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Transcript Overview
Name | Cr_01252.1 |
Unique Name | Cr_01252.1_PI489777_v1 |
Type | mRNA |
Organism | Cicer reticulatum (wild chickpea) |
Sequence length | 9524 |
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Orthologs
Syntenic blocks
Orthologs
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
Cr_01252.1_PI489777_v1 | Cr_01252.1_PI489777_v1 | Cicer reticulatum | polypeptide |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterProScan: C. reticulatum PI489777 genome v1
Date Performed: 2019-05-28
IPR Term | IPR Description | Source | Source Term | Source Description | Alignment |
None | No IPR available | COILS | Coil | Coil | coord: 1159..1179 |
None | No IPR available | MOBIDB_LITE | mobidb-lite | disorder_prediction | coord: 97..116 |
None | No IPR available | MOBIDB_LITE | mobidb-lite | disorder_prediction | coord: 97..115 |
None | No IPR available | PANTHER | PTHR22774:SF11 | AMINO-TERMINAL REGION OF CHOREIN | coord: 1..1211 |
IPR026854 | Vacuolar protein sorting-associated protein 13, N-terminal domain | PFAM | PF12624 | Chorein_N | coord: 2..103 e-value: 6.4E-12 score: 45.6 |
IPR026728 | UHRF1-binding protein 1-like | PANTHER | PTHR22774 | UNCHARACTERIZED | coord: 1..1211 |
Sequences
The
following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >Cr_01252.1_PI489777_v1 ID=Cr_01252.1_PI489777_v1; Name=Cr_01252.1; organism=Cicer reticulatum; type=mRNA; length=9524bp ATGGAGTCGATACTTGGTCGTGCTCTTGAATACACTCTCAAGTATTGGCT CAAATCCTTCTCACGAGATCAGTTCAAGTTACAAGGCCACACCGTTCACC TTTCCAATTTAGGTTACTTTTTCTCCAAATCCAAATCCAAATTCGAATCT ACTTTCATTTCACTGACTTTCATTCTCGATTTCAGATATCAACGGCGACG CTTTGCATTCCAGCGTTGGATTGCCGCCGGCGTTGAATGTCGCATCCGCC AAAGTTGGAAAACTCGAGATAACGGTTGATTTCGAGATACTTGGTTACTA ACTTTTTTTTTTTTTTTATTTTCAGTTCTTTTGCTGTGTTGTTGATTTGA TTGATTAATCTGTTGTTTGTGTAGCTTCCGTCAGTTAGTAATGTGCAAAT TGAACCAATTGTTATTCAAATTGATAAACTCGATCTGGTTCTTGAAGAGA ATTCTGATTTCGATGCATCTTCAAGTTCAAATAGGTAAACATGATACCAA ACTATGCTTGAAATGGACAATGTTTGGATAATAAATGGTTTAATTAAGCG ATCAAAGCATTAGTGTTAAGTATCATATAAGTGGTTATATATGAGCTATT TTTATAATAAAGGATAAAACAAAGTGGAACTATTTTCATATAAGTTATAA ACTGTATTTAGAAGCTGTCTGAGAAAGTTTATGGAAATAAGCTGAAAACA GCTTATTGATATCTCATATACTGTTTCCATAAATTTTCTAAACAGTCTCT CAAGTGTTTATGTTGGTTGATAAACTCAAATAAGATAATCCAAATAGGCT CATGATGCTTGATCCTTTTGTTGTTGCTATCGGTCTATTGATTTTTCTTG GCTGTTTTGGTTGTTTATGTGCAGTTCAGCGACCTCTGCTGCTACAGCCA AGGGAAGCAAGACTAGCGGTTACGGTTTTGCTGATAAGGTTTGAGTTTGA ATCTCATCTTTTTTAAGCCAGAGTTGATGTGTATGATCAATGATGATGAA GGGTGATATATAACTACTAACACTGTGCCTTGGTTGTTTTTGAAGTCACT TTTCACAATGGGAAATGGGGACATGGCTTGGGGATTTGAATTTGAATGGT TGTTATGTTCTAAATTACATAGATAAAGATGTAGGAACAGATAAATTTGT TGACTATAGGAAGAGGTTATTGGATCTTTGACAAATATCGAGCAGAACAG GATGATAAGGATTTAGTGAATGGGAATTTTAGGATAATTCATAATTTCTG TTAGTCGGTAAATTGGTCAGTTAGTTTTCGTTATGAACACCCTATTTTAT ACATTGTTACATGTAGTTATGTTTGCTATCCTATGCTGCCTTGTATATAA GATGTAATATGTATTTTTGTAAATCAAATCATACAGGTCTTTTTACAAAT CTCAATAGGGAAACAAATCACATGTCTCCTTTGCATGTCCCTTTTTTTGT CCTTCCAATTAAAAGATAAAACCTTACACAAATTAATGACTAAGATAGAG AATGCTAATATTTTATAGGTGATGGGACAAAAGGGTAAAGTTTATTTCAT TCCTAGTGGAAAGATGGTTTCTTGCAATGCCTTCCAGCCTAACTCATTCC TTTCTTTTAGATTTGGTAGTTCCTGGCAAATGCCAATCACTTGTCCACAT ACACAAATTTATTATTGGGATGTTACTTGACCGTACTGATTGTGGGCAAT CATCAGGTCGCAGATGGCATGACTATACAAATTCATACAGTTAATCTATT ACTTGAAACTCGCGGTGGTTCTCGTCGCCCAGGTGGAGCAACATGGTAAG TTCCTGTTACCAGCTGATAGAGCACTTTCTATTGTTTTGTGGATCATGTA TATGCATTAGCACAGGATTGCTCTTTAGTCATTGTTGTCAAATAGTGGCC ATGGCAGATTGCGGTGGCAGATTTTTTTACAAGCATCATGGCCAATTTGT GAAGATGGAGGTGCCATGGCATTTTATGGCAGAAATGACAGCTTAAAATA GCTGATTTTTGGCTTTCCGCCATGGTCCACTGTCCACAATCGATAGTGCG GATTTTAGTATGTTGTTCTCTGCTGTAGTTGCAGTATCTAACTACAGCTT GTAATGGAGTTAAAATATAGTAGGTTCTATGGGGTAACTTTAAGCATAGA TACGGGGAGTGATGTGTTTTACATTGGTTTTCACTCAAAGATATGTTATA CCTCAAACCATATATATCAACATGTCCATTTGTTGTCTCCGGTTGCAGGG CACCACCTATGGCATCTATCACCATACGCAACCTTTTGCTGTATACCACA AATGAAAACTGGCAGGCAATTACTTTGAAACTCTGGGTTCTATAATTTCT GAATCTTGTCCAGTGTAGCATTTTATTGAAGAATTTTTCCTTATCTCAGG TTGTAAATCTTAAGGAAGCACGGGACTTCTCCAGTAACACGAAGTACATA TATGTCTTCAAAGTAATATACCCCTTTTGGCTTTCACTATTTTTAATATG TGTGTCTAACTCTAATCTGCGTTGGTGTGATTTCTTTCATTCATATTGCT CTTCTATATTATTGCGCTCCTTTTCTTATAAGTTTCTTTACTAAAGAAAT ATTTTCTGTTCTCAGTGATGAGGATAATGTCGCTTCTGTGTGCATTACCA CCTATTAATTCTCAGTTTTTATCCTGTCCAGAAACTGGAATGGGAATCTT TGTCTATTGATCTTTTGCCGCATCCAGACATGTTTGCTGATGTTACATTT GGACGCTCTGAAGAGGGATCAAACCTGAGGGATGATGATGGTGCAAAAAG AGTATTCTTTGGAGGAGAGCGTTTTGTGGAAGGAATATCAGGAGAAGCAT ATGTAATAAATGCTGTTCCTCCAAGCTATTTTACAAGTATTCAGTTTTAT TATAGAATGTTATGAGTCATGAAATATAGGTTGGATGTATGATTAACAGA TAACGATTCAGAGAACTGAATTGAATAGCCCACTTGGACTTGAGGTTCAA TTGCACATCAACGAAGCTGTTTGCCCTGCGTTAAGTGAACCAGGTAAGTA AAACGGATCACTTTATTTTTATTGTATCCATATTGAATTGAATAAAATGC ATAGATATAGTACGGGGTTAACACAACCTATATGAGCAGGACTTCGTGCA CTTCTTCGCTTCATGACCGGAGTATATGTTTGTCTAAACAGGGGTGATGT TGATTCAAAGGCTCAACAGGTTTCTTATTGTCAACTTTTTATTGCCTTTG AGAACACCAAGTCTCAGTACTTTGTTTTTTTGTACAAAATCTTGTTTCCT TATGGCTTTCTCTAAGTCTATCTGTAATTGAATTGTGACAGCGATCCACT GAAGCAGCTAGGTGTTCTCTTGTTTCAATTGTCGTAGATCATATGTTTCT TTGCATTAAAGATACTGGTTTGTCTTTGGCATGTGCATAATTCTTTTTAT TTTGATCTATATCTCCTTCAATTATTATTGAATATCCTGGGGCTACTAGT GTTATGTATAGCATTACATGCAAAATGATCCAACAATTGGTATTAACTTT CAGAGTTCCAGCTTGAGTTTTTGATGCAGTCCCTCTTTTTCTCTAGGGTA AGTTTTTTGATATTTTCTTTGCTGACAAGTTAAATTCTTGTACTCTTTCT TTATTTCTTCAGCGTACTCTCAATACCGTTGCTGGTTGTACTACCTTAGC CTTATCTAGTAGGTTGAATAGAACTGAGTTTATTTTAAACCAAACTTAAA CAATAATACAAAACCTTATATTTGCCTTTAATACTTTTTTTAACGGGAGG TTTAAGACACCTTTCATATATAGTATATTTTGGTTCACTAGATTCTCACC GGGTAACAACATGAGAGACAAACCTCTCTTATACCTGTGGACACTTGGTA TATTTTGCTATAATTAGTATTAATGATTCAGAAAAAAGATAAGGAAAAAT AAAATAAAAATGTAAACATTAAATTATGTGGTCTATGTGATTTTGGCATG ATGAGTTTTCTTCTTTTAATAATCAGGCTTTTAGTGGCAGTAGACTTATA CTGTTTGATTGACTATCCTTGTAGGCCAGTCTTTCTGAAGTAGATAATGA CAAGAACTTAACCAAGATTTCAATTGCTGGATTATTTTTAAGGTTTGTGT CTTTCAACTCTGTTTGAACAACTATTGAAACAATTAAGTGAGCTGTGTGT GTATGCTTGGTTGCGGTTGTTTGTGTCAATGTATTCTGTGCTCATATCAT ATGATTTACTAAATGGAATCCAAGAGGCAACTTATCTGAATATATTGGTA ATCTGTTATGAACCACTGCTTTTGTGGTTAGATATTCTCGAATGGGAGAA ATTAATACACTTGAAAAGGGGGAAAGGAAAAGAGAAAGAGTTGCTTATAT TCTTAAGGAGGGACAATATCGTTGCATGATAAATCATTTTAGTGGCTCTT GATAATTGAAACGGCATAATCTTCTTCTTCCAGCACTTCAATGAAACTAA ATTATAGTTTGCGTTTATTGGAATGCAGGGACACCTTTTCCTCCCCTCCA TGTACTTTAGTGCAACCATCAATGCAAGCTTTCACTGGAGATGCTTTTGA TGTGCCAGAATTTGGTATTTATAAGTCATTAGCGCTCTTGAACGCATTTC AGAAACTTTTATGTACTGCTTGTTAAAAATTTGTTTCTATCCTTTCTCTT GACAGCTAGAAGCTTTTCCCCCCCGATATATCCTCTAGGAGAACAACAAT GGCAGTTAAGTGAGGGAACCCCTCTAATATGCCTCCATGCTCTCCAGATC ATACCTTCTCCACTTCCACCATCCTTTGCTTCTAAAACCGTTATTGACTG TCAGCCTCTGATGGTATGTGCAGAATTTTACAAAAAATGCTCTGTTATGG GACTTATAGTGCACCATTTTTTTTGCCAATCATATTATTTGATGTTTTTT TTTCTTCTTCCAGATTCATCTCCAAGAAGATTCATGCCTGAGGATATCCT CTTTTTTAGCTGATGGTATTGTTGTCAGTCCTGGTGACATCTTACCAGAT TTCTCAGTGAAATCTTTTATTTTCACTCTCAAGGGATTGGATCTTACAGT TCCTTTTGACAAGGCCAAAATGGATACTTCTAAAAGTGACATAGACAATA CACTCCATACATCCTTTACTGGAGCAAGGCTTCATATTGAAAGCCTTTCA TTTTTAGATTCACCTTCATTGAAACTAAGAATGCTGAACCTTGAGAAGGA TCCTGCTTGCTTCTGTCTCTGGGAAGGTCAACCAGTTGATGCTACCCAGA AGAAGTGGACTGCCAGAGCATCCCAGCTTACTTTGTCTCTGGAAGCATGC ACCGGTACAACTGGACGTCAGACTGCAGGATTGTGGAGATGTGTTGATCT GACAGAAGCTTGCATTGAAGTAGCCATGGCAACCGCTGATGGAAGCCCGT TGTTAAAAATTCCTCCTCCTGGGGGTATTGTCAGGGTTGGAGTTGCTTGC GAACAGTATTTGTCCAACACTTCTGTTGAGCAATTATTTTATGTCCTAGA TCTATACGGTTATTTTGGAAAAGTTAGTGAAATGATGGCAATGGCTGGAA AAAAGAAACAACTGGAGGACGTTGGGCACAAATCTTTCAGTGGAAAGCTT ATGGACAAGGCTCCTAGTGACACTGCTGTGAGTTTATCAGTGAAAGACCT CCAACTTCGATTCCTGGAGTCTTCACCAATGATTGTTGAGGGACTGCCAT TAGTGCAATTTGTTGGAAATGATCTGTTTACCAGTGCCACTCATAGAACC CTTGGTGGGGCTATTGTTGTTTCATCTTCTCTACGCTGGGAGAGTGTTGA GATAAGTTGTGTGGATGCTGAGGGGAAGTTGGCATCTGAAAGTGGCTCTT TCTTGAGTTCTAGCATAAATGTTCCTTCACCAAGTGACAATGGATATCCT CAACTAAGAGCTGTATTCTGGGTGCATAAGAACGAGAGACATCAAATGGA TGGAAATGCTCATTCAATCCCTTTTCTTGACATAAGCATGGTCCAAGTCA TACCATTACATGAACAAGACTTGGAGTCTCATAGTTTGAATGTCTCAGCT TCCATATCTGGTGTTCGTCTTGGTGGGGGAATGAACTATACTGAAGCCCT ACTGCATAGATTTGGAATACTTGAGCTTGATGGAGCTCCTGGAAAGGGTC TTTGTAAAGGGTTGGAAAACTTACAAAAGGGGCCATTGTCAAAACTTTTT AAATCAACTCCTATGATTCTTGATGATTCAGAAGATGGTATGAAACAAAC AATGTCATCTTATTTTCTCTAGTTGGTCAATTTGGTTAATACATAATAAG TTTATTCTAAGTTCATATTCCTTATGTTCATATCTTAGTTTAAATTAATT TTTCTTGGTTAATAACTTTTCACCAGTTGAAAGCATGGGGGAAGGGAAAG AAACAGGTTTTCCACGCTTGAAGAAGCCAGATGATGTGGATGTAACTATA AAATTGAGAGACTGGTTATTTGCTCTCGAAGGTGCACAGGATATGGCTGA AAGGTGGTGGTTCTCCAGCCATGAGGATGAAGGAAGAGAAGAGAGGTGTT GGCACACATCTTTCCATAGTTTACAAGTAAATGCAAAAAGAAGCCCGAAT AATGTTAAAGATGAAAAAGCACAAATGCATAGAATACAGCATCATTCAGT AGAAGTGGTTACGGTGAGTTCATGCTTCTTTCTGATTTTTCAAGATTTAA TGTCTGGGTTTATAAATCTGTGTTCCAAACTAATGCAGAATAAAAGATTT ACTGTCTGCTTTCAAGAATGTAGTTATTTTGTTTTACACTATAATAATAG AGAGAAAACTAGATTAAATTACGACAAATAATCTGACATCAAGCATTGTG TCGACAGGAATATCTAAACACAATGACATATTCATTCATCTGTAGTTCCA TCTTATAATGCATGATATCATTCCTCCATTATATATATGAAAACCAGGCA AACTACTAGAACTAGACTGAAAATATAACTTTTTTTGTGGGATGGGGAAA CTTTAATGGATCATTTGACCTGCTACTATTCTTTTGACTACTAAATACTG CTTTGTGTATAGAGAAACAATTCATTTGTGAAAACTGAAAACAATCAAAC ATCTGCTTGCAAACATATATAGACTCTTGGTTTTGATAAAATATCATGAA AACCTACTTCTCATGCTTGAAGCTGATAATTTTTCAATATATTGTTCTCT TTTCTCAACTACCTTTCCTAATTCATTTTTTTCTTTACAGTTAATAACTA ATAATTCATCTATGTTGATTTGGTTAGCTTCAGTGGCCAAAGATATACAT CAAGTTTGTGACATTTAATTCAACCTTAAAAAATTAAAGTAGCATTATAT TGTTCATTTAGGTAAAAATTAAATTAGTGTGTAATTTTCAAGCATTTTTA TCTATTTTATATTAATTTTAAAACATTAATGAGGGATTTACTTTTACAAA TCCTTAAAAATGAAATTAATGTTAAACTCTTAAGCTCTTAAAGGGCTGTT CATTCATTTCTTCAAAGTCAGAAGATAAGGTTTTCTGACATGGACAAACA TAAGACGAGAAGGTTTTATTGTTACATTTTTAATGAATTATATGTTGATT ATGCTTATCAAAGTACATTTGGTATATACTTTGGAAATGTTAAATGCCAT CTATTCTGGATAATATATGATTTATTAGCTCTTGGCTTAAGCATGTTAAA ACTAAATATCCTTATTAAAGGGTTTTCTTTGCCTATCTTCTCATTTCGGT CTCCTGTCATACAATCTTACATGCTGAGCCTGAACATGCAGGTGGGAGTT CAAGGGCTGCAAATCCTGAAGCCTCATACCCAAAAAAAGGTTCCTTCATC AATGGTAATTGCCAACGGGGTTAAGGAACTTAATGACACAATTGGAGGAA TTGGTCTTGAAGTTCGCCTGATATTATGTGAGGAGAATGTTGATGATGAA ACGACTAACTGGGAAGTGGAAAATCTAAAATTCTCAGTTGGACAGCCGGT AATGAGAACTGTTGATTTAAGTATGGGTCATTGTCTCTCCTTTATTAGAT GATTGTCTGTAATGTTGATTTTACCGTGCAGGTTGAGGTGGTTGTAACGA AGGATGAGGTTCAGCACCTTACTTTTTTGTGCAAATCTGAAATTGATTCA ATTGGACGGATAACTGCTGGAATTATACGGTTGCTTAAGTTAGAAGGCTC TATTGGTCAGTCTGTAGTAGATCAACTAGGCAACCTAGGTATGTTTCCAA AGTTTCTTACTCATTGAATTCTATTTTTACTCATAAATTTGGTAGAATCT TTTGCATTACCTTAAAGTTAGAAAGTGATGGGACTGTTTTATTATCTTTG GATCATATAGAACAGTAGATGGATTTTATACTTAGGTCTAGCATTCTTGA CAGGTGTAGCATATAGATCAAAGAGAGGCAGTGTACAAGAGTACTTGCTA GGCACAAGGATTTTATAAGTGTTTTTTTCTCTTCTCAAAAACATAATTTA TAGGAAATGGATAATGCTTCAATTCAAAGTGTCTAGGATCCAAGTGGCTG TTAAACTGATAACTACCTTAGCTGGATGCCATATAATAATACTTCAAATA AGCAGTATAAACCCTGAAAGATGAGAACTCATTTATTTCTTGGTAAAAAG AGATGGAAGTGCAAAGGCATCACTATGATTTAAAGACATCTCAACTCTGT TGGCACCTCAGAGAAAGATGAAAACTAATGGTAATGCGTAAAAATGAGAA ATCTTGAAGACTGAGAGGCACTTGAACAATTTTTTGAAAATGCTGAATTT ACTCTAACTCTAGTTCTACTGATTTTCAATTCATACATATGTAGACAAGC ACCTTGCAGTGGTATAAGTAAATACTAAGGGTATGTTTGATTAGCTTTTC AAAAACTGGTTTCTGTTTTAAAAAAAAATTAAGAAAGAACAAAATAACAA ATTTAGTTCTTTGTTGATTTTTAAAACAGAACAATGTTTTTAAAAAGTAT AATCAAACAGCTCTAATTCTCTGGATTTCCTCTTGAACCGGAGATGTTAT TTAGGTTAACTACAATTTCAACAAGCACGTCATAAGACAAGCACATCATA GATGTTTGCATGCTGATGCACTCTTGTTTATTCAACTATCATCATCTAAT AATGGCATGGCATGATGACTTGCAGGAAGTGAAGGCATTGACAAGATCTT CTCTTCTGAAAAGGCTAGTAGAGATGGTAGTGTTAGTAGTAGAGGACTTT CTCCATTACCAAACTCCTTAATTGAAGAACCAAAAAAAACTAAGGAGCAG ACATTAGCTTTGCTCGAGGAAGCAGTTATGGACTCACAGGCTAAACTTAA TGATTTAATCAGTGATATTGGTACTTCAGAGTCTTCTTCCTCACAACACC TTACCATCGTCAAAGTAAGTCAAAAGATCGACACTATGCAGGGCTTATTG ATGCAATTGCGGAATCAACTTTAA back to topprotein sequence of Cr_01252.1_PI489777_v1 >Cr_01252.1_PI489777_v1 ID=Cr_01252.1_PI489777_v1; Name=Cr_01252.1_PI489777_v1; organism=Cicer reticulatum; type=polypeptide; length=1214bp MESILGRALEYTLKYWLKSFSRDQFKLQGHTVHLSNLDINGDALHSSVGL PPALNVASAKVGKLEITLPSVSNVQIEPIVIQIDKLDLVLEENSDFDASS SSNSSATSAATAKGSKTSGYGFADKVADGMTIQIHTVNLLLETRGGSRRP GGATWAPPMASITIRNLLLYTTNENWQVVNLKEARDFSSNTKYIYVFKKL EWESLSIDLLPHPDMFADVTFGRSEEGSNLRDDDGAKRVFFGGERFVEGI SGEAYITIQRTELNSPLGLEVQLHINEAVCPALSEPGLRALLRFMTGVYV CLNRGDVDSKAQQRSTEAARCSLVSIVVDHMFLCIKDTEFQLEFLMQSLF FSRASLSEVDNDKNLTKISIAGLFLRDTFSSPPCTLVQPSMQAFTGDAFD VPEFARSFSPPIYPLGEQQWQLSEGTPLICLHALQIIPSPLPPSFASKTV IDCQPLMIHLQEDSCLRISSFLADGIVVSPGDILPDFSVKSFIFTLKGLD LTVPFDKAKMDTSKSDIDNTLHTSFTGARLHIESLSFLDSPSLKLRMLNL EKDPACFCLWEGQPVDATQKKWTARASQLTLSLEACTGTTGRQTAGLWRC VDLTEACIEVAMATADGSPLLKIPPPGGIVRVGVACEQYLSNTSVEQLFY VLDLYGYFGKVSEMMAMAGKKKQLEDVGHKSFSGKLMDKAPSDTAVSLSV KDLQLRFLESSPMIVEGLPLVQFVGNDLFTSATHRTLGGAIVVSSSLRWE SVEISCVDAEGKLASESGSFLSSSINVPSPSDNGYPQLRAVFWVHKNERH QMDGNAHSIPFLDISMVQVIPLHEQDLESHSLNVSASISGVRLGGGMNYT EALLHRFGILELDGAPGKGLCKGLENLQKGPLSKLFKSTPMILDDSEDVE SMGEGKETGFPRLKKPDDVDVTIKLRDWLFALEGAQDMAERWWFSSHEDE GREERCWHTSFHSLQVNAKRSPNNVKDEKAQMHRIQHHSVEVVTVGVQGL QILKPHTQKKVPSSMVIANGVKELNDTIGGIGLEVRLILCEENVDDETTN WEVENLKFSVGQPVEVVVTKDEVQHLTFLCKSEIDSIGRITAGIIRLLKL EGSIGQSVVDQLGNLGSEGIDKIFSSEKASRDGSVSSRGLSPLPNSLIEE PKKTKEQTLALLEEAVMDSQAKLNDLISDIGTSESSSSQHLTIVKVSQKI DTMQGLLMQLRNQL back to topmRNA from alignment at Cr_LG_1:13522332..13531855+ Legend: exonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Cr_01252.1_PI489777_v1 ID=Cr_01252.1_PI489777_v1; Name=Cr_01252.1; organism=Cicer reticulatum; type=mRNA; length=9524bp; location=Sequence derived from: Cr_LG_1:13522332..13531855+ (Cicer reticulatum ATGGAGTCGATACTTGGTCGTGCTCTTGAATACACTCTCAAGTATTGGCT
CAAATCCTTCTCACGAGATCAGTTCAAGTTACAAGGCCACACCGTTCACC
TTTCCAATTTAGGTTACTTTTTCTCCAAATCCAAATCCAAATTCGAATCT
ACTTTCATTTCACTGACTTTCATTCTCGATTTCAGATATCAACGGCGACG
CTTTGCATTCCAGCGTTGGATTGCCGCCGGCGTTGAATGTCGCATCCGCC
AAAGTTGGAAAACTCGAGATAACGGTTGATTTCGAGATACTTGGTTACTA
ACTTTTTTTTTTTTTTTATTTTCAGTTCTTTTGCTGTGTTGTTGATTTGA
TTGATTAATCTGTTGTTTGTGTAGCTTCCGTCAGTTAGTAATGTGCAAAT
TGAACCAATTGTTATTCAAATTGATAAACTCGATCTGGTTCTTGAAGAGA
ATTCTGATTTCGATGCATCTTCAAGTTCAAATAGGTAAACATGATACCAA
ACTATGCTTGAAATGGACAATGTTTGGATAATAAATGGTTTAATTAAGCG
ATCAAAGCATTAGTGTTAAGTATCATATAAGTGGTTATATATGAGCTATT
TTTATAATAAAGGATAAAACAAAGTGGAACTATTTTCATATAAGTTATAA
ACTGTATTTAGAAGCTGTCTGAGAAAGTTTATGGAAATAAGCTGAAAACA
GCTTATTGATATCTCATATACTGTTTCCATAAATTTTCTAAACAGTCTCT
CAAGTGTTTATGTTGGTTGATAAACTCAAATAAGATAATCCAAATAGGCT
CATGATGCTTGATCCTTTTGTTGTTGCTATCGGTCTATTGATTTTTCTTG
GCTGTTTTGGTTGTTTATGTGCAGTTCAGCGACCTCTGCTGCTACAGCCA
AGGGAAGCAAGACTAGCGGTTACGGTTTTGCTGATAAGGTTTGAGTTTGA
ATCTCATCTTTTTTAAGCCAGAGTTGATGTGTATGATCAATGATGATGAA
GGGTGATATATAACTACTAACACTGTGCCTTGGTTGTTTTTGAAGTCACT
TTTCACAATGGGAAATGGGGACATGGCTTGGGGATTTGAATTTGAATGGT
TGTTATGTTCTAAATTACATAGATAAAGATGTAGGAACAGATAAATTTGT
TGACTATAGGAAGAGGTTATTGGATCTTTGACAAATATCGAGCAGAACAG
GATGATAAGGATTTAGTGAATGGGAATTTTAGGATAATTCATAATTTCTG
TTAGTCGGTAAATTGGTCAGTTAGTTTTCGTTATGAACACCCTATTTTAT
ACATTGTTACATGTAGTTATGTTTGCTATCCTATGCTGCCTTGTATATAA
GATGTAATATGTATTTTTGTAAATCAAATCATACAGGTCTTTTTACAAAT
CTCAATAGGGAAACAAATCACATGTCTCCTTTGCATGTCCCTTTTTTTGT
CCTTCCAATTAAAAGATAAAACCTTACACAAATTAATGACTAAGATAGAG
AATGCTAATATTTTATAGGTGATGGGACAAAAGGGTAAAGTTTATTTCAT
TCCTAGTGGAAAGATGGTTTCTTGCAATGCCTTCCAGCCTAACTCATTCC
TTTCTTTTAGATTTGGTAGTTCCTGGCAAATGCCAATCACTTGTCCACAT
ACACAAATTTATTATTGGGATGTTACTTGACCGTACTGATTGTGGGCAAT
CATCAGGTCGCAGATGGCATGACTATACAAATTCATACAGTTAATCTATT
ACTTGAAACTCGCGGTGGTTCTCGTCGCCCAGGTGGAGCAACATGGTAAG
TTCCTGTTACCAGCTGATAGAGCACTTTCTATTGTTTTGTGGATCATGTA
TATGCATTAGCACAGGATTGCTCTTTAGTCATTGTTGTCAAATAGTGGCC
ATGGCAGATTGCGGTGGCAGATTTTTTTACAAGCATCATGGCCAATTTGT
GAAGATGGAGGTGCCATGGCATTTTATGGCAGAAATGACAGCTTAAAATA
GCTGATTTTTGGCTTTCCGCCATGGTCCACTGTCCACAATCGATAGTGCG
GATTTTAGTATGTTGTTCTCTGCTGTAGTTGCAGTATCTAACTACAGCTT
GTAATGGAGTTAAAATATAGTAGGTTCTATGGGGTAACTTTAAGCATAGA
TACGGGGAGTGATGTGTTTTACATTGGTTTTCACTCAAAGATATGTTATA
CCTCAAACCATATATATCAACATGTCCATTTGTTGTCTCCGGTTGCAGGG
CACCACCTATGGCATCTATCACCATACGCAACCTTTTGCTGTATACCACA
AATGAAAACTGGCAGGCAATTACTTTGAAACTCTGGGTTCTATAATTTCT
GAATCTTGTCCAGTGTAGCATTTTATTGAAGAATTTTTCCTTATCTCAGG
TTGTAAATCTTAAGGAAGCACGGGACTTCTCCAGTAACACGAAGTACATA
TATGTCTTCAAAGTAATATACCCCTTTTGGCTTTCACTATTTTTAATATG
TGTGTCTAACTCTAATCTGCGTTGGTGTGATTTCTTTCATTCATATTGCT
CTTCTATATTATTGCGCTCCTTTTCTTATAAGTTTCTTTACTAAAGAAAT
ATTTTCTGTTCTCAGTGATGAGGATAATGTCGCTTCTGTGTGCATTACCA
CCTATTAATTCTCAGTTTTTATCCTGTCCAGAAACTGGAATGGGAATCTT
TGTCTATTGATCTTTTGCCGCATCCAGACATGTTTGCTGATGTTACATTT
GGACGCTCTGAAGAGGGATCAAACCTGAGGGATGATGATGGTGCAAAAAG
AGTATTCTTTGGAGGAGAGCGTTTTGTGGAAGGAATATCAGGAGAAGCAT
ATGTAATAAATGCTGTTCCTCCAAGCTATTTTACAAGTATTCAGTTTTAT
TATAGAATGTTATGAGTCATGAAATATAGGTTGGATGTATGATTAACAGA
TAACGATTCAGAGAACTGAATTGAATAGCCCACTTGGACTTGAGGTTCAA
TTGCACATCAACGAAGCTGTTTGCCCTGCGTTAAGTGAACCAGGTAAGTA
AAACGGATCACTTTATTTTTATTGTATCCATATTGAATTGAATAAAATGC
ATAGATATAGTACGGGGTTAACACAACCTATATGAGCAGGACTTCGTGCA
CTTCTTCGCTTCATGACCGGAGTATATGTTTGTCTAAACAGGGGTGATGT
TGATTCAAAGGCTCAACAGGTTTCTTATTGTCAACTTTTTATTGCCTTTG
AGAACACCAAGTCTCAGTACTTTGTTTTTTTGTACAAAATCTTGTTTCCT
TATGGCTTTCTCTAAGTCTATCTGTAATTGAATTGTGACAGCGATCCACT
GAAGCAGCTAGGTGTTCTCTTGTTTCAATTGTCGTAGATCATATGTTTCT
TTGCATTAAAGATACTGGTTTGTCTTTGGCATGTGCATAATTCTTTTTAT
TTTGATCTATATCTCCTTCAATTATTATTGAATATCCTGGGGCTACTAGT
GTTATGTATAGCATTACATGCAAAATGATCCAACAATTGGTATTAACTTT
CAGAGTTCCAGCTTGAGTTTTTGATGCAGTCCCTCTTTTTCTCTAGGGTA
AGTTTTTTGATATTTTCTTTGCTGACAAGTTAAATTCTTGTACTCTTTCT
TTATTTCTTCAGCGTACTCTCAATACCGTTGCTGGTTGTACTACCTTAGC
CTTATCTAGTAGGTTGAATAGAACTGAGTTTATTTTAAACCAAACTTAAA
CAATAATACAAAACCTTATATTTGCCTTTAATACTTTTTTTAACGGGAGG
TTTAAGACACCTTTCATATATAGTATATTTTGGTTCACTAGATTCTCACC
GGGTAACAACATGAGAGACAAACCTCTCTTATACCTGTGGACACTTGGTA
TATTTTGCTATAATTAGTATTAATGATTCAGAAAAAAGATAAGGAAAAAT
AAAATAAAAATGTAAACATTAAATTATGTGGTCTATGTGATTTTGGCATG
ATGAGTTTTCTTCTTTTAATAATCAGGCTTTTAGTGGCAGTAGACTTATA
CTGTTTGATTGACTATCCTTGTAGGCCAGTCTTTCTGAAGTAGATAATGA
CAAGAACTTAACCAAGATTTCAATTGCTGGATTATTTTTAAGGTTTGTGT
CTTTCAACTCTGTTTGAACAACTATTGAAACAATTAAGTGAGCTGTGTGT
GTATGCTTGGTTGCGGTTGTTTGTGTCAATGTATTCTGTGCTCATATCAT
ATGATTTACTAAATGGAATCCAAGAGGCAACTTATCTGAATATATTGGTA
ATCTGTTATGAACCACTGCTTTTGTGGTTAGATATTCTCGAATGGGAGAA
ATTAATACACTTGAAAAGGGGGAAAGGAAAAGAGAAAGAGTTGCTTATAT
TCTTAAGGAGGGACAATATCGTTGCATGATAAATCATTTTAGTGGCTCTT
GATAATTGAAACGGCATAATCTTCTTCTTCCAGCACTTCAATGAAACTAA
ATTATAGTTTGCGTTTATTGGAATGCAGGGACACCTTTTCCTCCCCTCCA
TGTACTTTAGTGCAACCATCAATGCAAGCTTTCACTGGAGATGCTTTTGA
TGTGCCAGAATTTGGTATTTATAAGTCATTAGCGCTCTTGAACGCATTTC
AGAAACTTTTATGTACTGCTTGTTAAAAATTTGTTTCTATCCTTTCTCTT
GACAGCTAGAAGCTTTTCCCCCCCGATATATCCTCTAGGAGAACAACAAT
GGCAGTTAAGTGAGGGAACCCCTCTAATATGCCTCCATGCTCTCCAGATC
ATACCTTCTCCACTTCCACCATCCTTTGCTTCTAAAACCGTTATTGACTG
TCAGCCTCTGATGGTATGTGCAGAATTTTACAAAAAATGCTCTGTTATGG
GACTTATAGTGCACCATTTTTTTTGCCAATCATATTATTTGATGTTTTTT
TTTCTTCTTCCAGATTCATCTCCAAGAAGATTCATGCCTGAGGATATCCT
CTTTTTTAGCTGATGGTATTGTTGTCAGTCCTGGTGACATCTTACCAGAT
TTCTCAGTGAAATCTTTTATTTTCACTCTCAAGGGATTGGATCTTACAGT
TCCTTTTGACAAGGCCAAAATGGATACTTCTAAAAGTGACATAGACAATA
CACTCCATACATCCTTTACTGGAGCAAGGCTTCATATTGAAAGCCTTTCA
TTTTTAGATTCACCTTCATTGAAACTAAGAATGCTGAACCTTGAGAAGGA
TCCTGCTTGCTTCTGTCTCTGGGAAGGTCAACCAGTTGATGCTACCCAGA
AGAAGTGGACTGCCAGAGCATCCCAGCTTACTTTGTCTCTGGAAGCATGC
ACCGGTACAACTGGACGTCAGACTGCAGGATTGTGGAGATGTGTTGATCT
GACAGAAGCTTGCATTGAAGTAGCCATGGCAACCGCTGATGGAAGCCCGT
TGTTAAAAATTCCTCCTCCTGGGGGTATTGTCAGGGTTGGAGTTGCTTGC
GAACAGTATTTGTCCAACACTTCTGTTGAGCAATTATTTTATGTCCTAGA
TCTATACGGTTATTTTGGAAAAGTTAGTGAAATGATGGCAATGGCTGGAA
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ATGCAATTGCGGAATCAACTTTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at Cr_LG_1:13522332..13531855+ >Cr_01252.1_PI489777_v1 ID=Cr_01252.1_PI489777_v1; Name=Cr_01252.1; organism=Cicer reticulatum; type=CDS; length=3645bp; location=Sequence derived from: Cr_LG_1:13522332..13531855+ (Cicer reticulatum ATGGAGTCGATACTTGGTCGTGCTCTTGAATACACTCTCAAGTATTGGCT CAAATCCTTCTCACGAGATCAGTTCAAGTTACAAGGCCACACCGTTCACC TTTCCAATTTAGATATCAACGGCGACGCTTTGCATTCCAGCGTTGGATTG CCGCCGGCGTTGAATGTCGCATCCGCCAAAGTTGGAAAACTCGAGATAAC GCTTCCGTCAGTTAGTAATGTGCAAATTGAACCAATTGTTATTCAAATTG ATAAACTCGATCTGGTTCTTGAAGAGAATTCTGATTTCGATGCATCTTCA AGTTCAAATAGTTCAGCGACCTCTGCTGCTACAGCCAAGGGAAGCAAGAC TAGCGGTTACGGTTTTGCTGATAAGGTCGCAGATGGCATGACTATACAAA TTCATACAGTTAATCTATTACTTGAAACTCGCGGTGGTTCTCGTCGCCCA GGTGGAGCAACATGGGCACCACCTATGGCATCTATCACCATACGCAACCT TTTGCTGTATACCACAAATGAAAACTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAAG CACGGGACTTCTCCAGTAACACGAAGTACATATATGTCTTCAAAAAACTG GAATGGGAATCTTTGTCTATTGATCTTTTGCCGCATCCAGACATGTTTGC TGATGTTACATTTGGACGCTCTGAAGAGGGATCAAACCTGAGGGATGATG ATGGTGCAAAAAGAGTATTCTTTGGAGGAGAGCGTTTTGTGGAAGGAATA TCAGGAGAAGCATATATAACGATTCAGAGAACTGAATTGAATAGCCCACT TGGACTTGAGGTTCAATTGCACATCAACGAAGCTGTTTGCCCTGCGTTAA GTGAACCAGGACTTCGTGCACTTCTTCGCTTCATGACCGGAGTATATGTT TGTCTAAACAGGGGTGATGTTGATTCAAAGGCTCAACAGCGATCCACTGA AGCAGCTAGGTGTTCTCTTGTTTCAATTGTCGTAGATCATATGTTTCTTT GCATTAAAGATACTGAGTTCCAGCTTGAGTTTTTGATGCAGTCCCTCTTT TTCTCTAGGGCCAGTCTTTCTGAAGTAGATAATGACAAGAACTTAACCAA GATTTCAATTGCTGGATTATTTTTAAGGGACACCTTTTCCTCCCCTCCAT GTACTTTAGTGCAACCATCAATGCAAGCTTTCACTGGAGATGCTTTTGAT GTGCCAGAATTTGCTAGAAGCTTTTCCCCCCCGATATATCCTCTAGGAGA ACAACAATGGCAGTTAAGTGAGGGAACCCCTCTAATATGCCTCCATGCTC TCCAGATCATACCTTCTCCACTTCCACCATCCTTTGCTTCTAAAACCGTT ATTGACTGTCAGCCTCTGATGATTCATCTCCAAGAAGATTCATGCCTGAG GATATCCTCTTTTTTAGCTGATGGTATTGTTGTCAGTCCTGGTGACATCT TACCAGATTTCTCAGTGAAATCTTTTATTTTCACTCTCAAGGGATTGGAT CTTACAGTTCCTTTTGACAAGGCCAAAATGGATACTTCTAAAAGTGACAT AGACAATACACTCCATACATCCTTTACTGGAGCAAGGCTTCATATTGAAA GCCTTTCATTTTTAGATTCACCTTCATTGAAACTAAGAATGCTGAACCTT GAGAAGGATCCTGCTTGCTTCTGTCTCTGGGAAGGTCAACCAGTTGATGC TACCCAGAAGAAGTGGACTGCCAGAGCATCCCAGCTTACTTTGTCTCTGG AAGCATGCACCGGTACAACTGGACGTCAGACTGCAGGATTGTGGAGATGT GTTGATCTGACAGAAGCTTGCATTGAAGTAGCCATGGCAACCGCTGATGG AAGCCCGTTGTTAAAAATTCCTCCTCCTGGGGGTATTGTCAGGGTTGGAG TTGCTTGCGAACAGTATTTGTCCAACACTTCTGTTGAGCAATTATTTTAT GTCCTAGATCTATACGGTTATTTTGGAAAAGTTAGTGAAATGATGGCAAT GGCTGGAAAAAAGAAACAACTGGAGGACGTTGGGCACAAATCTTTCAGTG GAAAGCTTATGGACAAGGCTCCTAGTGACACTGCTGTGAGTTTATCAGTG AAAGACCTCCAACTTCGATTCCTGGAGTCTTCACCAATGATTGTTGAGGG ACTGCCATTAGTGCAATTTGTTGGAAATGATCTGTTTACCAGTGCCACTC ATAGAACCCTTGGTGGGGCTATTGTTGTTTCATCTTCTCTACGCTGGGAG AGTGTTGAGATAAGTTGTGTGGATGCTGAGGGGAAGTTGGCATCTGAAAG TGGCTCTTTCTTGAGTTCTAGCATAAATGTTCCTTCACCAAGTGACAATG GATATCCTCAACTAAGAGCTGTATTCTGGGTGCATAAGAACGAGAGACAT CAAATGGATGGAAATGCTCATTCAATCCCTTTTCTTGACATAAGCATGGT CCAAGTCATACCATTACATGAACAAGACTTGGAGTCTCATAGTTTGAATG TCTCAGCTTCCATATCTGGTGTTCGTCTTGGTGGGGGAATGAACTATACT GAAGCCCTACTGCATAGATTTGGAATACTTGAGCTTGATGGAGCTCCTGG AAAGGGTCTTTGTAAAGGGTTGGAAAACTTACAAAAGGGGCCATTGTCAA AACTTTTTAAATCAACTCCTATGATTCTTGATGATTCAGAAGATGTTGAA AGCATGGGGGAAGGGAAAGAAACAGGTTTTCCACGCTTGAAGAAGCCAGA TGATGTGGATGTAACTATAAAATTGAGAGACTGGTTATTTGCTCTCGAAG GTGCACAGGATATGGCTGAAAGGTGGTGGTTCTCCAGCCATGAGGATGAA GGAAGAGAAGAGAGGTGTTGGCACACATCTTTCCATAGTTTACAAGTAAA TGCAAAAAGAAGCCCGAATAATGTTAAAGATGAAAAAGCACAAATGCATA GAATACAGCATCATTCAGTAGAAGTGGTTACGGTGGGAGTTCAAGGGCTG CAAATCCTGAAGCCTCATACCCAAAAAAAGGTTCCTTCATCAATGGTAAT TGCCAACGGGGTTAAGGAACTTAATGACACAATTGGAGGAATTGGTCTTG AAGTTCGCCTGATATTATGTGAGGAGAATGTTGATGATGAAACGACTAAC TGGGAAGTGGAAAATCTAAAATTCTCAGTTGGACAGCCGGTTGAGGTGGT TGTAACGAAGGATGAGGTTCAGCACCTTACTTTTTTGTGCAAATCTGAAA TTGATTCAATTGGACGGATAACTGCTGGAATTATACGGTTGCTTAAGTTA GAAGGCTCTATTGGTCAGTCTGTAGTAGATCAACTAGGCAACCTAGGAAG TGAAGGCATTGACAAGATCTTCTCTTCTGAAAAGGCTAGTAGAGATGGTA GTGTTAGTAGTAGAGGACTTTCTCCATTACCAAACTCCTTAATTGAAGAA CCAAAAAAAACTAAGGAGCAGACATTAGCTTTGCTCGAGGAAGCAGTTAT GGACTCACAGGCTAAACTTAATGATTTAATCAGTGATATTGGTACTTCAG AGTCTTCTTCCTCACAACACCTTACCATCGTCAAAGTAAGTCAAAAGATC GACACTATGCAGGGCTTATTGATGCAATTGCGGAATCAACTTTAA back to top
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