLEADSVCGSHSIAIPLALVLPYLFRLNQCLRQYKDT GEKTALLNALKYSTAVPVIFLSALKYHVFPERWTNLYRPLWLMSAVVNSL YSFYWDLARDWDLSGFTRIFKFSKPHLLSHLLHGRRWVYFWVIGSNLVLR CTWTYKLSAHLRHNHLTVFTIASLEIFRRFQWIFFRIENEWNKMNSKAHV QLSAGDMPNEEEELLHSNNHSV back to topmRNA from alignment at Chr_LG13-CM007373.1:3683354..3691554+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0 ID=rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0; Name=rna-TanjilR_06521; organism=Lupinus angustifolius; type=mRNA; length=8201bp; location=Sequence derived from: Chr_LG13-CM007373.1:3683354..3691554+ (Lupinus angustifolius ATGTTTGGAGGTCTTGCGAGTCCTAATAGCAGTCCGCATTTGAGGAAGTC
TGGAAGCAGACCTGTTATCTATGATCTTGGTAACTTCATTTATAAGCATA
TGCACTATTTTACCTTTTGCATATATGCATATCAACACATCTTATAGTAG
TTCAATTTTCAGGTGCAAATGAGGTAGAAAATGGTGCTGATGTTGGTTTA
TTACATTCAACAGAGGCAAATGATTTTAAGGGTTCTATATTACCGATAAG
TACTGCTACAATAATGCCCTCACCTATGCTGTTATGGAGATTTAAGGTCT
TATTTACTTTTTGGGAAGCATTAGGAACTTTCTTGAAAATTGTCTTCTAG
AATGTATTAGATGGTATTATTAAGTAAGCAGAAAAAAATTGGACTTGTCA
TGGAATTGCTCCATTTCATTCTTGTGGGGTTGCTAGTGTATTGATTATTT
TGGAGAGACAAATATTCAGTTGGTTGATTAGATGAAAAATATTCTTGTGT
GGCTTGTACTGCTTTCCCTCCTTCTTTGTCCTGCATTCTGGTTCTTCTAC
TTTTTCAGAATCTAATTTAGATGGAATGTCCAGGTACTATTGTTCCTTTT
CTGGGGCTTCTTCTGTTGCAAGGTCAGTCATATTTTCTCTTCGCGGTGTT
TATGTTTAAATCCACCATGGAATACTGAGATACTTATAACTTTAATAAGT
TAACGAAGTACCCCCTTGACATAAGGATTGTCATATTGCCAAAATTTTAT
AAGCTTTATATGAAAATTGCAGATTGGATGGGACTCTGTCATGAGAATGA
GTGCAGATAAGAGGGACTTATTTCTCTATGAggcatttttatattataat
ccTCTTCTTCTTGCGGTTagtcttctttctctctttctctgtcACAGGGT
CTCTCTGTGCACATGTGAGTGTATCAGTTTGCATCTAGGTTCAAGGAGCT
TAAAGTACTTTTTAAAAAAGTCTTCTTTGCATTCTTTGTTAAGTCAATGT
TCTtcgtgttattttttatatttcagaCGTTGATGGTTTGGCTTTGGGGA
GTCAACCTATGGGTTTTTGCTCATGGTAGTGTCAATTATGCAAAGATATT
TGATCTCGATCAAAATCATTTGACTCACAGAGAAATATGGAAGGTAACAA
TTATTGCCACTCTGCTCAAGGTTTGGTCCGCTTAATAATGTAGTTGTACT
TTTATTCTTCTCCACTCGGTTTTTTTTTTATACCTGAAATAGGCATACAG
CGGAatcttaataatataacaaataaagataaataagGAAGCAAAACAAA
CATTAATCCCATGTTGTGTTCTAGGAGGGAATAGGATTCCAGACAAAGGA
ATCCCTGTTGTTGTGTTCTATAGGTATTAGGTAGGAATGAAATGATTCAC
ATATTAAATGTGCTGTGTTTTTTTATAAGCTTGTCATCTTTGTTTTGGTT
GTCAGTGATTTGGTcttaaattattgttattatatcactAAAAAGGGTGG
CTCAACACACTAGGCTCCCACCTAGTAGAGTCtagggtagatgtacacag
cCTTACCCTCGCAAGCGAAGAGGTTGCTCCCTAGATTTGACTCTTGACCT
CCAAGTCACAAGGCTAGCAACCTTAGCCATATGTTGAAGCTCACCCACAT
TATTATATCTCCAAGTAGAACATAAAAAAGTTCATGTATTTCTTCCCACC
TCTTTCCATTTCttcaatttgtttattttttcaacactgcttttctttcc
ttttcttcaatttctaAATAATTTGGCTTGAATACCTgacttatttcttt
ttatttttgtgttcatTGCAGTGGGCCACATGGATGACAATTATTGTTCC
AACCAGTATGACAGCATACCTTTATCTTTATTCTCATGGAGAAGTCTCTT
ATGCTGCATCACAACCAGTGTAATAGATGCATCcactcttattattatta
ttatatattttgtccccTTTGCATTTTAGTACTGCAGTATTGTCATATCC
TATCAGTATATAATTTGATTGCTATGTGTGTTTATTAATGAACAATGATG
ATTAGTTTCAGCCACCGACTATAACAATTAGTTTTGATGGACTAATCAAT
GTGGCTTCAACTCATTTTGATGCAAAATGTCCTTGCCCCTGTGTGCTGCT
TATGTGATAACACCGGCACAGAATTacagaaaaagaagaaggaaattTCA
CAATCGATTCGGAATCAATTCGATTCCGAATACTAATACCTCGTTTATTG
CTTTGAAGAATGGAGAAGATTACAAGatgaaccctaattgattccccGAA
CCAATTGCACGTTACAAGATTAATTCCCTGAATTAATCCCTCTCCTCTAC
TCAATTCTCAAAAGATACTAACACTAACCCCCCTAACATCTATTTATAGC
TTCTGCCCCAAGCTATCCTTTCTCCTACGGCAGTTATTCTAACTGCTATG
GCAGTTAATTCTGCCACATCATACTGCCACGTGGCCTCCTTCAGTACACC
TGCGTGATGGGTGGtctctccctcatcctatcattatGTCACTAGGAGGA
GGTTGAAAGAGTCTGGGATTTAGTTTATAAGAGTATGATTTCATTGATAA
ACTAATGATGTTGGGTTGGGAACCATTACTTAGGTAGCAGGCTGCCCCCC
CTCACCCCCCCAAGTACTCTTCTGTCATTTCCGTAATATCTACTTAGATT
GTCCTTAAGAGGTATCTTAATTGCTTAGCTTTGAGTATCTCTTTGATTAA
GAGTATCCAAGAGGGAAATGGCAGGTTACCCTCCTGAAATTGTGTAGCCT
GATCTGAAATATGATGCACCAAATAATTCTACTTCAGGTGCAATAGGGTC
AACTGCTGATCATGATACCATTAATATTTGGCAtctccttttgtttttct
tttaggCAGAGCATTTATTGTACTGTTTTCTTATTGAGCTtcacaattga
tttttttattcaaattccTTTCCATTTTTACTTAGCAAATTTCTTAATTT
GGGATCATTATTGGTTGAAAAGCAGTGCATGTTTGTCTGAATCACCTGAG
TTTTTGgtgtcaaaatataaataggatATTCATCATAAATTTGCCTATGT
TTATTCTGTGTTTCACCAGTGAAAAAAGTGAAACATTGTTATTCACTCAG
AGGAAAACTACTGCAGCTAATACACATTGatcttattttgttaatttacg
TATATTATTGGTGGTTGTTTATTCCCACTTGTGCTTCCTTTTAGCTTGAT
ACTATGGTTTTGGATTTGATCTGTTTTCTTCTGCAGGTTCTCTTGTATGC
TGCTGTTGTGATGGTTTTGATATTCCCATTTGATATCTTTCACTTGTCTT
CTCGGTTTTACTTCTTAAGGACACTTTGGCGGATAGTCTTTCCATTGAAG
GTAAGCTTGctcttattttaatatattatataatttatgtttgtCAATTC
CTGCAGTGCTACTGTTGAATTGGAAGACTTGGTGTGTTAATGTCAGAGCT
TTATATTTATGCTATGAGCTAACAGATGATATCAACATGAAGATAGATTA
CTAGATTCGTATTTCACATATAACATGAAGATACAATACTAGattcatat
ataacatattCATTAGTTTCTTGTCTGGGTTGACCAGTTGAGGGTTCAAC
AAAATTTGCACGATCATGTATGCAACTCCCTCTCCGTGGGAACCATTACT
AAAGCATGTGACTGGTATTACTTCAGTATATGAGATGACTGCAATGCAGA
TGTTCATTTACTTTCTGCTCCAATGTAATGAAGAAAGGAGAAAAGCAGGC
AAGGGTTTGTGTCATAAGTGATTCATTGATAATAATTGATGACCTTATTG
CCTTTTCCATGATGGCACCCACCTATGAATGAAGCTGTTTGTGTACACAT
TAAATAGATACGACTACTTGCAGAAGTAAATCCCTTGATGAAGCACTATG
TTGAGCTTTTGCAATATCTTCCCTTGAAGATAGCTGGGAATTATTGCAAA
TTTGCAACGCTAAACTTACTATACTTAGAAGAGAATCATTCATATTCTTT
ATTTACTTCATTTGTAAAGCTTATGTCTGTCACCAAGCTCTACCCCAGAT
TCATTAGATCCCTTACCAACCAATTCTTTGTGTAATTTGTTGGAACtata
tttgaatataatttaatttcttgTATTTTCGTCAAAACAGGCAATATCAT
TCTCTGATTTTTTCCTGGCTGATATTTTAACTTCAATGGCAAAGGTTTGC
TCCCTCATCTGTCTTACTTTTCTCTAGCAAATATAGTTTCTTTGATGTTA
ATATTTGTAATaaagaaagtaagaaaataGTTGATTGTTTTTATAGGCTA
TGTGTATGTACTTGTAGTAGGTATTGTATTATTATAGATACAGAGAACCC
ACACTGGCAGTCTGACACAACCTTGAGAATATAAAGCTGACATAATTTGT
TTATCTAAATTTTCAGTTGCTATTAGTGCACTACAatgtattttgattaa
aattagcaATTTTATGCAGGTCTTTTCTGATTTGGAACGTTCAGTATGCA
GAATGGTCCATCAGCAGGTTTGATTCTGATAAATTGAAGTTCGTGTGTTG
TGTTGAATCTGAACAGAATTATCAATATTATGCGATTGCCTTGTTCCAGC
TTTCCTGGCAGGCTGGCATCTATTGAGTGCAAAACTTTGTTTAGCACTTG
TTGCTCTTGACCTTCATGTTACTTGGTCCACTTGTATTATATTATTGACA
TCATGCTATCTGCTAGTGAAGACCAAAAACCAACTCAGCATCAAATATTT
AGTGTTTACCATTACCTAATCTAGTAAAGTGGGTGGGATCTTGCCAGTGA
TAAAACCTTTTCCTTGACCTACGTCTAACACCATAACTTTTGGGATGATT
GGTTTTAGACATGGTATTTGGGCCTTTTTGACTAAATGGCCAGGGGTTGA
TCCTCACTGATTCCTCTCTTGTAATCAAATTAAGCTTCAACACATGATTC
CTTTGCTGTGCCCAAACTTCAACCCTATAGAGAGGGCATGTTAGAGATAA
AACCTGCTTTTTGGTTTGCACTTAAGATCTTACCTTGCTAGGATGACTGG
ATCCTTGGAAATACTGTTGTGTAGATGACAAACGTAATTTAGCAGAAGGT
TAAGCTGCATAGTAGGAGAAAAATTATGTATAAGGTCGCCTGCTCCTAAA
CTCTCCTTTTGACTGAAGTCCCAAGGAATAAATATCCGAGTTCATAGAGA
AACGTAACAGGAATGATGTAATGGTTTTTTAAAGGCAGGTGATTTGAGGA
GCCTGAGGGGATTTAACAGGAAACCATTAGTCAGTAATGTTGTAAGCTTA
GGTCTAAAACAGTctattgtaatatttcaaaggATGTGATTATTTGGAGA
TCTTTCTGGTTTAAGGGTCAGGTTTCGTGTATGGAACAATTTGATAAACT
TTAAACATATTATATACTTCGTTTTATTTAGCATTGTGATCATGGAATAA
GGCAACCAgatttcattaaataattattctCTATTACCATGATGTAACTA
AATGCTCTTCCCATTAGAGTTAAAAATAAGATCGGCCCATTTGTTTGTCC
TGTGGACAGCAAGTCTAATATGCTGTTacaattatatttctttaacatGT
TTAACCATTTTAGAAACTTTCTAGATGcattaacaatgaaaataatggTG
CTGTTTAAGGAAACTCCCTTGGCTGTTTGGTTTCCTTTATTCTTAAAGAG
ACCTAAACCTATTGCCTATCATTCTTTATTGTCATATATCTTATCCATTG
ACATTTAGACTTCTGGACTACTGTGTTCTGGCTTTCTGTTACAGCAAGTG
CTTCAGTTCTCTCATTAGGGGATCCTTTTACAAACTATTTGTAGGTTGCC
ACAATTGCTTGGTTGGAAGCTGATTCTGTTTGTGGCAGTCACTCTATTGC
GATCCCTTTAGCTCTTGTCTTGCCTTACCTTTTCCGTTTAAACCAATGTC
TCCGGCAGTACAAAGATACAGGGGAGAAAACTGCTCTTCTGAACGGTTAG
AGCACATGCTTTACtcaaattaatgaaaatttgaatttcataatttcatt
tgatATTGGCTGTGATTTTGATCAGAGTTTGAGCAGTCATGTACAATATC
ATCGACTTTGGTACTGTGTGCTTTTTAACTGTATTTTtaatatggattta
atatgtatacactgacagtgtaagtgttttttatactgtcagtaaatcat
ccatcattgatttgttaaccaccattgactctcaaacaaaagtaatacaa
atcaatggtggatgatatgctgacagtgtaaaaaaatttacactgtcaat
gcaccgattttaaactcttttaatATATCTTCCCAATCATTAAAGATAAT
TTCTTAAACAGATTTAAGATTCTTTTCCTGCTTTGTAATAATACATGTTT
TTGCTTATGGTTTCAGCTTTAAAATACTCGACAGCTGTGCCAGTGATTTT
TCTTTCTGCTCTCAAGTATCATGTCTTCCCTGAAAGGTGGACAAACTTAT
ATAGGCCTCTCTGGCTTATGTCAGCTGTTGTTAACTCTTTATACTCTTTC
TACTGGGATTTGGCTCGAGATTGGGACTTGAGGTATATATAATGTCCGTC
CTTACCTTGCACCTTTCATAGTATCTTTGGAACTTAGCTTCTTTTTAAAT
TCAGGAATATAGATCCTTTTGTCTGAGGGAAGTGAGTTTCAATCATGGTT
AAACACCTTTTAAATGGAAGAAATTGCTTTTATCTACTTAAAGCCCTTTT
ATCTTGTGCCACAGAAGGGTCAAATGGGCATAAATTACTGGATTAAGTCT
AAATTCCTGCTGGTTTCTATTTCTACTGTGGCATGCTTGGGGTTTGAAAT
CATGTGGTAATcgtatttttttagtttttatgtgCACAAGTGAGGTTTTT
ATTGGAACTTCCTGCTTTCACATGTAATCACAGTCCTGATCATGTGATTT
GACGGTCCCAATTGTTTGCATGAGGTATTGGAGAAGCTGAGGGGTTAAAA
TGTTTAACGGCAAGTCTAATGGCATAGATATTATCTGTTAAGTTGATCAA
ACCGTTTTACATGTGCCTCAATCTTGTTATTAAGGTGACCCACTACATGA
GACTCTTGCTTAGTGGGGTCcaaggagggtagatgtatgcaatCTTATCC
CTGCAAGTGGGGAGGCTATTTCCAGGATTTCAACATGTGATATCATGGTT
ACTAAACAACAATCTTACCATTGTCTCGATCTTGTTATCAAgggcataaa
tattatatttcttttattagatttttattataaacatgaagaaaaaaaat
ttcttGTTAGATATGAATTGTGTATTGTGATATACTttgtaaatattcaa
ttttcttttgctaGTGGCTTCACTCGAATATTCAAGTTCAGCAAGCCACA
CTTGCTCTCACATCTGTTACATGGAAGGAGATGGGTAAGCACTGTTATAT
GCAAATAGGTTGAATTCAACAGTTTTTTTTCTATCTCCCTTAAAAAGGTT
GTTACCTTACTGAATTTTGAAGATAAAAATTGGAAATACCTCTCTCCTTG
TAGCTCCAACACATTTTAGGCTCTTACTAAGTTATCAGGCGTTCCTCACA
CAGTTCTTTGCATGTAAAAGAGTTAAAAAAATCTTACTCAACTATTCTAG
CAcctttaaaacataataaagtcAATTAAATTATTGGCACCTTACCATAG
CCTATATTTAAATTTACCTCTTATAACTTTATATGTGCATATAAtcatat
tagtttatttttaacagttttGCTAAATATGTAAAAATCCCATTTCATaa
agaagaatgaaaataatagtacagaaccaaaataaaataacagaTTGTTT
TTCAGTGTCCTGAAGCAGTTTATATATACACCTGAAATTGCAGGTATACT
TTTGGGTGATTGGGAGCAATCTGGTTTTGCGTTGCACATGGACATACAAG
CTGTCTGCACATCTTCGCCATAATCACCTGACTGTGTTCACAATTGCTTC
CTTGGAGATCTTCCGCCGCTTCCAGTGGATCTTTTTCCGTATAGAAAATG
AGTGGAATAAGATGAATTCCAAAGCACATGTACAGCTTTCAGCAGGTGAC
ATGCCGAACGAAGAAGAGGAATTGCTTCATTCCAATAACCATAGTGTATA
G back to topCoding sequence (CDS) from alignment at Chr_LG13-CM007373.1:3683354..3691554+ >rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0 ID=rna-TanjilR_06521_La_Tanjil_v1.0; Name=rna-TanjilR_06521; organism=Lupinus angustifolius; type=CDS; length=1269bp; location=Sequence derived from: Chr_LG13-CM007373.1:3683354..3691554+ (Lupinus angustifolius ATGTTTGGAGGTCTTGCGAGTCCTAATAGCAGTCCGCATTTGAGGAAGTC TGGAAGCAGACCTGTTATCTATGATCTTGGTGCAAATGAGGTAGAAAATG GTGCTGATGTTGGTTTATTACATTCAACAGAGGCAAATGATTTTAAGGGT TCTATATTACCGATAAGTACTGCTACAATAATGCCCTCACCTATGCTGTT ATGGAGATTTAAGGTACTATTGTTCCTTTTCTGGGGCTTCTTCTGTTGCA AGATTGGATGGGACTCTGTCATGAGAATGAGTGCAGATAAGAGGGACTTA TTTCTCTATGAggcatttttatattataatccTCTTCTTCTTGCGaCGTT GATGGTTTGGCTTTGGGGAGTCAACCTATGGGTTTTTGCTCATGGTAGTG TCAATTATGCAAAGATATTTGATCTCGATCAAAATCATTTGACTCACAGA GAAATATGGAAGGTTCTCTTGTATGCTGCTGTTGTGATGGTTTTGATATT CCCATTTGATATCTTTCACTTGTCTTCTCGGTTTTACTTCTTAAGGACAC TTTGGCGGATAGTCTTTCCATTGAAGGTCTTTTCTGATTTGGAACGTTCA GTATGCAGAATGGTCCATCAGCAGGTTGCCACAATTGCTTGGTTGGAAGC TGATTCTGTTTGTGGCAGTCACTCTATTGCGATCCCTTTAGCTCTTGTCT TGCCTTACCTTTTCCGTTTAAACCAATGTCTCCGGCAGTACAAAGATACA GGGGAGAAAACTGCTCTTCTGAACGCTTTAAAATACTCGACAGCTGTGCC AGTGATTTTTCTTTCTGCTCTCAAGTATCATGTCTTCCCTGAAAGGTGGA CAAACTTATATAGGCCTCTCTGGCTTATGTCAGCTGTTGTTAACTCTTTA TACTCTTTCTACTGGGATTTGGCTCGAGATTGGGACTTGAGTGGCTTCAC TCGAATATTCAAGTTCAGCAAGCCACACTTGCTCTCACATCTGTTACATG GAAGGAGATGGGTATACTTTTGGGTGATTGGGAGCAATCTGGTTTTGCGT TGCACATGGACATACAAGCTGTCTGCACATCTTCGCCATAATCACCTGAC TGTGTTCACAATTGCTTCCTTGGAGATCTTCCGCCGCTTCCAGTGGATCT TTTTCCGTATAGAAAATGAGTGGAATAAGATGAATTCCAAAGCACATGTA CAGCTTTCAGCAGGTGACATGCCGAACGAAGAAGAGGAATTGCTTCATTC CAATAACCATAGTGTATAG back to top
Annotated Terms
The
following terms have been associated with
this mRNA:
Vocabulary: INTERPRO
Term | Definition |
IPR004342 | EXS_C |
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016021 | integral component of membrane |
|